Лиор Пахтер
Лиор Пахтер | |
|---|---|
 Лиор Пахтер в 2013 году | |
| Рожденный | Лиор Сэмюэл Пахтер 3 мая 1973 г. |
| Альма-матер | Калифорнийский технологический институт (BS) Массачусетский технологический институт (доктор философии) |
| Награды | Сотрудник ISCB (2017 г.) |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биология Биоинформатика Геномика Информатика Математика [1] |
| Учреждения | Калифорнийский университет, Беркли |
| Диссертация | Плитка домино, распознавание генов и мыши (1999) |
| Докторантура | Бонни Бергер [2] |
| Докторанты | Коул Трапнелл [2] [3] |
| Веб-сайт | Лиор арендатор |
Лиор Сэмюэл Пэчтер — компьютерный биолог . Он работает в Калифорнийском технологическом институте , где является профессором вычислительной биологии Брена. Его исследовательские интересы широко варьируются, включая геномику , комбинаторику , вычислительную геометрию , машинное обучение , научные вычисления и статистику . [1] [4] [5]
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Пахтер родился в Израиле и вырос в Южной Африке . [6] Он получил степень бакалавра математики в Калифорнийском технологическом институте в 1994 году. [4] Он получил докторскую степень по математике в Массачусетском технологическом институте в 1999 году под руководством Бонни Бергер . [2] с Эриком Лендером и Дэниелом Клейтманом в качестве сосоветников. [4]
Карьера и исследования
[ редактировать ]Пахтер работал на факультете Калифорнийского университета в Беркли с 1999 по 2018 год. [7] и получил кресло Саклера в 2012 году. [4]
Помимо своего технического вклада, Пахтер известен тем, что использует новые медиа для продвижения открытой науки. [8] а в своем блоге он опубликовал мысленный эксперимент , согласно которому «ближайший сосед «идеального человека» — из Пуэрто-Рико . [9] Это привлекло значительное внимание средств массовой информации, [10] и ответ был опубликован в журнале Scientific American . [11] Он также известен своей резкой критикой проекта «Все мы» по диверсификации генетики человека. [12]
Награды и почести
[ редактировать ]В 2017 году Пахтер был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [13]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Публикации Лиора Пахтера , проиндексированные Google Scholar
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Лиор Пахтер в проекте «Математическая генеалогия»
- ^ Трапнелл, Коул; Пахтер, Лиор; Зальцберг, Стивен Л. (2009). «TopHat: обнаружение соединений сплайсинга с помощью RNA-Seq» . Биоинформатика . 25 (9): 1105–1111. doi : 10.1093/биоинформатика/btp120 . ISSN 1460-2059 . ПМЦ 2672628 . ПМИД 19289445 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Биографические данные: Лиор Пахтер (PDF) , 2017 г. , получено 16 мая 2017 г.
- ^ Трапнелл, Коул; Уильямс, Брайан А; Пертеа, Гео; Мортазави, Али; Кван, Гордон; ван Барен, Марийке Дж; Зальцберг, Стивен Л; Уолд, Барбара Дж; Пахтер, Лиор (2010). «Сборка транскриптов и количественная оценка с помощью RNA-Seq выявляют неаннотированные транскрипты и переключение изоформ во время дифференцировки клеток» . Природная биотехнология . 28 (5): 511–515. дои : 10.1038/nbt.1621 . ISSN 1087-0156 . ПМК 3146043 . ПМИД 20436464 .
- ^ Эскенази, Джо (14 июня 2002 г.), «Петиция о продаже активов UC беспокоит произраильских активистов» , Jweekly .
- ^ «Калифорнийский университет в Беркли, факультет математики, Лиор Пахтер» . Проверено 8 июня 2019 г.
- ^ Лесен, Эми Э. (2015), «Новая парадигма научной коммуникации? Социальные сети, Твиттер, наука и участие общественности: обзор литературы», в книге Лесен, Эми Э. (редактор), « Учёные, эксперты и гражданские права». Взаимодействие: идти по тонкой грани , Исследования Ashgate в области экологической политики и практики, Ashgate Publishing, Ltd., стр. 111–136, ISBN 9781472415240 . См., в частности, стр. 119–120 .
- ^ Пахтер, Лиор (2 декабря 2014 г.). «Идеальный человек — пуэрториканец» . Биты ДНК - Обзоры и комментарии по вычислительной биологии Лиора Пахтера . Проверено 11 декабря 2016 г.
- ^ Вальдес, Мария Г. (4 декабря 2014 г.), «Новое исследование показывает, что идеальный генетически говорящий человек родом с этого карибского острова!» , Латин Таймс
- ^ Олексик, Тарас К.; Мартинес-Крусадо, Хуан Карлос (5 февраля 2015 г.). «Почему нет идеального человека ни в Пуэрто-Рико, ни где-либо еще» . Научный американец . .
- ^ пахтер, лиор (26 февраля 2024 г.). «все мы потерпели неудачу» . вордпресс . Проверено 8 марта 2024 г.
все мы потерпели неудачу
- ^ «13 февраля 2017 г.: Международное общество вычислительной биологии назвало семь членов классом стипендиатов ISCB 2017 г.» . www.iscb.org . Проверено 13 февраля 2017 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Официальный сайт
СМИ, связанные с Лиором Пахтером, на Викискладе?
- Живые люди
- Американские биологи XXI века
- Американские математики XX века
- Американские математики XXI века
- Израильские биологи
- Израильские математики
- Израильские ученые-компьютерщики
- Южноафриканские биологи
- Южноафриканские математики
- Южноафриканские ученые-компьютерщики
- Выпускники Калифорнийского технологического института
- Калифорнийский университет, факультет Беркли
- Комбинатористы
- Исследователи геометрических алгоритмов
- 1973 года рождения
- Американские биоинформатики
- Члены Международного общества вычислительной биологии
- Выпускники Массачусетского технологического института