Дана Пеэр

Дана Пеэр
Дана Пеэр
	Дана Пеэр
Рожденный	1971 (52–53 года)
Альма-матер	Еврейский университет Иерусалима
Супруг	Ицик Пеер
Дети	Инбар, Кармель
Награды	Сотрудник Паккарда (2009) ; Премия Овертона (2014) ;
	Научная карьера
Поля	Биология ; Вычислительная биология ; Системная биология
Учреждения	Гарвардская медицинская школа ; Колумбийский университет ; Мемориальный онкологический центр Слоана-Кеттеринга
Диссертация	От экспрессии генов к молекулярным путям (2003)
Докторантура	Нир Фридман
Другие научные консультанты	Джордж М. Черч

Дана Пеер (1971 г.р.), председатель и профессор программы вычислительной и системной биологии в Институте Слоана Кеттеринга, исследователь в области вычислительной системной биологии. Исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI) с 2021 года. Ранее она была профессором Колумбийского университета факультета биологических наук . Исследования Пеера сосредоточены на понимании организации, функций и эволюции молекулярных сетей, в частности, на том, как генетические вариации изменяют регуляторную сеть и как эти генетические вариации могут вызывать рак.

Ранняя жизнь и образование

Пеер родился в Израиле. ^{[ 7 ]} Ее муж, Ицик Пеер , работает компьютерным биологом в Колумбийском университете. Вместе они воспитали двух дочерей. ^{[ 4 ]}

Пеер получил степень бакалавра математики в 1995 году, а также степень магистра в 1999 году и степень доктора компьютерных наук в 2003 году в Еврейском университете Иерусалима . Она получила степень магистра под руководством Ави Видгерсона и защитила докторскую диссертацию в лаборатории Нира Фридмана . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Впоследствии она работала над докторской диссертацией у Джорджа Чёрча в Гарварде . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Ее стипендия была сосредоточена на том, как генетическая изменчивость меняет регуляторную сеть между людьми и как это впоследствии проявляется в фенотипическом разнообразии. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Карьера

В 2006 году Пеер основал исследовательскую группу на факультете биологических наук и системной биологии Колумбийского университета . Группа Пеера в Колумбии разработала вычислительные методы, которые объединяют различные источники данных высокопроизводительной геномики с целью разработки целостного представления о клетке на системном уровне. ^{[ 14 ]}

В 2016 году Пеер присоединился к Институту Слоана Кеттеринга в Нью-Йорке. ^{[ 15 ]} находясь в Слоане, Пеэр был выбран исследователем Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI) . В сентябре 2021 года, ^{[ 16 ]}

Пеер также участвует в создании Атласа клеток легких человека в качестве члена организационного комитета, сопредседателя рабочей группы по анализу и члена инициативы «Атлас клеток легких человека», а также входит в состав научно-консультативного совета scverse. ^{[ 17 ]}

Исследовать

В своей докторской работе Пеер продемонстрировала, что байесовские сети могут описывать взаимодействия между тысячами генов, что позволяет анализировать данные с недавно доступных микрочипов ДНК , которые генерируют тысячи шумных измерений экспрессии генов. ^{[ 18 ]} Этот подход широко применяется к данным секвенирования в масштабе генома. В своей постдокторской работе она использовала эту структуру для изучения сигнальных сетей белков в данных многомерной проточной цитометрии . ^{[ 19 ]}

В Колумбии Пеер применил байесовские сети для интеграции различных типов данных для изучения сетей регуляции генов , определяя, как изменение последовательности ДНК меняет регуляцию экспрессии генов, с целью создания персонализированной медицины . ^{[ 20 ]}

Исследовательская группа Пеера разработала серию методов высокопроизводительного анализа данных отдельных клеток, первоначально для работы с новым многомерным типом данных, полученным с помощью массовой цитометрии , которая количественно определяет несколько десятков белков на клетку для миллионов клеток при время. Они представили применение нелинейного уменьшения размерности с помощью t-распределенного стохастического встраивания соседей (t-SNE) для визуализации данных многомерного секвенирования одноклеточной РНК. ^{[ 21 ]} и использование графа ближайших соседей для представления множества данных о состояниях клеток, определяемых РНК. ^{[ 22 ]} Группа Пеера использовала эту формализацию для идентификации дискретных типов ячеек или состояний клеток, применив метод обнаружения сообщества Лувена к кластерным данным. ^{[ 23 ]} и продемонстрировали, что клетки могут быть упорядочены по траекториям дифференцировки из отдельных образцов из-за асинхронности клеток, обнаруженных в образцах тканей. ^{[ 22 ]} Моделируя траектории как марковский процесс, они показали, что клеткам можно присвоить вероятности достижения любой заданной конечной судьбы на траектории. ^{[ 24 ]} В 2020 году группы Пеера и Фабиана Тейса представили CellRank, алгоритм, который раскрывает клеточную динамику путем объединения траекторий, основанных на сходстве клеток с информацией о локальной скорости РНК, который идентифицирует зарождающиеся состояния транскрипции по соотношению сплайсированных и несплайсированных РНК. стенограммы. ^{[ 25 ]}

