✖


Jump to content

Сайрус Чотия

Сайрус Чотия
ФРС
Чотия в 2015 году
Рожденный
Сайрус Хоми Чотия

( 1942-02-19 ) 19 февраля 1942 г. [18]
Умер 26 ноября 2019 г. (26 ноября 2019 г.) (77 лет) [19]
Образование Школа Аллейна [20]
Альма-матер
Награды
Научная карьера
Учреждения
Диссертация [ ProQuest   301370414 Кристаллические структуры некоторых молекул, активных в холинергических нервных рецепторах]   (1973).
Докторантура Питер Дж. Полинг [4]
Другие научные консультанты Майкл Левитт [5]
Фредерик М. Ричардс [5]
Докторанты
Другие известные студенты Артур Леск ( постдок )
Веб-сайт www2 .mrc-lmb .камера .и .uk /лидеры групп / почетный / Сайрус-Хотия

Сайрус Хоми Чотиа (19 февраля 1942 г. - 26 ноября 2019 г.) [18] ФРС [21] [19] английский биохимик , заслуженный учёный Совета медицинских исследований (MRC Лаборатории молекулярной биологии (LMB) ) Кембриджского университета. [22] [23] и почетный научный сотрудник Вольфсон-колледжа в Кембридже . [21] [24] [25] [26] [27] [28] [29]

Образование [ править ]

Чотия получила образование в школе Аллейна . [20] затем пошел учиться в Даремский университет, получив степень бакалавра наук в 1965 году. [18] Затем Чотия получила степень магистра наук в Биркбек-колледже в 1967 году и докторскую степень в Университетском колледже Лондона. [30] под руководством Питера Полинга [ Викиданные ] , [31] сын Лайнуса Полинга .

и Исследования карьера ​

После получения докторской степени Чотия проработал в Лаборатории молекулярной биологии (ЛМБ) три года . Затем он работал с Майклом Левиттом. [5] в Институте науки Вейцмана [32] [33] за которыми последовали два года с Жоэлем Жаненом в Институте Пастера в Париже. [34]

В 1976 году Чотия вернулся в Англию, чтобы работать в Университетском колледже Лондона и LMB. С Артуром Леском [3] [35] он показал, что белки адаптируются к мутациям путем изменения структуры.

В 1992 году он предположил, что большинство белков построены из доменов, принадлежащих небольшому числу семейств. [36] Он сотрудничал с Алексеем Мурзиным, Стивеном Бреннером и Тимом Хаббардом для создания базы данных Структурной классификации белков (SCOP). [37] [38] периодическая таблица всех известных белковых структур. С Джулианом Гофом [14] он создал базу данных Superfamily [39] который использует скрытые модели Маркова для идентификации последовательностей белков, связанных с последовательностями известных структур.

За свою карьеру Чотия руководил 19 успешными аспирантами. [40] включая Алекса Бейтмана , [6] Стивен Э. Бреннер , [10] Марк Бендер Герштейн , [11] Джулиан Гоф , [13] Сара Тейхманн , [15] Биссан аль-Лазикани , [41] [42] [43] Гога Апич, [44] Саманта Барре [ нужна ссылка ] [45] Мэтью Баштон, [46] [47] [48] [49] Дэн Болсер, [50] Майкл Бреманг, [51] Бернар де Боно, [52] [53] Эмма Гэнли (урожденная Хилл), [54] [55] [56] Мартин Мадера, [57] [58] Сергей Маслов, [59] Сьюзен Миллер, [60] [61] [62] Чон Пак (он же Чон Бхак), [63] [64] [65] Раджкумар Сасидхаран, [66] [67] и Кристина Фогель . [68] [69]

Награды и почести [ править ]

Чотия была избрана членом Королевского общества (FRS) в 2000 году . [18] В его свидетельстве об избрании и кандидатуре говорится:

Доктор Чотиа показал, как аминокислотные последовательности белков определяют их структуру, функции и эволюцию. На основе анализа закономерностей их строения он разработал общепринятую в настоящее время классификацию белковых структур. Его картина эволюции белков предполагает, как белки расходятся и приобретают новые функции. Он помог нам понять, как их явно ограниченный набор слегка отличающихся структур позволяет иммуноглобину распознавать почти безграничное разнообразие различных антигенов. [70]

