✖


Jump to content

Гомеобокс

Гомеодомен
Antennapedia связанный Гомеодоменный белок Drosophila melanogaster, с фрагментом ДНК . [1] Спираль узнавания и неструктурированный N-конец связаны в большой и малой бороздках соответственно.
Идентификаторы
Символ Гомеодомен
Пфам PF00046
Пфам Клан CL0123
ИнтерПро ИПР001356
УМНЫЙ SM00389
PROSITE PDOC00027
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1ahd / SCOPe / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1ahd​, 1akh​, 1apl​, 1au7​, 1b72​, 1b8i​, 1bw5​, 1cqt​, 1du0​, 1du6​, 1e3o​, 1enh​, 1f43​, 1fjl​, 1ftt​, 1ftz​, 1gt0​, 1hdd​, 1hdp​, 1hf0​, 1hom​, 1ic8​, 1ig7​, 1jgg​, 1k61​, 1kz2​, 1le8​, 1lfb​, 1lfu​, 1mh3​, 1mh4​, 1mnm​, 1nk2​, 1nk3​, 1o4x​, 1ocp​, 1oct​, 1p7i​, 1p7j​, 1pog​, 1puf​, 1qry​, 1s7e​, 1san​, 1uhs​, 1vnd​, 1wi3​, 1x2m​, 1x2n​, 1yrn​, 1yz8​, 1zq3​, 1ztr​, 2cqx​, 2cra​, 2cue​, 2cuf​, 2dmq​, 2e1o​, 2ecb​, 2ecc​, 2h8r​, 2hdd​, 2hi3​, 2hoa​, 2jwt​, 2lfb​, 2p81​, 2r5y​, 2r5z​, 3hdd​, 9ant​

Гомеобокс последовательность — это ДНК длиной около 180 пар оснований , которая регулирует крупномасштабные анатомические особенности на ранних стадиях эмбрионального развития. Мутации в гомеобоксе могут изменить масштабные анатомические особенности взрослого организма.

Гомеобоксы обнаружены в генах , которые участвуют в регуляции анатомического развития ( морфогенеза ) у животных , грибов , растений и многочисленных одноклеточных эукариот . [2] Гены гомеобокса кодируют гомеодомена белковые продукты , которые являются факторами транскрипции , имеющими характерную белковую структуру, которая связывает ДНК и регулирует экспрессию генов-мишеней. [3] [4] [2] Белки гомеодомена регулируют экспрессию генов и дифференцировку клеток на ранних стадиях эмбрионального развития, поэтому мутации в генах гомеобокса могут вызывать нарушения развития. [5]

Гомеозис — это термин, придуманный Уильямом Бейтсоном для описания полной замены отдельной части тела другой частью тела, например антеннепедией — заменой антенны на голове плодовой мухи ногами. [6] Приставка «гомео-» в словах «гомеобокс» и «гомеодомен» происходит от этого мутационного фенотипа , который наблюдается, когда некоторые из этих генов мутируют у животных . Домен гомеобокса был впервые идентифицирован в ряде и сегментационных белков дрозофилы гомеотических , но теперь известно, что он хорошо консервативен у многих других животных, включая позвоночных . [3] [7] [8]

Открытие [ править ]

У дрозофилы с мутантным фенотипом антеннепедии наблюдается гомеотическая трансформация усиков в ножкообразные структуры на голове.

Существование генов гомеобокса было впервые обнаружено у дрозофилы путем выделения гена, ответственного за гомеотическую трансформацию, при которой из головы вместо ожидаемых усиков растут ноги. Уолтер Геринг идентифицировал ген антеннепедии , который вызвал этот гомеотический фенотип. [9] Анализ антеннопедии показал, что этот ген содержит последовательность из 180 пар оснований, которая кодирует ДНК-связывающий домен, который Уильям МакГиннис назвал «гомеобоксом». [10] О существовании дополнительных дрозофилы генов , содержащих гомеобоксную последовательность антеннпедии , независимо сообщили Эрнст Хафен, Майкл Левайн , Уильям Макгиннис и Уолтер Якоб Геринг из Базельского университета в Швейцарии , а также Мэтью П. Скотт и Эми Вайнер из Университета Индианы в Блумингтоне в 1984 году. . [11] [12] Выделение гомологичных генов Эдвардом де Робертисом и Уильямом Макгиннисом показало, что многочисленные гены различных видов содержат гомеобокс. [13] [14] Последующие филогенетические исследования, детализирующие эволюционные взаимоотношения между генами, содержащими гомеобокс, показали, что эти гены присутствуют у всех двусторонних животных.

