✖


Jump to content

Джулиан Гоф (ученый)

Джулиан Гоф
Рожденный
Джулиан Джон Терстан Гоф [6]

сентябрь 1974 г. (49 лет) [2]
Образование Школа Персе
Альма-матер
Известный База данных суперсемейств
Научная карьера
Поля
Учреждения
Диссертация Скрытые модели Маркова и их применение к анализу генома в контексте структуры белка   (2001)
Докторантура Сайрус Чотия [4] [5]
Веб-сайт www2 .mrc-lmb .камера .и .uk /лидеры групп /а-г /Джулиан-Гоф /

Джулиан Джон Терстан Гоф (1974 г.р.) [2] был руководителем группы в Лаборатории молекулярной биологии (LMB) Совета медицинских исследований (MRC). [1] [7] [8] Раньше он был [ когда? ] профессор биоинформатики университета Бристольского . [9]

Образование

[ редактировать ]

Гоф получил образование в школе Персе. [10] в Кембридже и Бристольском университете , где в 1998 году ему была присуждена совместная почетная степень по математике и физике . [9] [10] Он защитил докторскую диссертацию в Лаборатории молекулярной биологии (LMB) под руководством Сайруса Чотиа по анализу генома и структуре белка, будучи аспирантом Сидней-Сассекского колледжа в Кембридже , который окончил в 2001 году. [5]

Карьера и исследования

[ редактировать ]

После получения докторской степени Гоф завершил постдокторантуру в LMB и Стэнфордском университете под руководством Майкла Левитта . Впоследствии он был научным сотрудником RIKEN в Токио, а затем был назначен преподавателем , Бристольского университета где работал с 2007 года. [10] Он также был приглашенным ученым в Институте Пастера в Париже и доцентом Токийского медицинского и стоматологического университета . [9]

Научные интересы Гофа лежат в области биоинформатики , вычислительной биологии , молекулярной биологии , геномики. [1] что привело к созданию базы данных Superfamily. [11] [12] скрытых марковских моделей (HMM), представляющих все белки известной структуры. Его исследования были опубликованы в ведущих рецензируемых научных журналах, включая Nature , [13] [14] Наука , [15] [16] Клетка , [17] Исследования нуклеиновых кислот , [18] [19] [20] [21] [22] ПНАС , [23] [24] журнал Биохимический , [25] Журнал молекулярной биологии , [26] [27] [28] Геномные исследования , [29] Биоинформатика , [30] ПЛОС Генетика , [31] Природная генетика [32] и Журнал бактериологии . [33]

Исследование Гофа финансировалось Исследовательским советом по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC), Исследовательским советом по инженерным и физическим наукам (EPSRC), Советом по исследованиям природной среды (NERC), [34] Европейского союза (ЕС) Седьмая рамочная программа исследований (FP7), Японское общество содействия науке (JSPS) и королевское общество . Лондонское [9]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с Публикации Джулиана Гофа , индексируемые Google Scholar Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ Jump up to: а б с д «Джулиан ГОФ» . Лондон: Регистрационная палата правительства Соединенного Королевства. Архивировано из оригинала 18 июля 2016 года.
  3. ^ «Генетренер (генетически управляемый фитнес) претендует на крупную технологическую награду» . Бристольский университет. 3 июня 2013 г. Архивировано из оригинала 11 ноября 2014 г.
  4. ^ Джулиан Гоф в проекте «Математическая генеалогия»
  5. ^ Jump up to: а б Гоф, Джулиан (2001). Скрытые модели Маркова и их применение к анализу генома в контексте структуры белка (PDF) (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   879396947 . ЭТОС   599547 . Архивировано из оригинала (PDF) 11 марта 2015 года.
  6. ^ «Каталог диссертаций Университетской библиотеки: Джулиан Джон Терстан Гоф» . Кембриджский университет. Архивировано из оригинала 15 апреля 2015 года.
  7. ^ Джулиан Гоф на DBLP библиографическом сервере Отредактируйте это в Викиданных
  8. ^ Публикации Джулиана Гофа , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
  9. ^ Jump up to: а б с д «Группа вычислительной геномики: профессор Джулиан Гоф» . Бристольский университет. Архивировано из оригинала 11 марта 2015 года.
  10. ^ Jump up to: а б с «Профиль Джулиана Гофа» . ЛинкедИн . Архивировано из оригинала 15 апреля 2015 года.
  11. ^ Гоф, Дж .; Чотия, К. (2002). «СУПЕРСЕМЕЙСТВО: HMM, представляющие все белки известной структуры. Поиск последовательностей SCOP, выравнивание и назначение генома» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 268–272. дои : 10.1093/нар/30.1.268 . ПМК   99153 . ПМИД   11752312 .
  12. ^ Де Лима Мораис, окружной прокурор; Фанг, Х.; Рэкхэм, OJL; Уилсон, Д.; Петика, Р.; Чотия, К. ; Гоф, Дж. (2010). «СУПЕРСЕМЕЙСТВО 1.75, включая доменно-ориентированный метод онтологии генов» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (Проблема с базой данных): D427–D434. дои : 10.1093/нар/gkq1130 . ПМК   3013712 . ПМИД   21062816 .
  13. ^ Консорциум FANTOM и RIKEN PMI и CLST (DGT); Форрест, Арканзас; Каваджи, Х; Рели, М; Бэйли, Дж. К.; Де Хун, MJ; Хаберле, В; Лассманн, Т; Кулаковский, ИВ; Лицио, М; Ито, М; Андерссон, Р; Мунгалл, CJ; Михан, Т.Ф.; Шмайер, С; Бертен, Н; Йоргенсен, М; Даймонт, Э; Арнер, Э; Шмидл, К; Шефер, Ю; Медведева Ю.А.; Плесси, К; Витезич, М; Северин, Дж; Семпл, С; Исидзу, Ю; Янг, РС; Франческатто, М; и др. (2014). «Атлас экспрессии млекопитающих на уровне промотора» . Природа . 507 (7493): 462–70. Бибкод : 2014Natur.507..462T . дои : 10.1038/nature13182 . ПМЦ   4529748 . ПМИД   24670764 .