Пеер применяет эти методы для моделирования биологических вопросов, касающихся клеточной пластичности и фенотипических вариаций отдельных клеток при раке, биологии развития и иммунологии, включая микроокружение опухоли . ^{[ 26 ]} метастазы ^{[ 26 ]} и реакции на такое лечение, как иммунотерапия . «Мы начинаем понимать, что пластичность является ключевым признаком рака», — сказал доктор Пеер. «Именно пластичность раковой клетки позволяет ей совершать такие изменения, чтобы выжить».

Принимая премию Овертона Международного общества вычислительной биологии в 2014 году, Пеер сказал: «Математика строга, а биология запутана, поэтому задача состоит в том, чтобы найти закономерность в беспорядке, а машинное обучение предоставляет мощный набор инструментов». ^{[ 13 ]}

Избранные публикации

Фридман, Нир; Линиал, Михал; Нахман, Ифтах; Пеэр, Дана (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных экспрессии». Журнал вычислительной биологии . 7 (3–4): 601–620. дои : 10.1089/106652700750050961 . ПМИД 11108481 .
Сакс, Карен; Перес, Омар; Пе'Эр, Дана; Лауффенбургер, Дуглас А.; Нолан, Гарри П. (2005). «Причинные белковые сигнальные сети, полученные на основе многопараметрических одноклеточных данных». Наука . 308 (5721): 523–529. Бибкод : 2005Sci...308..523S . дои : 10.1126/science.1105809 . ПМИД 15845847 . S2CID 8160280 .
Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир Эль-ад Давид; Тадмор, Мишель Д.; Саймондс, Эрин Ф.; Чен, Тиффани Дж.; Шенфельд, Дэниел К.; Нолан, Гарри П.; Пеэр, Дана (2014). «Обнаружение траектории одиночных клеток раскрывает прогресс и регуляторную координацию в развитии B-клеток человека» . Клетка . 157 (3): 714–725. дои : 10.1016/j.cell.2014.04.005 . ПМК 4045247 . ПМИД 24766814 .
Левин, Джейкоб Х.; Саймондс, Эрин Ф.; Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир, Эль-ад Д.; Тадмор, Мишель Д.; Литвин, Орен; Финберг, Харрис Г.; Ягер, Астрея; Зундер, Эли Р.; Финк, Рэйчел; Гедман, Аманда Л.; Радтке, Ина; Даунинг, Джеймс Р.; Пе'Эр, Дана; Нолан, Гарри П. (2015). «Фенотипическое исследование ОМЛ на основе данных выявляет клетки-предшественники, которые коррелируют с прогнозом» . Клетка . 162 (1): 184–197. дои : 10.1016/j.cell.2015.05.047 . ПМЦ 4508757 . ПМИД 26095251 . S2CID 11608684 .
Азизи, Эльхам; Карр, Эмброуз Дж.; Плитас, Джордж; Корниш, Эндрю Э.; Конопацкий, Екатерина; Прабхакаран, Сандхья; Найнис, Юозас; Ву, Кенмин; Киселёвас, Вайдотас; Сетти, Ману; Чой, Кристи; Фромм, Рэйчел М.; Дао, Фуонг; Маккенни, Питер Т.; Васти, Руби С.; Кадаверу, Кришна; Мазутис, Линас; Руденский, Александр Юрьевич; Пеэр, Дана (2018). «Одноклеточная карта разнообразных иммунных фенотипов в микроокружении опухоли молочной железы» . Клетка . 174 (5): 1293–1308.e36. дои : 10.1016/j.cell.2018.05.060 . ПМК 6348010 . ПМИД 29961579 .
Новочин, Соня; Сетти, Ману; Куо, Ин-И; Лю, Винсент; Гарг, Видур; Шарма, Рошан; Саймон, Клэр С.; Саиз, Нестор; Гарднер, Руи; Буте, Стефан К.; Черч, Дина М.; Худлесс, Памела А.; Хаджантонакис, Анна-Катерина; Пеэр, Дана (2019). «Новый ландшафт энтодермы кишечника мыши при разрешении отдельных клеток» . Природа . 569 (7756): 361–367. Бибкод : 2019Natur.569..361N . дои : 10.1038/s41586-019-1127-1 . ПМК 6724221 . ПМИД 30959515 .
Лони, Эшли М.; Ху, Цзин; Кэмпбелл, Натаниэль Р.; Бахум, Сэмюэл Ф.; Сетти, Ману; Лавалле, Винсент-Филипп; Се, Юбин; Масилионис, Игнас; Карр, Эмброуз Дж.; Коттапалли, Санджай; Алладж, Виола; Материя, Марисса; Рехтман, Наташа; Ксавье, Джон Б.; Мазутис, Линас; Пуарье, Джон Т.; Рудин, Чарльз М.; Пеэр, Дана; Массаге, Джоан (2020). «Регенеративные линии и иммуноопосредованная обрезка при метастазах рака легких» . Природная медицина . 26 (2): 259–269. дои : 10.1038/ s41591-019-0750-6 ПМК 7021003 . ПМИД 32042191 .
Фридман, Н.; Линиал, М.; Нахман, И.; Пеер, Д. (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных экспрессии». Журнал вычислительной биологии . 7 (3–4): 601–620. CiteSeerX 10.1.1.191.139 . дои : 10.1089/106652700750050961 . ПМИД 11108481 .
Сигал, Э.; Шапира, М.; Регев, А.; Пеер, Д.; Ботштейн, Д.; Коллер, Д.; Фридман, Н. (2003). «Сети модулей: идентификация регуляторных модулей и их регуляторов, зависящих от состояния, на основе данных об экспрессии генов». Природная генетика . 34 (2): 166–176. дои : 10.1038/ng1165 . ПМИД 12740579 . S2CID 6146032 .
Сакс, К.; Перес, О; Пе'Эр, Д; Лауффенбургер, Д.А.; Нолан, врач общей практики (2005). «Причинные белковые сигнальные сети, полученные на основе многопараметрических одноклеточных данных». Наука . 308 (5721): 523–9. Бибкод : 2005Sci...308..523S . дои : 10.1126/science.1105809 . ПМИД 15845847 . S2CID 8160280 .
Бендалл, Южная Каролина; Саймондс, Э.Ф.; Цю, П.; Амир, Э.-А.Д.; Круцик, П.О.; Финк, Р.; Бруггнер, Р.В.; Меламед Р.; Трехо, А.; Орнатский О.И.; Бальдерас, РС; Плевритис, СК; Сакс, К.; Пе'Эр, Д.; Таннер, SD; Нолан, врач общей практики (2011). «Одноклеточная массовая цитометрия дифференциальных иммунных реакций и реакций на лекарства в кроветворном континууме человека» . Наука . 332 (6030): 687–696. Бибкод : 2011Sci...332..687B . дои : 10.1126/science.1198704 . ПМЦ 3273988 . ПМИД 21551058 .