В 2015 году Чотия была избрана членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [71] и был награжден премией ISCB за достижения в области старшего ученого в честь своей работы по использованию вычислительных методов для понимания структуры белка. [1] [72]

Вместе с Дэвидом Хаусслером и Майклом Уотерманом Чотия был удостоен премии Дэна Дэвида 2015 года за вклад в область биоинформатики . [2]

Ссылки [ править ]

У Схолии есть профиль Сайруса Чотии (Q5201079) .
  1. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «ISCB Сайрус Чотия, Кертис Хаттенхауэр и Ларри Хантер названы лауреатами премии ISCB 2015 года» . Архивировано из оригинала 11 февраля 2015 года.
  2. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Соучредитель Википедии Джимми Уэйлс среди лауреатов премии Дэна Дэвида 2015 года» . Проверено 13 февраля 2015 г.
  3. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Леск, А.; Чотия, К. (1980). «Как разные аминокислотные последовательности определяют сходные белковые структуры: структура и эволюционная динамика глобинов». Журнал молекулярной биологии . 136 (3): 225–270. дои : 10.1016/0022-2836(80)90373-3 . ПМИД   7373651 .
  4. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Сайрус Чотия в проекте «Математическая генеалогия»
  5. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Сайрус Х. Чотия, Древо химии» . Архивировано из оригинала 27 февраля 2015 года.
  6. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Бейтман, Александр Джордж (1997). Эволюция структуры и функции суперсемейства иммуноглобулинов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  7. ^ «Доктор Алекс Бейтман – Институт Wellcome Trust Sanger» . Архивировано из оригинала 7 февраля 2012 года.
  8. ^ Бейтман, А ; Эдди, СР ; Чотия, К. (1996). «Члены суперсемейства иммуноглобулинов у бактерий» . Белковая наука . 5 (9): 1939–41. дои : 10.1002/pro.5560050923 . ПМК   2143528 . ПМИД   8880921 .
  9. ^ Бейтман, А; Чотия, К. (1995). «Очертания структур внеклеточных доменов рецепторов фактора роста фибробластов». Структурная биология природы . 2 (12): 1068–74. дои : 10.1038/nsb1295-1068 . ПМИД   8846218 . S2CID   20501031 .
  10. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Бреннер, Стивен Эллиот (1996). Молекулярное родство: эволюционные и структурные взаимоотношения белков . lib.cam.ac.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. EThOS   uk.bl.ethos.596888 .
  11. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Герштейн, Марк Бендер (1992). Распознавание белков: поверхности и конформационные изменения (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  12. ^ Герштейн, М .; Чотия, К. (1991). «Анализ замыкания белковой петли. Два типа шарниров производят одно движение в лактатдегидрогеназе». Журнал молекулярной биологии . 220 (1): 133–149. дои : 10.1016/0022-2836(91)90387-L . ПМИД   2067013 .
  13. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Гоф, Джулиан Джон Терстан (2002). Скрытые модели Маркова и их применение к анализу генома в контексте структуры белка (PDF) (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. EThOS   uk.bl.ethos.599547 . Архивировано из оригинала (PDF) 11 марта 2015 года.
  14. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Домашняя страница доктора Джулиана Гофа в Бристольском университете» . Архивировано из оригинала 25 марта 2012 года.
  15. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Тейхманн, Сара Амалия (1999). Эволюция генома: анализ протеомов новыми методами (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  16. ^ Парк, Дж; Тейхманн, SA ; Хаббард, Т ; Чотия, К. (1997). «Промежуточные последовательности улучшают обнаружение гомологии между последовательностями». Журнал молекулярной биологии . 273 (1): 349–54. дои : 10.1006/jmbi.1997.1288 . ПМИД   9367767 .