Гомеодоменная структура [ править ]

Характерная складка белка гомеодомена состоит из домена длиной 60 аминокислот, состоящего из трех альфа-спиралей. Ниже показан консенсусный гомеодомен (цепь ~60 аминокислот): [15] 

            Helix 1          Helix 2         Helix 3/4
         ______________    __________    _________________
RRRKRTAYTRYQLLELEKEFHFNRYLTRRRRIELAHSLNLTERHIKIWFQNRRMKWKKEN
....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|
         10        20        30        40        50        60
Комплекс гомеодомен-ДНК vnd/NK-2. Спираль 3 гомеодомена связывается с большой бороздкой ДНК, а N-концевое плечо связывается с малой бороздкой по аналогии с другими комплексами гомеодомен-ДНК.

Спираль 2 и спираль 3 образуют так называемую структуру «спираль-виток-спираль » (HTH), в которой две альфа-спирали соединены короткой петлевой областью. Две N-концевые спирали гомеодомена антипараллельны , а более длинная С-концевая спираль примерно перпендикулярна осям, установленным первыми двумя. Именно эта третья спираль напрямую взаимодействует с ДНК посредством ряда водородных связей и гидрофобных взаимодействий, а также косвенных взаимодействий через молекулы воды, которые происходят между конкретными боковыми цепями и открытыми основаниями внутри большой бороздки ДНК. [7]

Гомеодоменные белки обнаружены у эукариот . [2] Благодаря мотиву HTH они имеют ограниченное сходство последовательностей и структурное сходство с прокариотическими факторами транскрипции. [16] такие как белки фага лямбда , которые изменяют экспрессию генов у прокариот . Мотив HTH демонстрирует некоторое сходство последовательностей, но сходную структуру в широком диапазоне ДНК-связывающих белков (например, белков -кронов и репрессоров , белков гомеодомена и т. д.). Одно из принципиальных различий между мотивами HTH в этих разных белках возникает из-за стереохимической потребности в глицине , который необходим, чтобы избежать стерического взаимодействия бета-углерода с основной цепью: для кро- и репрессорных белков глицин, по-видимому, обязателен. , тогда как для многих гомеотических и других ДНК-связывающих белков требования смягчены.

Специфика последовательности [ править ]

Гомеодомены могут связываться как специфично, так и неспецифически с B-ДНК , при этом С-концевая спираль узнавания выравнивается в большой бороздке ДНК, а неструктурированный пептидный «хвост» на N-конце выравнивается в малой бороздке. Спираль узнавания и межспиральные петли богаты остатками аргинина и лизина , которые образуют водородные связи с основной цепью ДНК. Консервативные гидрофобные остатки в центре спирали узнавания помогают стабилизировать упаковку спирали. Гомеодоменные белки отдают предпочтение последовательности ДНК 5'-ТААТ-3'; независимое от последовательности связывание происходит со значительно более низкой аффинностью. Специфичности одного гомеодоменного белка обычно недостаточно для распознавания конкретных промоторов гена-мишени, что делает связывание кофактора важным механизмом контроля специфичности последовательности связывания и экспрессии гена-мишени. Для достижения более высокой целевой специфичности гомеодоменные белки образуют комплексы с другими факторами транскрипции для распознавания промоторной области конкретного гена-мишени.

Биологическая функция [ править ]

Гомеодоменные белки функционируют как факторы транскрипции благодаря свойствам связывания ДНК консервативного мотива HTH. Гомеодоменные белки считаются главными контролирующими генами, а это означает, что один белок может регулировать экспрессию многих генов-мишеней. Гомеодоменные белки управляют формированием осей и структур тела во время раннего эмбрионального развития . [17] Многие гомеодоменные белки вызывают клеточную дифференцировку , инициируя каскады корегулируемых генов, необходимых для образования отдельных тканей и органов . Другие белки этого семейства, такие как NANOG, участвуют в поддержании плюрипотентности и предотвращении дифференцировки клеток.

Регламент [ править ]

Hox-гены и связанные с ними микроРНК являются высококонсервативными главными регуляторами развития с жестким тканеспецифичным пространственно-временным контролем. Известно, что эти гены не регулируются при некоторых видах рака и часто контролируются метилированием ДНК. [18] [19] Регуляция Hox-генов очень сложна и включает в себя реципрокные взаимодействия, в основном ингибирующие. Известно, что дрозофила использует комплексы полисот и триторакс для поддержания экспрессии Hox-генов после подавления генов парного правила и разрыва, которое происходит во время личиночного развития. Белки группы Polycomb могут заглушать Hox-гены путем модуляции структуры хроматина . [20]

Мутации [ править ]

Мутации в генах гомеобокса могут вызывать легко видимые фенотипические изменения в идентичности сегментов тела, такие как мутантные фенотипы Antennapedia и Bithorax у дрозофилы . Дупликация генов гомеобокса может производить новые сегменты тела, и такие дупликации, вероятно, сыграли важную роль в эволюции сегментированных животных.

