Кристоф Дессимо
Кристоф Дессимо | |
|---|---|
 Кристоф Дессимо выступает на Интеллектуальных системах молекулярной биологии (ISMB) / Европейской конференции по вычислительной биологии (ECCB) в Базеле , 2019 г. | |
| Рожденный | Кристоф Дессимо 1980 (43–44 года) |
| Альма-матер | ETH Цюрих (магистр, доктор философии) |
| Известный | Ортологическая матрица (ОМА) [4] |
| Награды | Премия Овертона (2019) [1] |
| Научная карьера | |
| Поля | Биоинформатика Геномика Филогенетика Эволюция Вычислительная биология [2] |
| Учреждения | Университет Лозанны Европейский институт биоинформатики Университетский колледж Лондона Швейцарский институт биоинформатики |
| Диссертация | Сравнительная геномика с использованием парных эволюционных расстояний (2009) |
| Докторантура | Гастон Гонне [3] |
| Веб-сайт | лаборатория |
Кристоф Дессимо — профессор Швейцарского национального научного фонда (SNSF) в Университете Лозанны , доцент Университетского колледжа Лондона и руководитель группы в Швейцарском институте биоинформатики . [5] [2] [6] [7] [8] В 2019 году он был удостоен премии Овертона за вклад в вычислительную биологию . [1] Начиная с апреля 2022 года он будет совместным исполнительным директором Швейцарского института биоинформатики SIB вместе с Роном Аппелем .
Образование
[ редактировать ]Дессимо получил степень магистра наук в 2003 году. [5] и доктор компьютерных наук в 2009 году в ETH Zurich , Швейцария. [9] где его докторскую диссертацию возглавлял Гастон Гонне. [3] и исследован Амосом Байрохом . [9]
Карьера и исследования
[ редактировать ]После постдокторских исследований в Европейском институте биоинформатики (EBI) в кампусе Wellcome Genome в Хинкстоне , Кембриджшир , [10] он поступил на работу в Университетский колледж Лондона (UCL) в качестве преподавателя в 2013 году, а в 2015 году получил должность читателя . [5] В 2015 году он поступил на работу в Университет Лозанны в качестве профессора, сохранив должность в UCL. [11] С 2016 года Дессимо возглавляет группу в Швейцарском институте биоинформатики. [5] где его научные интересы лежат в области биоинформатики , геномики , филогенетики , эволюции и вычислительной биологии . [2] [12] [13] [14] [15]
Дессимо известен своим управлением Ортологической матрицей (OMA). [4] который предоставляет информацию об ортологичных белках . OMA имеет важные применения в прогнозировании функций белков . [1] Подход Дессимоза к сравнительному анализу оказал большое влияние на три ключевые области вычислительной биологии: ортологический вывод , выравнивание последовательностей и онтологию генов (GO). [1] [16] [17]
Награды и почести
[ редактировать ]Дессимоз был награжден премией Овертона от Международного общества вычислительной биологии (ISCB) в 2019 году за выдающийся вклад в вычислительную биологию. [1]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и Ковац, Диана; Шамир, Рон; Фогг, Кристиана (2019). «Премия ISCB Овертона 2019: Кристоф Дессимо» . F1000Исследования . 8 : 722. дои : 10.12688/f1000research.19220.1 . ISSN 2046-1402 . ПМК 6534074 . ПМИД 31164977 .
- ^ Перейти обратно: а б с Публикации Кристофа Дессимо, проиндексированные Google Scholar
- ^ Перейти обратно: а б Кристоф Дессимо в проекте «Математическая генеалогия»
- ^ Перейти обратно: а б Альтенхофф, Адриан М; Гловер, Наташа М; Поезд, Клеман-Мари; Калеб, Клара; Уорик Вестроци, Алекс; Дилус, Дэвид; де Фариас, Тарчизио М; Зиле, Карина; Стивенсон, Чарльз; Лонг, Цзяо; Редестиг, Хеннинг; Гонне, Гастон Х; Дессимо, Кристоф (2018). «База данных ортологии OMA в 2018 году: обнаружение эволюционных взаимосвязей между всеми сферами жизни с помощью более богатых веб- и программных интерфейсов» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д477–Д485. дои : 10.1093/нар/gkx1019 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 5753216 . ПМИД 29106550 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Дессимо, Кристоф (2019). «Лаборатория Десимоз» . lab.desimoz.org
- ^ Кристофа Дессимо Публикации из Европы PubMed Central
- ^ Публикации Кристофа Дессимо, индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Дессимо на Кристоф
- ^ Перейти обратно: а б Дессимо, Кристоф (2009). Сравнительная геномика с использованием попарных эволюционных расстояний . ethz.ch (кандидатская диссертация). ETH Цюрих. doi : 10.3929/ethz-a-005762050 . hdl : 20.500.11850/72801 . OCLC 935351416 .