  17. ^ Тейхманн, SA ; Парк, Дж; Чотия, К. (1998). «Структурные соответствия белкам Mycoplasmagentium демонстрируют обширные дупликации генов и перестройки доменов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (25): 14658–63. Бибкод : 1998PNAS...9514658T . дои : 10.1073/pnas.95.25.14658 . ПМЦ   24505 . ПМИД   9843945 . Значок открытого доступа
  18. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Анон (2014). «Чотия, Сайрус Хоми» . Кто есть кто (онлайн- изд. Oxford University Press ). А&С Черный. дои : 10.1093/ww/9780199540884.013.10866 . (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании .)
  19. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Сайрус Чотия (1942–2019)» . 27 ноября 2019 г. Проверено 27 ноября 2019 г. .
  20. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Премия Дэна Дэвида присуждена доктору Сайрусу Чотиа» . Школа Аллейна. Архивировано из оригинала 23 марта 2015 года.
  21. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Колледж Вольфсона: почетный научный сотрудник доктор Сайрус Чотия, магистр естественных наук, FRS» . Архивировано из оригинала 5 февраля 2012 года.
  22. ^ «Сайрус Чотия: Белковое происхождение биологической сложности, почетный LMB» . Архивировано из оригинала 15 февраля 2012 года.
  23. ^ «Структурная геномика и структура белка» . Mrc-lmb.cam.ac.uk. Архивировано из оригинала 14 февраля 2015 года . Проверено 24 июня 2014 г.
  24. ^ Сайрус Чотия на DBLP библиографическом сервере Отредактируйте это в Викиданных
  25. ^ «Сайрус Чотия» . Google Академик . Проверено 24 июня 2014 г.
  26. ^ Чотия, К. ; Леск, AM ; Трамонтано, А.; Левитт, М .; Смит-Гилл, С.Дж.; Эйр, Г.; Шериф, С.; Падлан, Э.А.; Дэвис, Д.; Тюльпан, WR; Колман, премьер-министр ; Спинелли, С.; Альзари, премьер-министр; Поляк, Р.Дж. (1989). «Конформации гипервариабельных областей иммуноглобулина». Природа . 342 (6252): 877–883. Бибкод : 1989Natur.342..877C . дои : 10.1038/342877a0 . ПМИД   2687698 . S2CID   4241051 .
  27. ^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, ТЛ; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Коццетто, Д; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж .; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Дж.Дж .; Миннечи, Ф; Мистри, Дж; Мурзин, А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Оутс, Мэн; Пунта, М; Рэкхэм, О.Дж.; Штальхаке, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Оренго, К (2015). «Genome3D: использование структуры, чтобы помочь пользователям понять их последовательности» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D382–6. дои : 10.1093/nar/gku973 . ПМЦ   4384030 . ПМИД   25348407 .
  28. ^ Чотия, К ; Гоф, Дж .; Фогель, К; Тейхманн, С.А. (2003). «Эволюция белкового репертуара». Наука . 300 (5626): 1701–3. Бибкод : 2003Sci...300.1701C . дои : 10.1126/science.1085371 . ПМИД   12805536 . S2CID   27681885 .
  29. ^ Публикации Сайруса Чотиа, индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  30. ^ Чотия, Сайрус (1973). Кристаллические структуры некоторых молекул, активных в отношении холинергических нервных рецепторов (кандидатская диссертация). Университетский колледж Лондона. OCLC   926297115 . ПроКвест   301370414 .
  31. ^ Чотия, К.; Полинг, П. (1969). «О конформациях галлюциногенных молекул и их соотношении» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 63 (4): 1063–1070. Бибкод : 1969PNAS...63.1063C . дои : 10.1073/pnas.63.4.1063 . ПМК   223427 . ПМИД   4311249 .
  32. ^ Чотия, К.; Левитт, М.; Ричардсон, Д. (1977). «Структура белков: упаковка альфа-спиралей и складчатых листов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (10): 4130–4134. Бибкод : 1977PNAS...74.4130C . дои : 10.1073/pnas.74.10.4130 . ПМК   431889 . ПМИД   270659 .
