Jump to content

Рафаэль Иризарри (ученый)

Рафаэль Ирисарри
Рожденный
Рафаэль Анхель Иризарри
Альма-матер
Известный Биопроводник
Награды
Научная карьера
Поля Статистика
Биостатистика
Наука о данных
Геномика
Эпигенетика [1]
Диссертация Статистика и музыка: подгонка модели локальной гармоники к музыкальным звуковым сигналам   (1998)
Докторантура Дэвид Р. Бриллинджер [2]
Веб-сайт Рафалаб .org Отредактируйте это в Викиданных

Рафаэль Иризарри — профессор биостатистики в Гарвардской школе общественного здравоохранения им. Т.Ч. Чана и профессор биостатистики и вычислительной биологии в Институте рака Даны-Фарбера . [1] [3] [4] [5] Иризарри известен как один из основателей проекта Bioconductor .

Образование

[ редактировать ]

Ирисарри получил степень бакалавра наук по математике в Университете Пуэрто-Рико в Рио-Пьедрас в 1993 году, а затем степень магистра гуманитарных наук в Калифорнийском университете в Беркли в 1994 году. Он продолжил обучение в Беркли, получив докторскую степень по статистике в 1998. Его докторская диссертация была посвящена использованию статистики для моделирования гармоний звуковых сигналов и была написана под руководством Дэвида Р. Бриллинджера . [2] [6] [7]

Исследования и карьера

[ редактировать ]

Иризарри поступил в Школу общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса в 1998 году, где его исследования были сосредоточены на геномике и вычислительной биологии . [6] Он работал над анализом и обработкой данных, полученных в результате экспериментов с микрочипами , и помог разработать метод Robust Multiarray Analysis (RMA) для анализа микрочипов в сотрудничестве со статистиком Терри Спидом и его коллегами; [8] позже этот метод был расширен как метод замороженного RMA (fRMA). [9] [10] Он также работал над анализом данных секвенирования следующего поколения .

Иризарри — один из основателей проекта Bioconductor , проекта программного обеспечения с открытым исходным кодом для анализа геномных данных на языке программирования R. [11] [12] [13] Он участвовал в разработке нескольких наиболее часто используемых пакетов Bioconductor, включая пакет affy для анализа данных микрочипов Affymetrix . [10] [14] [15]

Иризарри — разработчик и преподаватель онлайн-курса «Анализ данных для наук о жизни» на платформе edX Гарвардского университета ; на этом курсе обучается более 30 000 студентов в год. [10] [16]

Награды и почести

[ редактировать ]

2009 г. Премия президента COPSS в области статистики. [17]

Премия Мортимера Шпигельмана 2009 г. от Американской ассоциации общественного здравоохранения. [18] [19] вручается выдающимся статистикам общественного здравоохранения в возрасте до 40 лет.

2017 года Премия Бенджамина Франклина в области биоинформатики за продвижение бесплатных материалов и методов в открытом доступе в области наук о жизни. [20] [21]

В 2020 году он был избран членом Международного общества вычислительной биологии . [22]