Эволюция [ править ]

Сам гомеобокс мог возникнуть из несвязывающего ДНК трансмембранного домена на С-конце фермента MraY. Это основано на метагеномных данных, полученных от переходного архея Lokiarchaeum , который считается прокариотом, наиболее близким к предку всех эукариот. [21] [ ненадежный источник? ]

Филогенетический анализ последовательностей генов гомеобокса и структур белков гомеодомена позволяет предположить, что последний общий предок растений, грибов и животных имел по крайней мере два гена гомеобокса. [22] Молекулярные данные показывают, что некоторое ограниченное количество Hox-генов существовало у Cnidaria еще до появления первых настоящих Bilatera , что делает эти гены допалеозойскими . [23] Принято считать, что три основных кластера животных класса ANTP, Hox, ParaHox и NK (MetaHox), являются результатом сегментных дупликаций. В результате первого дублирования были созданы MetaHox и ProtoHox, последний из которых позже дублировался в Hox и ParaHox. Сами кластеры были созданы путем тандемной дупликации одного гомеобоксного гена ANTP-класса. [24] Дупликация генов с последующей неофункционализацией ответственна за многие гомеобоксные гены, обнаруженные у эукариот. [25] [26] Сравнение генов гомеобокса и кластеров генов использовалось для понимания эволюции структуры генома и морфологии тела многоклеточных животных. [27]

Типы гомеобокса генов ​

Hox-гены [ править ]

Экспрессия гена Hox у Drosophila melanogaster .
Основная статья: ген Hox

Hox-гены представляют собой наиболее широко известное подмножество гомеобоксных генов. Это важные гены многоклеточных животных , которые определяют идентичность эмбриональных областей вдоль передне-задней оси. [28] Первый Hox-ген позвоночных был выделен у Xenopus Эдвардом Де Робертисом и его коллегами в 1984 году. [29] Основной интерес к этому набору генов обусловлен их уникальным поведением и расположением в геноме. Hox-гены обычно встречаются в организованном кластере. Линейный порядок Hox-генов внутри кластера напрямую коррелирует с порядком их экспрессии как во времени, так и в пространстве во время развития. Это явление называется коллинеарностью.

Мутации в этих гомеозисных генах вызывают смещение сегментов тела во время эмбрионального развития. Это называется эктопия . Например, когда один ген теряется, сегмент развивается в более передний, а мутация, приводящая к усилению функции, заставляет сегмент развиваться в более задний. Известными примерами являются Antennapedia и bithorax у Drosophila , которые могут вызывать развитие ног вместо усиков и развитие удвоенной грудной клетки соответственно. [30]

У позвоночных четыре кластера паралогов частично дублируют функции, но также приобрели несколько производных функций. Например, HoxA и HoxD определяют идентичность сегмента вдоль оси конечности . [31] [32] Конкретные члены семейства Hox участвуют в ремоделировании сосудов, ангиогенезе и заболеваниях путем управления изменениями в деградации матрикса, интегринах и компонентах ЕСМ. [33] HoxA5 участвует в атеросклерозе. [34] [35] HoxD3 и HoxB3 представляют собой проинвазивные ангиогенные гены, которые активируют интегрины b3 и a5 и Efna1 в ЭК соответственно. [36] [37] [38] [39] HoxA3 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток (EC) путем активации MMP14 и uPAR. И наоборот, HoxD10 и HoxA5 обладают противоположным эффектом, подавляя миграцию ЭК и ангиогенез, а также стабилизируя слипчивые соединения за счет повышения регуляции TIMP1/понижения uPAR и MMP14, а также за счет повышения регуляции Tsp2/понижения VEGFR2, Efna1, Hif1alpha и COX-2 соответственно. [40] [41] HoxA5 также усиливает активность опухолевого супрессора p53 и Akt1 за счет подавления PTEN. [42] Было показано, что подавление HoxA5 замедляет рост гемангиомы . [43] HoxA5 оказывает далеко идущее влияние на экспрессию генов, вызывая активацию около 300 генов при его индукции в клеточных линиях рака молочной железы. [43] Сверхэкспрессия домена трансдукции белка HoxA5 предотвращает воспаление, проявляющееся ингибированием TNF-индуцируемого связывания моноцитов с HUVEC. [44] [45]

Гены LIM [ править ]

