Лоуренс Хантер
Ларри Хантер | |
|---|---|
 Ларри Хантер в 2002 году | |
| Рожденный | Лоуренс Э. Хантер 18 января 1961 г. |
| Альма-матер | Йельский университет (доктор философии) |
| Известный | Интеллектуальные системы молекулярной биологии (ISMB) Международное общество вычислительной биологии (ISCB) |
| Награды | Сотрудник ISCB (2010 г.) |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биология Искусственный интеллект Биоинформатика [1] |
| Учреждения | Медицинский факультет Университета Колорадо Университет Джорджа Мейсона |
| Диссертация | Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт (1989) |
| Докторантура | Роджер Шэнк [2] |
| Веб-сайт | компбио |
Лоуренс Э. Хантер — профессор и директор Центра вычислительной фармакологии и программы вычислительной биологии медицинского факультета Университета Колорадо , а также профессор компьютерных наук Университета Колорадо в Боулдере . [3] Он всемирно известный ученый, [1] [4] ориентирован на вычислительную биологию, основанное на знаниях извлечение информации из первичной биомедицинской литературы, [5] семантическая интеграция ресурсов знаний в молекулярной биологии и использование знаний при анализе данных с высокой пропускной способностью, а также за его основополагающую работу в области вычислительной биологии, которая привела к возникновению крупной профессиональной организации в этой области и двух международные конференции. [6]
Образование
[ редактировать ]Хантер защитил докторскую диссертацию в Йельском университете в 1989 году, защитив диссертацию на тему «Планирование приобретения знаний: получение знаний через опыт» , по диагностике рака легких по гистологическим изображениям с использованием рассуждений на основе конкретных случаев . [7] под руководством Роджера Шанка . [2]
Карьера и исследования
[ редактировать ]Столкнувшись с выбором между карьерой в основных приложениях искусственного интеллекта — программировании игр и оборонной работе — Хантер выбрал новую дисциплину — биоинформатику . С 1989 по 2000 год Хантер работал ученым-компьютерщиком и руководителем отдела национальных институтов здравоохранения , посвященного статистическим и биоинформатическим исследованиям. Он был внештатным преподавателем Университета Джорджа Мейсона с 1991 по 2000 год. [ нужна ссылка ] и доцент Медицинской школы Денверского университета Колорадо с 2000 по 2008 год. В 2008 году он получил звание профессора. [8]
ИСКБ
[ редактировать ]ставшее крупнейшей профессиональной организацией в области вычислительной биологии и биоинформатики , В 1997 году Хантер основал Международное общество вычислительной биологии (ISCB) . [9]
Конференции
[ редактировать ]Хантер также был основателем трех успешных международных конференций по биоинформатике: Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии (ISMB) и Тихоокеанского симпозиума по биокомпьютерам (PSB). [10] и Конференция по биоинформатике Роки Маунтин. [11] Он также является соорганизатором конференции по биологической визуализации Vizbi. [12] Хантер был сооснователем и членом совета директоров Molecular Mining Corporation с 1997 по 2003 год.
Награды, почести и влияние
[ редактировать ]Хантер — член Американского колледжа медицинской информатики. [ нужна ссылка ] [ когда? ] и лауреат премии Энгельмора Ассоциации по развитию искусственного интеллекта (AAAI) 2003 года за инновационные применения искусственного интеллекта . [ нужна ссылка ]
Хантеру приписывают то, что он был одним из основателей области биоинформатики . [ нужна ссылка ] На протяжении всей своей карьеры Хантер исследовал и руководил исследовательскими группами, исследующими разработку и применение передовых вычислительных методов биомедицины для высокопроизводительных анализов, особенно применение статистических и основанных на знаниях методов, в частности биоонтологий. [13] к анализу высокопроизводительных данных и биомедицинских текстов. Он предложил нейробиологически и эволюционно обоснованные вычислительные модели познания, а также этические проблемы, связанные с вычислительной биологией. Он выступал за расширение деятельности в области науки о данных в биомедицине, включив в нее методы, основанные на знаниях. [14]
Он стал членом ISCB в 2010 году. Другие награды и награды включают премию Риджента за стипендию и технические достижения 1994 года. [ нужна ссылка ] Премия за выдающиеся заслуги, Национальная медицинская библиотека , 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998 гг. [ нужна ссылка ] Премия за выдающиеся достижения в исследованиях, Медицинского факультета Университета Колорадо , 2007 г. факультет фармакологии [ нужна ссылка ] Премия за выдающиеся достижения в преподавании, факультет профилактической медицины и биометрии медицинского факультета Университета Колорадо , 2004 г. [ нужна ссылка ]
Публикации
[ редактировать ]Избранные публикации включают:
- Риндфлеш, Т.; Танабэ, Л.; Вайнштейн Дж.; Хантер, Л. (2000). «ЭДГАР: Извлечение лекарств, генов и связей из биомедицинской литературы» . Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 517–528. дои : 10.1142/9789814447331_0049 . ISBN 978-981-02-4188-9 . ПМК 2709525 . ПМИД 10902199 .
- Шанк, RC; Коллинз, GC; Хантер, Луизиана (1986). «Превосходящее формирование индуктивных категорий в обучении». Поведенческие и мозговые науки . 9 (4): 639. дои : 10.1017/S0140525X00051578 . S2CID 144458369 .
