SOX5

SOX5
Идентификаторы
Псевдонимы	SOX5 , LL-SOX5B, L-SOX5F, LAMSHF, SRY-бокс 5, транскрипционный фактор 5 SRY-бокс
Внешние идентификаторы	Опустить : 604975 ; МГИ : 98367 ; Гомологен : 21378 ; Генные карты : SOX5 ; OMA : SOX5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12p12.1 Start 23,529,504 bp End 24,562,544 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6 G3|6 76.14 cM Start 143,828,425 bp End 144,781,977 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in Achilles tendon synovial joint sural nerve tibia ganglionic eminence ventricular zone cartilage tissue left testis right testis skin of thigh Top expressed in seminiferous tubule spermatid ganglionic eminence Rostral migratory stream lumbar subsegment of spinal cord subiculum foot ankle joint lateral geniculate nucleus external carotid artery More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA-binding transcription factor activity DNA binding protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Cellular component nucleus Biological process cellular response to transforming growth factor beta stimulus regulation of transcription, DNA-templated transcription by RNA polymerase II positive regulation of cartilage development positive regulation of chondrocyte differentiation positive regulation of mesenchymal stem cell differentiation transcription, DNA-templated asymmetric neuroblast division regulation of transcription by RNA polymerase II cell fate commitment negative regulation of transcription, DNA-templated positive regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6660 20678 Вместе ENSG00000134532 ENSMUSG00000041540 ЮниПрот P35711 P35710 RefSeq (мРНК) showНМ_001261414 НМ_001261415 НМ_006940 НМ_152989 НМ_178010 NM_001330785 НМ_001113559 НМ_001243163 НМ_011444 НМ_001347506 RefSeq (белок) showНП_001248343 НП_001248344 НП_001317714 НП_008871 НП_694534 NP_821078 НП_001107031 НП_001230092 НП_001334435 НП_035574 Местоположение (UCSC) Чр 12: 23,53 – 24,56 Мб Chr 6: 143,83 – 144,78 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор SOX-5 представляет собой белок , который у человека кодируется SOX5 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов SOX (SRY-родственный HMG-box), участвующих в регуляции эмбрионального развития и определении судьбы клеток. Кодируемый белок может действовать как регулятор транскрипции после образования белкового комплекса с другими белками. Кодируемый белок может играть роль в хондрогенезе. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 8. Для этого гена идентифицировано множество вариантов транскрипта, кодирующих различные изоформы.

Мутации в гене SOX5 могут вызвать синдром Лэмба-Шаффера .

См. также

• SOX-гены

Дальнейшее чтение

• Камачи Ю., Утикава М., Кондо Х. (апрель 2000 г.). «Сопряжение SOX: с партнерами в регуляции эмбрионального развития». Тенденции в генетике . 16 (4): 182–7. дои : 10.1016/S0168-9525(99)01955-1 . ПМИД   10729834 .
• Боулз Дж., Шеперс Г., Купман П. (ноябрь 2000 г.). «Филогения семейства SOX факторов транскрипции развития на основе последовательностей и структурных показателей» . Биология развития . 227 (2): 239–55. дои : 10.1006/dbio.2000.9883 . ПМИД   11071752 .
• Уилсон М., Купман П. (август 2002 г.). «Соответствие SOX: партнерские белки и кофакторы семейства регуляторов транскрипции SOX». Текущее мнение в области генетики и развития . 12 (4): 441–6. дои : 10.1016/S0959-437X(02)00323-4 . ПМИД   12100890 .
• Шеперс Г.Е., Тисдейл Р.Д., Купман П. (август 2002 г.). «Двадцать пар sox: степень, гомология и номенклатура семейств генов транскрипционных факторов sox мыши и человека» . Развивающая клетка . 3 (2): 167–70. дои : 10.1016/S1534-5807(02)00223-X . ПМИД   12194848 .
• Денни П., Свифт С., Брэнд Н., Дабхаде Н., Бартон П., Эшворт А. (июнь 1992 г.). «Консервативное семейство генов, связанных с геном, определяющим семенники, SRY» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (11): 2887. doi : 10.1093/nar/20.11.2887 . ПМЦ   336939 . ПМИД   1614875 .
• Коннор Ф., Кэри П.Д., Рид СМ, Престон Н.С., Дрисколл ПК, Денни П., Крейн-Робинсон С., Эшворт А. (август 1994 г.). «Свойства связывания и изгибания ДНК постмейотически экспрессируемого белка Sox-5, родственного Sry» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (16): 3339–46. дои : 10.1093/нар/22.16.3339 . ПМК   523727 . ПМИД   8078769 .
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Лефевр В., Ли П., де Кромбрюг Б. (октябрь 1998 г.). «Новая длинная форма Sox5 (L-Sox5), Sox6 и Sox9 совместно экспрессируются в хондрогенезе и совместно активируют ген коллагена типа II» . Журнал ЭМБО . 17 (19): 5718–33. дои : 10.1093/emboj/17.19.5718 . ПМК   1170900 . ПМИД   9755172 .
• Ууситало Х, Хилтунен А, Ахонен М, Гао Т.Дж., Лефевр В., Харли В., Кяхари В.М., Вуорио Е (октябрь 2001 г.). «Ускоренная активация L-Sox5, Sox6 и Sox9 за счет переноса гена BMP-2 во время заживления переломов у мышей» . Журнал исследований костей и минералов . 16 (10): 1837–45. дои : 10.1359/jbmr.2001.16.10.1837 . ПМИД   11585348 . S2CID   42947355 .
• Зафарана Г., Гиллис А.Дж., ван Гурп Р.Дж., Олссон П.Г., Элстродт Ф., Ступ Х., Миллан Дж.Л., Остерхейс Дж.В., Лоойенга Л.Х. (март 2002 г.). «Коамплификация DAD-R, SOX5 и EKI1 в семиномах яичек человека со специфической сверхэкспрессией DAD-R коррелирует со сниженным уровнем апоптоза и более ранними клиническими проявлениями». Исследования рака . 62 (6): 1822–31. ПМИД   11912161 .
• Икеда Т., Чжан Дж., Чано Т., Мабути А., Фукуда А., Кавагути Х., Накамура К., Икегава С. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация и характеристика длинной формы гена Sox5 (L-SOX5) человека». Джин . 298 (1): 59–68. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00927-7 . ПМИД   12406576 .