Кертис Хаттенхауэр
Кертис Хаттенхауэр | |
---|---|
Рожденный | [9] | 18 июня 1981 г.
Альма-матер |
|
Награды | Премия Овертона (2015) [1] |
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | Гарвардский университет |
Диссертация | Анализ больших коллекций геномных данных (2009 г.) |
Докторантура | Olga Troyanskaya [8] |
Веб-сайт | Хаттенхауэр |
Кертис Хаттенхауэр – профессор вычислительной биологии и биоинформатики кафедры биостатистики Школы общественного здравоохранения университета Гарвардского . [7] [10] [11] [12]
Образование
[ редактировать ]Хаттенхауэр получил степень бакалавра в Технологическом институте Роуза-Халмана в 2000 году по специальности информатика, химия и математика. Затем он два года проработал разработчиком программного обеспечения в Microsoft , работая над платформой Microsoft Natural Language Development Platform. Хаттенхауэр получил степень магистра компьютерной лингвистики в Университете Карнеги-Меллона в 2003 году, где он учился у Дэнни Дюрана и Эрика Нюберга . В 2003 году Хаттенхауэр перешёл в Принстонский университет , где в 2008 году ему была присуждена степень доктора философии за исследования в области геномики под руководством Ольги Троянской . Его докторская диссертация называлась «Анализ больших коллекций геномных данных» . [1] [13]
Исследовать
[ редактировать ]Хаттенхауэр присоединился к Гарвардской школе общественного здравоохранения имени Т.Ч. Чана в 2009 году в качестве доцента кафедры вычислительной биологии и биоинформатики . [1] В 2013 году стал доцентом. [8] Лаборатория Хаттенхауэра активно сотрудничала с проектом NIH Human Microbiome Project (HMP), чтобы идентифицировать и охарактеризовать микроорганизмы, обнаруженные как у здоровых, так и у больных людей. [2] [3] [4] С 2015 года он является одним из руководителей одного из последующих центров HMP2 по изучению микробной экосистемы кишечника при воспалительных заболеваниях кишечника. [14]
Награды и почести
[ редактировать ]Хаттенхауэр получил награду NSF CAREER в 2010 году за исследования микробных сообществ. [8] [15] и был награжден Президентской премией за раннюю карьеру для ученых и инженеров в 2012 году. [16] В 2015 году Хаттенхауэр был удостоен премии Овертона. [1] от Международного общества вычислительной биологии . Его научный руководитель Ольга Троянская была удостоена той же премии в 2011 году. [17] Хаттенхауэр также является членом редакционной коллегии академических журналов Genome Biology , Microbiome и BMC Bioinformatics . [18] [19] [20]
Выберите публикации
[ редактировать ]- М. Росс; М. Наталия Гарсия; Вивьен Бонацци; и др. (14 июня 2012 г.). «Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека» . Природа . 486 (7402): 207–14. Бибкод : 2012Natur.486..207T . дои : 10.1038/NATURE11234 . ISSN 1476-4687 . ПМК 3564958 . ПМИД 22699609 . Викиданные Q24626370 .
- Никола Сегата; Жак Изар; Леви Уолдрон; Дирк Геверс; Лариса Миропольская; Венди С. Гарретт ; Кертис Хаттенхауэр (24 июня 2011 г.). «Открытие и объяснение метагеномных биомаркеров» . Геномная биология . 12 (6): 60 рандов. дои : 10.1186/GB-2011-12-6-R60 . ISSN 1465-6906 . ПМК 3218848 . ПМИД 21702898 . Викиданные Q35557728 . }}
- Морган Ланжилль; Джесси Заневельд; Дж. Грегори Капорасо; и др. (25 августа 2013 г.). «Прогнозирующее функциональное профилирование микробных сообществ с использованием последовательностей маркерного гена 16S рРНК» . Природная биотехнология . 31 (9): 814–821. дои : 10.1038/NBT.2676 . ISSN 1087-0156 . ПМК 3819121 . ПМИД 23975157 . Викиданные Q29615050 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Фогг, Кристиана Н.; Ковац, Дайан Э. (2015). «Премия ISCB Овертона 2015 года вручена Кертису Хаттенхауэру» . PLOS Вычислительная биология . 11 (6): e1004319. Бибкод : 2015PLSCB..11E4319F . дои : 10.1371/journal.pcbi.1004319 . ISSN 1553-7358 . ПМЦ 4466272 . ПМИД 26067840 .
- ^ Перейти обратно: а б Консорциум проекта микробиома человека; Геверс, Дирк; Найт, Роб; Абубакер, Сахар; Бэджер, Джонатан Х.; Чинвалла, Асиф Т.; Кризи, Хизер Х.; Эрл, Эшли М.; Фицджеральд, Майкл Г.; Фултон, Роберт С.; Джильо, Мишель Г .; Холлсворт-Пепин, Кимберли; Волки, Элизабет А.; Мадупу, Рамана; Грин, Винсент; Мартин, Джон К.; Митрева, Македония; Музный, Донна М.; Содергрен, Эрика Дж.; Версалович, Джеймс; Воллам, Ай М.; Уорли, Ким С.; Уортман, Дженнифер Р.; Янг, Сара К.; Цзэн, Цяньдун; Агаард, Кьерсти М.; Аболюд, химик О.; Аллен-Верко, Эмма ; Альм, Эрик Дж.; и др. (2012). «Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека» . Природа 486 (7402): 207–14. Бибкод : 2012Nature.486..207T . дои : 10.1038/nature11234 . ПМК 3564958 . ПМИД 22699609 .
