ИКЗФ1
| ИКЗФ1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | IKZF1 , Hs.54452, IK1, IKAROS, LYF1, LyF-1, PPP1R92, PRO0758, ZNFN1A1, CVID13, цинковый палец семейства IKAROS 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 603023 ; МГИ : 1342540 ; Гомологен : 55948 ; Генные карты : IKZF1 ; ОМА : IKZF1 – ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ДНК-связывающий белок Ikaros, также известный как белок 1 цинкового пальца семейства Ikaros, представляет собой белок , который у человека кодируется IKZF1 геном . [5] [6] [7]
Икарос - фактор транскрипции
[ редактировать ]Ikaros — это транскрипционный фактор, который кодируется генами IKZF семейства Ikaros группы цинковых пальцев . Цинковый палец — это небольшой структурный мотив белка, который позволяет белку связываться с молекулой ДНК или РНК, который характеризуется координацией одного или нескольких ионов цинка (Zn 2+ ), чтобы стабилизировать складку.
Икарос выполняет важные функции в кроветворной системе и является известным регулятором развития иммунных клеток , главным образом ранних В-клеток , CD4+ Т-клеток . Его дисфункция связана с развитием хронического лимфоцитарного лейкоза. [8] [9] В частности, в последние годы было обнаружено, что Икарос является основным супрессором опухолей, участвующим в остром В-клеточном лимфобластном лейкозе человека. [8] и что он также участвует в дифференцировке и функционировании отдельных Т-хелперных клеток. [10]
Икарос также играет роль на более поздних стадиях развития В-клеток во время рекомбинации VDJ в переключении класса изотипов антител и экспрессии рецептора В-клеток. [11]
У мышей, нокаутных по Ikaros, Т-клетки, но не В-клетки, образуются на поздних стадиях развития мышей из-за поздней компенсаторной экспрессии родственного гена Aiolos (IKZF3). [12] Мыши-мутанты Ikaros являются эмбрионально летальными из-за анемии; у них наблюдаются серьезные дефекты терминальной дифференцировки эритроцитов и гранулоцитов , а также избыточное образование макрофагов . [13] SNP, расположенные вблизи 3'-области IKZF1 у людей, связаны с предрасположенностью к детскому острому лимфобластному лейкозу (ОЛЛ). [14] а также диабет 1 типа . [15] Эти два эффекта, по-видимому, имеют противоположные направления: аллель, обозначающая восприимчивость к ALL, защищает от СД1 и наоборот. [15]
Дальнейшие данные показывают, что Икарос регулирует развитие медуллярных эпителиальных клеток тимуса (mTEC) . Условное удаление Ikzf1 в эпителиальных клетках тимуса с помощью Foxn1 - Cre у мышей приводит к нарушению регуляции различных подмножеств mTEC, включая потерю Aire+ mTEC. Утрата Aire (аутоиммунного регулятора), экспрессирующего mTEC, также вызывает глобальную потерю тканеограниченных антигенов (TRA) и популяций Aire-зависимых миметических клеток , причем потеря TRA в конечном итоге приводит к нарушению иммунной толерантности . [16]
Гены группы семейства цинковых пальцев Икарос
[ редактировать ]Семейство транскрипционных факторов Ikaros Zinc Finger (IkZF) является известным регулятором развития гемопоэтических клеток и многих иммунных клеток, включая клетки CD4. + Т-клетки.
Семейство IkZF состоит из пяти членов: Икарос (кодируется геном Ikzf1 ), Гелиос ( Ikzf2 ), Айолос ( Ikzf3 ), Эос ( Ikzf4 ) и Пегас ( Ikzf5 ). Эти факторы содержат N-концевые домены цинковых пальцев (ZF), которые отвечают за прямое взаимодействие с ДНК, и C-концевые ZF, которые облегчают гомо- и гетеродимеризацию между членами семейства IkZF. [17]
Уровень IKZF1 повышается в гранулоцитах, В-клетках, Т-клетках CD4 и CD8, а также NK-клетках и снижается в эритробластах, мегакариоцитах и моноцитах. [18]
Дефицит Икароса
[ редактировать ]Мутация гена IKZF1 может вызвать дисфункцию транскрипционного фактора Ikaros. Дисфункция влияет на экспрессию в В-клетках , что может привести к нарушению регуляции передачи сигналов BCR во время развития В-клеток и связано с трансформацией В-клеток. В таком случае нарушение регуляции может привести к низкой скорости пролиферации и усилению апоптоза В-клеток. Дерегуляция может быть связана с лимфопролиферативными заболеваниями и различными формами лейкемии . [19]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что IKZF1 взаимодействует с:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185811 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018654 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Георгопулос К., Мур Д.Д., Дерфлер Б. (октябрь 1992 г.). «Икарос, ранний лимфоид-специфичный транскрипционный фактор и предполагаемый медиатор коммитирования Т-клеток». Наука . 258 (5083): 808–12. Бибкод : 1992Sci...258..808G . дои : 10.1126/science.1439790 . ПМИД 1439790 .
