ТВХ22

ТВХ22
Идентификаторы
Псевдонимы	TBX22 , ABERS, CLPA, CPX, TBXX, dJ795G23.1, T-box 22, фактор транскрипции T-box 22
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 300307 ; МГИ : 2389465 ; Гомологен : 9666 ; Генные карты : TBX22 ; ОМА : TBX22 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	80,031,774 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	106,732,584 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; gonad; ; right auricle; ; Descending thoracic aorta; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; ascending aorta;
	Top expressed in
	tongue; ; nasal septum; ; ciliary body; ; olfactory gland; ; iris; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; medial nasal prominence; ; oral mucosa; ; spermatocyte;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	multicellular organism development; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	50945
	245572
	ENSG00000277800 ; ENSG00000122145
	ENSMUSG00000031241
	Q9Y458
	Q8K402
	НМ_001109878 ; НМ_001109879 ; НМ_001303475 ; НМ_016954
	НМ_001290747 ; НМ_145224 ; НМ_181319
	НП_001103348 ; НП_001103349 ; НП_001290404 ; НП_058650
	НП_001277676 ; НП_660259 ; НП_851836
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции Т-бокса TBX22 представляет собой белок , который у человека кодируется TBX22 геном . ^[5]

TBX22 является членом филогенетически консервативного семейства белков, имеющих общий ДНК-связывающий домен, T-box . Гены Т-бокса кодируют факторы транскрипции, участвующие в регуляции процессов развития. Мутации в этом гене связаны с наследственным Х-сцепленным заболеванием — расщелиной неба с анкилоглоссией (узой языка), и считается, что он играет важную роль в палатогенезе у человека. ^[5] Ранее он был картирован на длинном плече Х-хромосомы, а теперь продемонстрировано, что причиной этого синдрома являются мутации в гене TBX22. ^[6] Мутации TBX22 также приводят к несиндромальной расщелине неба в некоторых популяциях. ^[7]

TBX22 состоит из семи экзонов, охватывающих 8,7 тысяч оснований геномной ДНК в Xq21.1. мРНК TBX22 имеет длину 2099 пар оснований и кодирует белок, состоящий из 400 аминокислот, содержащий Т-домен в своей NH ₂ -концевой области, который обладает уникальной особенностью отсутствия 20 аминокислот по сравнению с другими известными Т-доменами. ^[8]

Функция

Гены Т-бокса являются членами семейства регуляторов транскрипции, которые содержат область, кодирующую консервативный ДНК-связывающий мотив, состоящий примерно из 200 аминокислот: Т-домен. Эти гены сгруппированы на основе гомологии, существующей между их продуктами и мышиным белком Brachyury (или T). У человека и мыши к настоящему времени идентифицированы и картированы по всему геному многочисленные гены, содержащие Т-домен. Пространственно-временная экспрессия этих генов строго регулируется в ходе развития как позвоночных, так и беспозвоночных. ^[8]

Функциональные исследования показали, что несколько генов T-box участвуют в спецификации мезодермы у развивающихся эмбрионов мышей или Xenopus . У мышей ген Brachyury экспрессируется в ранних клетках мезодермы, а затем его экспрессия ограничивается хордой . Белок Brachyury связывается в виде димера с 20-нуклеотидной частично палиндромной последовательностью, распознаваемой его Т-доменом. В более общем плане было показано, что гены Т-бокса имеют решающее значение во время развития для правильного морфогенеза и органогенеза . Было показано, что аномальная экспрессия нескольких генов Т-бокса вызывает аномалии развития у мышей, дрозофил или рыбок данио.

Клиническое значение

Мутации TBX22 в двух семьях предсказывали наличие Х-сцепленной расщелины неба и анкилоглоссии. Электрофореграммы последовательности геномной ДНК, амплифицированной из экзона 5 (семейство K) и экзона 4 (семейство W), относятся к пораженным (мутантным) самцам и незатронутым (контрольным) самкам. *Представляет собой сайт варианта последовательности.

