Филип Борн
Фил Борн | |
---|---|
![]() Филип Эрик Борн | |
Рожденный | Филип Эрик Борн 1953 (70–71 год) [6] |
Альма-матер | Университет Флиндерса (доктор философии) |
Известный |
|
Супруг | Рома Чалупа |
Дети |
|
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | Наука о данных Вычислительная биология Научное общение [5] Биоинформатика |
Учреждения | |
Диссертация | Анализ кристаллической структуры: металлические комплексы, представляющие биологический интерес, и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов (1979). |
Известные студенты | Вернер Г. Кребс |
Веб-сайт | наука о данных |
Филип Эрик Борн (род. 1953) — австралийский биоинформатик , [10] писатель-фантаст, [7] и бизнесмен. [9] В настоящее время он является заведующим кафедрой науки о данных Стивенсона, директором Школы науки о данных и профессором биомедицинской инженерии. [11] и был первым заместителем директора по науке о данных в Национальных институтах здравоохранения , где его проекты включают управление инициативой «Большие данные к знаниям» , а также бывшим заместителем вице-канцлера в UCSD . [12] Он внес свой вклад в создание учебников и является решительным сторонником литературы и программного обеспечения с открытым доступом. Его разнообразные интересы охватывают структурную биологию , медицинскую информатику , информационные технологии , структурную биоинформатику , научные коммуникации и фармацевтические науки . [10] Его статьи высоко цитируются, а индекс Хирша превышает 80. [13] [14] [5]
Образование
[ редактировать ]Борн получил образование физико-химика в середине-конце 1970-х годов и получил докторскую степень в 1979 году. [6] в Университете Флиндерса .
Карьера и исследования
[ редактировать ]После получения докторской степени Борн перешел в Шеффилдский университет, чтобы заниматься постдокторскими исследованиями в 1979–1981 годах. [15] за которым последовал переезд в Колумбийский университет в Нью-Йорке в 1981 году. В 1995 году он переехал в Калифорнийский университет в Сан-Диего , где работал профессором кафедры фармакологии. В 2014 году он перешёл в НИЗ и стал заместителем директора по науке о данных. В январе 2017 года было объявлено, что он принял должность директора Института науки о данных Университета Вирджинии . [16]
Он известен тем, что написал книгу «Unix для VMS» пользователей (1990). [7] и за участие в разработке алгоритма комбинаторного расширения для трехмерного выравнивания белковых структур , [17] совместно с И. Шиндяловым (1998). В 1999 году он стал содиректором Protein Data Bank . [18] Он был президентом ISCB ( 2002–2003). [19] Он является членом Американской ассоциации медицинской информатики с 2002 года. [20] Он является главным редактором-основателем журнала PLoS Computational Biology (2005-). В 2007 году он стал соучредителем SciVee . [9] Борн — редактор популярной серии редакционных статей «Десять простых правил» , опубликованных в журнале PLoS Computational Biology . [21] Он занимал должность заместителя вице-канцлера по инновациям и промышленным альянсам. [12] и профессор фармакологии Школы фармации и фармацевтических наук Скэггса в Калифорнийского университета Сан-Диего (UCSD). [22] [23] Он является советником Hypothes.is. проекта [24] и заместитель директора по науке о данных в Национальных институтах здравоохранения , где его проекты включают управление инициативой «Большие данные к знаниям» . [25] [26]
Публикации
[ редактировать ]Борн — автор многочисленных научных статей и глав книг, а также редактор учебника по структурной биоинформатике . [27] [28] и фармацевтическая информатика [29] Другие публикации [5] включать:
- Структурная биоинформатика 1-е издание [27]
- Структурная биоинформатика 2-е издание [28]
- Аптечная информатика [29]
- Unix для пользователей VMS [7]
- Борн, Филип Э. (1 января 1997 г.). Поваренная книга по обслуживанию Интернета для UNIX . Прентис Холл. ISBN 9780135199923 .
- Харт, Дэвид Л.; Борн, Филип Э. (12 августа 1998 г.). Поваренная книга веб-сервера Mac OS 8 (1-е изд.). Прентис Холл PTR. ISBN 9780135200162 .
- Борн, Филип Э. (1 января 2000 г.). Путеводитель по метрополитену Unix . Прентис Холл. ISBN 9780131844582 .
- Берман, HM; Уэстбрук, Дж.; Фэн, З.; Гиллиланд, Г.; Бхат, Теннесси; Вайссиг, Х.; Шиндялов И.Н.; Борн, ЧП (1 января 2000 г.). «Банк данных о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (1): 235–242. дои : 10.1093/нар/28.1.235 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 102472 . ПМИД 10592235 .
Награды и почести
[ редактировать ]Борн был избран членом AAAS по фармацевтическим наукам в 2011 году. [1] и член Международного общества вычислительной биологии (ISCB) в 2011 году. [2] В 2010 году он получил Джима Грея в области электронных наук от Microsoft. премию [3] а в 2009 году получил премию Бенджамина Франклина (2009). [4] [30]
Личная жизнь
[ редактировать ]Борн женат с 1983 года на Роме Чалупе, у них двое детей: Скотт Борн (1985-) и Мелани Борн (1997-). [ нужна ссылка ] В его интересы входят мотоциклы, [31] полеты и походы
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Доктор Фил Борн избран научным сотрудником AAAS по фармацевтическим наукам» . Pharmacy.ucsd.edu . Проверено 27 февраля 2011 г.
- ^ Jump up to: а б «Мужчины ISCB» . Архивировано из оригинала 28 марта 2015 г. Проверено 15 августа 2011 г.
