ФОКСП1

ФОКСП1
Доступные структуры ПДБ Поиск Human UniProt: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2KIU
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXP1 , 12CC4, HSPC215, MFH, QRF1, hFKH1B, вилочная коробка P1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605515 ; Гомологен : 136512 ; Генные карты : FOXP1 ; ОМА : FOXP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 3 (human) Band 3p13 Start 70,954,693 bp End 71,583,978 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in pancreatic ductal cell cardia saphenous vein pylorus mucosa of ileum pericardium urethra buccal mucosa cell epithelium of lactiferous gland lactiferous duct n/a More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function metal ion binding sequence-specific DNA binding protein self-association androgen receptor binding DNA-binding transcription factor activity DNA binding protein binding identical protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding chromatin binding transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding transcription factor binding protein homodimerization activity protein heterodimerization activity Cellular component nucleus nucleoplasm cytoplasm Biological process regulation of monocyte differentiation negative regulation of androgen receptor signaling pathway negative regulation of B cell apoptotic process positive regulation of endothelial cell migration transcription, DNA-templated response to lipopolysaccharide regulation of defense response to bacterium endothelial cell activation regulation of endothelial tube morphogenesis macrophage activation osteoclast development positive regulation of smooth muscle cell proliferation T follicular helper cell differentiation regulation of macrophage colony-stimulating factor production regulation of tumor necrosis factor production regulation of inflammatory response osteoclast differentiation monocyte activation regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of transcription, DNA-templated regulation of transcription by RNA polymerase II somatic stem cell population maintenance negative regulation of transcription by RNA polymerase II in utero embryonic development positive regulation of mesenchymal cell proliferation pre-B cell differentiation positive regulation of immunoglobulin production heart development skeletal muscle tissue development motor neuron axon guidance ventral spinal cord development striatum development lung development forebrain development immunoglobulin V(D)J recombination response to testosterone sarcomere organization positive regulation of transcription, DNA-templated positive regulation of transcription by RNA polymerase II smooth muscle tissue development positive regulation of epithelial cell proliferation cardiac muscle cell differentiation regulation of cardiac muscle cell proliferation negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development lung secretory cell differentiation cellular response to tumor necrosis factor innate vocalization behavior regulation of action potential regulation of lung goblet cell differentiation negative regulation of lung goblet cell differentiation cellular response to ionomycin positive regulation of hydrogen peroxide-induced cell death positive regulation of cardiac muscle cell differentiation cellular response to DNA damage stimulus negative regulation of gene expression positive regulation of B cell receptor signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 27086 н/д Вместе ENSG00000114861 н/д ЮниПрот Q9H334 н/д RefSeq (мРНК) showНМ_001012505 НМ_001244808 НМ_001244810 НМ_001244812 НМ_001244813 NM_001244814 NM_001244815 NM_001244816 NM_032682 NM_001349338 NM_001349340 NM_001349341 NM_001349342 NM_001349343 NM_001349344 NM_001349337 NM_001370548 н/д RefSeq (белок) showНП_001012523 НП_001231737 НП_001231739 НП_001231741 НП_001231742 NP_001231743 NP_001231744 NP_001231745 NP_116071 NP_001336267 NP_001336269 NP_001336270 NP_001336271 NP_001336272 NP_001336273 NP_001336266 н/д Местоположение (UCSC) Chr 3: 70,95 – 71,58 Мб н/д в PubMed Поиск н/д
Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Белок P1 forkhead box — это белок , который у человека кодируется FOXP1 геном . FOXP1 необходим для правильного развития мозга, сердца и легких у млекопитающих . Он является членом большого FOX семейства транскрипционных факторов .

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству P семейства транскрипционных факторов forkhead box (FOX). Факторы транскрипции Forkhead Box играют важную роль в регуляции транскрипции генов, специфичных для тканей и клеток, как во время развития, так и во взрослом возрасте. Белок P1 forkhead box содержит как ДНК-связывающий , так и белок-связывающий домены. Этот ген может действовать как супрессор опухоли, поскольку он теряется в некоторых типах опухолей и картируется в хромосомной области (3p14.1), которая, как сообщается, содержит ген(ы)-супрессор опухоли. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.