Основная статья: Домен LIM

Гены LIM (названные по начальным буквам названий трех белков, в которых характерный домен был впервые идентифицирован) кодируют два цистеиновых и богатых гистидином доменов LIM из 60 аминокислот и гомеодомен. Домены LIM участвуют в белок-белковых взаимодействиях и могут связывать молекулы цинка. Белки домена LIM обнаружены как в цитозоле, так и в ядре. Они участвуют в ремоделировании цитоскелета, в местах фокальной адгезии, в качестве каркасов для белковых комплексов и в качестве факторов транскрипции. [46]

Гены Пакса [ править ]

Основная статья: Гены Пакса

Большинство генов Pax содержат гомеобокс и парный домен, который также связывает ДНК для повышения специфичности связывания, хотя некоторые гены Pax полностью или частично потеряли последовательность гомеобокса. [47] Гены Pax участвуют в сегментации эмбриона , развитии нервной системы , формировании лобных полей глаза , развитии скелета и формировании структур лица. Pax 6 является главным регулятором развития глаз, поэтому этот ген необходим для развития зрительного пузырька и последующих структур глаза. [48]

ДЛЯ генов [ править ]

Основная статья: Семья ПОУ

Белки, содержащие область POU, состоят из гомеодомена и отдельного структурно гомологичного домена POU, который содержит два мотива спираль-поворот-спираль и также связывает ДНК. Два домена связаны гибкой петлей, которая достаточно длинна, чтобы растягиваться вокруг спирали ДНК, позволяя двум доменам связываться на противоположных сторонах целевой ДНК, вместе покрывая сегмент из восьми оснований с консенсусной последовательностью 5'-ATGCAAAT-3. '. Отдельные домены белков POU связываются с ДНК лишь слабо, но при связывании обладают сильным сродством к последовательностям. Домен POU сам по себе имеет значительное структурное сходство с репрессорами, экспрессируемыми в бактериофагах , особенно в фаге лямбда .

растений гомеобокса Гены ​

Как и у животных, гены гомеобокса растений кодируют типичный ДНК-связывающий гомеодомен длиной 60 аминокислот или, в случае TALE (расширение трех аминокислотных петель), гены гомеобокса - атипичный гомеодомен, состоящий из 63 аминокислот. В соответствии с их консервативной структурой интрон-экзон и уникальной архитектурой кодомена они были сгруппированы в 14 отдельных классов: HD-ZIP I–IV, BEL, KNOX, PLINC, WOX, PHD, DDT, NDX, LD, SAWADEE и PINTOX. [25] Сохранение кодоменов предполагает общее эукариотическое происхождение TALE. [49] и гомеодоменные белки, не относящиеся к TALE. [50]

Гены человека гомеобокса ​

Hox-гены у человека организованы в четыре хромосомных кластера:

имя хромосома ген
HOXA (или иногда HOX1) – HOXA@ хромосома 7 НОХА1 , НОХА2 , НОХА3 , НОХА4 , НОХА5 , НОХА6 , НОХА7 , НОХА9 , НОХА11 , НОХА10 , НОХА13
HOXB - HOXB@ хромосома 17 НОХB1 , НОХB2 , НОХB3 , НОХB4 , НОХB5 , НОХB6 , НОХB7 , НОХB8 , НОХB9 , НОХB13
НОХС - НОХС@ хромосома 12 НОХC4 , НОХС5 , НОХС6 , НОХС8 , НОХС9 , НОХС10 , НОХС11 , НОХС12 , НОХС13
ХОКСД - ХОКСД@ хромосома 2 HOXD1 , HOXD3 , HOXD4 , HOXD8 , HOXD9 , HOXD10 , HOXD11 , HOXD12 , HOXD13

Гены ParaHox аналогично обнаруживаются в четырех областях. К ним относятся CDX1 , CDX2 , CDX4 ; ГСХ1 , ГСХ2 ; и PDX1 . Другие гены, считающиеся Hox-подобными, включают EVX1 , EVX2 ; ГБХ1 , ГБХ2 ; МЕОКС1 , МЕОК2 ; и MNX1 . NK-подобные (NKL) гены, некоторые из которых считаются «MetaHox», сгруппированы с Hox-подобными генами в большую ANTP-подобную группу. [51] [52]

У людей есть семейство «гомеобоксов без дистального отдела» : DLX1 , DLX2 , DLX3 , DLX4 , DLX5 и DLX6 . Гены Dlx участвуют в развитии нервной системы и конечностей. [53] Их считают подмножеством NK-подобных генов. [51]

Человеческие гомеобоксные гены TALE (расширение трех аминокислотных петель) для «атипичного» гомеодомена состоят из 63, а не из 60 аминокислот: IRX1 , IRX2 , IRX3 , IRX4 , IRX5 , IRX6 ; МЭИС1 , МЭИС2 , МЭИС3 ; МКХ ; АТС1 , АТС2 , АТС3 , АТС4 ; ПКНОКС1 , ПКНОКС2 ; TGIF1 , TGIF2 , TGIF2LX , TGIF2LY . [51]