- ^ Jump up to: а б «Филип Э. Борн выигрывает премию Джима Грея в области электронных наук от Microsoft в 2010 году» . Eurekalert.org. 18 октября 2010 г. Проверено 27 февраля 2011 г.
- ^ Jump up to: а б «Премия Бенджамина Франклина» . Биоинформатика.org . Проверено 27 февраля 2011 г.
- ^ Jump up to: а б с Публикации Филипа Борна , индексируемые Google Scholar
- ^ Jump up to: а б Борн, Филип Эрик (1979). Анализ кристаллической структуры: металлические комплексы, представляющие биологический интерес, и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов (кандидатская диссертация). Университет Флиндерса. OCLC 708090572 .
- ^ Jump up to: а б с д Борн, Фил Э. (1990). Unix для пользователей VMS . Digital Press Ньютон, Массачусетс, США. ISBN 1-55558-034-3 .
- ^ Берман, HM ; Уэстбрук, Дж.; Фэн, З.; Гиллиланд, Г.; Бхат, Т.; Вайссиг, Х.; Шиндялов И.; Борн, П. (2000). «Банк данных о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (1): 235–242. дои : 10.1093/нар/28.1.235 . ПМЦ 102472 . ПМИД 10592235 .
- ^ Jump up to: а б с Финк, Дж.Л.; Борн, ЧП (2007). «Переосмысление научной коммуникации в эпоху электронных технологий» . CTWatch ежеквартально . 3 (3).
- ^ Jump up to: а б Публикации Филипа Борна , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ «Филип Э. Борн» . 6 июля 2017 г.
- ^ Jump up to: а б «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 31 июля 2012 г. Проверено 2 июля 2012 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка ) - ^ страница в Университете Вирджинии
- ^ старый сайт Борна
- ^ Клегг, Джорджия; Стэнсфилд, РФД; Борн, ЧП; Харрисон, премьер-министр (1980). «Упаковка спирали и конформация субъединиц апоферритина селезенки лошади». Природа . 288 (5788): 298–300. Бибкод : 1980Natur.288..298C . дои : 10.1038/288298a0 . ПМИД 7432529 . S2CID 4335735 .
- ^ «UVA назначает исследователя НИЗ новым директором Института науки о данных» . 11 января 2017 г.
- ^ Шиндялов И.Н.; Борн, ЧП (1998). «Выравнивание структуры белка путем постепенного комбинаторного расширения (CE) оптимального пути» . Инженерный дизайн и отбор белков . 11 (9): 739–747. дои : 10.1093/протеин/11.9.739 . ПМИД 9796821 .
- ^ Берман, HM ; Уэстбрук, Дж.; Фэн, З.; Гиллиланд, Г.; Бхат, Т.; Вайссиг, Х.; Шиндялов И.; Борн, П. (2000). «Банк данных о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (1): 235–242. дои : 10.1093/нар/28.1.235 . ПМЦ 102472 . ПМИД 10592235 .
- ^ «ISCB — Бывшие президенты» . Архивировано из оригинала 28 августа 2015 года . Проверено 3 сентября 2015 г.
- ^ Гринс, РА; Мэдсен, Э.; Миллер, РА (2003). «Стипендиаты и международные партнеры Американского колледжа медицинской информатики, 2002 г.» . Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 10 (3): 281–286. дои : 10.1197/jamia.M1326 . ПМК 400512 .
- ^ Десять простых правил
- ^ http://www.sdsc.edu/pb/ Веб-страница лаборатории Борна
- ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf Филип Э. Борн, доктор философии. резюме
- ^ Официальный сайт Hypothes.is
- ^ НИЗ назначает доктора Филипа Э. Борна первым заместителем директора по науке о данных
- ^ Марголис, Р.; Дерр, Л.; Данн, М.; Уэрта, М.; Ларкин, Дж.; Шихан, Дж.; Гайер, М.; Грин, ЭД (2014). «Инициатива Национального института здравоохранения «От больших данных к знаниям» (BD2K): использование больших биомедицинских данных» . Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 21 (6): 957–8. дои : 10.1136/amiajnl-2014-002974 . ISSN 1067-5027 . ПМК 4215061 . ПМИД 25008006 .
- ^ Jump up to: а б Борн, Филип Э.; Вайссиг, Хельга (2003). Структурная биоинформатика . Джон Уайли и сыновья.
- ^ Jump up to: а б Гу, Дженни; Борн, Филип Э. (март 2009 г.). Структурная биоинформатика (2-е изд.). Уайли-Блэквелл. ISBN 978-0-470-18105-8 .
- ^ Jump up to: а б Андерсон, Филип О.; Борн, Филип Э. (декабрь 2009 г.). Аптечная информатика . ЦРК Пресс. ISBN 978-1-4200-7175-7 .
- ^ «Признание Борна: евангелист открытого доступа получает премию Бенджамина Франклина 2009 года» . Bio-itworld.com . Проверено 27 февраля 2011 г.
- ^ ОФЛ | Филип Борн | Блог о путешествиях
- 1953 года рождения
- Живые люди
- Австралийские биоинформатики
- Австралийские руководители
- Австралийские эмигранты в США
- Австралийские писатели научно-популярной литературы
- факультет Колумбийского университета
- Члены Американской ассоциации содействия развитию науки
- Члены Международного общества вычислительной биологии
- Выпускники Университета Флиндерса
- Калифорнийский университет, факультет Сан-Диего
- Факультет Университета Вирджинии