Y-бокс-связывающий белок 1

YBX1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1H95
Идентификаторы
Псевдонимы	YBX1 , BP-8, CSDA2, CSDB, DBPB, MDR-NF1, NSEP-1, NSEP1, YB-1, YB1, CBF-A, EFI-A, белок, связывающий Y-бокс 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 154030 ; МГИ : 99146 ; Гомологен : 88707 ; Генные карты : YBX1 ; ОМА : YBX1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	42,703,805 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	119,151,801 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; Achilles tendon; ; gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh; ; skeletal muscle tissue; ; left ventricle; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; primitive streak; ; tail of embryo; ; abdominal wall; ; medial ganglionic eminence; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; seminiferous tubule; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; migratory enteric neural crest cell; ; maxillary prominence;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; RNA binding; nucleic acid binding; GTPase binding; double-stranded DNA binding; single-stranded DNA binding; chromatin binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; CRD-mediated mRNA stability complex; nuclear membrane; intracellular membrane-bounded organelle; U12-type spliceosomal complex; nucleoplasm; extracellular region; cytoplasmic stress granule; extracellular exosome; nucleus; histone pre-mRNA 3'end processing complex; cytosol; ribonucleoprotein complex;
Biological process	CRD-mediated mRNA stabilization; mRNA splicing, via spliceosome; regulation of transcription, DNA-templated; mRNA processing; transcription by RNA polymerase II; protein localization to cytoplasmic stress granule; transcription, DNA-templated; positive regulation of cell division; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; in utero embryonic development; RNA splicing; negative regulation of striated muscle cell differentiation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; Notch signaling pathway; cellular response to interleukin-7;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4904
	22608
	ENSG00000065978
	ENSMUSG00000028639
	P67809
	P62960
	НМ_004559
	НМ_011732
	НП_004550
	НП_035862
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, связывающий Y-бокс, также известный как фактор транскрипции Y-бокса или белок 1, связывающий чувствительные к нуклеазе элементы, представляет собой белок , который у людей кодируется YBX1 геном . ^[5] YBX1 представляет собой РНК-связывающий белок. ^[6] который стабилизирует информационные РНК, модифицированные N6-метиладенозином. ^[7]

Клиническое значение

YBX1 является потенциальной мишенью для лечения рака. ^[8] YB-1 помогает репликации аденовируса типа 5, широко используемого вектора в генной терапии . ^[8] Таким образом, YB-1 может вызывать «онколитический» эффект в YB-1-положительных раковых клетках, обработанных аденовирусами.

Взаимодействия

Было показано, что белок 1, связывающий Y-бокс, взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000065978 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028639 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ EntrezGene 4904 YBX1 Y-бокс-связывающий белок 1
^ Квон Э., Тодорова К., Ван Дж., Хорос Р., Ли К.К., Нил В.А. и др. (апрель 2018 г.). «РНК-связывающий белок YBX1 регулирует эпидермальные предшественники на посттранскрипционном уровне» . Природные коммуникации . 9 (1): 1734. Бибкод : 2018NatCo...9.1734K . дои : 10.1038/s41467-018-04092-0 . ПМК 5928080 . ПМИД 29712925 .
^ Фэн М., Се Х, Хан Г., Чжан Т., Ли Ю, Ли Ю и др. (июль 2021 г.). «YBX1 необходим для поддержания выживания клеток миелолейкоза путем регуляции стабильности BCL2 m6A-зависимым образом» . Кровь . 138 (1): 71–85. дои : 10.1182/blood.2020009676 . ПМЦ 8667054 . ПМИД 33763698 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лаге Х., Суровяк П., Холм П.С. (ноябрь 2008 г.). «[YB-1 как потенциальная мишень в терапии рака]» . Der Pathologie (на немецком языке). 29 (Приложение 2): 187–190. дои : 10.1007/s00292-008-1030-2 . ПМИД 18773210 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Койич С., Медеот Е., Гуччионе Е., Крмак Х., Зара И., Мартинелли В. и др. (май 2004 г.). «Белок Ankrd2, связь между саркомером и ядром скелетных мышц». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 313–325. дои : 10.1016/j.jmb.2004.03.071 . ПМИД 15136035 .
^ Чернухин И.В., Шамсуддин С., Робинсон А.Ф., Карн А.Ф., Пол А., Эль-Кади А.И. и др. (сентябрь 2000 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между двумя плюрипотентными белками, фактором связывания ДНК/РНК Y-box, YB-1, и мультивалентным фактором цинковых пальцев, CTCF» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29915–29921. дои : 10.1074/jbc.M001538200 . ПМИД 10906122 .
^ Окамото Т., Идзуми Х., Имамура Т., Такано Х., Исэ Т., Учиуми Т. и др. (декабрь 2000 г.). «Прямое взаимодействие р53 с белком, связывающим Y-бокс, YB-1: механизм регуляции экспрессии генов человека» . Онкоген . 19 (54): 6194–6202. дои : 10.1038/sj.onc.1204029 . ПМИД 11175333 .
^ Исе Т., Нагатани Г., Имамура Т., Като К., Такано Х., Номото М. и др. (январь 1999 г.). «Белок 1, связывающий фактор транскрипции Y-box, преимущественно связывается с модифицированной цисплатином ДНК и взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Исследования рака . 59 (2): 342–346. ПМИД 9927044 .
^ Чиби М, Мейер М, Скепу А, Дж. Рис DJ, Мулман-Смук JC, Пью DJ (декабрь 2008 г.). «RBBP6 взаимодействует с многофункциональным белком YB-1 через его домен RING-пальца, что приводит к убиквитинированию и протеосомной деградации YB-1». Журнал молекулярной биологии . 384 (4): 908–916. дои : 10.1016/j.jmb.2008.09.060 . ПМИД 18851979 .
^ Раффецедер У., Фрай Б., Рауэн Т., Юршотт К., Ройер Х.Д., Янсен П.Л. и др. (май 2003 г.). «Взаимодействие фактора сплайсинга SRp30c с Y-box-белком-1 обеспечивает ядерный челночный доступ YB-1 и выбор альтернативного сайта сплайсинга» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18241–18248. дои : 10.1074/jbc.M212518200 . ПМИД 12604611 .

