Jump to content

Андерс Крог

Андерс Крог
Национальность датский
Альма-матер Копенгагенский университет
Занятие Профессор
Известный скрытые марковские модели , нейронные сети
Награды Сотрудник ISCB (2017 г.)
Научная карьера
Поля Биоинформатика
Учреждения Копенгагенский университет
Веб-сайт люди .binf .дк /крог

Андерс Крог биоинформатик из Копенгагенского университета . [1] где он возглавляет университетский центр биоинформатики . Он известен своими новаторскими работами по использованию скрытых моделей Маркова в биоинформатике (совместно с Дэвидом Хаусслером ), [2] [3] [4] и является соавтором широко используемого учебника по биоинформатике. [5] Кроме того, он также был соавтором одного из первых учебников по нейронным сетям . [6] Его текущие исследовательские интересы включают анализ промоутеров , [7] [8] [9] некодирующая РНК , [10] [11] [12] предсказание генов [13] [14] [15] и предсказание структуры белка . [16] [17] [18] [19] [20]

В 2017 году Крог был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [21]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ "Пользователь: Крог - БИНФ - Центр Биоинформатики" . Архивировано из оригинала 02 сентября 2011 г. Проверено 14 апреля 2011 г. Профессор Андерс Крог, Центр биоинформатики, кафедра молекулярной биологии, Копенгагенский университет
  2. ^ Крог А., Браун М., Миан И.С., Шёландер К., Хаусслер Д. (1994). «Скрытые марковские модели в вычислительной биологии. Приложения к моделированию белков». Дж. Мол. Биол . 235 (5): 1501–31. дои : 10.1006/jmbi.1994.1104 . ПМИД   8107089 .
  3. ^ Крог А., Миан И.С., Хаусслер Д. (1994). «Скрытая модель Маркова, которая находит гены в ДНК E. coli» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (22): 4768–78. дои : 10.1093/нар/22.22.4768 . ПМК   308529 . ПМИД   7984429 .
  4. ^ Шёландер К., Карплюс К., Браун М. и др. (1996). «Смеси Дирихле: метод улучшенного обнаружения слабой, но значительной гомологии белковых последовательностей» . Вычислить. Прил. Биосци . 12 (4): 327–45. дои : 10.1093/биоинформатика/12.4.327 . ПМИД   8902360 .
  5. ^ Дурбин, Ричард М .; Эдди, Шон Р .; Крог, Андерс ; Митчисон, Грэм (1998), Анализ биологических последовательностей: вероятностные модели белков и нуклеиновых кислот (1-е изд.), Кембридж, Нью-Йорк: Cambridge University Press , ISBN  0-521-62971-3 , OCLC   593254083
  6. ^ Введение в теорию нейронных вычислений (Исследования Института Санта-Фе в области наук о сложности). (1991) Джон А. Герц, Ричард Г. Палмер, Андерс Крог, Westview Press
  7. ^ Марстранд Т.Т., Фрелсен Дж., Мольтке И. и др. (2008). Копли Р. (ред.). «Как можно скорее: основа статистики чрезмерного представительства сайтов связывания факторов транскрипции» . ПЛОС ОДИН . 3 (2): e1623. Бибкод : 2008PLoSO...3.1623M . дои : 10.1371/journal.pone.0001623 . ПМК   2229843 . ПМИД   18286180 . Значок открытого доступа
  8. ^ Фрит М.К., Вален Э., Крог А., Хаяшизаки Ю., Карнинчи П., Санделин А. (2008). «Код инициации транскрипции в геномах млекопитающих» . Геном Рез . 18 (1): 1–12. дои : 10.1101/гр.6831208 . ПМК   2134772 . ПМИД   18032727 .
  9. ^ Брин Дж.К., Вален Э., Тан М.Х. и др. (2008). «JASPAR, база данных открытого доступа с профилями связывания факторов транскрипции: новый контент и инструменты в обновлении 2008 года» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (Проблема с базой данных): D102–6. дои : 10.1093/нар/gkm955 . ПМК   2238834 . ПМИД   18006571 .
