ЗНФ366

ЗНФ366
Идентификаторы
Псевдонимы	ZNF366 , DCSCRIPT, белок цинковых пальцев 366, DC-SCRIPT
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 610159 ; МГИ : 2178429 ; Гомологен : 17637 ; Генные карты : ZNF366 ; ОМА : ZNF366 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	72,507,410 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	99,387,164 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; testicle; ; epithelium of colon; ; smooth muscle tissue; ; gonad; ; apex of heart; ; appendix; ; left ventricle; ; lymph node; ; subcutaneous adipose tissue;
	Top expressed in
	lung; ; muscle of thigh; ; quadriceps femoris muscle; ; muscle tissue; ; spleen; ; skeletal muscle tissue; ; white adipose tissue; ; adrenal gland; ; cerebellum; ; human kidney;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; estrogen receptor binding; protein binding; transcription corepressor activity; metal ion binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	negative regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; response to estrogen;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	167465
	238803
	ENSG00000178175
	ENSMUSG00000050919
	Q8N895
	Q6NS86
	НМ_152625
	НМ_001004149
	НП_689838
	НП_001004149
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок цинкового пальца 366 , также известный как DC-SCRIPT (транскрипт, специфичный для дендритных клеток), представляет собой белок , который у людей кодируется ZNF366 геном . ^[5] Ген ZNF366 был впервые идентифицирован в исследовании сравнения ДНК между последовательностью Fugu Rubripes длиной 85 т.п.н. , содержащей 17 генов с гомологичными локусами в черновом геноме человека . ^[6]

Функция

В 2006 году DC-SCRIPT был выделен и охарактеризован в дендритных клетках, полученных из моноцитов человека (mo-DC). ^[7]

DC-SCRIPT содержит ДНК-связывающий домен (11 C ₂ H ₂ цинковых (Zn) пальцев) , окруженный богатой пролином и кислой областью, которая может взаимодействовать с C-концево-связывающим белком 1 (CtBP1), глобальным корепрессор . Было обнаружено, что в иммунной системе как мышей , так и людей DC-SCRIPT специфически экспрессируется в дендритных клетках (ДК). ^[8]

Было показано, что в клетках COS-1 DC-SCRIPT взаимодействует с ДНК-связывающим доменом эстрогенового рецептора (ERDBD) и подавляет активность ER посредством ассоциации с RIP140, CtBP и гистондеацетилазами. ^[9]

Было обнаружено, что в ДК DC-SCRIPT высоко экспрессируется в обычных ДК первого типа (cDC1) под контролем PU.1. ^[10] Присутствие DC-SCRIPT важно для спецификации линии cDC1s посредством поддержания экспрессии регуляторного фактора интерферона 8 (IRF8). cDC1 с дефицитом DC-SCRIPT имели нарушенную способность захватывать и представлять клеточно-ассоциированные антигены и секретировать IL-12p40. ^[11]

Рак молочной железы

В 2010 году было показано, что DC-SCRIPT может действовать как корегулятор множественных ядерных рецепторов, оказывая противоположное воздействие на NR типа I и типа II. DC-SCRIPT способен подавлять транскрипцию, опосредованную ER и PR, тогда как он может активировать транскрипцию, опосредованную RAR и PPAR. В том же исследовании было показано, что ткань опухоли молочной железы экспрессирует более низкие уровни DC-SCRIPT, чем нормальная ткань молочной железы одного и того же пациента, и что экспрессия мРНК DC-SCRIPT является независимым прогностическим фактором хорошей выживаемости больных раком молочной железы с рецептором эстрогена. и/или опухоли, положительные по рецептору прогестерона. ^[12]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178175 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050919 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: белок 366 цинковых пальцев ZNF366» .
^ Гиллиган П., Бреннер С., Венкатеш Б. (июль 2002 г.). «Сравнение последовательностей фугу и человека идентифицирует новые человеческие гены и консервативные некодирующие последовательности». Джин . 294 (1–2): 35–44. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00793-X . ПМИД 12234665 .
^ Триантис В., Транцикова Д.Е., Луман М.В., Хартгерс ФК, Янссен Р.А., Адема Г.Дж. (январь 2006 г.). «Идентификация и характеристика DC-SCRIPT, нового экспрессируемого дендритными клетками члена семейства регуляторов транскрипции цинковых пальцев» . Журнал иммунологии . 176 (2): 1081–9. дои : 10.4049/jimmunol.176.2.1081 . ПМИД 16393996 .
^ Триантис В., Мулен В., Луман М.В., Хартгерс ФК, Янссен Р.А., Адема Г.Дж. (май 2006 г.). «Молекулярная характеристика мышиного гомолога белка DC-SCRIPT, полученного из DC». Журнал биологии лейкоцитов . 79 (5): 1083–91. дои : 10.1189/jlb.1005588 . hdl : 2066/49437 . ПМИД 16522745 . S2CID 27847791 .
^ Лопес-Гарсия Дж., Периясами М., Томас Р.С., Кристиан М., Леао М., Джат П. и др. (2006). «ZNF366 представляет собой корепрессор рецептора эстрогена, который действует через CtBP и деацетилазы гистонов» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6126–36. дои : 10.1093/nar/gkl875 . ПМК 1693901 . ПМИД 17085477 .
^ Шопен М., Лун А.Т., Жан Ю., Шредер Дж., Кофлан Х., Д'Амико А. и др. (январь 2019 г.). «Фактор транскрипции PU.1 способствует идентичности и функции обычных дендритных клеток посредством индукции регулятора транскрипции DC-SCRIPT» . Иммунитет . 50 (1): 77–90.e5. doi : 10.1016/j.immuni.2018.11.010 . ПМИД 30611612 .
^ Чжан С., Кофлан Х.Д., Ашайрипанах М., Сейзова С., Куэ А.Дж., Браун Д.В. и др. (апрель 2021 г.). «Судьба и функция обычных дендритных клеток типа 1 контролируются DC-SCRIPT». Наука Иммунология . 6 (58): eabf4432. doi : 10.1126/sciimmunol.abf4432 . ПМИД 33811060 . S2CID 232771588 .
^ Ансемс М., Онтелес С., Луман М.В., Картхаус Н., Балт П., Боненкамп Дж.Дж. и др. (январь 2010 г.). «DC-SCRIPT: модуляция ядерных рецепторов и прогностическое значение при первичном раке молочной железы» . Журнал Национального института рака . 102 (1): 54–68. дои : 10.1093/jnci/djp441 . ПМИД 20008677 .