Кроме того, у человека имеются следующие гомеобоксные гены и белки: [51]

  1. ^ Сгруппированы как Lmx 1/5, 2/9, 3/4 и 6/8.
  2. ^ Сгруппированы как шесть 1/2, 3/6 и 4/5.
  3. ^ Сомнительно, согласно [51]
  4. ^ Пакса Гены . Сгруппированы как Pax2/5/8, Pax3/7 и Pax4/6.
  5. ^ Нк4.
  6. ^ Нк5.

См. также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ ВВП : 1AHD ; Биллетер М., Цянь Ю.К., Оттинг Г., Мюллер М., Геринг В., Вютрих К. (декабрь 1993 г.). «Определение структуры раствора ядерного магнитного резонанса комплекса гомеодомен-ДНК Antennapedia». Журнал молекулярной биологии . 234 (4): 1084–93. дои : 10.1006/jmbi.1993.1661 . ПМИД   7903398 .
  2. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Бурглин Т.Р., Аффольтер М (июнь 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление» . Хромосома . 125 (3): 497–521. дои : 10.1007/s00412-015-0543-8 . ПМЦ   4901127 . ПМИД   26464018 .
  3. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Геринг WJ (август 1992 г.). «Гомеобокс в перспективе». Тенденции биохимических наук . 17 (8): 277–80. дои : 10.1016/0968-0004(92)90434-B . ПМИД   1357790 .
  4. ^ Геринг WJ (декабрь 1993 г.). «Изучение гомеобокса». Джин . 135 (1–2): 215–21. дои : 10.1016/0378-1119(93)90068-E . ПМИД   7903947 .
  5. ^ Ссылка на ГХ. «Гомеобоксы» . Домашний справочник по генетике . Архивировано из оригинала 21 декабря 2019 г. Проверено 20 ноября 2019 г.
  6. ^ Материалы для изучения изменчивости, рассмотренные с особым вниманием к разрыву в происхождении видов. Уильям Бейтсон 1861–1926. Лондон: Macmillan 1894 xv, 598 стр.
  7. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Шофилд ПН (1987). «Шаблоны, головоломки и парадигмы - Загадка гомеобокса». Тенденции нейробиологии . 10 :3–6. дои : 10.1016/0166-2236(87)90113-5 . S2CID   53188259 .
  8. ^ Скотт М.П., ​​Тамкун Дж.В., Хартцелл Г.В. (июль 1989 г.). «Структура и функции гомеодомена». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 989 (1): 25–48. дои : 10.1016/0304-419x(89)90033-4 . ПМИД   2568852 .
  9. ^ Гарбер Р.Л., Куроива А., Геринг В.Дж. (1983). «Геномные и кДНК-клоны гомеотического локуса Antennapedia у дрозофилы» . Журнал ЭМБО . 2 (11): 2027–36. дои : 10.1002/j.1460-2075.1983.tb01696.x . ПМК   555405 . ПМИД   6416827 .
  10. ^ «Вальтер Якоб Геринг (1939-2014) | Энциклопедия проекта «Эмбрион»» . «эмбрион.asu.edu ». Архивировано из оригинала 09.12.2019 . Проверено 9 декабря 2019 г.
  11. ^ Макгиннис В., Левин М.С., Хафен Э., Куроива А., Геринг В.Дж. (1984). «Консервативная последовательность ДНК в гомеотических генах Drosophila Antennapedia и комплексов биторакса». Природа . 308 (5958): 428–33. Бибкод : 1984Natur.308..428M . дои : 10.1038/308428a0 . ПМИД   6323992 . S2CID   4235713 .
  12. ^ Скотт, член парламента, Вайнер А.Дж. (июль 1984 г.). «Структурные взаимоотношения между генами, контролирующими развитие: гомология последовательностей между локусами Antennapedia, Ultrabithorax и fushi tarazu дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 81 (13): 4115–9. Бибкод : 1984PNAS...81.4115S . дои : 10.1073/pnas.81.13.4115 . ПМЦ   345379 . ПМИД   6330741 .
  13. ^ Карраско А.Е., Макгиннис В., Геринг В.Дж., Де Робертис Э.М. (1984). «Клонирование гена X. laevis, экспрессированного во время раннего эмбриогенеза, кодирующего пептидную область, гомологичную гомеотическим генам дрозофилы». Клетка . 37 (2): 409–414. дои : 10.1016/0092-8674(84)90371-4 . ПМИД   6327066 . S2CID   30114443 .