- Риндфлеш, TC; Раджан, СП; Хантер, Л. (2000). «Извлечение молекулярных связей из биомедицинского текста». Материалы шестой конференции по прикладной обработке естественного языка - . стр. 188–195. дои : 10.3115/974147.974173 . S2CID 16166432 .
- Планирование изучения Материалы двенадцатой ежегодной конференции Общества когнитивных наук, Бостон, Массачусетс, июль 1990 г., стр. 26–34, Lawrence Erlbaum Associates, Хиллсдейл, Нью-Джерси. в. [15]
- Хантер, Лоуренс (1993). Искусственный интеллект и молекулярная биология . Менло-Парк, Калифорния: AAAI Press. ISBN 978-0-262-58115-8 .
- Баумгартнер, Вашингтон; Коэн, КБ; Фокс, Л.М.; Акваа-Менса, Г.; Хантер, Л. (2007). «Ручное курирование недостаточно для аннотирования геномных баз данных» . Биоинформатика . 23 (13): i41–i48. doi : 10.1093/биоинформатика/btm229 . ПМК 2516305 . ПМИД 17646325 .
- Хантер, Л .; Лу, З.; Фирби, Дж.; Баумгартнер-младший, Вашингтон; Джонсон, Х.Л.; Огрен, П.В.; Коэн, КБ (2008). «OpenDMAP: механизм концептуального анализа с открытым исходным кодом, основанный на онтологии, с приложениями для сбора знаний о транспорте белков, взаимодействиях белков и экспрессии генов, специфичных для определенного типа клеток» . БМК Биоинформатика . 9:78 . дои : 10.1186/1471-2105-9-78 . ПМК 2275248 . ПМИД 18237434 .
- Лич, С.М.; Типни, Х.; Фэн, В.; Баумгартнер, Вашингтон; Касливал, П.; Шайлер, Р.П.; Уильямс, Т.; Спритц, РА; Хантер, Л. (2009). Мияно, Сатору (ред.). «Ускорение биомедицинских открытий с применением к черепно-лицевому развитию» . PLOS Вычислительная биология . 5 (3): e1000215. Бибкод : 2009PLSCB...5E0215L . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000215 . ПМЦ 2653649 . ПМИД 19325874 .
- Хантер, Лоуренс (2009). Процессы жизни: введение в молекулярную биологию . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 0-262-01305-3 . [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Публикации Лоуренса Хантера , проиндексированные Google Scholar
- ^ Jump up to: а б Хантер, Лоуренс Э. (1989). Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт (кандидатская диссертация). Йельский университет. hdl : 10079/bibid/9838922 . OCLC 24116492 . ПроКвест 303852846 .
- ^ «Лоуренс Хантер, доктор философии». Compbio.ucdenver.edu . Проверено 12 апреля 2018 г.
- ^ Лоуренс Хантер на DBLP библиографическом сервере
- ^ Хантер, Л .; Коэн, КБ (2006). «Биомедицинская обработка речи: что за пределами PubMed?» . Молекулярная клетка . 21 (5): 589–594. doi : 10.1016/j.molcel.2006.02.012 . ПМК 1702322 . ПМИД 16507357 .
- ^ «Пионер с индивидуальностью: Ларри Хантер, основатель Международного общества вычислительной биологии». Мир биоинформатики : 6. Осень 2002 г.
- ^ Гибсон, Тодд А. (2012). «Корни биоинформатики в ISMB» . PLOS Вычислительная биология . 8 (8): e1002679. Бибкод : 2012PLSCB...8E2679G . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002679 . ПМЦ 3431341 . ПМИД 22952443 .
- ^ Jump up to: а б Хантер, Лоуренс (2009). Процессы жизни: введение в молекулярную биологию . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-01305-5 .
- ^ «Материалы 6-й Международной конференции по интеллектуальным системам молекулярной биологии. Монреаль, Квебек, Канада. 28 июня - 1 июля 1998 г.». Слушания. Международная конференция по интеллектуальным системам молекулярной биологии . 6 : 1–223. 1998. ПМИД 9867411 .
- ^ «Материалы 4-й Международной конференции по интеллектуальным системам молекулярной биологии. ISMB-96». Слушания. Международная конференция по интеллектуальным системам молекулярной биологии . 4 : 1–262. 1996. ПМИД 9005023 .
- ^ «Рокки 09 – Добро пожаловать!» . Iscb.org . Проверено 12 апреля 2018 г.
- ^ О'Донохью, Шон. «ВИЗБИ – Визуализация биологических данных» . Vizbi.org . Проверено 12 апреля 2018 г.
- ^ Ливингстон, Кевин М.; Бада, Майкл; Баумгартнер, Уильям А.; Хантер, Лоуренс Э. (23 апреля 2015 г.). «КаБОБ: семантическая интеграция биомедицинских баз данных на основе онтологий» . БМК Биоинформатика . 16 (1): 126. дои : 10.1186/s12859-015-0559-3 . ISSN 1471-2105 . ПМЦ 4448321 . ПМИД 25903923 .
- ^ Хантер, Лоуренс Э. (2017). «Биомедицинская наука о данных, основанная на знаниях» . EPJ Наука о данных . 1 (1–2): 19–25. дои : 10.3233/DS-170001 . ISSN 2193-1127 . ПМК 6171523 . ПМИД 30294517 .
- ^ Лик, Дэвид Б.; Рам, Эшвин (1995). Целенаправленное обучение . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-18165-5 .
