LMX1A

LMX1A
Идентификаторы
Псевдонимы	LMX1A , LMX1, LMX1.1, фактор транскрипции гомеобокса LIM 1 альфа, DFNA7
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600298 ; МГИ : 1888519 ; Гомологен : 24921 ; Генные карты : LMX1A ; ОМА : LMX1A — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	165,356,715 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	167,676,310 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; gastric mucosa; ; left testis; ; rectum; ; right testis; ; subcutaneous adipose tissue;
	Top expressed in
	choroid plexus of lateral ventricle; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; otic vesicle; ; notochord; ; yolk sac; ; Neural groove; ; zygote; ; neural fold; ; extraocular muscle; ; Neurogenic placodes;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; DNA binding; sequence-specific DNA binding; metal ion binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	neuron differentiation; cerebellum development; multicellular organism development; midbrain development; central nervous system development; regulation of transcription, DNA-templated; axon guidance; dentate gyrus development; transcription, DNA-templated; negative regulation of neuron differentiation; central nervous system neuron differentiation; hippocampus development; regulation of cell growth; brain development; dopaminergic neuron differentiation; regulation of gene expression; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; synapse organization; olfactory behavior; memory; locomotory behavior; midbrain dopaminergic neuron differentiation; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4009
	110648
	ENSG00000162761
	ENSMUSG00000026686
	Q8TE12
	Q9JKU8
	НМ_001033507 ; НМ_001174069 ; НМ_177398 ; НМ_177399
	НМ_033652
	НП_001167540 ; НП_796372
	НП_387501
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор 1 гомеобокса LIM, альфа , также известный как LMX1A , представляет собой белок , который у человека кодируется LMX1A геном . ^[5]^[6]

Функция

Инсулин вырабатывается исключительно бета-клетками островков Лангерганса поджелудочной железы. Уровень и специфичность бета-клеточной экспрессии гена инсулина регулируются набором ядерных генов, которые связываются со специфическими последовательностями в промоторе инсулинового гена INS и взаимодействуют с РНК-полимеразой для активации или подавления транскрипции. LMX1 представляет собой LIM гомеобокса транскрипционный фактор , который связывает A/T-богатую последовательность в промоторе инсулина и стимулирует транскрипцию инсулина. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что LMX1A взаимодействует с TCF3. ^[8] и LHX3 . ^[9]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162761 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026686 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: LMX1A LIM гомеобоксный транскрипционный фактор 1, альфа» .
^ Герман М.С., Ван Дж., Фернальд А.А., Эспиноза Р., Ле Бо М.М., Белл Дж.И. (ноябрь 1994 г.). «Локализация генов, кодирующих два фактора транскрипции, LMX1 и CDX3, регулирующих экспрессию гена инсулина, на хромосомах 1 и 13 человека». Геномика . 24 (2): 403–4. дои : 10.1006/geno.1994.1639 . ПМИД 7698771 .
^ «Энтрез Ген: LMX1A» .
^ Джонсон Дж.Д., Чжан В., Рудник А., Раттер В.Дж., немецкий MS (июль 1997 г.). «Транкрипционная синергия между белками LIM-гомеодомена и основными белками спираль-петля-спираль: домен LIM2 определяет специфичность» . Мол. Клетка. Биол . 17 (7): 3488–96. дои : 10.1128/mcb.17.7.3488 . ПМК 232202 . ПМИД 9199284 .
^ Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .

Дальнейшее чтение

Немецкий М.С., Ван Дж., Чедвик Р.Б., Раттер В.Дж. (1992). «Синергическая активация гена инсулина белком LIM-гомео-домена и основным белком спираль-петля-спираль: построение функционального комплекса миниэнхансеров инсулина» . Генс Дев . 6 (11): 2165–76. дои : 10.1101/gad.6.11.2165 . ПМИД 1358758 .
Герман М.С., Ван Дж., Фернальд А.А., Эспиноза Р., Ле Бо М.М., Белл Г.И. (1994). «Локализация генов, кодирующих два фактора транскрипции, LMX1 и CDX3, регулирующие экспрессию гена инсулина, на хромосомах 1 и 13 человека». Геномика . 24 (2): 403–4. дои : 10.1006/geno.1994.1639 . ПМИД 7698771 .
Юрата Л.В., Гилл Г.Н. (1997). «Функциональный анализ ядерного интерактора домена LIM NLI» . Мол. Клетка. Биол . 17 (10): 5688–98. дои : 10.1128/MCB.17.10.5688 . ПМК 232417 . ПМИД 9315627 .
Яннотти К.А., Иноуэ Х., Бернал Э., Аоки М., Лю Л., Донис-Келлер Х., Герман М.С., Пермутт М.А. (1997). «Идентификация гена человека, связанного с LMX1 (LMX1.1), LMX1.2: тканеспецифическая экспрессия и картирование связей на хромосоме 9». Геномика . 46 (3): 520–4. дои : 10.1006/geno.1997.5075 . ПМИД 9441763 .
Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (1998). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .
Тамим Ф., Вулфорд Дж. К., Ван Дж., Герман М. С., Богардус С., Прохазка М. (2002). «Клонирование, экспрессия и геномная структура человеческого LMX1A, а также скрининг вариантов у индейцев пима». Джин . 290 (1–2): 217–25. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00582-6 . ПМИД 12062816 .
Миллен К.Дж., Миллониг Дж.Х., Хаттен М.Э. (2004). «Развитие интернейронов dl1 на крыше и спинном мозге у мутантной мыши draher» . Дев. Биол . 270 (2): 382–92. дои : 10.1016/j.ydbio.2004.03.008 . ПМИД 15183721 .
Хассель С., Эйхнер А., Якимович М., Хеллман У., Кнаус П., Сушельницкий С. (2004). «Белки, связанные с костным морфогенетическим белковым рецептором типа II (BMPR-II), идентифицированные с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». Протеомика . 4 (5): 1346–58. дои : 10.1002/pmic.200300770 . ПМИД 15188402 . S2CID 6773754 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162761 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026686 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: LMX1A LIM гомеобоксный транскрипционный фактор 1, альфа» .

[pmid7698771-6] Герман М.С., Ван Дж., Фернальд А.А., Эспиноза Р., Ле Бо М.М., Белл Дж.И. (ноябрь 1994 г.). «Локализация генов, кодирующих два фактора транскрипции, LMX1 и CDX3, регулирующих экспрессию гена инсулина, на хромосомах 1 и 13 человека». Геномика . 24 (2): 403–4. дои : 10.1006/geno.1994.1639 . ПМИД 7698771 .

[entrez2-7] «Энтрез Ген: LMX1A» .

[pmid9199284-8] Джонсон Дж.Д., Чжан В., Рудник А., Раттер В.Дж., немецкий MS (июль 1997 г.). «Транкрипционная синергия между белками LIM-гомеодомена и основными белками спираль-петля-спираль: домен LIM2 определяет специфичность» . Мол. Клетка. Биол . 17 (7): 3488–96. дои : 10.1128/mcb.17.7.3488 . ПМК 232202 . ПМИД 9199284 .

[pmid9452425-9] Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]