ТБПЛ1

ТБПЛ1
Идентификаторы
Псевдонимы	TBPL1 , MGC:8389, MGC:9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, белок, связывающий ТАТА-бокс, подобный 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605521 ; МГИ : 1339946 ; Гомологен : 3577 ; GeneCards : TBPL1 ; OMA : TBPL1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	133,990,432 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	22,607,837 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	oocyte; ; secondary oocyte; ; left testis; ; right testis; ; sperm; ; ganglionic eminence; ; gonad; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 9; ; middle temporal gyrus;
	Top expressed in
	spermatid; ; spermatocyte; ; seminiferous tubule; ; medial ganglionic eminence; ; tail of embryo; ; superior cervical ganglion; ; neural tube; ; ventricular zone; ; seminal vesicula; ; granulocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; transcription coactivator activity; protein binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription factor binding;
Cellular component	cytoplasm; transcription factor TFIIA complex; nucleus; transcription factor TFIIIB complex; transcription regulator complex; transcription factor TFIID complex;
Biological process	spermatid nucleus differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; acrosome assembly; dTTP biosynthetic process; transcription, DNA-templated; spermatogenesis; DNA-templated transcription, initiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; RNA polymerase III preinitiation complex assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9519
	237336
	ENSG00000028839
	ENSMUSG00000071359
	P62380 ; Q7Z6T9
	P62340
	НМ_004865 ; НМ_001253676
	НМ_011603
	НП_001240605 ; НП_004856
	НП_035733
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, подобный ТАТА-бокс-связывающему белку, представляет собой белок , который у человека кодируется TBPL1 геном . ^[5]^[6]^[7]^[8]

Функция

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белок, который координирует эту активность, представляет собой транскрипционный фактор IID (TFIID), который связывается с основным промотором, обеспечивая правильное положение полимеразы, служит основой для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из ТАТА-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF), чтобы облегчить сборку комплекса и инициацию транскрипции. Этот ген кодирует белок, который выполняет ту же функцию, что и ТБФ, и заменяет ТБФ на некоторых промоторах, не распознаваемых TFIID. Он необходим для спермиогенеза и считается важным для экспрессии генов, регулируемых развитием. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что TBPL1 взаимодействует с GTF2A1 . ^[9]^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000028839 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071359 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Обаяши Т., Кисимото Т., Макино Ю., Симада М., Накадай Т., Аоки Т., Кавата Т., Нива С., Тамура Т. (февраль 1999 г.). «Выделение кДНК, картирование хромосом и экспрессия человеческого TBP-подобного белка». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 255 (1): 137–42. дои : 10.1006/bbrc.1999.0159 . ПМИД 10082669 .
^ Рабенштейн, доктор медицинских наук, Чжоу С., Лис Дж.Т., Тцзян Р. (апрель 1999 г.). «Фактор 2, связанный с TATA-бокс-связывающим белком (TBP), (TRF2), третий член семейства TBP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4791–6. Бибкод : 1999PNAS...96.4791R . дои : 10.1073/pnas.96.9.4791 . ПМК 21770 . ПМИД 10220372 .
^ Чонг Дж.А., Моран М.М., Тейхманн М., Качмарек Дж.С., Редер Р., Клэпхэм Д.Э. (апрель 2005 г.). «ТАТА-связывающий белок (TBP)-подобный фактор (TLF) является функциональным регулятором транскрипции: реципрокная регуляция генов нейрофиброматоза 1 типа и c-fos с помощью TLF/TRF2 и TBP» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (7): 2632–43. дои : 10.1128/MCB.25.7.2632-2643.2005 . ПМЦ 1061635 . ПМИД 15767669 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: TBPL1 TBP-подобный 1» .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Тейхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Фактор-2, родственный ТАТА-связывающему белку человека (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13720–5. Бибкод : 1999PNAS...9613720T . дои : 10.1073/pnas.96.24.13720 . ПМК 24131 . ПМИД 10570139 .

Дальнейшее чтение

Обаяши Т., Макино Ю., Тамура Т.А. (февраль 1999 г.). «Идентификация мышиного TBP-подобного белка (TLP), отдаленно связанного с фактором, связанным с TBP дрозофилы» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (3): 750–5. дои : 10.1093/нар/27.3.750 . ПМК 148243 . ПМИД 9889269 .
Тейхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Фактор-2, родственный ТАТА-связывающему белку человека (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13720–5. Бибкод : 1999PNAS...9613720T . дои : 10.1073/pnas.96.24.13720 . ПМК 24131 . ПМИД 10570139 .
Мартьянов И., Бранкорсини С., Гансмюллер А., Парвинен М., Дэвидсон И., Сассоне-Корси П. (февраль 2002 г.). «Различные функции TBP и TLF/TRF2 во время сперматогенеза: потребность TLF для образования гетерохроматических хромоцентров в гаплоидных круглых сперматидах» . Разработка . 129 (4): 945–55. дои : 10.1242/dev.129.4.945 . ПМИД 11861477 .
Киффер-Квон П., Мартьянов И., Дэвидсон И. (октябрь 2004 г.). «Клеточно-специфическая ядрышковая локализация фактора 2, связанного с ТБФ» . Молекулярная биология клетки . 15 (10): 4356–68. дои : 10.1091/mbc.E04-02-0138 . ПМК 519132 . ПМИД 15269281 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

TBPL1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000028839 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071359 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10082669-5] Обаяши Т., Кисимото Т., Макино Ю., Симада М., Накадай Т., Аоки Т., Кавата Т., Нива С., Тамура Т. (февраль 1999 г.). «Выделение кДНК, картирование хромосом и экспрессия человеческого TBP-подобного белка». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 255 (1): 137–42. дои : 10.1006/bbrc.1999.0159 . ПМИД 10082669 .

[pmid10220372-6] Рабенштейн, доктор медицинских наук, Чжоу С., Лис Дж.Т., Тцзян Р. (апрель 1999 г.). «Фактор 2, связанный с TATA-бокс-связывающим белком (TBP), (TRF2), третий член семейства TBP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4791–6. Бибкод : 1999PNAS...96.4791R . дои : 10.1073/pnas.96.9.4791 . ПМК 21770 . ПМИД 10220372 .

[pmid15767669-7] Чонг Дж.А., Моран М.М., Тейхманн М., Качмарек Дж.С., Редер Р., Клэпхэм Д.Э. (апрель 2005 г.). «ТАТА-связывающий белок (TBP)-подобный фактор (TLF) является функциональным регулятором транскрипции: реципрокная регуляция генов нейрофиброматоза 1 типа и c-fos с помощью TLF/TRF2 и TBP» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (7): 2632–43. дои : 10.1128/MCB.25.7.2632-2643.2005 . ПМЦ 1061635 . ПМИД 15767669 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: TBPL1 TBP-подобный 1» .

[pmid17353931-9] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid10570139-10] Тейхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Фактор-2, родственный ТАТА-связывающему белку человека (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13720–5. Бибкод : 1999PNAS...9613720T . дои : 10.1073/pnas.96.24.13720 . ПМК 24131 . ПМИД 10570139 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]