- ^ Хам К., Эрнст П., Ло К., Ким Г.С., Терк С., Смейл С.Т. (ноябрь 1994 г.). «Лимфоидный фактор транскрипции LyF-1 кодируется специфическими, альтернативно сплайсированными мРНК, полученными из гена Ikaros» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (11): 7111–23. дои : 10.1128/mcb.14.11.7111 . ПМК 359245 . ПМИД 7935426 .
- ^ «Ген Энтреза: IKZF1 Цинковый палец 1 семейства IKAROS (Икарос)» .
- ^ Перейти обратно: а б Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Роль Икароса в остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе» . Всемирный журнал биологической химии . 2 (6): 108–114. дои : 10.4331/wjbc.v2.i6.108 . ПМК 3135856 . ПМИД 21765975 .
- ^ Оливейра В.К., Ласерда М.П., Мораес Б.Б., Гомеш С.П., Марикато Дж.Т., Соуза О.Ф. и др. (сентябрь 2019 г.). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые сведения о злокачественной трансформации в хронический лимфоцитарный лейкоз». Журнал биологии лейкоцитов . 106 (3): 581–594. дои : 10.1002/JLB.MA1118-454R . ПМИД 31299112 . S2CID 196350761 .
- ^ Пауэлл, доктор медицинских наук, Рид К.А., Срикумар Б.К., Острайх К.Дж. (2019). «Факторы транскрипции цинковых пальцев Ikaros: регуляторы сигнальных путей цитокинов и CD4». + -хелперных клеток» . Frontiers in Immunology . 10 : 1299. doi : 10.3389/fimmu.2019.01299 . PMC 6563078. Дифференциация Т PMID 31244845 .
- ^ Селларс М., Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Икарос в развитии и функционировании В-клеток» . Всемирный журнал биологической химии . 2 (6): 132–9. дои : 10.4331/wjbc.v2.i6.132 . ПМК 3135860 . ПМИД 21765979 .
- ^ Георгопулос К., Винэнди С., Авиталь Н. (1997). «Роль гена Ikaros в развитии и гомеостазе лимфоцитов». Ежегодный обзор иммунологии . 15 : 155–76. doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.155 . ПМИД 9143685 .
- ^ Папатанасиу П., Перкинс А.С., Кобб Б.С., Феррини Р., Шридхаран Р., Хойн Г.Ф. и др. (июль 2003 г.). «Распространенная неудача гематолимфоидной дифференцировки, вызванная рецессивным аллелем, заполняющим нишу, транскрипционного фактора Икарос» . Иммунитет . 19 (1): 131–44. дои : 10.1016/s1074-7613(03)00168-7 . ПМИД 12871645 .
- ^ Папэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А., Олвер Б., Шеридан Э. и др. (сентябрь 2009 г.). «Локусы 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей» . Природная генетика . 41 (9): 1006–10. дои : 10.1038/ng.430 . ПМЦ 4915548 . ПМИД 19684604 .
- ^ Перейти обратно: а б Сваффорд А.Д., Хаусон Дж.М., Дэвисон Л.Дж., Уоллес С., Смит DJ, Шуленбург Х. и др. (март 2011 г.). «Аллель IKZF1 (Икарос), обуславливающий предрасположенность к детскому острому лимфобластному лейкозу, защищает от диабета 1 типа» . Диабет . 60 (3): 1041–4. дои : 10.2337/db10-0446 . ПМК 3046822 . ПМИД 21270240 .