  33. ^ Левитт, М .; Чотия, К. (1976). «Структурные закономерности глобулярных белков». Природа . 261 (5561): 552–558. Бибкод : 1976Natur.261..552L . дои : 10.1038/261552a0 . ПМИД   934293 . S2CID   4154884 .
  34. ^ Свит, Р.; Райт, Х.; Джанин, Дж.; Чотия, К.; Блоу, Д. (1974). «Кристаллическая структура комплекса свиного трипсина с ингибитором трипсина сои (Куниц) при разрешении 2,6 А». Биохимия . 13 (20): 4212–4228. дои : 10.1021/bi00717a024 . ПМИД   4472048 .
  35. ^ Леск, А.; Чотия, К. (1980). «Доступность растворителя, поверхности белков и сворачивание белков» . Биофизический журнал . 32 (1): 35–47. Бибкод : 1980BpJ....32...35L . дои : 10.1016/S0006-3495(80)84914-9 . ПМЦ   1327253 . ПМИД   7248454 .
  36. ^ Чотия, Сайрус (1992). «Тысяча семей для молекулярного биолога» . Природа . 357 (6379): 543–4. Бибкод : 1992Natur.357..543C . дои : 10.1038/357543a0 . ПМИД   1608464 . S2CID   4355476 .
  37. ^ Хаббард, Т .; Мурзин А.; Бреннер, С .; Чотия, К. (1997). «SCOP: База данных структурной классификации белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (1): 236–239. дои : 10.1093/нар/25.1.236 . ПМК   146380 . ПМИД   9016544 .
  38. ^ «Гранты правительства Великобритании предоставлены Сайрусу Чотии» . Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала 15 октября 2014 года.
  39. ^ Гоф, Дж .; Чотия, К. (2002). «СУПЕРСЕМЕЙСТВО: HMM, представляющие все белки известной структуры. Поиск последовательностей SCOP, выравнивание и назначение генома» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 268–272. дои : 10.1093/нар/30.1.268 . ПМК   99153 . ПМИД   11752312 .
  40. ^ Алекс Бейтман (2015). «Академическое генеалогическое древо Сайруса Чотии» . твиттер. Архивировано из оригинала 15 июля 2015 года.
  41. ^ Аль-Лазикани, Бисан (1999). Канонические структуры иммуноглобулинов и Т-клеточных рецепторов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  42. ^ «Руководитель группы доктора Биссана аль-Лазикани» . Институт исследования рака. Архивировано из оригинала 5 марта 2015 года.
  43. ^ Аль-Лазикани, Б; Леск, AM; Чотия, К. (2000). «Канонические структуры гипервариабельных областей рецепторов Т-клеточного алфавита». Журнал молекулярной биологии . 295 (4): 979–95. дои : 10.1006/jmbi.1999.3358 . ПМИД   10656805 .
  44. ^ Апик, Гордана (2003). Эволюция мультидоменных белков в геномах . lib.cam.ac.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   894594841 . EThOS   uk.bl.ethos.619919 .
  45. ^ Барре, Саманта; Гринберг, Эндрю С.; Флайник, Мартин Ф.; Чотия, Сайрус (1994). «Структурная консервативность гипервариабельных областей в эволюции иммуноглобулинов». Структурная биология природы . 1 (12): 915–920. дои : 10.1038/nsb1294-915 . ПМИД   7773781 . S2CID   39728494 .
  46. ^ Баштон, Мэтью (2004). Функциональный анализ комбинаций доменов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  47. ^ «Доктор Мэтью Баштон: научный сотрудник проекта INSTINCT» . Архивировано из оригинала 5 марта 2015 года.
  48. ^ Баштон, М; Чотия, К. (2002). «Геометрия комбинации доменов в белках». Журнал молекулярной биологии . 315 (4): 927–39. дои : 10.1006/jmbi.2001.5288 . ПМИД   11812158 .
  49. ^ Баштон, М; Чотия, К. (2007). «Поколение новых функций белка путем комбинации доменов» . Структура . 15 (1): 85–99. дои : 10.1016/j.str.2006.11.009 . ПМИД   17223535 .
  50. ^ Болсер, Дэниел Мюррей (2007). Поверхности, участвующие в образовании белковых комплексов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  51. ^ Бреманг, Майкл Энтони (2012). Репертуар белков мыши: исследования альтернативного сплайсинга, функций и качества (докторская диссертация). Кембриджский университет.
  52. ^ де Боно, Бернар (2004). Белки суперсемейства иммуноглобулинов у человека и мыши (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  53. ^ де Боно, Б. (2003). «Эксегеза: процедура улучшения предсказания генов и ее использование для поиска белков суперсемейства иммуноглобулинов в геномах человека и мыши» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (21): 6096–6103. дои : 10.1093/нар/gkg828 . ПМК   275470 . ПМИД   14576296 .