Членство

Редакционно-консультативный совет Cell ^{[ 27 ]}
Организационный комитет Атласа клеток человека и сопредседатель рабочей группы по анализу ^{[ 28 ]}
EMBL Научно-консультативный комитет ^{[ 29 ]}
ISREC - Научно-консультативный совет EPFL ^{[ 30 ]}
Национальный консультативный комитет благотворительных фондов Pew , Программа биомедицинских ученых Pew ^{[ 31 ]}
Член Международного общества вычислительной биологии ^{[ 32 ]}
Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI) Следователь ^{[ 33 ]}
Член исследования рака. Американской ассоциации академии ^{[ 34 ]}

Награды

Известные женщины в сфере здравоохранения по версии Crain, 2019 г. ^{[ 35 ]}
2019 г. Эрнста В. Бертнера Премия Мемориала ^{[ 36 ]}
2014 г. НИЗ Премия пионера директора ^{[ 37 ]}
2014 г. Премия ISCB Овертона ^{[ 38 ]}
2012 г. Премия RECOMB " Испытание временем" ^{[ 39 ]}
Грант 2011 г. «Противостояние инновационным исследованиям рака» ^{[ 40 ]}
2009 г. Стипендия Packard в области науки и техники ^{[ 41 ]}
2007 г. НИЗ Премия нового новатора директора ^{[ 4 ]}
Премия за карьеру 2005 года в журнале Interface of Science, Фонд Берроуза Wellcome ^{[ 42 ]}
2023 г. Премия ISCB Innovator ^{[ 43 ]}

