Гистон деацетилаза 5
HDAC5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | HDAC5 , HD5, NY-CO-9, гистондеацетилаза 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Омим : 605315 ; MGI : 1333784 ; Гомологен : 3995 ; GeneCards : HDAC5 ; OMA : HDAC5 - ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викидид | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Гистондеацетилаза 5 является ферментом , который у людей кодируется HDAC5 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Гистоны играют важную роль в регуляции транскрипции, прогрессировании клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование гистона/деацетилирование изменяет структуру хромосомы и влияет на доступ транскрипционного фактора к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству гистон -деацетилазы класса II/ACUC/APHA. Он обладает активностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию при привязке к промотору. Он коиммунопреципитирует только с членом семейства HDAC3 и может образовывать мультикомплексные белки. Он также взаимодействует с белками энхансера-энхансера миоцитов (MEF2), что приводит к репрессии MEF2-зависимых генов. Считается, что этот ген связан с раком толстой кишки. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [ 7 ]
Активированная AMP-активированная регуляция протеинкиназы глюкозы GLUT4 происходит путем фосфорилирования HDAC5. [ 8 ]
HDAC5 участвует в консолидации памяти и предполагает, что развитие более селективных ингибиторов HDAC для лечения болезни Альцгеймера следует избегать нацеливания HDAC5. [ 9 ] Его функция может быть эффективно изучена с помощью нокдауна SIRNA на основе независимой валидации. [ 10 ]
Сверхэкспрессия HDAC5 в клеточных линиях уротелиальной карциномы ингибирует долгосрочную пролиферацию, но может способствовать переходу эпителиально-мезенхимального ( EMT ) [ 11 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что гистондеацетилаза 5 взаимодействует с:
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000108840 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000008855 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Гризингер CM, Hassig CA, Schreiber SL (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс человеческих гистоновых деацетилаз, связанных с дрожжами HDA1P» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–73. Bibcode : 1999pnas ... 96.4868g . doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC 21783 . PMID 10220385 .
- ^ Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B, Gure AO, Stockert E, Gordan JD, et al. (Май 1998). «Характеристика антигенов рака толстой кишки человека, распознаваемой аутологичными антителами». Международный журнал рака . 76 (5): 652–8. doi : 10.1002/(SICI) 1097-0215 (19980529) 76: 5 <652 :: AID-IJC7> 3.0.CO; 2-P . PMID 9610721 . S2CID 916155 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный «Ген Entrez: HDAC5 гистондеацетилаза 5» .
- ^ McGee SL, Van Denderen BJ, Howlett KF, Mollica J, Schertzer JD, Kemp BE, Hargreaves M (апрель 2008 г.). «AMP-активированная протеинкиназа регулирует транскрипцию GLUT4 с помощью фосфорилирующей гистондеацетилазы 5» . Диабет . 57 (4): 860–7. doi : 10.2337/db07-0843 . PMID 18184930 . S2CID 17274354 .
- ^ Agis-Balboa RC, Pavelka Z, Kerimoglu C, Fischer A (январь 2013 г.). «Потеря HDAC5 ухудшает функцию памяти: последствия для болезни Альцгеймера». Журнал болезни Альцгеймера . 33 (1): 35–44. doi : 10.3233/jad-2012-121009 . HDL : 2434/223089 . PMID 22914591 .
- ^ Munkácsy G, Sztupinszki Z, Herman P, Bán B, Monetary Z, Szarvas N, Győrffy B (сентябрь 2016 г.). «Валидация эффективности молчания РНКи с использованием данных генов показывает 18,5% частоту отказов в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия: нуклеиновые кислоты . 5 (9): E366. Doi : 10.1038/mtna.2016.66 . PMC 5056990 . PMID 27673562 .
- ^ Ягува Васудеван А.А., Хоффманн М.Дж., Бек М.Л., Пошманн Г., Пецш П., Вик С. и др. (Апрель 2019). «Экспрессия HDAC5 в клеточных линиях уротелиальной карциномы ингибирует долгосрочную пролиферацию, но может способствовать переходу эпителиально-мезенхимы» . Международный журнал молекулярных наук . 20 (9): 2135. DOI : 10.3390/IJMS20092135 . PMC 6539474 . PMID 31052182 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II непосредственно набираются с помощью транскрипционного репрессора BCL6» . Журнал биологической химии . 277 (24): 22045–52. doi : 10.1074/jbc.m201736200 . PMID 11929873 .
- ^ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (октябрь 2002 г.). «Ассоциация диацетилаз гистонов II класса с гетерохроматином белка 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (20): 7302–12. doi : 10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002 . PMC 139799 . PMID 12242305 .
- ^ Watamoto K, Towatari M, Ozawa Y, Miyata Y, Okamoto M, Abe A, et al. (Декабрь 2003 г.). «Измененное взаимодействие HDAC5 с GATA-1 во время дифференцировки клеток MEL». Онкоген . 22 (57): 9176–84. doi : 10.1038/sj.onc.1206902 . PMID 14668799 . S2CID 24491249 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (март 2002 г.). «Комплекс ядерного рецептора N-Cor-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2» . Молекулярная клетка . 9 (3): 611–23. doi : 10.1016/s1097-2765 (02) 00468-9 . PMID 11931768 .
- ^ Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультипротеинового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT/N-COR». Молекулярная клетка . 9 (1): 45–57. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00429-4 . HDL : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 . PMID 11804585 .
- ^ Гризингер CM, Schreiber SL (июль 2000 г.). «Регуляция гистондеацетилазы 4 и 5 и транскрипционную активность с помощью 14-3-3-зависимой клеточной локализации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Bibcode : 2000pnas ... 97.7835g . doi : 10.1073/pnas.140199597 . PMC 16631 . PMID 10869435 .
- ^ Koipally J, Georgopoulos K (август 2002 г.). «Молекулярное рассечение схемы репрессии Икарос» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. doi : 10.1074/jbc.m201694200 . PMID 12015313 .
- ^ Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (май 2000). «MHDA1/HDAC5 гистон -деацетилаза взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A» . Журнал биологической химии . 275 (20): 15594–9. doi : 10.1074/jbc.m908437199 . PMID 10748098 .
- ^ Кастыр А., Булахтуф А., Версини Г., Боннет С., Огеро П., Винон Ф. и др. (2004). «Множественные домены рецепторного белка 140 способствуют ингибированию транскрипции» . Исследование нуклеиновых кислот . 32 (6): 1957–66. doi : 10.1093/nar/gkh524 . PMC 390375 . PMID 15060175 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (январь 2000 г.). «Ядерные рецепторы корепрессоры партнеры с гистоновыми деацетилазами класса II в пути SIN3-независимого репрессии» . Гены и развитие . 14 (1): 45–54. doi : 10.1101/gad.14.1.45 . PMC 316335 . PMID 10640275 .
- ^ Vega RB, Harrison BC, Meadows E, Roberts CR, Papst PJ, Olson EN, McKinsey TA (октябрь 2004 г.). «Протеинкиназы C и D опосредуют агонист-зависимую гипертрофию сердца посредством ядерной экспорта гистондеацетилазы 5» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (19): 8374–85. doi : 10.1128/mcb.24.19.8374-8385.2004 . PMC 516754 . PMID 15367659 .
- ^ Chauchereau A, Mathieu M, De Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z, et al. (Ноябрь 2004 г.). «HDAC4 опосредует транскрипционную репрессию с помощью острого промиелоцитарного лейкемии, ассоциированного с белком PLZF». Онкоген . 23 (54): 8777–84. doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . PMID 15467736 . S2CID 26092755 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Вердин Е., Декидт Ф., Каслер Х.Г. (май 2003). «Гистоновые деацетилазы класса II: универсальные регуляторы» (PDF) . Тенденции в генетике . 19 (5): 286–93. doi : 10.1016/s0168-9525 (03) 00073-8 . HDL : 2268/80861 . PMID 12711221 .
- Huang EY, Zhang J, Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T, Lazar MA (январь 2000 г.). «Ядерные рецепторы корепрессоры партнеры с гистоновыми деацетилазами класса II в пути SIN3-независимого репрессии» . Гены и развитие . 14 (1): 45–54. doi : 10.1101/gad.14.1.45 . PMC 316335 . PMID 10640275 .
- Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (май 2000). «MHDA1/HDAC5 гистон -деацетилаза взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A» . Журнал биологической химии . 275 (20): 15594–9. doi : 10.1074/jbc.m908437199 . PMID 10748098 .
- Гризингер CM, Schreiber SL (июль 2000 г.). «Регуляция гистондеацетилазы 4 и 5 и транскрипционную активность с помощью 14-3-3-зависимой клеточной локализации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (14): 7835–40. Bibcode : 2000pnas ... 97.7835g . doi : 10.1073/pnas.140199597 . PMC 16631 . PMID 10869435 .
- Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (июль 2000 г.). «BCOR, новый корепрессор, участвующий в репрессиях BCL-6» . Гены и развитие . 14 (14): 1810–23. doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . PMC 316791 . PMID 10898795 .
- Mahlknecht U , Schnittger S, Ottmann OG, Schoch C, Mosebach M, Hiddemann W, Hoelzer D (октябрь 2000). «Хромосомная организация и локализация гена гистон -деацетилазы человека (HDAC5)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1493 (3): 342–8. doi : 10.1016/s0167-4781 (00) 00191-3 . PMID 11018260 .
- Zhang CL, McKinsey TA, Lu Jr, Olson EN (январь 2001 г.). «Ассоциация COOH-концевого связывающего белка (CTBP) и репрессора транскрипции MEF2 (MITR) способствует репрессии транскрипции транскрипционного фактора MEF2» . Журнал биологической химии . 276 (1): 35–9. doi : 10.1074/jbc.m007364200 . PMID 11022042 .
- McKinsey TA, Zhang CL, Lu J, Olson EN (ноябрь 2000 г.). «В зависимости от сигнала ядерной экспорт гистондеацетилазы регулирует дифференцировку мышц» . Природа . 408 (6808): 106–11. Bibcode : 2000natur.408..106M . doi : 10.1038/35040593 . PMC 4459600 . PMID 11081517 .
- McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (декабрь 2000 г.). «Активация транскрипционного фактора 2 энхансера-фактора миоцита с помощью кальция/кальмодулин-зависимого протеинкиназы связывания 14-3-3 с гистондеацетилазой 5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14400–5. Bibcode : 2000pnas ... 97144400M . doi : 10.1073/pnas.260501497 . PMC 18930 . PMID 11114197 .
- Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность гистон -деацетилазы человека HDAC7 связана с HDAC3 in vivo» . Журнал биологической химии . 276 (38): 35826–35. doi : 10.1074/jbc.m104935200 . PMID 11466315 .
- McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (сентябрь 2001 г.). «Идентификация сертификационной последовательности ядерного экспорта ядерного экспорта в гистоновых деацетилазах класса II» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (18): 6312–21. doi : 10.1128/mcb.21.18.6312-6321.2001 . PMC 87361 . PMID 11509672 .
- Ozawa Y, Towatari M, Tsuzuki S, Hayakawa F, Maeda T, Miyata Y, et al. (Октябрь 2001 г.). «Гистондеацетилаза 3 ассоциируется и подавляет фактор транскрипции GATA-2». Кровь . 98 (7): 2116–23. doi : 10.1182/blood.v98.7.2116 . PMID 11567998 .
- Поттер Г.Б., Бодоин Г.М., Деренцо К.Л., Зарак Дж. М., Чен Ш., Томпсон К.С. (октябрь 2001 г.). «Безволосочный ген мутирован при врожденных расстройствах выпадения волос кодирует нового корепрессора ядерного рецептора» . Гены и развитие . 15 (20): 2687–701. doi : 10.1101/gad.916701 . PMC 312820 . PMID 11641275 .
- Fischle W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (январь 2002 г.). «Ферментативная активность, связанная с HDAC класса II, зависит от мультипротеинового комплекса, содержащего HDAC3 и SMRT/N-COR». Молекулярная клетка . 9 (1): 45–57. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00429-4 . HDL : 11858/00-001M-0000-002C-9FF9-9 . PMID 11804585 .
- Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II непосредственно набираются с помощью транскрипционного репрессора BCL6» . Журнал биологической химии . 277 (24): 22045–52. doi : 10.1074/jbc.m201736200 . PMID 11929873 .
- Huang Y, Tan M, Gosink M, Wang KK, Sun Y (май 2002). «Гистондеацетилаза 5 не является геном -мишенью p53, но ее сверхэкспрессия ингибирует рост опухолевых клеток и вызывает апоптоз». РАНКА . 62 (10): 2913–22. PMID 12019172 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- HDAC5+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .