Джерард Клейвегт

Джерард Клейвегт
Джерард Клейвегт
Рожденный	Геррит Джейкоб Клейвегт ; 1962 (61–62 года) ; Розенбург, Нидерланды
Национальность	Голландский
Альма-матер	Университет Утрехта
	Научная карьера
Поля	Структурная биология ;
Учреждения	Европейский институт биоинформатики ; Университет Упсалы
Диссертация	Компьютерное присвоение 2D и 3D ЯМР-спектров белков (1991)
Веб-сайт	http://www.ebi.ac.uk/about/people/gerard-kleywegt

Джерард Джейкоб Клейвегт (родился 5 июня 1962 года в Розенбурге ) — голландский рентгеновский кристаллограф и бывший руководитель группы Банка данных белков в Европе в EBI ; ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} член Всемирного банка данных по белкам . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Образование

Клейвегт получил докторскую степень в Утрехтском университете в 1991 году.

Карьера

После получения докторской степени Клейвегт проводил постдокторские исследования вместе с Элвином Джонсом в Уппсальском университете . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} до перехода в EBI.

Исследовать

Исследования Клейвегта сосредоточены на кристаллографии белков. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и Банк данных по белкам . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}

Ссылки

^ «Вспоминая 2016 год» .
^ «Страница исследовательской группы Джерарда Клейвегта в EBI» . Архивировано из оригинала 20 октября 2014 г.
^ Гарвуд, Джереми (май 2009 г.) «Страж структурной целостности» . Лабораторное время . стр. 19-23
^ Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х.; Маркли, Дж.Л.; Берли, СК (2010). «Защита целостности белкового архива» . Природа . 463 (7280): 425. дои : 10.1038/463425c . ПМЦ 4456675 . ПМИД 20110969 .
^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, Т.Л.; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Коццетто, Д; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж .; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Г.Дж. Миннечи, Ф; Мистри, Дж; Мурзин А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Оутс, Мэн; Совет, М; Рэкхэм, О.Дж.; Штальхаке, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Оренго, К (2015). «Genome3D: использование структур, чтобы помочь пользователям понять их последовательности» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D382-6. дои : 10.1093/nar/gku973 . ПМК 4384030 . ПМИД 25348407 .
^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, ТЛ; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Манжета, А; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж .; Хантер, С; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Дж. Дж . ; Миннечи, Ф; Митчелл, А; Мурзин, А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Рэкхэм, О.Дж.; Смит, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Йейтс, С; Оренго, К. (2013). «Genome3D: совместный проект Великобритании по аннотированию геномных последовательностей с помощью предсказанных трехмерных структур на основе доменов SCOP и CATH» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D499-507. дои : 10.1093/нар/gks1266 . ПМЦ 3531217 . ПМИД 23203986 .
^ Джонс, штат Калифорния; Клейвегт, Г.Дж. (2007). «Экспериментальные данные для структурных документов». Наука . 317 (5835): 194с. дои : 10.1126/science.317.5835.194c .
^ Клейвегт, Г.Дж.; Джонс, Т.А. (1996). «Фи/психология: новый взгляд на Рамачандрана» . Структура . 4 (12): 1395–400. дои : 10.1016/s0969-2126(96)00147-5 . ПМИД 8994966 .
^ Читай, Р.Дж.; Адамс, PD; Арендал ВБ, 3-й; Брунгер, АТ; Эмсли, П; Йоостен, Р.П.; Клейвегт, Г.Дж.; Криссинель, Е.Б.; Люттеке, Т; Отвиновский, З; Перракис, А; Ричардсон, Дж. С.; Шеффлер, штат Вашингтон; Смит, Дж.Л.; Тикл, Эй Джей; Вренд, Г; Зварт, PH (2011). «Новое поколение инструментов кристаллографической проверки для банка данных белков» . Структура . 19 (10): 1395–412. дои : 10.1016/j.str.2011.08.006 . ПМЦ 3195755 . ПМИД 22000512 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Читай, Р.Дж .; Клейвегт, Дж.Дж. (2009). «Проверка структуры, контролируемой регистром» . Acta Crystallographica Раздел D. 65 (Часть 2): 140–7. дои : 10.1107/S0907444908041085 . ПМЦ 2631636 . ПМИД 19171969 .
^ Клейвегт, Дж.Дж .; Прочтите, Р.Дж. (1997). «Не ваша средняя плотность» . Структура . 5 (12): 1557–69. дои : 10.1016/s0969-2126(97)00305-5 . ПМИД 9438862 .
^ Монтелионе, GT; Нильгес, М; Бакс, А; Гюнтерт, П; Херрманн, Т; Ричардсон, Дж. С.; Швитерс, CD; Вранкен, ВФ; Вуистер, ГВ; Уишарт, Д.С.; Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Маркли, Дж. Л. (2013). «Рекомендации рабочей группы по валидации ЯМР wwPDB» . Структура . 21 (9): 1563–70. дои : 10.1016/j.str.2013.07.021 . ПМЦ 3884077 . ПМИД 24010715 .
^ Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2013). «Как сообщество сформировало банк данных о белках» . Структура . 21 (9): 1485–91. дои : 10.1016/j.str.2013.07.010 . ПМЦ 4435976 . ПМИД 24010707 .
^ Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2013). «Будущее банка данных о белках» . Биополимеры . 99 (3): 218–22. дои : 10.1002/bip.22132 . ПМЦ 3684242 . ПМИД 23023942 .
^ Берман, HM ; Клейвегт, Дж.Дж .; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2012). «Банк данных о белках в 40 лет: размышления о прошлом, чтобы подготовиться к будущему» . Структура . 20 (3): 391–6. дои : 10.1016/j.str.2012.01.010 . ПМК 3501388 . ПМИД 22404998 .
^ Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х.; Маркли, Дж.Л.; Берли, СК (2010). «Защита целостности белкового архива» . Природа . 463 (7280): 425. дои : 10.1038/463425c . ПМЦ 4456675 . ПМИД 20110969 .
^ Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2014). «Архив Protein Data Bank как открытый ресурс данных» . Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 28 (10): 1009–14. дои : 10.1007/s10822-014-9770-y . ПМК 4196035 . ПМИД 25062767 .
^ Берман, HM; Берли, СК; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2014). «Ответ на оперативное обновление ссылок на литературу в Банке данных белков» . Acta Crystallographica Раздел D. 70 (Часть 10): 2780. doi : 10.1107/S1399004714020513 . ПМЦ 4984264 . ПМИД 25286863 .