- ^ Син Дж. Х., Сучаров Дж., Кашьяп С., Ван Ю, Проект I, Лю X и др. (октябрь 2023 г.). «Ikaros является основным регулятором Aire + Гомеостаз mTEC, разнообразие клеток-миметиков тимуса и центральная толерантность». Science Immunology . 8 (88): eabq3109. : 10.1126 /sciimmunol.abq3109 . PMID 37889983. . S2CID 264518068 doi
- ^ Пауэлл, доктор медицинских наук, Рид К.А., Шрикумар Б.К., Острайх К.Дж. (06 июня 2019 г.). «+ Дифференциация Т-хелперных клеток» . Границы в иммунологии . 10 : 1299. дои : 10.3389/fimmu.2019.01299 . ПМК 6563078 . ПМИД 31244845 .
- ^ Уоткинс Н.А., Гуснанто А., де Боно Б., Де С., Миранда-Сааведра Д., Харди Д.Л. и др. (май 2009 г.). «Атлас HaemAtlas: характеристика экспрессии генов в дифференцированных клетках крови человека» . Кровь . 113 (19): е1–е9. дои : 10.1182/blood-2008-06-162958 . ПМК 2680378 . ПМИД 19228925 .
- ^ Оливейра В.К., Ласерда М.П., Мораес Б.Б., Гомеш С.П., Марикато Дж.Т., Соуза О.Ф. и др. (июль 2019 г.). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые сведения о злокачественной трансформации в хронический лимфоцитарный лейкоз». Журнал биологии лейкоцитов . 106 (3): 581–594. дои : 10.1002/JLB.MA1118-454R . ПМИД 31299112 . S2CID 196350761 .
- ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие Икароса с CtBP обнаруживает механизм репрессии, который не зависит от активности деацетилазы гистонов» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19594–602. дои : 10.1074/jbc.M000254200 . PMID 10766745 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие схемы подавления Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. дои : 10.1074/jbc.M201694200 . ПМИД 12015313 .
- ^ Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авиталь Н., Ву Л., Георгопулос К. и др. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер Икароса по димеризации, выраженный в самых ранних кроветворных предшественниках» . Современная биология . 8 (9): 508–15. Бибкод : 1998CBio....8..508K . дои : 10.1016/s0960-9822(98)70202-7 . ПМИД 9560339 . S2CID 17835058 .
- ^ Морган Б., Сан Л., Авиталь Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Э. и др. (апрель 1997 г.). «Айолос, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидами, который взаимодействует с Икаросом, регулируя дифференцировку лимфоцитов» . Журнал ЭМБО . 16 (8): 2004–13. дои : 10.1093/emboj/16.8.2004 . ПМЦ 1169803 . ПМИД 9155026 .
- ^ Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Э. и др. (март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах» . Иммунитет . 10 (3): 345–55. дои : 10.1016/s1074-7613(00)80034-5 . ПМИД 10204490 .
- ^ Хонма И., Кийосава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе» . Письма ФЭБС . 447 (1): 76–80. дои : 10.1016/s0014-5793(99)00265-3 . ПМИД 10218586 . S2CID 28898354 .
- ^ Пердомо Дж., Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Эос и пегас, два члена семейства белков Ikaros с различной активностью связывания ДНК» . Журнал биологической химии . 275 (49): 38347–54. дои : 10.1074/jbc.M005457200 . ПМИД 10978333 .
- ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2002 г.). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют С-концевого связывающего белка и участвуют в независимом от деацетилазы режиме репрессии» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23143–9. дои : 10.1074/jbc.M202079200 . ПМИД 11959865 .
- ^ Кацумура К.Р., Бресник Э.Х. (апрель 2017 г.). «Факторная революция GATA в гематологии» . Кровь . 129 (15): 2092–2102. дои : 10.1182/blood-2016-09-687871 . ПМЦ 5391619 . ПМИД 28179282 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Тоннель С., Калмелс Б., Марок С., Габер Дж., Шабаннон С. (январь 2002 г.). «Экспрессия гена Икарос и лейкемия». Лейкемия и лимфома . 43 (1): 29–35. дои : 10.1080/10428190210186 . ПМИД 11908734 . S2CID 23932398 .
- Вестман Б.Дж., Маккей Дж.П., Гелл Д. (октябрь 2002 г.). «Икарос: ключевой регулятор кроветворения». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 34 (10): 1304–7. дои : 10.1016/S1357-2725(02)00070-5 . ПМИД 12127581 .
- Молнар А., Ву П., Ларгеспада Д.А., Ворткамп А., Шерер С., Коупленд Н.Г. и др. (январь 1996 г.). «Ген Ikaros кодирует семейство ограниченных лимфоцитами белков, связывающих ДНК с цинковыми пальцами, высококонсервативных у человека и мышей» . Журнал иммунологии . 156 (2): 585–92. дои : 10.4049/jimmunol.156.2.585 . ПМИД 8543809 . S2CID 24893140 .