Ссылки

^ Фогг, Кристиана Н.; Ковац, Дайан Э. (2014). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Дану Пеер высшей награды в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2014 год» . PLOS Вычислительная биология . 10 (6): e1003682. Бибкод : 2014PLSCB..10E3682F . дои : 10.1371/journal.pcbi.1003682 . ПМЦ 4063598 . ПМИД 24945496 .
^ «98109969» .
^ «Дана Пеэр — Домашняя страница» . Архивировано из оригинала 29 июня 2010 года . Проверено 8 февраля 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с О, Клэр (20 сентября 2007 г.). «Колумбийские новости» . Новости Колумбии . Архивировано из оригинала 23 февраля 2014 года . Проверено 20 апреля 2023 г.
^ «TEDxYouth@TheSchool — Искра! — TEDx — TED.com» . www.ted.com . Проверено 8 февраля 2014 г.
^ «Дана Пеэр - Генеалогия» . www.geni.com . Проверено 19 июля 2014 г.
^ Ронель, Асаф (29 сентября 2019 г.). «Проект по картированию всех клеток человека изменит способы лечения болезней» . Гаарец . Проверено 22 марта 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Биографии исследователей, получивших гранты на инновационные исследования 2011 г.» . www.aacr.org . Архивировано из оригинала 22 февраля 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Дана Пеер - Диссертация» . Архивировано из оригинала 28 октября 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б Ли, СИ; Пе'Эр, Д; Дадли, AM; Черч, генеральный директор; Коллер, Д. (2006). «Идентификация регуляторных механизмов с использованием индивидуальных вариаций раскрывает ключевую роль модификации хроматина» . Труды Национальной академии наук . 103 (38): 14062–7. Бибкод : 2006PNAS..10314062L . дои : 10.1073/pnas.0601852103 . ПМЦ 1599912 . ПМИД 16968785 .
^ Ли, СИ; Пе'Эр, Д; Дадли, AM; Черч, генеральный директор; Коллер, Д. (2006). «Идентификация регуляторных механизмов с использованием индивидуальных вариаций раскрывает ключевую роль модификации хроматина» . Труды Национальной академии наук . 103 (38): 14062–7. Бибкод : 2006PNAS..10314062L . дои : 10.1073/pnas.0601852103 . ПМЦ 1599912 . ПМИД 16968785 .
^ «GET:: Признаки геномов и окружающей среды» . www.getconference.org . Проверено 8 февраля 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Биографии исследователей, получивших гранты на инновационные исследования 2011 г.» . www.aacr.org . Архивировано из оригинала 22 февраля 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.
^ «Центр вычислительной биологии и биоинформатики (C2B2) | Кафедра системной биологии Колумбийского университета» . systembiology.columbia.edu . Проверено 14 февраля 2023 г.
^ «Известные женщины в сфере здравоохранения - Дана Пеер» . Нью-йоркский бизнес Крэйна . 2019-08-02 . Проверено 14 февраля 2023 г.
^ «HHMI инвестирует 300 миллионов долларов в 33 новых следователя» . ХХМИ . Проверено 14 февраля 2023 г.
^ "Привет, мир" . scverse.org . 17 мая 2022 г. Проверено 14 февраля 2023 г.
^ Фридман, Н.; Линиал, М.; Нахман, И.; Пеер, Д. (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных о выражениях» . Журнал вычислительной биологии: журнал вычислительной молекулярно-клеточной биологии . 7 (3–4): 601–620. дои : 10.1089/106652700750050961 . ISSN 1066-5277 . ПМИД 11108481 .
^ Сакс, Карен; Перес, Омар; Пеэр, Дана; Лауффенбургер, Дуглас А.; Нолан, Гарри П. (22 апреля 2005 г.). «Причинные белковые сигнальные сети, полученные на основе многопараметрических данных об отдельных клетках» . Наука . 308 (5721): 523–529. Бибкод : 2005Sci...308..523S . дои : 10.1126/science.1105809 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 15845847 . S2CID 8160280 .
^ Санчес-Гарсия, Феликс; Вильяграса, Патрисия; Мацуи, Дзюнджи; Котляр, Дилан; Кастро, Вероника; Акавиа, Ури-Давид; Чен, Бо Цзюэнь; Сауседо-Куэвас, Лаура; Родригес Барруэко, Рут; Льобет-Навас, Дэвид; Сильва, Хосе М.; Пеэр, Дана (04 декабря 2014 г.). «Интеграция геномных данных позволяет избирательно обнаруживать причины рака молочной железы» . Клетка . 159 (6): 1461–1475. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.048 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4258423 . ПМИД 25433701 .
^ Амир Эль-ад Давид; Дэвис, Кара Л.; Тадмор, Мишель Д.; Саймондс, Эрин Ф.; Левин, Джейкоб Х.; Бендалл, Шон К.; Шенфельд, Дэниел К.; Кришнасвами, Смита; Нолан, Гарри П.; Пеер, Дана (июнь 2013 г.). «viSNE позволяет визуализировать многомерные данные об отдельных клетках и выявляет фенотипическую гетерогенность лейкемии» . Природная биотехнология . 31 (6): 545–552. дои : 10.1038/nbt.2594 . ISSN 1546-1696 . ПМК 4076922 . ПМИД 23685480 .