[1] «Вспоминая 2016 год» .

[2] «Страница исследовательской группы Джерарда Клейвегта в EBI» . Архивировано из оригинала 20 октября 2014 г.

[3] Гарвуд, Джереми (май 2009 г.) «Страж структурной целостности» . Лабораторное время . стр. 19-23

[Nature2010-4] Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х.; Маркли, Дж.Л.; Берли, СК (2010). «Защита целостности белкового архива» . Природа . 463 (7280): 425. дои : 10.1038/463425c . ПМЦ 4456675 . ПМИД 20110969 .

[5] Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, Т.Л.; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Коццетто, Д; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж .; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Г.Дж. Миннечи, Ф; Мистри, Дж; Мурзин А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Оутс, Мэн; Совет, М; Рэкхэм, О.Дж.; Штальхаке, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Оренго, К (2015). «Genome3D: использование структур, чтобы помочь пользователям понять их последовательности» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D382-6. дои : 10.1093/nar/gku973 . ПМК 4384030 . ПМИД 25348407 .

[6] Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, ТЛ; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Манжета, А; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж .; Хантер, С; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Дж. Дж . ; Миннечи, Ф; Митчелл, А; Мурзин, А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Рэкхэм, О.Дж.; Смит, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Йейтс, С; Оренго, К. (2013). «Genome3D: совместный проект Великобритании по аннотированию геномных последовательностей с помощью предсказанных трехмерных структур на основе доменов SCOP и CATH» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D499-507. дои : 10.1093/нар/gks1266 . ПМЦ 3531217 . ПМИД 23203986 .