Foxp1 является фактором транскрипции; в частности, это репрессор транскрипции . Гены Fox являются частью семейства ДНК-связывающих доменов вилковидной формы. Этот домен связывается с последовательностями промоторов и энхансеров многих генов. Foxp1 регулирует множество важных аспектов развития, включая развитие тканей: легких, мозга, тимуса и сердца. В сердце Foxp1 выполняет 3 жизненно важные роли: регуляцию созревания и пролиферации сердечных миоцитов , разделение путей оттока легочной артерии и аорты и экспрессию Sox4 в подушках и миокарде. Foxp1 также является важным геном в развитии мышц пищевода и эпителия пищевода. Foxp1 также является важным регулятором морфогенеза дыхательных путей легких. Foxp1 Эмбрионы с нокаутом сердца обнаруживают серьезные дефекты морфогенеза . Некоторые из этих дефектов включают дефекты созревания и пролиферации миоцитов , которые вызывают тонкую компактную зону миокарда желудочков, неразделение легочной артерии и аорты и кардиомиоцитов увеличение пролиферации и дефектная дифференцировка. Эти дефекты, вызванные инактивацией Foxp1, приводят к гибели плода. Нарушения FoxP1 были выявлены у очень редких пациентов-людей и, как и FoxP2, приводят к когнитивной дисфункции, включая умственную отсталость и расстройства аутистического спектра , а также речевые нарушения.

Было показано, что специфичная для эмбриональных стволовых клеток (ЭСК) изоформа FOXP1 стимулирует экспрессию генов транскрипционных факторов, необходимых для плюрипотентности , включая OCT4 , NANOG , NR5A2 и GDF3 , одновременно репрессируя гены, необходимые для дифференцировки ЭСК. Эта изоформа также способствует поддержанию плюрипотентности ЭСК и способствует эффективному перепрограммированию соматических клеток в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки . Эти результаты показывают ключевую роль события альтернативного сплайсинга в регуляции плюрипотентности посредством контроля критических ESC-специфичных программ транскрипции.