^ Jump up to: ^а ^б Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир Эль-Ад Давид; Тадмор, Мишель Д.; Саймондс, Эрин Ф.; Чен, Тиффани Дж.; Шенфельд, Дэниел К.; Нолан, Гарри П.; Пеер, Дана (24 апреля 2014 г.). «Обнаружение траектории одиночных клеток выявляет прогрессирование и регуляторную координацию развития B-клеток человека» . Клетка . 157 (3): 714–725. дои : 10.1016/j.cell.2014.04.005 . ISSN 1097-4172 . ПМК 4045247 . ПМИД 24766814 .
^ Левин, Джейкоб Х.; Саймондс, Эрин Ф.; Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир, Эль-ад Д.; Тадмор, Мишель Д.; Литвин, Орен; Финберг, Харрис Г.; Ягер, Астрея; Зундер, Эли Р.; Финк, Рэйчел; Гедман, Аманда Л.; Радтке, Ина; Даунинг, Джеймс Р.; Пеер, Дана (2 июля 2015 г.). «Фенотипическое исследование ОМЛ на основе данных выявляет клетки-предшественники, которые коррелируют с прогнозом» . Клетка . 162 (1): 184–197. дои : 10.1016/j.cell.2015.05.047 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4508757 . ПМИД 26095251 .
^ Сетти, Ману; Киселёвас, Вайдотас; Левин, Джейкоб; Гайосо, Адам; Мазутис, Линас; Пеер, Дана (апрель 2019 г.). «Характеристика вероятностей судьбы клеток в данных об отдельных клетках с помощью Palantir» . Природная биотехнология . 37 (4): 451–460. дои : 10.1038/s41587-019-0068-4 . ISSN 1546-1696 . ПМЦ 7549125 . ПМИД 30899105 .
^ Ланге, Мариус; Берген, Волкер; Кляйн, Михал; Сетти, Ману; Рейтер, Бернхард; Бахти, Мостафа; Ликерт, Хейко; Ансари, Мешаль; Шниринг, Джанин; Шиллер, Герберт Б.; Пеэр, Дана; Тайс, Фабиан Дж. (февраль 2022 г.). «CellRank для направленного картирования судеб отдельных клеток» . Природные методы . 19 (2): 159–170. дои : 10.1038/s41592-021-01346-6 . ISSN 1548-7105 . ПМЦ 8828480 . ПМИД 35027767 .
^ Jump up to: ^а ^б Новочин, Соня; Сетти, Ману; Куо, Ин-И; Лю, Винсент; Гарг, Видур; Шарма, Рошан; Саймон, Клэр С.; Саиз, Нестор; Гарднер, Руи; Буте, Стефан К.; Черч, Дина М.; Худлесс, Памела А.; Хаджантонакис, Анна-Катерина; Пеер, Дана (май 2019 г.). «Новый ландшафт энтодермы кишечника мыши при разрешении отдельных клеток» . Природа . 569 (7756): 361–367. Бибкод : 2019Natur.569..361N . дои : 10.1038/s41586-019-1127-1 . ISSN 1476-4687 . ПМК 6724221 . ПМИД 30959515 .
^ «Редакция: Ячейка» . www.cell.com . Проверено 18 января 2022 г.
^ «Управление» . www.humancellatlas.org . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Научно-консультативный комитет – Совет EMBL» . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ "О нас" . ЭПФЛ . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Подробности программы» . pew.org . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «2 марта 2021 г.: ISCB поздравляет и представляет класс стипендиатов 2021 года!» . www.iscb.org . Проверено 17 июня 2022 г.
^ «HHMI инвестирует 300 миллионов долларов в 33 новых следователя» . ХХМИ . Проверено 23 сентября 2021 г.
^ «AACR объявляет членов класса Академии AACR 2023 года и нового президента Академии AACR» . Американская ассоциация исследований рака (AACR) . Проверено 1 апреля 2024 г.
^ «Выдающиеся женщины в здравоохранении 2019» . Нью-йоркский бизнес Крэйна . 23 июля 2019 г. Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Дана Пеер из Института Слоана Кеттеринга назначена исследователем Медицинского института Говарда Хьюза | Мемориальный онкологический центр Слоана Кеттеринга» . www.mskcc.org . 23 сентября 2021 г. Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Программа награждения пионеров директора НИЗ — лауреаты премии 2014 г.» . commonfund.nih.gov . 18 сентября 2018 г. Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «24 января 2014 г.: Джин Майерс и Дана Пеер названы лауреатами премии ISCB 2014 года» . www.iscb.org . ИСКБ . Проверено 8 февраля 2014 г.
^ «РЕКОМБ Награды» . Серия конференций RECOMB . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Stand Up To Cancer награждает следующий раунд грантов на инновационные исследования - Институт рака Даны-Фарбер | Бостон, Массачусетс» . www.dana-farber.org . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Дана Пеер – Фонд Паккарда» . www.packard.org . Проверено 8 февраля 2014 г.
^ «Дана Пеер из Института Слоана Кеттеринга назначена исследователем Медицинского института Говарда Хьюза» . ЭврекАлерт! . Проверено 5 декабря 2022 г.
^ «Премия новатора ISCB» . www.iscb.org . Проверено 1 апреля 2024 г.

