Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Бета-рецептор ретиноида X ( RXR-бета ), также известный как NR2B2 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа B, член 2), представляет собой ядерный рецептор , который у человека кодируется геном RXRB . [5] [6]
Этот ген кодирует члена семейства ядерных рецепторов ретиноида X (RXR), которые участвуют в опосредовании эффектов ретиноевой кислоты (RA). Этот рецептор образует гетеродимеры с рецепторами ретиноевой кислоты , гормона щитовидной железы и витамина D , увеличивая как связывание ДНК, так и транскрипционную функцию на соответствующих ответных элементах. Ген расположен в области II класса главного комплекса гистосовместимости (MHC) на хромосоме 6. Был описан альтернативно сплайсированный вариант транскрипта, но его полная последовательность не определена. [6]
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [§ 1]
^ Jump up to: а б с ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 GRCh38: Версия ансамбля 89: ENSG00000235712, ENSG00000231321, 0000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 – ансамбль , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039656 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Фицгиббон Дж., Джиллетт Г.Т., Вудворд К.Дж., Бойл Дж.М., Вулф Дж., Пови С. (июль 1993 г.). «Картирование RXRB на хромосоме человека 6p21.3». Анналы генетики человека . 57 (Часть 3): 203–9. дои : 10.1111/j.1469-1809.1993.tb01596.x . ПМИД 8257090 . S2CID 26964941 . ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: рецептор ретиноида X RXRB, бета» . Санто А., Наркар В., Шен К., Урай И.П., Дэвис П.Дж., Надь Л. (декабрь 2004 г.). «Ретиноидные X-рецепторы: X-исследование их (пато)физиологических функций» . Смерть клеток и дифференцировка . 11 (Приложение 2): S126–43. дои : 10.1038/sj.cdd.4401533 ПМИД 15608692 . Лейд М., Кастнер П., Лайонс Р., Накшатри Х., Сондерс М., Захаревски Т., Чен Дж. Ю., Стауб А., Гарнье Дж. М., Мадер С. (январь 1992 г.). «Очистка, клонирование и идентичность RXR клеточного фактора HeLa, с которым RAR или TR гетеродимеризуются для эффективного связывания целевых последовательностей». Клетка . 68 (2): 377–95. дои : 10.1016/0092-8674(92)90478-У . ПМИД 1310259 . S2CID 40617478 . Флейшхауэр К., Пак Дж. Х., ДиСанто Дж. П., Маркс М., Озато К., Ян С. Ю. (апрель 1992 г.). «Выделение полноразмерного клона кДНК, кодирующего N-концевой вариант бета-рецептора ретиноида X человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (7): 1801. doi : 10.1093/nar/20.7.1801 . ПМК 312273 ПМИД 1315958 . Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора гормона щитовидной железы, рецептора ретиноевой кислоты, рецептора ретиноида X, фактора транскрипции промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени» . Молекулярная эндокринология . 6 (9): 1468–78. дои : 10.1210/mend.6.9.1331778 ПМИД 1331778 . S2CID 24291055 . Эпплен С., Эпплен Дж.Т. (1992). «Последовательность кДНК человека, гомологичная гену мышиного белка, связывающего промотор MHC класса I, содержит четыре дополнительных кодона в лимфоцитах». Геном млекопитающих . 3 (8): 472–5. дои : 10.1007/BF00356161 . ПМИД 1514958 . S2CID 1278904 . Ю В.К., Дельсерт С., Андерсен Б., Холлоуэй Дж.М., Девари О.В., Нэр А.М., Ким С.Ю., Бутин Дж.М., Гласс К.К., Розенфельд М.Г. (декабрь 1991 г.). «RXR бета: корегулятор, который усиливает связывание ретиноевой кислоты, гормона щитовидной железы и рецепторов витамина D с их родственными ответными элементами». Клетка . 67 (6): 1251–66. дои : 10.1016/0092-8674(91)90301-E . ПМИД 1662118 . S2CID 10354699 . Оньяте С.А., Цай С.Ю., Цай М.Дж. , О'Мэлли Б.В. (ноябрь 1995 г.). «Последовательность и характеристика коактиватора суперсемейства рецепторов стероидных гормонов». Наука . 270 (5240): 1354–7. Бибкод : 1995Sci...270.1354O . дои : 10.1126/science.270.5240.1354 . ПМИД 7481822 . S2CID 28749162 . Куистра Т., Лансинк М., Артс Дж., Ситтер Т., Тоет К. (сентябрь 1995 г.). «Участие рецептора ретиноевой кислоты альфа в стимуляции экспрессии гена тканевого активатора плазминогена в эндотелиальных клетках человека» . Европейский журнал биохимии . 