  14. ^ Макгиннис В., Гарбер Р.Л., Вирц Дж., Куроива А., Геринг В.Дж. (июнь 1984 г.). «Гомологичная белково-кодирующая последовательность в гомеотических генах дрозофилы и ее сохранение у других многоклеточных животных» . Клетка . 37 (2): 403–8. дои : 10.1016/0092-8674(84)90370-2 . ПМИД   6327065 . S2CID   40456645 . Архивировано из оригинала 04 мая 2021 г. Проверено 9 декабря 2019 г.
  15. ^ Бурглин ТР. «Страница гомеобокса» (gif) . Каролинский институт. Архивировано из оригинала 21 июля 2011 г. Проверено 30 января 2010 г.
  16. ^ «Суперсемейство CATH 1.10.10.60» . www.cathdb.info . Архивировано из оригинала 9 августа 2017 года . Проверено 27 марта 2018 г.
  17. ^ Корсетти М.Т., Бриата П., Сансеверино Л., Дага А., Айролди И., Симеоне А. и др. (сентябрь 1992 г.). «Дифференциальные свойства связывания ДНК трех гомеодоменовых белков человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (17): 4465–72. дои : 10.1093/нар/20.17.4465 . ПМК   334173 . ПМИД   1357628 .
  18. ^ Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Поток-зависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042 . ПМЦ   4754957 . ПМИД   25953647 .
  19. ^ Бхатлекар С., Филдс Дж. З., Боман Б. М. (август 2014 г.). «НОХ-гены и их роль в развитии рака человека». Журнал молекулярной медицины . 92 (8): 811–23. дои : 10.1007/s00109-014-1181-y . ПМИД   24996520 . S2CID   17159381 .
  20. ^ Портозо М., Кавалли Дж. (2008). «Роль РНКи и некодирующих РНК в опосредованном Polycomb контроле экспрессии генов и геномном программировании» . РНК и регуляция экспрессии генов: скрытый уровень сложности . Кайстер Академик Пресс. ISBN  978-1-904455-25-7 . Архивировано из оригинала 2 января 2012 г. Проверено 27 февраля 2008 г.
  21. ^ Бозоргмер Дж.Х. (2018). «Происхождение гомеобокса на C-конце MraY у Lokiarchaea» . дои : 10.13140/RG.2.2.35941.65760 . Архивировано из оригинала 4 мая 2021 г. Получено 26 октября 2018 г. - через ResearchGate . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
  22. ^ Бхаратан Дж., Янссен Б.Дж., Келлог Э.А., Синха Н. (декабрь 1997 г.). «Дублировались ли гомеодоменные белки до возникновения покрытосеменных, грибов и многоклеточных растений?» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (25): 13749–53. Бибкод : 1997PNAS...9413749B . дои : 10.1073/pnas.94.25.13749 . JSTOR   43805 . ПМК   28378 . ПМИД   9391098 .
  23. ^ Райан Дж.Ф., Мацца М.Э., Панг К., Матус Д.К., Баксеванис А.Д., Мартиндейл М.К. и др. (январь 2007 г.). «Добилатерийное происхождение кластера Hox и кода Hox: свидетельства актинии Nematostella vectensis» . ПЛОС ОДИН . 2 (1): е153. Бибкод : 2007PLoSO...2..153R . дои : 10.1371/journal.pone.0000153 . ПМЦ   1779807 . ПМИД   17252055 .
  24. ^ Гарсиа-Фернандес Дж. (декабрь 2005 г.). «Происхождение и эволюция кластеров генов гомеобокса». Обзоры природы Генетика . 6 (12): 881–92. дои : 10.1038/nrg1723 . ПМИД   16341069 . S2CID   42823485 .
  25. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Мукерджи К., Броккьери Л., Бурглин Т.Р. (декабрь 2009 г.). «Комплексная классификация и эволюционный анализ генов гомеобокса растений» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (12): 2775–94. дои : 10.1093/molbev/msp201 . ПМК   2775110 . ПМИД   19734295 .
  26. ^ Голландия PW (2013). «Эволюция генов гомеобокса». Междисциплинарные обзоры Wiley: Биология развития . 2 (1): 31–45. дои : 10.1002/wdev.78 . ПМИД   23799629 . S2CID   44396110 .
  27. ^ Ферье Д.Э. (2016). «Эволюция кластеров гомеобоксных генов у животных: гига-кластер и первичная и вторичная кластеризация» . Границы экологии и эволюции . 4 . дои : 10.3389/fevo.2016.00036 . hdl : 10023/8685 . ISSN   2296-701X .