Внешние ссылки

[1] Фогг, Кристиана Н.; Ковац, Дайан Э. (2014). «Международное общество вычислительной биологии удостоило Дану Пеер высшей награды в области биоинформатики/вычислительной биологии за 2014 год» . PLOS Вычислительная биология . 10 (6): e1003682. Бибкод : 2014PLSCB..10E3682F . дои : 10.1371/journal.pcbi.1003682 . ПМЦ 4063598 . ПМИД 24945496 .

[2] «98109969» .

[harvard-home-3] «Дана Пеэр — Домашняя страница» . Архивировано из оригинала 29 июня 2010 года . Проверено 8 февраля 2014 г.

[:1-4] Jump up to: ^а ^б ^с О, Клэр (20 сентября 2007 г.). «Колумбийские новости» . Новости Колумбии . Архивировано из оригинала 23 февраля 2014 года . Проверено 20 апреля 2023 г.

[ted-5] «TEDxYouth@TheSchool — Искра! — TEDx — TED.com» . www.ted.com . Проверено 8 февраля 2014 г.

[6] «Дана Пеэр - Генеалогия» . www.geni.com . Проверено 19 июля 2014 г.

[7] Ронель, Асаф (29 сентября 2019 г.). «Проект по картированию всех клеток человека изменит способы лечения болезней» . Гаарец . Проверено 22 марта 2023 г.

[aacr2-8] Jump up to: ^а ^б «Биографии исследователей, получивших гранты на инновационные исследования 2011 г.» . www.aacr.org . Архивировано из оригинала 22 февраля 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.

[thesis-abstract-9] Jump up to: ^а ^б «Дана Пеер - Диссертация» . Архивировано из оригинала 28 октября 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.

[:2-10] Jump up to: ^а ^б Ли, СИ; Пе'Эр, Д; Дадли, AM; Черч, генеральный директор; Коллер, Д. (2006). «Идентификация регуляторных механизмов с использованием индивидуальных вариаций раскрывает ключевую роль модификации хроматина» . Труды Национальной академии наук . 103 (38): 14062–7. Бибкод : 2006PNAS..10314062L . дои : 10.1073/pnas.0601852103 . ПМЦ 1599912 . ПМИД 16968785 .

[11] Ли, СИ; Пе'Эр, Д; Дадли, AM; Черч, генеральный директор; Коллер, Д. (2006). «Идентификация регуляторных механизмов с использованием индивидуальных вариаций раскрывает ключевую роль модификации хроматина» . Труды Национальной академии наук . 103 (38): 14062–7. Бибкод : 2006PNAS..10314062L . дои : 10.1073/pnas.0601852103 . ПМЦ 1599912 . ПМИД 16968785 .

[get-12] «GET:: Признаки геномов и окружающей среды» . www.getconference.org . Проверено 8 февраля 2014 г.

[aacr-13] Jump up to: ^а ^б «Биографии исследователей, получивших гранты на инновационные исследования 2011 г.» . www.aacr.org . Архивировано из оригинала 22 февраля 2014 года . Проверено 9 февраля 2014 г.

[14] «Центр вычислительной биологии и биоинформатики (C2B2) | Кафедра системной биологии Колумбийского университета» . systembiology.columbia.edu . Проверено 14 февраля 2023 г.

[15] «Известные женщины в сфере здравоохранения - Дана Пеер» . Нью-йоркский бизнес Крэйна . 2019-08-02 . Проверено 14 февраля 2023 г.

[16] «HHMI инвестирует 300 миллионов долларов в 33 новых следователя» . ХХМИ . Проверено 14 февраля 2023 г.

[17] "Привет, мир" . scverse.org . 17 мая 2022 г. Проверено 14 февраля 2023 г.

[18] Фридман, Н.; Линиал, М.; Нахман, И.; Пеер, Д. (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных о выражениях» . Журнал вычислительной биологии: журнал вычислительной молекулярно-клеточной биологии . 7 (3–4): 601–620. дои : 10.1089/106652700750050961 . ISSN 1066-5277 . ПМИД 11108481 .

[19] Сакс, Карен; Перес, Омар; Пеэр, Дана; Лауффенбургер, Дуглас А.; Нолан, Гарри П. (22 апреля 2005 г.). «Причинные белковые сигнальные сети, полученные на основе многопараметрических данных об отдельных клетках» . Наука . 308 (5721): 523–529. Бибкод : 2005Sci...308..523S . дои : 10.1126/science.1105809 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 15845847 . S2CID 8160280 .