- ^ Перейти обратно: а б Консорциум проекта микробиома человека; Нельсон, Карен Э.; Поп, Михай; Кризи, Хизер Х.; Джильо, Мишель Г.; Хаттенхауэр, Кертис; Геверс, Дирк; Петрозино, Джозеф Ф.; Абубакер, Сахар; Бэджер, Джонатан Х.; Чинвалла, Асиф Т.; Эрл, Эшли М.; Фицджеральд, Майкл Г.; Фултон, Роберт С.; Холлсворт-Пепин, Кимберли; Лобос, Элизабет А.; Мадупу, Рамана; Магрини, Винсент; Мартин, Джон К.; Митрева, Македонка; Музный, Донна М.; Содергрен, Эрика Дж.; Версалович, Джеймс; Воллам, Ай М.; Уорли, Ким С.; Уортман, Дженнифер Р.; Янг, Сара К.; Цзэн, Цяньдун; Агаард, Кьерсти М.; и др. (2012). «Основы исследования микробиома человека» . Природа . 486 (7402): 215–21. Бибкод : 2012Natur.486..215T . дои : 10.1038/nature11209 . ПМЦ 3377744 . ПМИД 22699610 .
- ^ Перейти обратно: а б Абубакер, С; Сегата, Н.; Голл, Дж; Шуберт, AM; Изард, Дж; Кантарель, БЛ; Родригес-Мюллер, Б; Цукер, Дж; Тиагараджан, М; Генриссат, Б; Уайт, О; Келли, ST; Мете, Б; Шлосс, PD; Геверс, Д; Митрева, М; Хаттенхауэр, К. (2012). «Метаболическая реконструкция метагеномных данных и ее применение к микробиому человека» . PLOS Вычислительная биология . 8 (6): e1002358. Бибкод : 2012PLSCB...8E2358A . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002358 . ПМЦ 3374609 . ПМИД 22719234 .
- ^ Хаттенхауэр, К; Мутунгу, Коннектикут; Индик, Н; Ян, В; Шредер, М; Форман, Джей-Джей; Троянская, О.Г.; Коллер, ХА (2009). «Детализация сетей регулирования посредством крупномасштабной интеграции данных» . Биоинформатика . 25 (24): 3267–74. doi : 10.1093/биоинформатика/btp588 . ПМЦ 2788929 . ПМИД 19825796 .
- ^ Хаттенхауэр, К; Хофманн, О (2010). «Краткое руководство по крупномасштабному анализу геномных данных» . PLOS Вычислительная биология . 6 (5): e1000779. Бибкод : 2010PLSCB...6E0779H . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000779 . ПМЦ 2877728 . ПМИД 20523745 .
- ^ Перейти обратно: а б Публикации Кертиса Хаттенхауэра , индексируемые Google Scholar
- ^ Перейти обратно: а б с «Резюме Кертиса Хаттенхауэра» (PDF) . huttenhower.org. 2015. Архивировано из оригинала (PDF) 02 марта 2015 г.
- ^ Хаттенхауэр, Кертис, 1981- , Библиотека Конгресса.
- ^ Чи, А; Хаттенхауэр, К; Гир, Л.Ю.; Кун, Джей-Джей; Сика, JE; Бай, ДЛ; Шабановиц, Дж; Берк, диджей; Троянская, О.Г.; Хант, Д.Ф. (2007). «Анализ сайтов фосфорилирования белков Saccharomyces cerevisiae методом масс-спектрометрии диссоциации с переносом электрона (ETD)» . Труды Национальной академии наук . 104 (7): 2193–8. Бибкод : 2007PNAS..104.2193C . дои : 10.1073/pnas.0607084104 . ПМК 1892997 . ПМИД 17287358 .
- ^ Хаттенхауэр, К; Найт, Р; Браун, Коннектикут; Капорасо, Дж.Г.; Клементе, Дж. К.; Геверс, Д; Францоза, Э.А.; Келли, ST; Найтс, Д; Лей, RE; Махуркар, А; Равель, Дж; Ученые за развитие исследований микробиома; Уайт, О (2014). «Развитие сообщества исследователей микробиома» . Клетка . 159 (2): 227–30. дои : 10.1016/j.cell.2014.09.022 . ПМК 4221798 . ПМИД 25303518 .
- ^ Публикации Кертиса Хаттенхауэра , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Хаттенхауэр, Кертис (2009). Анализ больших коллекций геномных данных (кандидатская диссертация). Принстонский университет. OCLC 298182845 .
- ^ «Дом - Кертис Хаттенхауэр - Гарвардская школа общественного здравоохранения им. Т.Ч. Чана» . www.hsph.harvard.edu . Проверено 4 августа 2015 г.
- ^ «Кёртис Хаттенхауэр получает высшую награду младшего факультета биоинформатики» . hsph.harvard.edu . 11 февраля 2015 г. Проверено 4 августа 2015 г.
- ^ «Президент Обама чествует молодых ученых и инженеров - NSF - Национальный научный фонд» . www.nsf.gov . Проверено 4 августа 2015 г.
- ^ Маллинз, Джастин; Моррисон Маккей, BJ (2 июня 2011 г.). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Майкла Эшбернера и Ольги Троянской высшей награды в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2011 год» . PLOS Вычислительная биология . 7 (6): e1002081. Бибкод : 2011PLSCB...7E2081M . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002081 . ПМК 3107244 .
- ^ «Геномная биология – Редколлегия» . www.genomebiology.com . Проверено 4 августа 2015 г.
- ^ «Микробиом – Редколлегия» . www.microbiomejournal.com . Проверено 4 августа 2015 г.
- ^ «Биоинформатика БМК – Редколлегия» . www.biomedcentral.com . Проверено 4 августа 2015 г.