  28. ^ Алонсо CR (ноябрь 2002 г.). «Hox-белки: формирование частей тела путем активации локализованной гибели клеток» . Современная биология . 12 (22): Р776-8. Бибкод : 2002CBio...12.R776A . дои : 10.1016/S0960-9822(02)01291-5 . ПМИД   12445403 . S2CID   17558233 .
  29. ^ Карраско А.Э., Макгиннис В., Геринг В.Дж., Де Робертис Э.М. (июнь 1984 г.). «Клонирование гена X. laevis, экспрессированного во время раннего эмбриогенеза, кодирующего пептидную область, гомологичную гомеотическим генам дрозофилы». Клетка . 37 (2): 409–14. дои : 10.1016/0092-8674(84)90371-4 . ПМИД   6327066 . S2CID   30114443 .
  30. ^ Шнойвли С., Клеменц Р., Геринг В.Дж. (1987). «Изменение плана тела дрозофилы путем эктопической экспрессии гомеотического гена Antennapedia». Природа . 325 (6107): 816–8. Бибкод : 1987Natur.325..816S . дои : 10.1038/325816a0 . ПМИД   3821869 . S2CID   4320668 .
  31. ^ Фроманталь-Рамен К., Варот Х, Мессадек Н., ЛеМер М., Долле П., Шамбон П. (октябрь 1996 г.). «Hoxa-13 и Hoxd-13 играют решающую роль в формировании паттерна автопода конечностей». Разработка . 122 (10): 2997–3011. дои : 10.1242/dev.122.10.2997 . ПМИД   8898214 .
  32. ^ Закани Дж., Дюбул Д. (апрель 1999 г.). «Hox-гены в развитии и эволюции пальцев». Исследования клеток и тканей . 296 (1): 19–25. дои : 10.1007/s004410051262 . ПМИД   10199961 . S2CID   3192774 .
  33. ^ Горски Д.Х., Уолш К. (ноябрь 2000 г.). «Роль гомеобоксных генов в ремоделировании сосудов и ангиогенезе» . Исследование кровообращения . 87 (10): 865–72. дои : 10.1161/01.res.87.10.865 . ПМИД   11073881 .
  34. ^ Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Поток-зависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042 . ПМЦ   4754957 . ПМИД   25953647 .
  35. ^ Данн Дж., Симмонс Р., Табет С., Джо Х. (октябрь 2015 г.). «Роль эпигенетики в реакции эндотелиальных клеток на стресс сдвига и атеросклерозе» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 67 : 167–76. doi : 10.1016/j.biocel.2015.05.001 . ПМЦ   4592147 . ПМИД   25979369 .
  36. ^ Будро Н., Эндрюс С., Среброу А., Раванпей А., Череш Д.А. (октябрь 1997 г.). «Индукция ангиогенного фенотипа Hox D3» . Журнал клеточной биологии . 139 (1): 257–64. дои : 10.1083/jcb.139.1.257 . ПМК   2139816 . ПМИД   9314544 .
  37. ^ Будро, штат Нью-Джерси, Варнер Дж. А. (февраль 2004 г.). «Гомеобоксный транскрипционный фактор Hox D3 способствует экспрессии и функционированию интегрина альфа5бета1 во время ангиогенеза» . Журнал биологической химии . 279 (6): 4862–8. дои : 10.1074/jbc.M305190200 . ПМИД   14610084 .
  38. ^ Майерс С., Шарбоно А., Будро Н. (январь 2000 г.). «Гомеобокс B3 способствует капиллярному морфогенезу и ангиогенезу» . Журнал клеточной биологии . 148 (2): 343–51. дои : 10.1083/jcb.148.2.343 . ПМК   2174277 . ПМИД   10648567 .
  39. ^ Чен Ю, Сюй Б, Ардериу Г, Хасимото Т, Янг ВЛ, Будро Н и др. (ноябрь 2004 г.). «Ретровирусная доставка гена гомеобокса D3 индуцирует церебральный ангиогенез у мышей» . Журнал церебрального кровотока и метаболизма . 24 (11): 1280–7. дои : 10.1097/01.WCB.0000141770.09022.AB . ПМИД   15545924 .
  40. ^ Майерс С., Шарбоно А., Чунг И., Хэнкс Д., Будро Н. (декабрь 2002 г.). «Устойчивая экспрессия гомеобокса D10 ингибирует ангиогенез» . Американский журнал патологии . 161 (6): 2099–109. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64488-4 . ПМК   1850921 . ПМИД   12466126 .
  41. ^ Мейс К.А., Хансен С.Л., Майерс С., Янг Д.М., Будро Н. (июнь 2005 г.). «НОХА3 индуцирует миграцию клеток в эндотелиальных и эпителиальных клетках, способствуя ангиогенезу и заживлению ран» . Журнал клеточной науки . 118 (Часть 12): 2567–77. дои : 10.1242/jcs.02399 . ПМИД   15914537 .