[20] Санчес-Гарсия, Феликс; Вильяграса, Патрисия; Мацуи, Дзюнджи; Котляр, Дилан; Кастро, Вероника; Акавиа, Ури-Давид; Чен, Бо Цзюэнь; Сауседо-Куэвас, Лаура; Родригес Барруэко, Рут; Льобет-Навас, Дэвид; Сильва, Хосе М.; Пеэр, Дана (04 декабря 2014 г.). «Интеграция геномных данных позволяет избирательно обнаруживать причины рака молочной железы» . Клетка . 159 (6): 1461–1475. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.048 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4258423 . ПМИД 25433701 .

[21] Амир Эль-ад Давид; Дэвис, Кара Л.; Тадмор, Мишель Д.; Саймондс, Эрин Ф.; Левин, Джейкоб Х.; Бендалл, Шон К.; Шенфельд, Дэниел К.; Кришнасвами, Смита; Нолан, Гарри П.; Пеер, Дана (июнь 2013 г.). «viSNE позволяет визуализировать многомерные данные об отдельных клетках и выявляет фенотипическую гетерогенность лейкемии» . Природная биотехнология . 31 (6): 545–552. дои : 10.1038/nbt.2594 . ISSN 1546-1696 . ПМК 4076922 . ПМИД 23685480 .

[Bendall_714–725-22] Jump up to: ^а ^б Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир Эль-Ад Давид; Тадмор, Мишель Д.; Саймондс, Эрин Ф.; Чен, Тиффани Дж.; Шенфельд, Дэниел К.; Нолан, Гарри П.; Пеер, Дана (24 апреля 2014 г.). «Обнаружение траектории одиночных клеток выявляет прогрессирование и регуляторную координацию развития B-клеток человека» . Клетка . 157 (3): 714–725. дои : 10.1016/j.cell.2014.04.005 . ISSN 1097-4172 . ПМК 4045247 . ПМИД 24766814 .

[23] Левин, Джейкоб Х.; Саймондс, Эрин Ф.; Бендалл, Шон К.; Дэвис, Кара Л.; Амир, Эль-ад Д.; Тадмор, Мишель Д.; Литвин, Орен; Финберг, Харрис Г.; Ягер, Астрея; Зундер, Эли Р.; Финк, Рэйчел; Гедман, Аманда Л.; Радтке, Ина; Даунинг, Джеймс Р.; Пеер, Дана (2 июля 2015 г.). «Фенотипическое исследование ОМЛ на основе данных выявляет клетки-предшественники, которые коррелируют с прогнозом» . Клетка . 162 (1): 184–197. дои : 10.1016/j.cell.2015.05.047 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 4508757 . ПМИД 26095251 .

[24] Сетти, Ману; Киселёвас, Вайдотас; Левин, Джейкоб; Гайосо, Адам; Мазутис, Линас; Пеер, Дана (апрель 2019 г.). «Характеристика вероятностей судьбы клеток в данных об отдельных клетках с помощью Palantir» . Природная биотехнология . 37 (4): 451–460. дои : 10.1038/s41587-019-0068-4 . ISSN 1546-1696 . ПМЦ 7549125 . ПМИД 30899105 .

[25] Ланге, Мариус; Берген, Волкер; Кляйн, Михал; Сетти, Ману; Рейтер, Бернхард; Бахти, Мостафа; Ликерт, Хейко; Ансари, Мешаль; Шниринг, Джанин; Шиллер, Герберт Б.; Пеэр, Дана; Тайс, Фабиан Дж. (февраль 2022 г.). «CellRank для направленного картирования судеб отдельных клеток» . Природные методы . 19 (2): 159–170. дои : 10.1038/s41592-021-01346-6 . ISSN 1548-7105 . ПМЦ 8828480 . ПМИД 35027767 .

[Nowotschin_361–367-26] Jump up to: ^а ^б Новочин, Соня; Сетти, Ману; Куо, Ин-И; Лю, Винсент; Гарг, Видур; Шарма, Рошан; Саймон, Клэр С.; Саиз, Нестор; Гарднер, Руи; Буте, Стефан К.; Черч, Дина М.; Худлесс, Памела А.; Хаджантонакис, Анна-Катерина; Пеер, Дана (май 2019 г.). «Новый ландшафт энтодермы кишечника мыши при разрешении отдельных клеток» . Природа . 569 (7756): 361–367. Бибкод : 2019Natur.569..361N . дои : 10.1038/s41586-019-1127-1 . ISSN 1476-4687 . ПМК 6724221 . ПМИД 30959515 .

[cell-ed-board-27] «Редакция: Ячейка» . www.cell.com . Проверено 18 января 2022 г.

[28] «Управление» . www.humancellatlas.org . Проверено 5 декабря 2022 г.

[29] «Научно-консультативный комитет – Совет EMBL» . Проверено 5 декабря 2022 г.