- ^ Голдман, Ник; Бертоне, Пол; Чен, Сиюань; Дессимо, Кристоф; ЛеПруст, Эмили М.; Сипос, Ботонд; Бирни, Юэн (2013). «На пути к практичному, высокоемкому и не требующему особого обслуживания хранению информации в синтезированной ДНК» . Природа . 494 (7435): 77–80. Бибкод : 2013Natur.494...77G . дои : 10.1038/nature11875 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 3672958 . ПМИД 23354052 .
- ^ «Доктор Кристоф Дессимо» . ucl.ac.uk. Проверено 6 марта 2019 г.
- ^ Водак, Шошана ; Суннокер, Микаэль; Бусетто, Альберто Джованни; Нумминен, Элина; Корандер, Юкка; Фолль, Матье; Дессимоз, Кристоф (2013). «Приблизительное байесовское вычисление» . PLOS Вычислительная биология . 9 (1): e1002803. Бибкод : 2013PLSCB...9E2803S . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002803 . ISSN 1553-7358 . ПМЦ 3547661 . ПМИД 23341757 .
- ^ Анисимова, Мария; Гил, Мануэль; Дюфайяр, Жан-Франсуа; Дессимо, Кристоф; Гаскюэль, Оливье (2011). «Обзор методов поддержки ветвей демонстрирует точность, мощность и надежность схем быстрой аппроксимации, основанных на правдоподобии» . Систематическая биология . 60 (5): 685–699. дои : 10.1093/sysbio/syr041 . ISSN 1076-836X . ПМЦ 3158332 . ПМИД 21540409 .
- ^ Эйзен, Джонатан А .; Альтенхофф, Адриан М.; Дессимо, Кристоф (2009). «Филогенетическая и функциональная оценка проектов и методов вывода ортологов» . PLOS Вычислительная биология . 5 (1): e1000262. Бибкод : 2009PLSCB...5E0262A . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000262 . ISSN 1553-7358 . ПМК 2612752 . ПМИД 19148271 .
- ^ Аббош, Кристофер; Биркбак, Николай Дж.; Уилсон, Гарет А.; Джамал-Ханджани, Мариам; Константин, Тюдор; Салари, Рахеле; Ле Кен, Джон; Мур, Дэвид А.; Виерия, Сельвараджу; Розенталь, Рэйчел; Марафиоти, Тереза; и др. (2017). «Филогенетический анализ ктДНК показывает эволюцию рака легких на ранней стадии» . Природа . 545 (7655): 446–451. Бибкод : 2017Natur.545..446A . дои : 10.1038/nature22364 . ISSN 0028-0836 . ПМК 5812436 . ПМИД 28445469 .
- ^ Дессимо, Кристоф (2017). Дессимо, Кристоф; Шкунца, Нивес (ред.). Справочник по онтологии генов . Методы молекулярной биологии. Том. 1446. дои : 10.1007/978-1-4939-3743-1 . ISBN 9781493937431 . ISSN 1064-3745 . S2CID 3708801 .
- ^ Годе, Паскаль; Шкунца, Нивес; Ху, Джеймс С.; Дессимо, Кристоф (2017). «Букварь по онтологии генов». Справочник по онтологии генов . Методы молекулярной биологии. Том. 1446. стр. 25–37. дои : 10.1007/978-1-4939-3743-1_3 . ISBN 978-1-4939-3741-7 . ISSN 1064-3745 . ПМК 6377150 . ПМИД 27812933 .