У людей два гена Т-box участвуют в наследственных заболеваниях: мутации в TBX5 вызывают синдром Холта-Орама , тогда как мутации в TBX3 вызывают локтевой-маммарный синдром . ^[8]

Мутации TBX22 вызывают Х-сцепленную расщелину неба и анкилоглоссию. ^[9] CPX был описан в небольшом количестве семей, демонстрирующих сильное X-сцепленное менделевское наследование. расщелины Фенотип преимущественно поражает мужчин, у которых наблюдаются вариации от полной расщелины вторичного неба, подслизистой расщелины или раздвоенного язычка до высокого сводчатого неба. Анкилоглоссия часто наблюдается у больных пациентов и женщин-носителей и оказалась полезным индикатором CPX. Временные и пространственные исследования с использованием гибридизации in situ как у человека, так и у мышей показали, что TBX22/Tbx22 экспрессируется преимущественно в небных полочках и языке во время палатогенеза , что указывает на специфическую роль TBX22 в развитии как неба, так и языка. Помимо семей с четко определенным Х-сцепленным наследованием, мутации TBX22 были выявлены в нескольких семьях, где размер родословной и/или семейный анамнез были слишком ограничены, чтобы предсказать тип наследования. В этих случаях диагноз в основном основывался на наличии анкилоглоссии, а также расщелины неба. ^[10]

Было продемонстрировано, что TBX22 вносит значительный вклад в распространенность расщелины неба, по крайней мере, в когортах Бразилии и Северной Америки. ^[8] На сегодняшний день зарегистрировано 10 различных мутаций TBX22 у пациентов с ХП и/или анкилоглоссией. ^[11] К ним относятся небольшие делеции/вставки, бессмысленные изменения, сайт сплайсинга, сдвиг рамки и миссенс-изменения. ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000122145 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000277800, ENSG00000122145 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031241 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: TBX22 T-box 22» .
^ Брейбрук С., Дудни К., Марсано А.С. и др. (2001). «Ген транскрипционного фактора T-box TBX22 мутирует при Х-сцепленной расщелине неба и анкилоглоссии». Нат. Жене . 29 (2): 179–83. дои : 10.1038/ng730 . ПМИД 11559848 . S2CID 28939959 .
^ Jump up to: ^а ^б Суфапитипорн К., Тонгкобпетч С., Сириван П., Шотельерсук В. (2008). «Мутации TBX22 являются частой причиной несиндромальной расщелины неба у населения Таиланда» . Клин. Жене . 72 (5): 478–83. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00891.x . PMID 17868388 . S2CID 2244618 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ложье-Анфосси Ф., Виллар Л. (2000). «Молекулярная характеристика нового гена Т-бокса человека (TBX22), расположенного в xq21.1, кодирующего белок, содержащий укороченный Т-домен». Джин . 255 (2): 289–96. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00326-7 . ПМИД 11024289 .
^ Диксон М.Дж., Маразита М.Л., Бити Т.Х., Мюррей Дж.К. (март 2011 г.). «Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний» . Нат. Преподобный Жене . 12 (3): 167–78. дои : 10.1038/nrg2933 . ПМК 3086810 . ПМИД 21331089 .
^ Марсано А.С., Дудни К., Брейбрук С. и др. (2004). «Мутации TBX22 являются частой причиной расщелины неба» . Дж. Мед. Жене . 41 (1): 68–74. дои : 10.1136/jmg.2003.010868 . ПМЦ 1757272 . ПМИД 14729838 .
^ Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): T-BOX 22; ТВХ22 - 300307