Дальнейшее чтение

Коллури Р., Торри Т.А., Киннибург А.Дж. (январь 1992 г.). «Белок, связывающий элемент промотора CT: определение двухцепочечного и нового одноцепочечного мотива связывания ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (1): 111–116. дои : 10.1093/нар/20.1.111 . ПМК 5356827 . ПМИД 1738588 .
Коллури Р., Киннибург Эй.Дж. (сентябрь 1991 г.). «Полноразмерная последовательность кДНК, кодирующая ДНК-связывающий белок, чувствительный к нуклеазе элемент» . Исследования нуклеиновых кислот . 19 (17): 4771. doi : 10.1093/nar/19.17.4771 . ПМК 328725 . ПМИД 1891370 .
Сакура Х, Маэкава Т, Имамото Ф, Ясуда К, Исии С (декабрь 1988 г.). «Два человеческих гена, выделенных новым методом, кодируют ДНК-связывающие белки, содержащие общую область гомологии». Джин . 73 (2): 499–507. дои : 10.1016/0378-1119(88)90514-8 . ПМИД 2977358 .
Дидье Д.К., Шиффенбауэр Дж., Вульф С.Л., Закеис М., Шварц Б.Д. (октябрь 1988 г.). «Характеристика кДНК, кодирующей белок, связывающийся с Y-боксом главного комплекса гистосовместимости класса II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (19): 7322–7326. Бибкод : 1988PNAS...85.7322D . дои : 10.1073/pnas.85.19.7322 . ПМК 282178 . ПМИД 3174636 .
Кудо С., Маттей М.Г., Фукуда М. (июль 1995 г.). «Характеристика гена dbpA, члена семейства белков, связывающих нуклеиновые кислоты, содержащих домен холодового шока». Европейский журнал биохимии . 231 (1): 72–82. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20672.x (неактивен 8 июня 2024 г.). ПМИД 7628487 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июнь 2024 г. ( ссылка )
Льоберас Дж., Маки Р.А., Селада А. (сентябрь 1995 г.). «Репрессия экспрессии гена главного комплекса гистосовместимости IA бета белками dbpA и dbpB (mYB-1)» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 5092–5099. дои : 10.1128/mcb.15.9.5092 . ПМК 230756 . ПМИД 7651426 .
Чен Н.Н., Чанг К.Ф., Галлия Г.Л., Керр Д.А., Джонсон Э.М., Крачмаров К.П. и др. (февраль 1995 г.). «Совместное действие клеточных белков YB-1 и Pur альфа с опухолевым антигеном полиомавируса JC человека определяет их взаимодействие с вирусным литическим контрольным элементом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (4): 1087–1091. Бибкод : 1995PNAS...92.1087C . дои : 10.1073/pnas.92.4.1087 . ПМК 42642 . ПМИД 7862639 .
Хорвиц Э.М., Мэлони К.А., Лей Т.Дж. (май 1994 г.). «Человеческий белок, содержащий домен «холодного шока», специфически связывается с H-ДНК, расположенной выше генов гамма-глобина человека» . Журнал биологической химии . 269 (19): 14130–14139. дои : 10.1016/S0021-9258(17)36764-9 . ПМИД 8188694 .
Кашанчи Ф., Дюваль Дж. Ф., Диттмер Дж., Мирескандари А., Рид Р.Л., Гитлин С.Д. и др. (январь 1994 г.). «Участие транскрипционного фактора YB-1 в экспрессии базального гена Т-клеточного лимфотропного вируса типа I человека» . Журнал вирусологии . 68 (1): 561–565. doi : 10.1128/JVI.68.1.561-565.1994 . ПМК 236322 . ПМИД 8254772 .
Макино Ю., Ога Т., То С., Койке К., Окумура К., Вада М. и др. (май 1996 г.). «Структурный и функциональный анализ промотора гена человеческого Y-бокс-связывающего белка (YB-1)» . Исследования нуклеиновых кислот . 24 (10): 1873–1878. дои : 10.1093/нар/24.10.1873 . ПМК 145870 . ПМИД 8657568 .