  54. ^ Хилл, Эмма Элизабет (2002). Эволюция семейств белков: последовательности генома и трехмерные структуры (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  55. ^ «Домашняя страница Эммы Хилл» . Калифорнийский университет, Беркли. Архивировано из оригинала 13 июля 2006 года.
  56. ^ «Эмма Гэнли (урожденная Хилл) сотрудница PLOS» . ПЛОС . Архивировано из оригинала 24 апреля 2015 года.
  57. ^ Мадера, Мартин (2005). Скрытые марковские модели для обнаружения удаленной гомологии (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  58. ^ Мадера, М. (2004). «База данных SUPERFAMILY 2004: дополнения и улучшения» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (90001): 235Д–239. дои : 10.1093/nar/gkh117 . ПМК   308851 . ПМИД   14681402 .
  59. ^ Маслоу, Сергей (2007). Формирование низкомолекулярного метаболизма Escherichia coli (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  60. ^ Миллер, GSP (1987). Компьютерное отображение и изготовление 3-D моделей (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   59769936 .
  61. ^ Миллер, Сьюзен; Жанен, Жоэль; Леск, Артур М.; Чотия, Сайрус (1987). «Внутренняя и поверхность мономерных белков». Журнал молекулярной биологии . 196 (3): 641–656. дои : 10.1016/0022-2836(87)90038-6 . ПМИД   3681970 .
  62. ^ Миллер, Сьюзен; Леск, Артур М.; Жанен, Жоэль; Чотия, Сайрус (1987). «Доступная площадь поверхности и стабильность олигомерных белков». Природа . 328 (6133): 834–836. Бибкод : 1987Natur.328..834M . дои : 10.1038/328834a0 . ПМИД   3627230 . S2CID   4349684 .
  63. ^ Пак, Чон Хва (1997). Анализ последовательности генома и методы (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  64. ^ Публикации Сайруса Чотии , проиндексированные Google Scholar
  65. ^ «Домашняя страница Чон Бхака: Предприниматель и учёный» . jongbhak.com. Архивировано из оригинала 20 декабря 2014 года.
  66. ^ Сасидхаран, Раджкумар (2004). Эволюция белков: выбор приемлемых мутаций (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  67. ^ Сасидхаран, Р.; Чотия, К. (2007). «Выбор приемлемых мутаций белка» . Труды Национальной академии наук . 104 (24): 10080–10085. Бибкод : 2007PNAS..10410080S . дои : 10.1073/pnas.0703737104 . ЧВК   1891269 . ПМИД   17540730 .
  68. ^ Фогель, Кристина (2004). Взгляд на эволюцию белкового репертуара (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  69. ^ Фогель, Кристина; Чотия, Сайрус (2006). «Расширение семейства белков и биологическая сложность» . PLOS Вычислительная биология . 2 (5): е48. Бибкод : 2006PLSCB...2...48В . дои : 10.1371/journal.pcbi.0020048 . ПМЦ   1464810 . ПМИД   16733546 . Значок открытого доступа
  70. ^ «EC/2000/04: Чотия, Кир» . Лондон: Королевское общество. Архивировано из оригинала 29 марта 2022 года . Проверено 18 ноября 2013 г.
  71. ^ Фогг, Китай; Ковац, Д.Э. (2015). «Сообщение от ISCB: Достижение ISCB в 2015 году в виде награды старшего научного сотрудника: Сайрус Чотия» . Биоинформатика . 31 (13): 2238–9. doi : 10.1093/биоинформатика/btv218 . ПМИД   26002905 .
  72. ^ «Знакомьтесь с выпуском стипендиатов ISCB 2015 года» . Архивировано из оригинала 20 февраля 2015 года . Проверено 15 февраля 2015 г.

В эту статью включен текст , доступный по лицензии CC BY 4.0 .

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Cyrus_Chothia&oldid=1231915329"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 69a772fda2dca2280a2772c0ce48bd7e__1719780540
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/69/7e/69a772fda2dca2280a2772c0ce48bd7e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Cyrus Chothia - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)