232 (2): 425–32. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.425zz.x ПМИД 7556191 . Перлманн Т., Янссон Л. (апрель 1995 г.). «Новый путь передачи сигналов витамина А, опосредованный гетеродимеризацией RXR с NGFI-B и NURR1» . Гены и развитие . 9 (7): 769–82. дои : 10.1101/gad.9.7.769 ПМИД 7705655 . Форман Б.М., Умесоно К., Чен Дж., Эванс Р.М. (май 1995 г.). «Уникальные пути ответа устанавливаются аллостерическими взаимодействиями между ядерными рецепторами гормонов» . Клетка . 81 (4): 541–50. дои : 10.1016/0092-8674(95)90075-6 ПМИД 7758108 . S2CID 3203590 . Занария Э., Мускателли Ф., Бардони Б., Стром Т.М., Гиоли С., Го В., Лалли Э., Мозер С., Уокер А.П., Маккейб Э.Р. (декабрь 1994 г.). «Необычный член суперсемейства ядерных рецепторов гормонов, ответственный за Х-сцепленную врожденную гипоплазию надпочечников». Природа . 372 (6507): 635–41. Бибкод : 1994Natur.372..635Z . дои : 10.1038/372635a0 . ПМИД 7990953 . S2CID 4363344 . Алмасан А., Мангельсдорф Д.Д., Онг Э.С., Валь Г.М., Эванс Р.М. (апрель 1994 г.). «Хромосомная локализация ретиноидных X-рецепторов человека». Геномика . 20 (3): 397–403. дои : 10.1006/geno.1994.1193 . ПМИД 8034312 . Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 . Флейшхауэр К., МакБрайд О.В., ДиСанто Дж.П., Озато К., Ян С.Ю. (январь 1993 г.). «Клонирование и картирование хромосом бета-рецептора ретиноида X человека: селективное сохранение аминокислотной последовательности рецептора ядерного гормона у млекопитающих». Генетика человека . 90 (5): 505–10. дои : 10.1007/BF00217449 . ПМИД 8381386 . S2CID 26472949 . Мэй М., Менгус Г., Лавин А.С., Шамбон П., Дэвидсон I (июнь 1996 г.). «Человеческий TAF(II28) способствует стимуляции транскрипции посредством активации функции 2 ретиноидных X-рецепторов» . Журнал ЭМБО . 15 (12): 3093–104. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . ПМК 450252 ПМИД 8670810 . Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 ПМИД 8889548 . Жойе А., Кавайлес В., Балагер П., Николя Ж.К. (февраль 1997 г.). «RIP 140 усиливает зависимую от ядерных рецепторов транскрипцию in vivo у дрожжей» . Молекулярная эндокринология . 11 (2): 193–202. дои : 10.1210/mend.11.2.9884 ПМИД 9013766 . Сюй XC, Соцци Дж., Ли Дж.С., Ли Дж.Дж., Пасторино Ю., Пилотти С., Кури Дж.М., Хонг В.К., Лотан Р. (май 1997 г.). «Подавление бета-рецептора ретиноевой кислоты при немелкоклеточном раке легких in vivo: последствия для развития рака легких» . Журнал Национального института рака . 89 (9): 624–9. дои : 10.1093/jnci/89.9.624 ПМИД 9150186 . Чен Х., Лин Р.Дж., Шильц Р.Л., Чакраварти Д., Нэш А., Надь Л., Привальский М.Л., Накатани Ю., Эванс Р.М. (август 1997 г.). «Коактиватор ядерных рецепторов ACTR представляет собой новую гистон-ацетилтрансферазу, образующую мультимерный активационный комплекс с P/CAF и CBP/p300» . Клетка . 90 (3): 569–80. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80516-4 ПМИД 9267036 . S2CID 15284825 . Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
показывать галерея PDB
1by4 : STRUCTURE AND MECHANISM OF THE HOMODIMERIC ASSEMBLY OF THE RXR ON DNA
1dsz : STRUCTURE OF THE RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE RETINOIC ACID RESPONSE ELEMENT DR1
1h9u : THE STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOID-X-RECEPTOR BETA LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH THE SPECIFIC SYNTHETIC AGONIST LG100268
1r0n : Crystal Structure of Heterodimeric Ecdsyone receptor DNA binding complex
1rxr : HIGH RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF THE RETINOID X RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURE
1uhl : Crystal structure of the LXRalfa-RXRbeta LBD heterodimer
2nll : RETINOID X RECEPTOR-THYROID HORMONE RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THYROID RESPONSE ELEMENT DNA
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
hide (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
показывать RAR Tooltip Retinoic acid receptor Retinoic acid metabolism inhibitors: Liarozole RXR Tooltip Retinoid X receptor