Функе Б., Зулегер Б., Бенавенте Р., Шустер Т., Голлер М., Стевенин Дж. и др. (октябрь 1996 г.). «Мышиный поли(С)-связывающий белок существует в нескольких изоформах и взаимодействует с несколькими РНК-связывающими белками» . Исследования нуклеиновых кислот . 24 (19): 3821–3828. дои : 10.1093/нар/24.19.3821 . ПМК 146158 . ПМИД 8871564 .
Койке К., Утиуми Т., Ога Т., Тох С., Вада М., Коно К. и др. (ноябрь 1997 г.). «Ядерная транслокация белка, связывающего Y-бокс, под действием ультрафиолетового облучения» . Письма ФЭБС . 417 (3): 390–394. Бибкод : 1997FEBSL.417..390K . дои : 10.1016/S0014-5793(97)01296-9 . ПМИД 9409758 . S2CID 24656107 .
То С., Накамура Т., Ога Т., Койке К., Учиуми Т., Вада М. и др. (январь 1998 г.). «Геномная организация гена человеческого белка Y-box (YB-1)». Джин . 206 (1): 93–97. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00570-2 . ПМИД 9461420 .
Савая Б.Е., Халили К., Амини С. (февраль 1998 г.). «Транскрипция промотора вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) в клетках центральной нервной системы: влияние YB-1 на экспрессию длинного концевого повтора ВИЧ-1» . Журнал общей вирусологии . 79. 79 (Часть 2) (2): 239–246. дои : 10.1099/0022-1317-79-2-239 . ПМИД 9472608 .
Мертенс П.Р., Альфонсо-Хауме М.А., Штайнманн К., Ловетт Д.Х. (декабрь 1998 г.). «Синергическое взаимодействие факторов транскрипции AP2 и YB-1 регулирует транскрипцию, зависимую от энхансера желатиназы А» . Журнал биологической химии . 273 (49): 32957–32965. дои : 10.1074/jbc.273.49.32957 . ПМИД 9830047 .
Исе Т., Нагатани Г., Имамура Т., Като К., Такано Х., Номото М. и др. (январь 1999 г.). «Белок 1, связывающий фактор транскрипции Y-box, преимущественно связывается с модифицированной цисплатином ДНК и взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Исследования рака . 59 (2): 342–346. ПМИД 9927044 .
Сафак М., Галлия Г.Л., Халили К. (апрель 1999 г.). «Взаимное взаимодействие между двумя клеточными белками, Puralpha и YB-1, модулирует транскрипционную активность JCVCY в глиальных клетках» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 2712–2723. дои : 10.1128/mcb.19.4.2712 . ПМК 84064 . ПМИД 10082537 .
Келм Р.Дж., Коган Дж.Г., Элдер П.К., Штраух А.Р., Гетц М.Дж. (май 1999 г.). «Молекулярные взаимодействия между одноцепочечными ДНК-связывающими белками, связанными с важным элементом MCAT в промоторе альфа-актина гладких мышц мыши» . Журнал биологической химии . 274 (20): 14238–14245. дои : 10.1074/jbc.274.20.14238 . ПМИД 10318844 .
Сафак М., Галлия Г.Л., Ансари С.А., Халили К. (декабрь 1999 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между Y-бокс-связывающим белком YB-1 и большим Т-антигеном вируса JC полиомы человека» . Журнал вирусологии . 73 (12): 10146–10157. doi : 10.1128/JVI.73.12.10146-10157.1999 . ПМК 113067 . ПМИД 10559330 .
Ансари С.А., Сафак М., Галлия Г.Л., Савая Б.Е., Амини С., Халили К. (октябрь 1999 г.). «Взаимодействие YB-1 с Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 и РНК TAR модулирует активность вирусного промотора» . Журнал общей вирусологии . 80. 80 (Часть 10) (10): 2629–2638. дои : 10.1099/0022-1317-80-10-2629 . ПМИД 10573156 .
Басаки Ю., Хосой Ф., Ода Ю., Фотовати А., Маруяма Ю., Ои С. и др. (апрель 2007 г.). «Akt-зависимая ядерная локализация Y-бокс-связывающего белка 1 при приобретении злокачественных характеристик клетками рака яичников человека» . Онкоген . 26 (19): 2736–2746. дои : 10.1038/sj.onc.1210084 . ПМИД 17072343 .