  14. ^ Оказаки, Ю.; Фуруно, М.; Касукава, Т.; Адачи, Дж.; Боно, Х.; Кондо, С.; Никайдо, И.; Осато, Н.; Сайто, Р.; Сузуки, Х.; Яманака, И.; Кийосава, Х.; Яги, К.; Томару, Ю.; Хасэгава, Ю.; Ногами, А.; Шенбах, К.; Годобори, Т. ; Бальдарелли, Р.; Хилл, ДП; Балт, К.; Хьюм, Д.А.; Квакенбуш, Дж .; Шримл, LM; Канапин А.; Мацуда, Х.; Баталов С.; Бейзель, К.В.; Блейк, Дж. А.; и др. (2002). «Анализ транскриптома мыши на основе функциональной аннотации 60 770 полноразмерных кДНК» . Природа . 420 (6915): 563–573. Бибкод : 2002Natur.420..563O . дои : 10.1038/nature01266 . hdl : 10161/11223 . ПМИД   12466851 .
  15. ^ Чотия, К ; Гоф, Дж .; Фогель, К; Тейхманн, С.А. (2003). «Эволюция белкового репертуара». Наука . 300 (5626): 1701–3. Бибкод : 2003Sci...300.1701C . дои : 10.1126/science.1085371 . ПМИД   12805536 . S2CID   27681885 .
  16. ^ Карнинчи, П; Касукава, Т; Катаяма, С; Гоф, Дж .; Фрит, MC; Маэда, Н.; Ояма, Р; Раваси, Т; Ленхард, Б; Уэллс, К; Кодзиус, Р; Симокава, К; Баич, В.Б.; Бреннер, SE ; Баталов С; Форрест, Арканзас; Заволан, М; Дэвис, MJ; Уилминг, LG; Айдинис, В; Аллен, Дж. Э.; Амбези-Импиомбато, А; Апвейлер, Р .; Атуралия, РН; Бейли, ТЛ; Бансал, М; Бакстер, Л; Бейзель, КВ; Берсано, Т; и др. (2005). «Транскрипционный ландшафт генома млекопитающих». Наука . 309 (5740): 1559–63. Бибкод : 2005Sci...309.1559F . дои : 10.1126/science.1112014 . ПМИД   16141072 . S2CID   8712839 .
  17. ^ Раваси, Т; Сузуки, Х; Каннистрачи, резюме; Катаяма, С.; Баич, В.Б.; Тан, К; Акалин А; Шмайер, С; Канамори-Катаяма, М; Бертен, Н; Карнинчи, П; Дауб, Колорадо; Форрест, Арканзас; Гоф, Дж; Гриммонд, С; Хан, Дж. Х.; Хашимото, Т; Скрыть, W; Хофманн, О; Камбуров А; Каур, М; Каваджи, Х; Кубосаки, А; Лассманн, Т; Ван Нимвеген, Э.; Макферсон, CR; Огава, К; Радованович, А; Шварц, А; Тисдейл, Р.Д.; Тегнер, Дж; Ленхард, Б; Тейхманн, С.А .; Аракава, Т.; Ниномия, Н; Мураками, К.; Тагами, М; Фукуда, С.; Имамура, К; Кай, С; Исихара, Р; Китадзуме, Ю; Каваи, Дж; Хьюм, Д.А.; Идекер, Т ; Хаяшизаки, Ю (2010). «Атлас комбинаторной регуляции транскрипции у мыши и человека» . Клетка . 140 (5): 744–52. дои : 10.1016/j.cell.2010.01.044 . ПМЦ   2836267 . ПМИД   20211142 . Значок открытого доступа
  18. ^ Льюис, TE; Силлито, я; Андреева А; Бланделл, ТЛ; Бьюкен, Д.В.; Чотия, К ; Коццетто, Д; Дана, Дж. М.; Филиппис, я; Гоф, Дж ; Джонс, DT; Келли, Луизиана; Клейвегт, Дж. Дж . ; Миннечи, Ф; Мистри, Дж; Мурзин, А.Г.; Очоа-Монтаньо, Б; Оутс, Мэн; Пунта, М; Рэкхэм, О.Дж.; Штальхаке, Дж; Штернберг, MJ ; Веланкар, С; Оренго, К (2015). «Genome3D: использование структуры, чтобы помочь пользователям понять их последовательности» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D382–6. дои : 10.1093/nar/gku973 . ПМЦ   4384030 . ПМИД   25348407 .
  19. ^ Митчелл, А; Чанг, Хай; Догерти, Л; Фрейзер, М; Хантер, С; Лопес, Р; Маканулла, К; Макменамин, К; Нука, Г; Пессе, С; Санградор-Вегас, А; Шереметьев, М; Рато, К; Йонг, С.Ю.; Бейтман, А ; Пунта, М; Эттвуд, Теннесси ; Сигрист, CJ; Редаски, Н; Ривуар, К; Ксенарий, я; Кан, Д; Гайо, Д; Борк, П ; Летунич, я; Гоф, Дж .; Оутс, М; Хафт, Д; Хуанг, Х; Натале, Д.А. (2015). «База данных семейств белков InterPro: классификационный ресурс спустя 15 лет» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D213–21. дои : 10.1093/nar/gku1243 . ПМЦ   4383996 . ПМИД   25428371 . Значок открытого доступа
  20. ^ Хантер, С.; Джонс, П.; Митчелл, А.; Апвейлер, Р.; Эттвуд, ТК; Бейтман, А.; Бернард, Т.; Биннс, Д.; Борк, П.; Бердж, С.; Де Кастро, Э.; Коггилл, П.; Корбетт, М.; Дас, У.; Догерти, Л.; Дюкенн, Л.; Финн, доктор медицинских наук; Фрейзер, М.; Гоф, Дж.; Хафт, Д.; Хуло, Н.; Кан, Д.; Келли, Э.; Летунич, И.; Лонсдейл, Д.; Лопес, Р.; Мадера, М.; Маслен, Дж.; Маканулла, К.; Макдауэлл, Дж. (2011). «ИнтерПро в 2011 году: Новые разработки в базе данных прогнозирования семейств и доменов» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D306–D312. дои : 10.1093/nar/gkr948 . ПМК   3245097 . ПМИД   22096229 .
  21. ^ Хантер, С.; Апвейлер, Р .; Эттвуд, Т .; Байрох, А. ; Бейтман, А .; Биннс, Д.; Борк, П. ; Дас, У.; Догерти, Л.; Дюкенн, Л.; Финн, доктор медицинских наук; Гоф, Дж .; Хафт, Д.; Хуло, Н.; Кан, Д.; Келли, Э.; Лограуд, А.; Летунич, И.; Лонсдейл, Д.; Лопес, Р.; Мадера, М.; Маслен, Дж.; Маканулла, К.; Макдауэлл, Дж.; Мистри, Дж.; Митчелл, А.; Малдер, Н.; Натале, Д.; Оренго, К.; Куинн, AF (январь 2009 г.). «ИнтерПро: база данных интегративных белковых сигнатур» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (Проблема с базой данных): D211–D215. дои : 10.1093/нар/gkn785 . ISSN   0305-1048 . ПМЦ   2686546 . ПМИД   18940856 . Значок открытого доступа
  22. ^ Малдер, Нью-Джерси; Апвейлер, Р .; Эттвуд, Теннесси ; Байрох, А ; Бейтман, А ; Биннс, Д; Брэдли, П; Борк, П ; Бухер, П; Черутти, Л; Копли, Р; Курсель, Э; Дас, У; Дурбин, Р ; Флейшманн, В; Гоф, Дж .; Хафт, Д; Харт, Н.; Хуло, Н; Кан, Д; Канапин А; Крестьянинова М; Лонсдейл, Д; Лопес, Р; Летунич, я; Мадера, М; Маслен, Дж; Макдауэлл, Дж; Митчелл, А; и др. (2005). «ИнтерПро, прогресс и состояние в 2005 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D201–5. дои : 10.1093/nar/gki106 . ПМК   540060 . ПМИД   15608177 . Значок открытого доступа
  23. ^ Виноградов С.Н.; Хогевейс, Д; Байи, X; Арредондо-Питер, Р.; Гертен, М; Гоф, Дж; Девильде, С; Моенс, Л; Ванфлетерен, младший (2005). «Три линии глобина, принадлежащие к двум структурным классам геномов трех царств жизни» . Труды Национальной академии наук . 102 (32): 11385–9. Бибкод : 2005PNAS..10211385V . дои : 10.1073/pnas.0502103102 . ПМЦ   1183549 . ПМИД   16061809 .
  24. ^ Герарди, Э; Юлс, Мэн; Мигель, Р.Н.; Бланделл, ТЛ; Ямеле, Л; Гоф, Дж; Бандиопадхьяй, А; Хартманн, Г; Батлер, Пи Джей (2003). «Функциональная карта и доменная структура MET, продукта протоонкогена c-met и рецептора фактора роста гепатоцитов / фактора рассеяния» . Труды Национальной академии наук . 100 (21): 12039–44. Бибкод : 2003PNAS..10012039G . дои : 10.1073/pnas.2034936100 . ПМК   218709 . ПМИД   14528000 .
  25. ^ Чотия, К; Гоф, Дж (2009). «Геномные и структурные аспекты эволюции белков». Биохимический журнал . 419 (1): 15–28. дои : 10.1042/BJ20090122 . ПМИД   19272021 .
  26. ^ Апик, Г; Гоф, Дж .; Тейхманн, С.А. (2001). «Комбинации доменов в протеомах архей, эубактерий и эукариот». Журнал молекулярной биологии . 310 (2): 311–25. дои : 10.1006/jmbi.2001.4776 . ПМИД   11428892 .
  27. ^ Гоф, Дж.; Карплюс, К.; Хьюи, Р.; Чотия, К. (2001). «Присвоение гомологии последовательностям генома с использованием библиотеки скрытых моделей Маркова, которые представляют все белки известной структуры1». Журнал молекулярной биологии . 313 (4): 903–919. CiteSeerX   10.1.1.144.6577 . дои : 10.1006/jmbi.2001.5080 . ПМИД   11697912 .
  28. ^ Тайхманн, SA ; Райсон, Южная Каролина; Торнтон, Дж. М. ; Райли, М; Гоф, Дж .; Чотия, К. (2001). «Эволюция и структурная анатомия метаболических путей малых молекул в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 311 (4): 693–708. CiteSeerX   10.1.1.121.1628 . дои : 10.1006/jmbi.2001.4912 . ПМИД   11518524 ​​.
  29. ^ Касукава, Т; Фуруно, М; Никайдо, я; Боно, Х; Хьюм, Д.А.; Балт, С; Хилл, ДП; Бальдарелли, Р; Гоф, Дж .; Канапин А; Мацуда, Х; Шримл, Л.М.; Хаясидзаки, Ю; Окадзаки, Ю; Квакенбуш, Дж (2003). «Разработка и оценка автоматизированного конвейера аннотаций и системы аннотаций кДНК» . Геномные исследования . 13 (6Б): 1542–51. дои : 10.1101/гр.992803 . ПМК   403710 . ПМИД   12819153 . Значок открытого доступа
  30. ^ Шихаб, штат Ха; Гоф, Дж; Купер, Д.Н.; День, IN; Гонт, ТР (2013). «Прогнозирование функциональных последствий аминокислотных замен, связанных с раком» . Биоинформатика . 29 (12): 1504–10. doi : 10.1093/биоинформатика/btt182 . ПМЦ   3673218 . ПМИД   23620363 .
  31. ^ Лю, Дж.; Гоф, Дж .; Рост, Б. (2006). «Отличие кодирующих белки от некодирующих РНК с помощью машин опорных векторов» . ПЛОС Генетика . 2 (4): е29. дои : 10.1371/journal.pgen.0020029 . ПМК   1449884 . ПМИД   16683024 .
  32. ^ Фантом, Консорциум; Сузуки, Х; Форрест, Арканзас; Ван Нимвеген, Э; Дауб, Колорадо; Балвирц, П.Дж.; Ирвин, КМ; Лассманн, Т; Раваси, Т; Хасэгава, Ю; Де Хун, MJ; Катаяма, С; Шредер, К; Карнинчи, П; Томару, Ю; Канамори-Катаяма, М; Кубосаки, А; Акалин А; Андо, Ю; Арнер, Э; Асада, М; Асахара, Х; Бейли, Т; Баич, В.Б.; Бауэр, Д; Бекхаус, АГ; Бертен, Н; Бьёркегрен, Дж; Бромбахер, Ф; и др. (2009). «Транскрипционная сеть, которая контролирует остановку роста и дифференцировку в линии клеток миелоидного лейкоза человека» . Природная генетика . 41 (5): 553–62. дои : 10.1038/ng.375 . ПМК   6711855 . ПМИД   19377474 .
  33. ^ Бабу, ММ; Прия, МЛ; Сельван, АТ; Мадера, М; Гоф, Дж; Аравинд, Л; Шанкаран, К. (2006). «База данных бактериальных липопротеинов (DOLOP) с функциональными назначениями предсказанным липопротеинам» . Журнал бактериологии . 188 (8): 2761–73. дои : 10.1128/JB.188.8.2761-2773.2006 . ПМК   1446993 . ПМИД   16585737 .
  34. ^ «Гранты правительства Великобритании вручены Джулиану Гофу» . Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала 15 марта 2015 года.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Julian_Gough_(scientist)&oldid=1231915479"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 45f066f9bfd5f546acf17a712fa37a08__1719780600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/45/08/45f066f9bfd5f546acf17a712fa37a08.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Julian Gough (scientist) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)