Ортологическая матрица

СОБСТВЕННЫЙ
Содержание
Описание	вывод ортологии среди 1000 полных геномов.
Контакт
Лаборатория	ETH Цюрих
Авторы	Кристоф Дессимо ; Адриан Шнайдер ; Адриан Альтенхофф ; Гастон Х. Гонне
Первичное цитирование	Альтенхофф и др.
Дата выпуска	2004
Доступ
Веб-сайт	омбраузер .org
URL-адрес загрузки	http://omabrowser.org/All/download.html
веб-службы URL-адрес	WSDL
Разнообразный
Выпуск данных ; частота	2 выпуска в год

OMA ( ортологическая MAtrix ) представляет собой базу данных ортологов, извлеченных из доступных полных геномов . ^[1]^[2] Ортологические прогнозы OMA доступны в нескольких формах:

Пары OMA: для данного гена список предсказанных ортологов у других видов . предоставляется
Группы ОМА: набор генов разных видов , которые все ортологичны .
Иерархические группы OMA: набор всех генов, которые произошли от одного предкового гена в данном таксономическом диапазоне.
Представление OMA Genome Pair: список всех предсказанных ортологов между двумя видами .

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Альтенхофф, Адриан М; Шнайдер Адриан; Гоннет Гастон Х; Десимоз Кристоф (январь 2011 г.). «OMA 2011: вывод ортологии среди 1000 полных геномов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D289-94. дои : 10.1093/нар/gkq1238 . ПМК 3013747 . ПМИД 21113020 .
^ Альтенхофф, Адриан М; Гловер, Наташа М; Поезд, Клеман-Мари; Калеб, Клара; Уорик Вестроци, Алекс; Дилус, Дэвид; де Фариас, Тарчизио М; Зиле, Карина; Стивенсон, Чарльз; Лонг, Цзяо; Редестиг, Хеннинг; Гонне, Гастон Х; Дессимо, Кристоф (2018). «База данных ортологии OMA в 2018 году: обнаружение эволюционных взаимосвязей между всеми сферами жизни с помощью более богатых веб- и программных интерфейсов» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д477–Д485. дои : 10.1093/нар/gkx1019 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 5753216 . ПМИД 29106550 .

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid21113020-1] Jump up to: ^а ^б Альтенхофф, Адриан М; Шнайдер Адриан; Гоннет Гастон Х; Десимоз Кристоф (январь 2011 г.). «OMA 2011: вывод ортологии среди 1000 полных геномов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D289-94. дои : 10.1093/нар/gkq1238 . ПМК 3013747 . ПМИД 21113020 .

[AltenhoffGlover2018-2] Альтенхофф, Адриан М; Гловер, Наташа М; Поезд, Клеман-Мари; Калеб, Клара; Уорик Вестроци, Алекс; Дилус, Дэвид; де Фариас, Тарчизио М; Зиле, Карина; Стивенсон, Чарльз; Лонг, Цзяо; Редестиг, Хеннинг; Гонне, Гастон Х; Дессимо, Кристоф (2018). «База данных ортологии OMA в 2018 году: обнаружение эволюционных взаимосвязей между всеми сферами жизни с помощью более богатых веб- и программных интерфейсов» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д477–Д485. дои : 10.1093/нар/gkx1019 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 5753216 . ПМИД 29106550 .

[1]

[2]