См. также

• ФоксП2
• ФОКС3

Дальнейшее чтение

• Като М, Като М (ноябрь 2004 г.). «Семейство генов FOX человека (обзор)». Международный журнал онкологии . 25 (5): 1495–1500. дои : 10.3892/ijo.25.5.1495 . ПМИД   15492844 .
• Ли С., Такер П.В. (декабрь 1993 г.). «ДНК-связывающие свойства и вторичная структурная модель гепатоцитарного ядерного фактора 3 / домена вилочной головки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (24): 11583–11587. Бибкод : 1993PNAS...9011583L . дои : 10.1073/pnas.90.24.11583 . ПМК   48028 . PMID   8265594 .
• Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ и др. (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–1560. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК   310934 . ПМИД   11042152 .
• Банхам А.Х., Бизли Н., Кампо Е., Фернандес П.Л., Фидлер С., Гаттер К. и др. (декабрь 2001 г.). «Фактор транскрипции крылатой спирали FOXP1 является новым геном-кандидатом-супрессором опухоли на хромосоме 3p». Исследования рака . 61 (24): 8820–8829. ПМИД   11751404 .
• Вольска М.К., Буковски К., Якубчак А. (2002). «[Встречаемость бета-лактамаз типа ESBL и IBL в палочках Pseudomonas aeruginosa]». Экспериментальная медицина и микробиология . 53 (1): 45–51. ПМИД   11757404 .
• Ван Б., Линь Д., Ли С., Такер П. (июль 2003 г.). «Множество доменов определяют экспрессию и регуляторные свойства репрессоров транскрипции Foxp1 forkhead» . Журнал биологической химии . 278 (27): 24259–24268. дои : 10.1074/jbc.M207174200 . ПМИД   12692134 .
• Ли С., Вайденфельд Дж., Морриси Э.Э. (январь 2004 г.). «Транкрипционная и ДНК-связывающая активность семейства Foxp1/2/4 модулируется гетеротипическими и гомотипическими белковыми взаимодействиями» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (2): 809–822. дои : 10.1128/MCB.24.2.809-822.2004 . ПМЦ   343786 . ПМИД   14701752 .
• Терамицу I, Кудо LC, Лондон SE, Geschwind DH, White SA (март 2004 г.). «Параллельная экспрессия FoxP1 и FoxP2 в мозге певчих птиц и человека предсказывает функциональное взаимодействие» . Журнал неврологии . 24 (13): 3152–3163. doi : 10.1523/JNEUROSCI.5589-03.2004 . ПМК   6730014 . ПМИД   15056695 .
• Фокс С.Б., Браун П., Хан С., Эш С., Лик Р.Д., Харрис А.Л. и др. (май 2004 г.). «Экспрессия транскрипционного фактора FOXP1 связана с рецептором эстрогена альфа и улучшением выживаемости при первичном раке молочной железы человека» . Клинические исследования рака . 10 (10): 3521–3527. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-03-0461 . ПМИД   15161711 .
• Ши С., Чжан Х., Чен З., Сулейман К., Фейнберг М.В., Баллантайн С.М. и др. (август 2004 г.). «Вовлечение интегрина регулирует дифференцировку моноцитов посредством транскрипционного фактора Foxp1» . Журнал клинических исследований . 114 (3): 408–418. дои : 10.1172/JCI21100 . ПМК   484980 . ПМИД   15286807 .
• Штребель Б., Винатцер Ю., Лампрехт А., Радерер М., Чотт А. (апрель 2005 г.). «T(3;14)(p14.1;q32) с участием IGH и FOXP1 представляет собой новую рецидивирующую хромосомную аберрацию при MALT-лимфоме» . Лейкемия . 19 (4): 652–658. дои : 10.1038/sj.leu.2403644 . ПМИД   15703784 .
• Банэм А.Х., Коннорс Дж.М., Браун П.Дж., Корделл Дж.Л., Отт Г., Шринивасан Г. и др. (февраль 2005 г.). «Экспрессия транскрипционного фактора FOXP1 тесно связана с меньшей выживаемостью у пациентов с диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомой» . Клинические исследования рака . 11 (3): 1065–1072. дои : 10.1158/1078-0432.1065.11.3 . ПМИД   15709173 .
• Браун П., Марафиоти Т., Кусек Р., Банхэм А.Х. (май 2005 г.). «Фактор транскрипции FOXP1 экспрессируется в большинстве фолликулярных лимфом, но редко экспрессируется в классической лимфоме Ходжкина и лимфоцитарной лимфоме». Журнал молекулярной гистологии . 36 (4): 249–256. дои : 10.1007/s10735-005-6521-3 . ПМИД   16200457 . S2CID   10290316 .
• Гиатроманолаки А., Кукуракис М.И., Сивридис Э., Гаттер К.К., Харрис А.Л., Банхэм А.Х. (январь 2006 г.). «Потеря экспрессии и ядерная/цитоплазматическая локализация транскрипционного фактора FOXP1 являются частыми явлениями при раннем раке эндометрия: связь с рецепторами эстрогена и экспрессией HIF-1альфа» . Современная патология . 19 (1): 9–16. doi : 10.1038/modpathol.3800494 . ПМИД   16258506 .
• Сагерт X, де Паепе П., Либбрехт Л., Ванхентенрейк В., Верхуф Г., Томас Дж. и др. (июнь 2006 г.). «Экспрессия белка P1 forkhead box в лимфомах лимфоидной ткани, ассоциированных со слизистой оболочкой, предсказывает плохой прогноз и трансформацию в диффузную крупноклеточную B-клеточную лимфому». Журнал клинической онкологии . 24 (16): 2490–2497. дои : 10.1200/JCO.2006.05.6150 . ПМИД   16636337 .
• Хараламбиева Е., Адам П., Вентура Р., Катценбергер Т., Калла Дж., Холлер С. и др. (июль 2006 г.). «Генетическая перестройка FOXP1 преимущественно выявляется в подмножестве диффузных крупных B-клеточных лимфом с экстранодальным проявлением» . Лейкемия . 20 (7): 1300–1303. дои : 10.1038/sj.leu.2404244 . ПМИД   16673020 .
• Ханненхалли С., Патт М.Э., Гилмор Дж.М., Ван Дж., Пармачек М.С., Эпштейн Дж.А. и др. (сентябрь 2006 г.). «Транскрипционная геномика связывает транскрипционные факторы FOX с сердечной недостаточностью человека» . Тираж . 114 (12): 1269–1276. doi : 10.1161/CIRCULATIONAHA.106.632430 . ПМИД   16952980 .
• Шу В., Лу М.М., Чжан Ю., Такер П.В., Чжоу Д., Морриси Э.Э. (май 2007 г.). «Foxp2 и Foxp1 совместно регулируют развитие легких и пищевода» . Разработка . 134 (10): 1991–2000. дои : 10.1242/dev.02846 . ПМИД   17428829 .
• Ван Б., Вайденфельд Дж., Лу М.М., Майка С., Кузиел В.А., Морриси Э.Э. и др. (сентябрь 2004 г.). «Foxp1 регулирует выносящий тракт сердца, морфогенез эндокардиальной подушки, а также пролиферацию и созревание миоцитов» . Разработка . 131 (18): 4477–4487. дои : 10.1242/dev.01287 . ПМИД   15342473 .

Внешние ссылки

• Более подробную клиническую информацию можно найти в записи OMIM № 613670 (умственная отсталость с нарушением речи и с аутистическими признаками или без них).
• Дополнительную информацию также можно найти в записи OMIM № 605515 (коробка с вилочной головкой P1).
• FOXP1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9H334 (белок P1 Forkhead Box) на PDBe-KB .
• Информацию для семей и людей, пострадавших от синдрома FOXP1, можно найти на сайте Международного фонда FOXP1 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .