Майкл Штернберг
Майк Штернберг | |
|---|---|
| Рожденный | Майкл Джозеф Эзра Штернберг 24 июня 1951 г. [ 3 ] |
| Альма-матер |
|
| Награды | |
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Учреждения | |
| Диссертация | Исследования конформации белка (1977) |
| Докторантура | Дэвид Чилтон Филлипс [ 2 ] |
| Веб-сайт | www |
Майкл Джозеф Эзра Штернберг (родился 24 июня 1951 г.) [ 3 ] — профессор Имперского колледжа Лондона , где он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики. [ 4 ] и руководитель группы структурной биоинформатики . [ 1 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Образование
[ редактировать ]Штернберг получил образование в гимназии округа Хендон и колледже Гонвилл и Кайус в Кембридже , где в 1972 году ему была присуждена степень бакалавра искусств в области естественных наук (теоретическая физика) . [ 3 ] Затем он получил степень магистра наук в области вычислительной техники в Имперском колледже Лондона, а затем получил степень доктора философии в Оксфордском университете ( Колледж Вольфсона, Оксфорд ) в 1978 году за исследования под руководством Дэвида Чилтона Филлипса . [ 2 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]
Карьера
[ редактировать ]После постдокторских исследований в Оксфордском университете Штернберг стал преподавателем кафедры кристаллографии Биркбек -колледжа в Лондоне . Он продолжил работу в Имперском фонде исследования рака и поступил в Имперский колледж в 2001 году. [ 3 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] Он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики. [ 4 ] в Имперском колледже.
Исследовать
[ редактировать ]Научные интересы Штернберга заключаются в предсказании структуры белков , предсказании функций белков , предсказании стыковки и взаимодействий макромолекул , сетевом моделировании для системной биологии на основе логики и разработке лекарств . [ 13 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]
Он является автором или соавтором нескольких книг, в том числе « От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию» , [ 26 ] Белковая инженерия: практический подход [ 27 ] и Прогнозирование структуры белка: практический подход . [ 28 ]
Во время своих исследований в Оксфорде он работал с Джанет Торнтон , и они провели один из первых систематических анализов структуры белка . Они установили, что бета-альфа-бета-единица в белках почти всегда правосторонняя, и это объясняет поразительное сходство между белковыми структурами. [ нужна ссылка ]
Его группа, в частности Лоуренс Келли, разработала широко используемый веб-сервер Phyre/Phyre2. [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] для предсказания структуры белка. Этот веб-ресурс использовали более 100 000 различных пользователей по всему миру. [ нужна ссылка ]
Недавно его аспирант Крис Йейтс разработал SuSPect, [ 32 ] новый мощный метод прогнозирования фенотипических эффектов однонуклеотидных полиморфизмов и других аминокислот вариантов .
Награды и почести
[ редактировать ]Штернберг был избран членом Королевского биологического общества (FRSB) и членом Института биологии (FIBiol) . Он является заместителем редактора журнала молекулярной биологии .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Публикации Майкла Штернберга, проиндексированные Google Scholar
- ^ Перейти обратно: а б Штернберг, Майкл Джозеф Эзра (1977). Исследования конформации белков (докторская диссертация). Оксфордский университет.
- ^ Перейти обратно: а б с д «ШТЕРНБЕРГ, профессор Майкл Джозеф Эзра» . Кто есть кто . Том. 2014 (онлайн- изд. Oxford University Press ). А&С Черный. (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании .)
- ^ Перейти обратно: а б «Имперский колледж Лондона» .
- ^ Публикации Майкла Штернберга, индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Майкл Дж. Э. Штернберг на DBLP библиографическом сервере
- ^ Публикации Майкла Штернберга, индексируемые Microsoft Academic.
- ^ Коэн, FE; Штернберг, MJ; Филлипс, округ Колумбия; Кунц, И.Д.; Коллман, Пенсильвания (1980). «Модель диффузии-столкновения-адгезии кинетики рефолдинга миоглобина». Природа . 286 (5773): 632–4. Бибкод : 1980Natur.286..632C . дои : 10.1038/286632a0 . ПМИД 7402344 . S2CID 4348559 .
- ^ Артымюк, П.Ю.; Блейк, CC; Грейс, Делавэр; Оутли, С.Дж.; Филлипс, округ Колумбия; Штернберг, MJ (1979). «Кристаллографические исследования динамических свойств лизоцима». Природа . 280 (5723): 563–8. Бибкод : 1979Natur.280..563A . дои : 10.1038/280563a0 . ПМИД 460438 . S2CID 32299121 .
- ^ Штернберг, MJ; Грейс, Делавэр; Филлипс, округ Колумбия (1979). «Динамическая информация кристаллографии белков. Анализ температурных факторов при уточнении структуры лизоцима куриного белка». Журнал молекулярной биологии . 130 (3): 231–52. дои : 10.1016/0022-2836(79)90539-4 . ПМИД 469942 .
- ^ Филлипс, округ Колумбия ; Штернберг, MJ ; Торнтон, Дж. М. ; Уилсон, Айова (1978). «Анализ структуры триозофосфатизомеразы и ее сравнение с лактатдегидрогеназой». Журнал молекулярной биологии . 119 (2): 329–51. дои : 10.1016/0022-2836(78)90440-0 . ПМИД 633372 .
- ^ Филлипс, округ Колумбия; Риверс, PS; Штернберг, MJ; Торнтон, Дж. М.; Уилсон, Айова (1977). «Анализ трехмерной структуры куриной триозофосфат-изомеразы». Труды Биохимического общества . 5 (3): 642–7. дои : 10.1042/bst0050642 . ПМИД 902882 .
- ^ Перейти обратно: а б Майкл Штернберг, Имперский колледж Лондона
- ^ Штернберг, MJ ; Торнтон, Дж. М. (1978). «Предсказание структуры белка по аминокислотной последовательности». Труды Биохимического общества . 6 (6): 1119–23. дои : 10.1042/bst0061119 . ПМИД 744369 .
- ^ Штернберг, MJ ; Торнтон, Дж. М. (1978). «Предсказание структуры белка по аминокислотной последовательности». Природа . 271 (5640): 15–20. Бибкод : 1978Natur.271...15S . дои : 10.1038/271015a0 . ПМИД 342964 . S2CID 4160357 .
- ^ Бланделл, TL ; Сибанда, БЛ; Штернберг, MJ ; Торнтон, Дж. М. (1987). «Основываясь на знаниях, предсказание белковых структур и создание новых молекул». Природа . 326 (6111): 347–52. Бибкод : 1987Natur.326..347B . дои : 10.1038/326347a0 . ПМИД 3550471 . S2CID 4330510 .
- ^ Васс, Миннесота; Бартон, Г.; Штернберг, MJE (2012). «Comb Func : прогнозирование функции белка с использованием гетерогенных источников данных» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (проблема с веб-сервером): W466–W470. дои : 10.1093/nar/gks489 . ПМЦ 3394346 . ПМИД 22641853 .
- ^ Келли, Луизиана; МакКаллум, Р.М.; Штернберг, MJE (2000). «Расширенная аннотация генома с использованием структурных профилей в программе 3D-PSSM». Журнал молекулярной биологии . 299 (2): 501–522. дои : 10.1006/jmbi.2000.3741 . ПМИД 10860755 .
- ^ Габб, штат Ха; Джексон, РМ; Штернберг, MJE (1997). «Моделирование стыковки белков с использованием комплементарности формы, электростатики и биохимической информации». Журнал молекулярной биологии . 272 (1): 106–20. дои : 10.1006/jmbi.1997.1203 . ПМИД 9299341 .
- ^ Бартон, Дж.Дж.; Штернберг, MJ (1987). «Стратегия быстрого множественного выравнивания белковых последовательностей. Уровни достоверности на основе сравнения третичных структур». Журнал молекулярной биологии . 198 (2): 327–37. дои : 10.1016/0022-2836(87)90316-0 . ПМИД 3430611 .
- ^ Звелебил, МЮ; Бартон, Дж.Дж.; Тейлор, WR; Штернберг, MJ (1987). «Прогнозирование вторичной структуры и активных центров белка с использованием выравнивания гомологичных последовательностей». Журнал молекулярной биологии . 195 (4): 957–61. дои : 10.1016/0022-2836(87)90501-8 . ПМИД 3656439 .
- ^ Кинг, РД ; Штернберг, MJE (1996). «Идентификация и применение концепций, важных для точного и надежного предсказания вторичной структуры белка» . Белковая наука . 5 (11): 2298–2310. дои : 10.1002/pro.5560051116 . ПМК 2143286 . ПМИД 8931148 .
- ^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, Т.Л.; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Коццетто, Д; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж ; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Г.Дж. Миннечи, Ф; Мистри, Дж; Мурзин А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Оутс, Мэн; Совет, М; Рэкхэм, О.Дж.; Штальхаке, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Оренго, К (2015). «Genome3D: использование структур, чтобы помочь пользователям понять их последовательности» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D382–6. дои : 10.1093/nar/gku973 . ПМЦ 4384030 . ПМИД 25348407 .
- ^ Радивояк, П.; Кларк, WT; Орон, ТР; Шнос, AM; Виткоп, Т.; Соколов А.; Грейм, К.; Фанк, Дж.; Верспур, К.; Бен-Гур, А.; Панди, Г.; Юнес, Дж. М.; Талвалкар, AS; Репо, С.; Соуза, МЛ; Пиовесан, Д.; Касадио, Р.; Ван, З.; Ченг, Дж.; Фанг, Х.; Гоф, Дж.; Коскинен, П.; Тёрёнен, П.; Ноксо-Койвисто, Дж.; Холм, Л.; Коццетто, Д.; Бьюкен, DWA; Брайсон, К.; Джонс, DT; и др. (2013). «Крупномасштабная оценка вычислительного предсказания функций белка» . Природные методы . 10 (3): 221–227. дои : 10.1038/nmeth.2340 . ПМЦ 3584181 . ПМИД 23353650 .
- ^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, ТЛ; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Манжета, А; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж ; Хантер, С; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Дж. Дж . ; Миннечи, Ф; Митчелл, А; Мурзин, А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Рэкхэм, О.Дж.; Смит, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Йейтс, С; Оренго, К. (2013). «Genome3D: совместный проект Великобритании по аннотированию геномных последовательностей с помощью предсказанных трехмерных структур на основе доменов SCOP и CATH» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D499–507. дои : 10.1093/нар/gks1266 . ПМЦ 3531217 . ПМИД 23203986 .
- ^ От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию. ISBN 0632008881
- ^ Белковая инженерия: практический подход ISBN 0199631387
- ^ Прогнозирование структуры белка: практический подход ISBN 0199634963 |
- ^ Келли, Луизиана; Штернберг, MJE (2009). «Прогнозирование структуры белка в Интернете: пример использования сервера Phyre». Протоколы природы . 4 (3): 363–71. дои : 10.1038/nprot.2009.2 . hdl : 10044/1/18157 . ПМИД 19247286 . S2CID 12497300 .
- ^ Беннетт-Ловси, РМ; Герберт, AD; Штернберг, MJE; Келли, Луизиана (2007). «Исследование крайностей пространства последовательностей/структур с распознаванием ансамблевых складок в программе Phyre». Белки: структура, функции и биоинформатика . 70 (3): 611–625. дои : 10.1002/prot.21688 . ПМИД 17876813 . S2CID 23530683 .
- ^ «Перенаправление на Phyre2» .
- ^ Йейтс, CM; Филиппис, я; Келли, Луизиана; Штернберг, MJ (2014). «SuSPect: улучшенное предсказание фенотипа варианта одной аминокислоты (SAV) с использованием сетевых функций» . Журнал молекулярной биологии . 426 (14): 2692–701. дои : 10.1016/j.jmb.2014.04.026 . ПМЦ 4087249 . ПМИД 24810707 .
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
| Другой | |