  10. ^ Линдоу М., Якобсен А., Найгаард С., Манг Ю., Крог А. (2007). «Внутригеномное сопоставление открывает огромный потенциал для микроРНК-опосредованной регуляции в растениях» . ПЛОС Компьютер. Биол . 3 (11): е238. Бибкод : 2007PLSCB...3..238L . дои : 10.1371/journal.pcbi.0030238 . ПМК   2098865 . ПМИД   18052543 . Значок открытого доступа
  11. ^ Линдгрин С., Гарднер П.П., Крог А. (2007). «MASTR: множественное выравнивание и предсказание структуры некодирующих РНК с использованием моделирования отжига». Биоинформатика . 23 (24): 3304–11. CiteSeerX   10.1.1.563.7072 . doi : 10.1093/биоинформатика/btm525 . ПМИД   18006551 .
  12. ^ Линдгрин С., Гарднер П.П., Крог А. (2006). «Измерение ковариации в выравнивании РНК: физический реализм улучшает информационные показатели». Биоинформатика . 22 (24): 2988–95. doi : 10.1093/биоинформатика/btl514 . ПМИД   17038338 .
  13. ^ Мунк К., Крог А. (2006). «Автоматическое создание средств поиска генов эукариотических видов» . БМК Биоинформатика . 7 : 263. дои : 10.1186/1471-2105-7-263 . ПМК   1522026 . ПМИД   16712739 . Значок открытого доступа
  14. ^ Мунк К., Гарднер П.П., Арктандер П., Крог А. (2006). «Подход скрытой марковской модели для определения экспрессии на микрочипах геномных плиток» . БМК Биоинформатика . 7 : 239. дои : 10.1186/1471-2105-7-239 . ПМЦ   1481622 . ПМИД   16672042 . Значок открытого доступа
  15. ^ Нильсен П., Крог А. (2005). «Крупномасштабное предсказание генов прокариот и сравнение с аннотацией генома» . Биоинформатика . 21 (24): 4322–9. doi : 10.1093/биоинформатика/bti701 . ПМИД   16249266 .
  16. ^ Крог А., Ларссон Б., фон Хейне Г., Зоннхаммер Э.Л. (2001). «Прогнозирование топологии трансмембранных белков с помощью скрытой модели Маркова: применение для полных геномов». Дж Мол Биол . 305 (3): 567–580. дои : 10.1006/jmbi.2000.4315 . ПМИД   11152613 .
  17. ^ Винтер О, Крог А (2004). «Обучение компьютеров сворачиванию белков». Физ. Преподобный Е. 70 (3): 030903. arXiv : cond-mat/0309497 . Бибкод : 2004PhRvE..70c0903W . дои : 10.1103/PhysRevE.70.030903 . ПМИД   15524499 . S2CID   103560 .
  18. ^ Выиграл KJ, Хамелрик Т, Прюгель-Беннетт А, Крог А (2007). «Эволюционный метод изучения структуры HMM: предсказание вторичной структуры белка» . БМК Биоинформатика . 8 : 357. дои : 10.1186/1471-2105-8-357 . ПМК   2072961 . ПМИД   17888163 . Значок открытого доступа
  19. ^ Хамелрик Т., Кент Дж. Т., Крог А. (2006). «Отбор реалистичных конформаций белка с использованием локального структурного смещения» . ПЛОС Компьютер. Биол . 2 (9): е131. Бибкод : 2006PLSCB...2..131H . дои : 10.1371/journal.pcbi.0020131 . ПМК   1570370 . ПМИД   17002495 . Значок открытого доступа
  20. ^ Бумсма В., Мардия К.В., Тейлор CC, Феркингхофф-Борг Дж., Крог А., Хамелрик Т. (2008). «Генеративная вероятностная модель локальной структуры белка» . ПНАС . 105 (26): 8932–8937. Бибкод : 2008PNAS..105.8932B . дои : 10.1073/pnas.0801715105 . ПМК   2440424 . ПМИД   18579771 .
  21. ^ «13 февраля 2017 г.: Международное общество вычислительной биологии назвало семь членов классом стипендиатов ISCB 2017 г.» . www.iscb.org . Проверено 13 февраля 2017 г.
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d4d4f6a163fd133e8eb8bacb1293c233__1701444420
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d4/33/d4d4f6a163fd133e8eb8bacb1293c233.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Anders Krogh - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)