  1. ^ Jump up to: а б Публикации Рафаэля Иризарри, проиндексированные Google Scholar Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ Jump up to: а б Рафаэль Ирисарри в проекте «Математическая генеалогия» Отредактируйте это в Викиданных
  3. ^ «Рафаэль Иризарри» . Физический факультет Гарвардского университета . Проверено 12 августа 2017 г.
  4. ^ «Рафаэль Ирисарри, доктор философии - DF/HCC» . Дана-Фарбер/Гарвардский онкологический центр . Проверено 12 августа 2017 г.
  5. ^ Циммер, Карл (1 июля 2016 г.). «Болезни роста в области эпигенетики, поскольку некоторые требуют капитального ремонта» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 30 августа 2017 г.
  6. ^ Jump up to: а б Ирисарри, Рафаэль. "О" . Лаборатория Рафаэля Иризарри .
  7. ^ Иризарри, Рафаэль (1998). Статистика и музыка: сопоставление модели локальной гармоники с музыкальными звуковыми сигналами (PDF) (докторская диссертация). OCLC   892825726 . S2CID   58781935 . ПроКвест   304424980 . Архивировано из оригинала (PDF) 12 августа 2017 г. Проверено 12 августа 2017 г. }
  8. ^ Певснер, Джонатан (2015). Биоинформатика и функциональная геномика (3-е изд.). Джон Уайли и сыновья. п. 488. ИСБН  978-1-118-58178-0 . Проверено 30 августа 2017 г.
  9. ^ МакКолл, Миннесота; Болстад, БМ; Иризарри, РА (22 января 2010 г.). «Замороженный робастный многоматричный анализ (fRMA)» . Биостатистика . 11 (2): 242–253. doi : 10.1093/biostatistics/kxp059 . ПМЦ   2830579 . ПМИД   20097884 .
  10. ^ Jump up to: а б с «Объявление лауреата премии Бенджамина Франклина 2017 года» . Биоинформатика.org . Проверено 12 августа 2017 г.
  11. ^ «Рафаэль Иризарри» . edX . 20 декабря 2013 года . Проверено 12 августа 2017 г.
  12. ^ Джентльмен, Роберт С .; Кэри, Винсент Дж; Бейтс, Дуглас М; Болстад, Бен; Деттлинг, Марсель ; Дюдуа, Сандрин ; Эллис, Байрон; Готье, Лоран; Ге, Юнчао; Джентри, Джефф; Хорник, Курт; Хотхорн, Торстен; Хубер, Вольфганг; Якус, Стефано; Ирисарри, Рафаэль; Лейш, Фридрих; Ли, Ченг; Меклер, Мартин; Россини, Энтони Дж; Савицкий, Гюнтер; Смит, Колин; Смит, Гордон; Тирни, Люк; Ян, Жан Ю.Х.; Чжан, Цзяньхуа (2004). «Биокондуктор: разработка открытого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики» . Геномная биология . 5 (10): 80 рандов. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r80 . ПМК   545600 . ПМИД   15461798 .
  13. ^ Мулекар, Мадхури (октябрь 2009 г.). «Статистики, отмеченные за вклад | Amstat News» . журнал.amstat.org . Проверено 30 августа 2017 г.
  14. ^ Ирисарри, Рафаэль; Готье, Лоран (2017). «Методы получения массивов олигонуклеотидов Affymetrix» . Биопроводник . doi : 10.18129/B9.bioc.affy . Проверено 12 августа 2017 г.
  15. ^ Готье, Л.; Коуп, Л.; Болстад, БМ; Иризарри, РА (10 февраля 2004 г.). «affy — анализ данных Affymetrix GeneChip на уровне зонда» . Биоинформатика . 20 (3): 307–315. doi : 10.1093/биоинформатика/btg405 . ПМИД   14960456 .
  16. ^ «Анализ данных для наук о жизни 1: Статистика и R» . Гарвардское онлайн-обучение . 10 апреля 2016 г. Проверено 12 августа 2017 г.
  17. ^ «Президентская премия» . Комитет президентов статистических обществ . Архивировано из оригинала 6 декабря 2015 г. Проверено 12 августа 2017 г.
  18. ^ «Проверка сложной биологии: как массивы могут дополнить ваши данные следующего поколения» . Научные вебинары . 5 декабря 2012 года . Проверено 12 августа 2017 г.
  19. ^ «Премия Мортимера Шпигельмана — РАЗДЕЛ СТАТИСТИКИ APHA» . сайты.google.com . Проверено 30 августа 2017 г.
  20. ^ «Премия Бенджамина Франклина» . Биоинформатика.org . Проверено 12 августа 2017 г.
  21. ^ «Рафаэль Иризарри выигрывает премию Бена Франклина 2017 года» . Гарвардская школа общественного здравоохранения им. Т.Ч. Чана, кафедра биостатистики . 11 апреля 2017 г. Архивировано из оригинала 12 августа 2017 г. Проверено 12 августа 2017 г.
  22. ^ «19 февраля 2020 г.: ISCB поздравляет и представляет класс стипендиатов 2020 года!» . www.iscb.org . Проверено 23 июня 2020 г.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d38bc95744d6111fc0bb84474980df2f__1698249960
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d3/2f/d38bc95744d6111fc0bb84474980df2f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Rafael Irizarry (scientist) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)