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассл С., Ансорж В. и др. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А. и др. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф. и др. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Внешние ссылки

ZNF366+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178175 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050919 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: белок 366 цинковых пальцев ZNF366» .

[pmid12234665-6] Гиллиган П., Бреннер С., Венкатеш Б. (июль 2002 г.). «Сравнение последовательностей фугу и человека идентифицирует новые человеческие гены и консервативные некодирующие последовательности». Джин . 294 (1–2): 35–44. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00793-X . ПМИД 12234665 .

[pmid16393996-7] Триантис В., Транцикова Д.Е., Луман М.В., Хартгерс ФК, Янссен Р.А., Адема Г.Дж. (январь 2006 г.). «Идентификация и характеристика DC-SCRIPT, нового экспрессируемого дендритными клетками члена семейства регуляторов транскрипции цинковых пальцев» . Журнал иммунологии . 176 (2): 1081–9. дои : 10.4049/jimmunol.176.2.1081 . ПМИД 16393996 .

[pmid16522745-8] Триантис В., Мулен В., Луман М.В., Хартгерс ФК, Янссен Р.А., Адема Г.Дж. (май 2006 г.). «Молекулярная характеристика мышиного гомолога белка DC-SCRIPT, полученного из DC». Журнал биологии лейкоцитов . 79 (5): 1083–91. дои : 10.1189/jlb.1005588 . hdl : 2066/49437 . ПМИД 16522745 . S2CID 27847791 .

[pmid17085477-9] Лопес-Гарсия Дж., Периясами М., Томас Р.С., Кристиан М., Леао М., Джат П. и др. (2006). «ZNF366 представляет собой корепрессор рецептора эстрогена, который действует через CtBP и деацетилазы гистонов» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6126–36. дои : 10.1093/nar/gkl875 . ПМК 1693901 . ПМИД 17085477 .

[10] Шопен М., Лун А.Т., Жан Ю., Шредер Дж., Кофлан Х., Д'Амико А. и др. (январь 2019 г.). «Фактор транскрипции PU.1 способствует идентичности и функции обычных дендритных клеток посредством индукции регулятора транскрипции DC-SCRIPT» . Иммунитет . 50 (1): 77–90.e5. doi : 10.1016/j.immuni.2018.11.010 . ПМИД 30611612 .

[11] Чжан С., Кофлан Х.Д., Ашайрипанах М., Сейзова С., Куэ А.Дж., Браун Д.В. и др. (апрель 2021 г.). «Судьба и функция обычных дендритных клеток типа 1 контролируются DC-SCRIPT». Наука Иммунология . 6 (58): eabf4432. doi : 10.1126/sciimmunol.abf4432 . ПМИД 33811060 . S2CID 232771588 .

[pmid20008677-12] Ансемс М., Онтелес С., Луман М.В., Картхаус Н., Балт П., Боненкамп Дж.Дж. и др. (январь 2010 г.). «DC-SCRIPT: модуляция ядерных рецепторов и прогностическое значение при первичном раке молочной железы» . Журнал Национального института рака . 102 (1): 54–68. дои : 10.1093/jnci/djp441 . ПМИД 20008677 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]