Зив Бар-Джозеф
Зив Бар-Джозеф | |
|---|---|
 Зив Бар-Джозеф выступает на ISMB в 2012 году. | |
| Рожденный | 1971 (52–53 года) [1] |
| Альма-матер |
|
| Награды | Премия Овертона (2012) |
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Учреждения | |
| Диссертация | Вывод о взаимодействиях, программах экспрессии и регуляторных сетях на основе биологических данных с высокой пропускной способностью (2003) |
| Докторантура | |
| Веб-сайт | www |
Зив Бар-Джозеф — израильский компьютерный биолог и профессор кафедры вычислительной биологии и машинного обучения Школы компьютерных наук Карнеги-Меллона . [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]
Образование
[ редактировать ]Бар-Джозеф изучал информатику на уровне бакалавра наук (1997 г.) и магистра наук (1999 г.) в Еврейском университете в Иерусалиме . Он получил докторскую степень по информатике в Массачусетском технологическом институте в 2003 году под руководством Дэвида К. Гиффорда и Томми С. Яакколы. [1] После этого он работал научным сотрудником в Лаборатории компьютерных наук и искусственного интеллекта Массачусетского технологического института (CSAIL) и Институте Уайтхеда . [11]
Исследовать
[ редактировать ]Исследования Бар-Джозефа в Карнеги-Меллоне в первую очередь сосредоточены на разработке вычислительных методов, позволяющих лучше понять взаимодействия и динамику сложных биологических систем, особенно систем, которые меняются со временем, таких как клеточный цикл . [3] [12]
В Массачусетском технологическом институте группа Бар-Джозефа разработала новый алгоритм для обнаружения регуляторных сетей генных модулей у дрожжей. Эти модули представляют собой группы генов, которые работают вместе, выполняя такие задачи, как дыхание, синтез белка и реакция на внешний стресс. [12] [13]
Его также интересует, как идеи информатики и биологии могут быть использованы для воздействия на другие области, в частности, как можно использовать природные алгоритмы для улучшения алгоритмов распределенных вычислений . [3] [14]
Награды и почести
[ редактировать ]Бар-Джозеф был награжден премией аспиранта DIMACS-Celera Genomics в области вычислительной молекулярной биологии и наградой NSF CAREER. [15] В 2012 году он был удостоен премии ISCB Овертона в знак признания его значительного и длительного вклада в вычислительную биологию . [16]
Он был сопредседателем конференции «Исследования в области вычислительной молекулярной биологии » (RECOMB) в 2009 и 2010 годах и вошел в состав правления журнала «Биоинформатика» в качестве заместителя редактора в 2013 году. [17]
Личная жизнь
[ редактировать ]Бар-Джозеф — заядлый бегун и пробежал несколько марафонов продолжительностью менее 3 часов. [3] [12] [16] Он живет в Питтсбурге и Шохаме с женой и тремя детьми. [12]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Бар-Джозеф, Зив (2003). Вывод о взаимодействиях, программах экспрессии и регуляторных сетях на основе биологических данных с высокой пропускной способностью (кандидатская диссертация). Массачусетский технологический институт. hdl : 1721.1/28289 .
- ^ «Открыли ли израильские ученые источник молодости?» . www.israel21c.org . Проверено 13 февраля 2014 г.
- ^ Jump up to: а б с д «Зив Бар-Джозеф» . www.cs.cmu.edu . Проверено 13 февраля 2014 г.
- ^ Ли, ТИ (2002). «Сети регуляции транскрипции у Saccharomyces cerevisiae». Наука . 298 (5594): 799–804. Бибкод : 2002Sci...298..799L . дои : 10.1126/science.1075090 . ПМИД 12399584 . S2CID 4841222 .
- ^ Бар-Джозеф, З. (2004). «Анализ данных экспрессии генов временных рядов» . Биоинформатика . 20 (16): 2493–2503. doi : 10.1093/биоинформатика/bth283 . ПМИД 15130923 .
- ^ Бар-Джозеф, публикации Зива, индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Зив Бар-Джозеф на DBLP библиографическом сервере
- ^ Публикации Зива Бар-Джозефа, индексированные Microsoft Academic
- ^ Зива Бар-Джозефа Страница профиля автора ACM. в цифровой библиотеке
- ^ Бар-Джозеф, З.; Эль-Янив, Р.; Лищинский, Д.; Верман, М. (2001). «Смешивание текстур и синтез текстурных фильмов с использованием статистического обучения». Транзакции IEEE по визуализации и компьютерной графике . 7 (2): 120. дои : 10.1109/2945.928165 .
- ^ «Зив Бар-Джозеф CV» (PDF) . Проверено 16 февраля 2014 г.
- ^ Jump up to: а б с д «Бегущий человек — Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона» . www.cs.cmu.edu . 23 августа 2011 г. Проверено 13 февраля 2014 г.
- ^ Бар-Джозеф, З.; Гербер, ГК; Ли, ТИ; Ринальди, Нью-Джерси; Йоу, Джей; Роберт, ФО; Гордон, Д.Б.; Френкель, Э.; Яаккола, ТС; Янг, РА; Гиффорд, ДК (2003). «Вычислительное открытие генных модулей и регуляторных сетей». Природная биотехнология . 21 (11): 1337–42. дои : 10.1038/nbt890 . ПМИД 14555958 . S2CID 6210576 .
- ^ «Алгоритмы в природе» . Проверено 21 февраля 2014 г.
- ^ «Резюме и биографии основных докладчиков» . www.iscb.org . ИСКБ . Проверено 16 февраля 2014 г.
- ^ Jump up to: а б Маллинз, Дж.; Моррисон Маккей, Би Джей (2012). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Гуннара фон Хейне и Зива Бар-Джозефа высшей награды в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2012 год» . PLOS Вычислительная биология . 8 (5): e1002535. Бибкод : 2012PLSCB...8E2535M . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002535 . ПМЦ 3364933 .
- ^ «Годовой отчет ISCB за 2013 год» . www.iscb.org . ИСКБ . Проверено 15 февраля 2014 г.