Внешние ссылки

YBX1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000065978 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028639 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] EntrezGene 4904 YBX1 Y-бокс-связывающий белок 1

[Kwon_2018-6] Квон Э., Тодорова К., Ван Дж., Хорос Р., Ли К.К., Нил В.А. и др. (апрель 2018 г.). «РНК-связывающий белок YBX1 регулирует эпидермальные предшественники на посттранскрипционном уровне» . Природные коммуникации . 9 (1): 1734. Бибкод : 2018NatCo...9.1734K . дои : 10.1038/s41467-018-04092-0 . ПМК 5928080 . ПМИД 29712925 .

[7] Фэн М., Се Х, Хан Г., Чжан Т., Ли Ю, Ли Ю и др. (июль 2021 г.). «YBX1 необходим для поддержания выживания клеток миелолейкоза путем регуляции стабильности BCL2 m6A-зависимым образом» . Кровь . 138 (1): 71–85. дои : 10.1182/blood.2020009676 . ПМЦ 8667054 . ПМИД 33763698 .

[Lage_2008-8] Перейти обратно: ^а ^б Лаге Х., Суровяк П., Холм П.С. (ноябрь 2008 г.). «[YB-1 как потенциальная мишень в терапии рака]» . Der Pathologie (на немецком языке). 29 (Приложение 2): 187–190. дои : 10.1007/s00292-008-1030-2 . ПМИД 18773210 .

[pmid15136035-9] Перейти обратно: ^а ^б Койич С., Медеот Е., Гуччионе Е., Крмак Х., Зара И., Мартинелли В. и др. (май 2004 г.). «Белок Ankrd2, связь между саркомером и ядром скелетных мышц». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 313–325. дои : 10.1016/j.jmb.2004.03.071 . ПМИД 15136035 .

[pmid10906122-10] Чернухин И.В., Шамсуддин С., Робинсон А.Ф., Карн А.Ф., Пол А., Эль-Кади А.И. и др. (сентябрь 2000 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между двумя плюрипотентными белками, фактором связывания ДНК/РНК Y-box, YB-1, и мультивалентным фактором цинковых пальцев, CTCF» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29915–29921. дои : 10.1074/jbc.M001538200 . ПМИД 10906122 .

[pmid11175333-11] Окамото Т., Идзуми Х., Имамура Т., Такано Х., Исэ Т., Учиуми Т. и др. (декабрь 2000 г.). «Прямое взаимодействие р53 с белком, связывающим Y-бокс, YB-1: механизм регуляции экспрессии генов человека» . Онкоген . 19 (54): 6194–6202. дои : 10.1038/sj.onc.1204029 . ПМИД 11175333 .

[pmid9927044-12] Исе Т., Нагатани Г., Имамура Т., Като К., Такано Х., Номото М. и др. (январь 1999 г.). «Белок 1, связывающий фактор транскрипции Y-box, преимущественно связывается с модифицированной цисплатином ДНК и взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Исследования рака . 59 (2): 342–346. ПМИД 9927044 .

[pmid18851979-13] Чиби М, Мейер М, Скепу А, Дж. Рис DJ, Мулман-Смук JC, Пью DJ (декабрь 2008 г.). «RBBP6 взаимодействует с многофункциональным белком YB-1 через его домен RING-пальца, что приводит к убиквитинированию и протеосомной деградации YB-1». Журнал молекулярной биологии . 384 (4): 908–916. дои : 10.1016/j.jmb.2008.09.060 . ПМИД 18851979 .

[pmid12604611-14] Раффецедер У., Фрай Б., Рауэн Т., Юршотт К., Ройер Х.Д., Янсен П.Л. и др. (май 2003 г.). «Взаимодействие фактора сплайсинга SRp30c с Y-box-белком-1 обеспечивает ядерный челночный доступ YB-1 и выбор альтернативного сайта сплайсинга» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18241–18248. дои : 10.1074/jbc.M212518200 . ПМИД 12604611 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]