  42. ^ Роудс К., Ардериу Г., Шарбоно А., Хансен С.Л., Хоффман В., Будро Н. (2005). «Роль Hox A5 в регуляции ангиогенеза и формирования сосудистого рисунка». Лимфатические исследования и биология . 3 (4): 240–52. дои : 10.1089/lrb.2005.3.240 . ПМИД   16379594 .
  43. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Ардериу Г, Куэвас И, Чен А, Каррио М, Ист Л, Будро, Нью-Джерси (2007). «HoxA5 стабилизирует слипчивые соединения за счет увеличения Akt1» . Адгезия и миграция клеток . 1 (4): 185–95. дои : 10.4161/cam.1.4.5448 . ПМК   2634105 . ПМИД   19262140 .
  44. ^ Чжу Ю., Куэвас И.К., Габриэль Р.А., Су Х., Нишимура С., Гао П. и др. (июнь 2009 г.). «Восстановление экспрессии транскрипционного фактора HoxA5 подавляет рост экспериментальных гемангиом головного мозга» . Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 68 (6): 626–32. doi : 10.1097/NEN.0b013e3181a491ce . ПМЦ   2728585 . ПМИД   19458547 .
  45. ^ Чен Х., Рубин Э., Чжан Х., Чунг С., Цзе CC, Гарретт Э. и др. (май 2005 г.). «Идентификация транскрипционных мишеней HOXA5» . Журнал биологической химии . 280 (19): 19373–80. дои : 10.1074/jbc.M413528200 . ПМИД   15757903 .
  46. ^ Кадрмас Дж.Л., Бекерле MC (ноябрь 2004 г.). «Домен LIM: от цитоскелета к ядру». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 5 (11): 920–31. дои : 10.1038/nrm1499 . ПМИД   15520811 . S2CID   6030950 .
  47. ^ Грусс П., Вальтер С. (май 1992 г.). «Пакс в разработке» . Клетка . 69 (5): 719–22. дои : 10.1016/0092-8674(92)90281-G . ПМИД   1591773 . S2CID   44613005 . Архивировано из оригинала 2 мая 2021 г. Проверено 11 декабря 2019 г.
  48. ^ Вальтер С., Грусс П. (декабрь 1991 г.). «Pax-6, парный ген мышиной коробки, экспрессируется в развивающейся ЦНС». Разработка . 113 (4): 1435–49. дои : 10.1242/dev.113.4.1435 . ПМИД   1687460 .
  49. ^ Бурглин Т.Р. (ноябрь 1997 г.). «Анализ генов гомеобокса суперкласса TALE (MEIS, PBC, KNOX, Iroquois, TGIF) выявил новый домен, консервативный у растений и животных» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (21): 4173–80. дои : 10.1093/нар/25.21.4173 . ПМК   147054 . ПМИД   9336443 .
  50. ^ Дерелле Р., Лопес П., Ле Гаядер Х., Мануэль М. (2007). «Гомеодоменные белки принадлежат к древнему молекулярному набору эукариот». Эволюция и развитие . 9 (3): 212–9. дои : 10.1111/j.1525-142X.2007.00153.x . ПМИД   17501745 . S2CID   9530210 .
  51. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и Холланд П.В., Бут Х.А., Бруфорд Э.А. (октябрь 2007 г.). «Классификация и номенклатура всех гомеобоксных генов человека» . БМК Биология . 5 (1): 47. дои : 10.1186/1741-7007-5-47 . ПМК   2211742 . ПМИД   17963489 .
  52. ^ Кулиер Ф., Попович С., Вилле Р., Бирнбаум Д. (15 декабря 2000 г.). «Кластеры генов MetaHox». Журнал экспериментальной зоологии . 288 (4): 345–351. doi : 10.1002/1097-010X(20001215)288:4<345::AID-JEZ7>3.0.CO;2-Y . ПМИД   11144283 .
  53. ^ Краус П., Луфкин Т. (июль 2006 г.). «Гомеобоксный ген Dlx, контролирующий конечности и черепно-лицевое развитие млекопитающих». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 140 (13): 1366–74. дои : 10.1002/ajmg.a.31252 . ПМИД   16688724 . S2CID   32619323 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Внешние ссылки [ править ]

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001356.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Homeobox&oldid=1216726233"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 76fd8b6fb1b8988035fdb15aa1e54d72__1711980000
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/76/72/76fd8b6fb1b8988035fdb15aa1e54d72.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Homeobox - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)