Дальнейшее чтение

Ложье-Анфосси Ф., Виллар Л. (2000). «Молекулярная характеристика нового гена Т-бокса человека (TBX22), расположенного в xq21.1, кодирующего белок, содержащий укороченный Т-домен». Джин . 255 (2): 289–96. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00326-7 . ПМИД 11024289 .
Брейбрук С., Дудни К., Марсано А.С. и др. (2001). «Ген транскрипционного фактора T-box TBX22 мутирует при Х-сцепленной расщелине неба и анкилоглоссии». Нат. Жене . 29 (2): 179–83. дои : 10.1038/ng730 . ПМИД 11559848 . S2CID 28939959 .
Олдред М.А. (2002). «Расщелина губы и неба: новые генетические подсказки». Тенденции молекулярной медицины . 7 (12): 539–40. дои : 10.1016/S1471-4914(01)02223-7 . ПМИД 11733204 .
Брейбрук С., Лисго С., Дудни К. и др. (2003). «Черепно-лицевая экспрессия человеческого и мышиного TBX22 коррелирует с фенотипом расщелины неба и анкилоглоссии, наблюдаемым у пациентов с CPX» . Хм. Мол. Жене . 11 (22): 2793–804. дои : 10.1093/hmg/11.22.2793 . ПМИД 12374769 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Марсано А.С., Дудни К., Брейбрук С. и др. (2004). «Мутации TBX22 являются частой причиной расщелины неба» . Дж. Мед. Жене . 41 (1): 68–74. дои : 10.1136/jmg.2003.010868 . ПМЦ 1757272 . ПМИД 14729838 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Росс М.Т., Графэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. Бибкод : 2005Natur.434..325R . дои : 10.1038/nature03440 . ПМЦ 2665286 . ПМИД 15772651 .
Андреу А.М., Паус Э., Джонс М.К. и др. (2007). «Миссенс-мутации TBX22, обнаруженные у пациентов с Х-сцепленной расщелиной неба, влияют на связывание ДНК, сумойлирование и репрессию транскрипции» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 81 (4): 700–12. дои : 10.1086/521033 . ПМК 2227921 . ПМИД 17846996 .
Суфапитипорн К., Тонгкобпетч С., Сириван П., Шотельерсук В. (2008). «Мутации TBX22 являются частой причиной несиндромальной расщелины неба у населения Таиланда» . Клин. Жене . 72 (5): 478–83. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00891.x . PMID 17868388 . S2CID 2244618 .

Внешние ссылки

TBX22 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
WikiGenes TBX22
TBX22 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека TBX22 в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000122145 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000277800, ENSG00000122145 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031241 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: TBX22 T-box 22» .

[Braybrook-6] Брейбрук С., Дудни К., Марсано А.С. и др. (2001). «Ген транскрипционного фактора T-box TBX22 мутирует при Х-сцепленной расщелине неба и анкилоглоссии». Нат. Жене . 29 (2): 179–83. дои : 10.1038/ng730 . ПМИД 11559848 . S2CID 28939959 .

[Suphapeetiporn-7] Jump up to: ^а ^б Суфапитипорн К., Тонгкобпетч С., Сириван П., Шотельерсук В. (2008). «Мутации TBX22 являются частой причиной несиндромальной расщелины неба у населения Таиланда» . Клин. Жене . 72 (5): 478–83. дои : 10.1111/j.1399-0004.2007.00891.x . PMID 17868388 . S2CID 2244618 .

[L-A-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ложье-Анфосси Ф., Виллар Л. (2000). «Молекулярная характеристика нового гена Т-бокса человека (TBX22), расположенного в xq21.1, кодирующего белок, содержащий укороченный Т-домен». Джин . 255 (2): 289–96. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00326-7 . ПМИД 11024289 .

[pmid21331089-9] Диксон М.Дж., Маразита М.Л., Бити Т.Х., Мюррей Дж.К. (март 2011 г.). «Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний» . Нат. Преподобный Жене . 12 (3): 167–78. дои : 10.1038/nrg2933 . ПМК 3086810 . ПМИД 21331089 .

[Marcano-10] Марсано А.С., Дудни К., Брейбрук С. и др. (2004). «Мутации TBX22 являются частой причиной расщелины неба» . Дж. Мед. Жене . 41 (1): 68–74. дои : 10.1136/jmg.2003.010868 . ПМЦ 1757272 . ПМИД 14729838 .

[11] Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): T-BOX 22; ТВХ22 - 300307

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]