[30] "О нас" . ЭПФЛ . Проверено 5 декабря 2022 г.

[31] «Подробности программы» . pew.org . Проверено 5 декабря 2022 г.

[iscb-fellow-32] «2 марта 2021 г.: ISCB поздравляет и представляет класс стипендиатов 2021 года!» . www.iscb.org . Проверено 17 июня 2022 г.

[:0-33] «HHMI инвестирует 300 миллионов долларов в 33 новых следователя» . ХХМИ . Проверено 23 сентября 2021 г.

[34] «AACR объявляет членов класса Академии AACR 2023 года и нового президента Академии AACR» . Американская ассоциация исследований рака (AACR) . Проверено 1 апреля 2024 г.

[35] «Выдающиеся женщины в здравоохранении 2019» . Нью-йоркский бизнес Крэйна . 23 июля 2019 г. Проверено 5 декабря 2022 г.

[36] «Дана Пеер из Института Слоана Кеттеринга назначена исследователем Медицинского института Говарда Хьюза | Мемориальный онкологический центр Слоана Кеттеринга» . www.mskcc.org . 23 сентября 2021 г. Проверено 5 декабря 2022 г.

[37] «Программа награждения пионеров директора НИЗ — лауреаты премии 2014 г.» . commonfund.nih.gov . 18 сентября 2018 г. Проверено 5 декабря 2022 г.

[iscb-prize-38] «24 января 2014 г.: Джин Майерс и Дана Пеер названы лауреатами премии ISCB 2014 года» . www.iscb.org . ИСКБ . Проверено 8 февраля 2014 г.

[39] «РЕКОМБ Награды» . Серия конференций RECOMB . Проверено 5 декабря 2022 г.

[40] «Stand Up To Cancer награждает следующий раунд грантов на инновационные исследования - Институт рака Даны-Фарбер | Бостон, Массачусетс» . www.dana-farber.org . Проверено 5 декабря 2022 г.

[packard-41] «Дана Пеер – Фонд Паккарда» . www.packard.org . Проверено 8 февраля 2014 г.

[42] «Дана Пеер из Института Слоана Кеттеринга назначена исследователем Медицинского института Говарда Хьюза» . ЭврекАлерт! . Проверено 5 декабря 2022 г.

[43] «Премия новатора ISCB» . www.iscb.org . Проверено 1 апреля 2024 г.

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 1 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

v т и Члены Международного общества вычислительной биологии по годам избрания
2009	David Haussler David Lipman Webb Miller David Sankoff Temple Smith Janet Thornton Michael Waterman
2010	Russ Altman Lawrence Hunter Eugene Myers Chris Sander Gary Stormo Alfonso Valencia
2011	Michael Ashburner Phil Bourne Søren Brunak Richard Durbin
2012	Bonnie Berger Peter Karp Jill Mesirov Pavel Pevzner Ron Shamir Martin Vingron Gunnar von Heijne
2013	Pierre Baldi David Eisenberg Minoru Kanehisa Satoru Miyano Ruth Nussinov Steven Salzberg
2014	Amos Bairoch Ewan Birney Nir Friedman Robert Gentleman Andrej Šali
2015	Rolf Apweiler Cyrus Chothia Julio Collado-Vides Mark Gerstein Des Higgins Thomas Lengauer Michael Levitt Burkhard Rost
2016	Helen M. Berman Steven Brenner Dan Gusfield Barry Honig Janet Kelso Michal Linial Christine Orengo Aviv Regev Lincoln Stein Sarah Teichmann Anna Tramontano Shoshana Wodak Haim Wolfson
2017	Alex Bateman Andrea Califano Daphne Koller Anders Krogh William Noble Lior Pachter Olga Troyanskaya Tandy Warnow
2018	Patricia Babbitt Terry Gaasterland Hanah Margalit Yves Moreau Bernard Moret William Pearson Mona Singh Mike Steel
2019	Vineet Bafna Eleazar Eskin Xiaole Shirley Liu Marie-France Sagot
2020	Serafim Batzoglou Judith Blake Mark Borodovsky Rita Casadio Paul Flicek Osamu Gotoh Rafael Irizarry Laxmi Parida Katherine Pollard Ben Raphael Zhiping Weng Xuegong Zhang
2021	Atul Butte A. Keith Dunker Eran Halperin Wolfgang Huber Sorin Istrail Christina Leslie Ming Li Núria López Bigas Dana Pe'er Teresa Przytycka Eytan Ruppin Gustavo Stolovitzky
2022	Barbara Bryant Sean Eddy Mikhail Gelfand Takashi Gojobori Trey Ideker David Jones Fran Lewitter Jun Liu Debora Marks Mihai Pop Reinhard Schneider

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ
Национальный	Израиль
академики	ДБЛП MathSciNet Проект математической генеалогии ОРЦИД Скопус zbMATH