[Science2007-7] Джонс, штат Калифорния; Клейвегт, Г.Дж. (2007). «Экспериментальные данные для структурных документов». Наука . 317 (5835): 194с. дои : 10.1126/science.317.5835.194c .

[8] Клейвегт, Г.Дж.; Джонс, Т.А. (1996). «Фи/психология: новый взгляд на Рамачандрана» . Структура . 4 (12): 1395–400. дои : 10.1016/s0969-2126(96)00147-5 . ПМИД 8994966 .

[9] Читай, Р.Дж.; Адамс, PD; Арендал ВБ, 3-й; Брунгер, АТ; Эмсли, П; Йоостен, Р.П.; Клейвегт, Г.Дж.; Криссинель, Е.Б.; Люттеке, Т; Отвиновский, З; Перракис, А; Ричардсон, Дж. С.; Шеффлер, штат Вашингтон; Смит, Дж.Л.; Тикл, Эй Джей; Вренд, Г; Зварт, PH (2011). «Новое поколение инструментов кристаллографической проверки для банка данных белков» . Структура . 19 (10): 1395–412. дои : 10.1016/j.str.2011.08.006 . ПМЦ 3195755 . ПМИД 22000512 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[10] Читай, Р.Дж .; Клейвегт, Дж.Дж. (2009). «Проверка структуры, контролируемой регистром» . Acta Crystallographica Раздел D. 65 (Часть 2): 140–7. дои : 10.1107/S0907444908041085 . ПМЦ 2631636 . ПМИД 19171969 .

[11] Клейвегт, Дж.Дж .; Прочтите, Р.Дж. (1997). «Не ваша средняя плотность» . Структура . 5 (12): 1557–69. дои : 10.1016/s0969-2126(97)00305-5 . ПМИД 9438862 .

[12] Монтелионе, GT; Нильгес, М; Бакс, А; Гюнтерт, П; Херрманн, Т; Ричардсон, Дж. С.; Швитерс, CD; Вранкен, ВФ; Вуистер, ГВ; Уишарт, Д.С.; Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Маркли, Дж. Л. (2013). «Рекомендации рабочей группы по валидации ЯМР wwPDB» . Структура . 21 (9): 1563–70. дои : 10.1016/j.str.2013.07.021 . ПМЦ 3884077 . ПМИД 24010715 .

[13] Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2013). «Как сообщество сформировало банк данных о белках» . Структура . 21 (9): 1485–91. дои : 10.1016/j.str.2013.07.010 . ПМЦ 4435976 . ПМИД 24010707 .

[14] Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2013). «Будущее банка данных о белках» . Биополимеры . 99 (3): 218–22. дои : 10.1002/bip.22132 . ПМЦ 3684242 . ПМИД 23023942 .

[15] Берман, HM ; Клейвегт, Дж.Дж .; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2012). «Банк данных о белках в 40 лет: размышления о прошлом, чтобы подготовиться к будущему» . Структура . 20 (3): 391–6. дои : 10.1016/j.str.2012.01.010 . ПМК 3501388 . ПМИД 22404998 .

[16] Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х.; Маркли, Дж.Л.; Берли, СК (2010). «Защита целостности белкового архива» . Природа . 463 (7280): 425. дои : 10.1038/463425c . ПМЦ 4456675 . ПМИД 20110969 .

[17] Берман, HM; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2014). «Архив Protein Data Bank как открытый ресурс данных» . Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 28 (10): 1009–14. дои : 10.1007/s10822-014-9770-y . ПМК 4196035 . ПМИД 25062767 .

[18] Берман, HM; Берли, СК; Клейвегт, Г.Дж.; Накамура, Х; Маркли, Дж. Л. (2014). «Ответ на оперативное обновление ссылок на литературу в Банке данных белков» . Acta Crystallographica Раздел D. 70 (Часть 10): 2780. doi : 10.1107/S1399004714020513 . ПМЦ 4984264 . ПМИД 25286863 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
академики	ДБЛП ОРЦИД
Другой	ИдРеф