- Нитфельд В., Мейерханс А. (январь 1996 г.). «Клонирование и секвенирование hIk-1, кДНК, кодирующей человеческий гомолог мышиного Ikaros/LyF-1». Письма по иммунологии . 49 (1–2): 139–41. дои : 10.1016/0165-2478(95)02479-4 . ПМИД 8964602 .
- Морган Б., Сан Л., Авиталь Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Э. и др. (апрель 1997 г.). «Айолос, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидами, который взаимодействует с Икаросом, регулируя дифференцировку лимфоцитов» . Журнал ЭМБО . 16 (8): 2004–13. дои : 10.1093/emboj/16.8.2004 . ПМЦ 1169803 . ПМИД 9155026 .
- Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авиталь Н., Ву Л., Георгопулос К. и др. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер Икароса по димеризации, выраженный в самых ранних кроветворных предшественниках» . Современная биология . 8 (9): 508–15. Бибкод : 1998CBio....8..508K . дои : 10.1016/S0960-9822(98)70202-7 . ПМИД 9560339 . S2CID 17835058 .
- Сунь Л., Хирема Н., Кротти Л., Ву X, Навара С., Васильев А. и др. (январь 1999 г.). «Экспрессия доминантно-негативных и мутантных изоформ антилейкемического транскрипционного фактора Икарос при остром лимфобластном лейкозе у детей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (2): 680–5. Бибкод : 1999PNAS...96..680S . дои : 10.1073/pnas.96.2.680 . ПМЦ 15196 . ПМИД 9892693 .
- Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Э. и др. (март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах» . Иммунитет . 10 (3): 345–55. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . ПМИД 10204490 .
- Хонма И., Кийосава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе» . Письма ФЭБС . 447 (1): 76–80. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00265-3 . ПМИД 10218586 . S2CID 28898354 .
- Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .
- Сан Л., Гудман П.А., Вуд С.М., Кротти М.Л., Сенсел М., Сатер Х. и др. (декабрь 1999 г.). «Экспрессия аберрантно сплайсированных онкогенных изоформ икароса при остром лимфобластном лейкозе у детей». Журнал клинической онкологии . 17 (12): 3753–66. дои : 10.1200/JCO.1999.17.12.3753 . ПМИД 10577847 .
- Хосокава Ю., Маэда Ю., Ичинохасама Р., Миура И., Таниваки М., Сето М. (апрель 2000 г.). «Ген Ikaros, центральный регулятор лимфоидной дифференцировки, сливается с геном BCL6 в результате транслокации t(3;7)(q27;p12) у пациента с диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомой». Кровь . 95 (8): 2719–21. дои : 10.1182/blood.V95.8.2719 . ПМИД 10753856 .
- Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие Икароса с CtBP обнаруживает механизм репрессии, который не зависит от активности деацетилазы гистонов» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19594–602. дои : 10.1074/jbc.M000254200 . PMID 10766745 .
- Пердомо Дж., Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Эос и пегас, два члена семейства белков Ikaros с различной активностью связывания ДНК» . Журнал биологической химии . 275 (49): 38347–54. дои : 10.1074/jbc.M005457200 . ПМИД 10978333 .
- Пейн К.Дж., Николас Дж.Х., Чжу Дж.Ю., Барски Л.В., Крукс Г.М. (август 2001 г.). «Авангард: преобладающая экспрессия новой изоформы Икароса в нормальном кроветворении человека» . Журнал иммунологии . 167 (4): 1867–70. doi : 10.4049/jimmunol.167.4.1867 . ПМИД 11489963 .
- Койпалли Дж., Хеллер Э.Дж., Сивитт Дж.Р., Георгопулос К. (апрель 2002 г.). «Нетрадиционное усиление экспрессии генов с помощью Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (15): 13007–15. дои : 10.1074/jbc.M111371200 . ПМИД 11799125 .
- Дорсам Г., Гетцль Э.Дж. (апрель 2002 г.). «Вазоактивный кишечный пептидный рецептор-1 (VPAC-1) является новым геном-мишенью гемолимфопоэтического транскрипционного фактора Икарос» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13488–93. дои : 10.1074/jbc.M107922200 . ПМИД 11812772 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- IKZF1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- IKZF1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
- Подробности о гене человека IKZF1 в браузере генома UCSC .