Хана Маргалит
Хана Маргалит | |
|---|---|
 | |
| Альма-матер | Еврейский университет Иерусалима (доктор философии) |
| Награды | Сотрудник ISCB (2018 г.) [1] Премия Ландау в области системной биологии (2008 г.) Премия Ротшильда в области вычислительной биологии [2] |
| Научная карьера | |
| Поля | Биоинформатика Вычислительная биология Системная биология [3] |
| Учреждения | Еврейский университет Иерусалима Национальные институты здравоохранения |
| Докторантура | Норман Гровер |
| Другие научные консультанты | Чарльз Делизи |
| Веб-сайт | Маргарита |
Хана Маргалит — профессор медицинского факультета Еврейского университета в Иерусалиме . [4] [5] Ее исследования сочетают в себе биоинформатику , вычислительную биологию и системную биологию , особенно в области регуляции генов у бактерий и эукариот . [3]
Образование
[ редактировать ]Маргалит получила степень бакалавра наук (по математике и биологии, 1974 г.) и степень магистра (по генетике с отличием, 1977 г.) в Еврейском университете в Иерусалиме. [4] В 1985 году она защитила докторскую диссертацию в области вычислительной молекулярной биологии под руководством Нормана Гровера в Еврейском университете Иерусалима. [ нужна ссылка ]
Карьера и исследования
[ редактировать ]Маргалит завершила постдокторское исследование в Национальных институтах здравоохранения (NIH) в лаборатории математической биологии под руководством Чарльза ДеЛизи , где разработала первый вычислительный алгоритм для прогнозирования антигенных пептидов, распознаваемых иммунными клетками. [6] В 1989 году она вернулась в Израиль и основала независимую исследовательскую группу на медицинском факультете Еврейского университета в Иерусалиме.
Ее ранние исследования включали разработку вычислительных алгоритмов для прогнозирования связывания антигенных пептидов с MHC . молекулами [7] вычислительные модели связывания белка с ДНК , предпочтений [8] [9] также в сотрудничестве с Ниром Фридманом , [10] идентификация пар доменов как строительных блоков сетей межбелкового взаимодействия, [11] анализ интегрированной сети белок-белковых и белок-ДНК взаимодействий [12] (в сотрудничестве с Ури Алоном ), а также вычислительные модели для прогнозирования малых молекул регуляторной РНК у бактерий, [13] которые были проверены экспериментально в сотрудничестве с Шоши Алтувиа и Герхартом Вагнером.
Совсем недавно лаборатория Маргалита изучала динамику регуляции малыми РНК. [14] (в сотрудничестве с Офером Бихамом ) и с помощью вычислений предсказал, что существуют вирусные молекулы микроРНК , которые подавляют иммунную систему человека, механизм, который был экспериментально подтвержден в сотрудничестве с Офером Мандельбоймом. [15] С 2012 года Маргалит объединяет экспериментальные и вычислительные исследования для изучения взаимодействий малых РНК-мишеней у бактерий. [16]
Маргалит был одним из пионеров в области биоинформатики и вычислительной биологии в Израиле и во всем мире. В Еврейском университете она стала соучредителем программы «Информатика и науки о жизни» в области биоинформатики и вычислительной биологии (в 1999 году) и программы для выпускников «Геномика и биоинформатика» (в 2000 году). В 2002 году она была избрана первым президентом Израильского общества биоинформатики и вычислительной биологии (2002–2004). Маргалит выступил наставником более 50 аспирантов, многие из которых занимают должности преподавателей биоинформатики в Израиле и за рубежом. [17]
Награды и почести
[ редактировать ]В 2008 году она была удостоена премии Майкла Ландау в области системной биологии. [18] В 2018 году Маргалит был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB) за выдающийся вклад в области вычислительной биологии и биоинформатики . [1] В 2020 году профессор Маргалит был удостоен премии Ротшильда в области вычислительной биологии. [19]
Личная жизнь
[ редактировать ]Маргалит замужем за Ави и имеет троих детей. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Анон (2018). «Стипендиаты ISCB» . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии. Архивировано из оригинала 15 апреля 2015 г. Проверено 13 марта 2018 г.
- ^ «Премия Ротшильдов» . Премия Ротшильдов . Проверено 7 марта 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Публикации Ханы Маргалит, проиндексированные Google Scholar
- ^ Jump up to: а б «Подробности основного доклада» . www.iscb.org . Проверено 28 ноября 2018 г.
- ^ «Лаборатория Ханы Маргалит» . margalit.huji.ac.il .
- ^ Маргалит, Х.; Спудж, Дж.Л.; Корнетт, JL; Прекрати, КБ; Делизи, К.; Берзофский, Дж. А. (1987). «Прогнозирование антигенных сайтов иммунодоминантных хелперных Т-клеток на основе первичной последовательности». Журнал иммунологии . 138 (7): 2213–2229. ISSN 0022-1767 . ПМИД 2435793 .
- ^ Алтувия, Ю.; Шуелер, О.; Маргалит, Х. (1995). «Рейтинг потенциальных связывающихся пептидов с молекулами MHC с помощью вычислительного подхода». Журнал молекулярной биологии . 249 (2): 244–250. дои : 10.1006/jmbi.1995.0293 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 7540211 .
- ^ Мандель-Гутфройнд, Ю.; Шуелер, О.; Маргалит, Х. (1995). «Комплексный анализ водородных связей в регуляторных белковых ДНК-комплексах: в поисках общих принципов». Журнал молекулярной биологии . 253 (2): 370–382. дои : 10.1006/jmbi.1995.0559 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 7563096 .
- ^ Мандель-Гутфройнд, Ю.; Маргалит, Х. (1998). «Количественные параметры взаимодействия аминокислот и оснований: значение для предсказания сайтов связывания белок-ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (10): 2306–2312. дои : 10.1093/нар/26.10.2306 . ISSN 0305-1048 . ПМК 147552 . ПМИД 9580679 .
- ^ Каплан, Томми; Фридман, Нир; Маргалит, Хана (2005). «Ab Initio Прогнозирование целевых факторов транскрипционных факторов с использованием структурных знаний» . PLOS Вычислительная биология . 1 (1): е1. Бибкод : 2005PLSCB...1....1K . дои : 10.1371/journal.pcbi.0010001 . ISSN 1553-734X . ПМК 1183507 . ПМИД 16103898 .
- ^ Спринзак, Э.; Маргалит, Х. (24 августа 2001 г.). «Коррелированные последовательности-сигнатуры как маркеры белок-белкового взаимодействия». Журнал молекулярной биологии . 311 (4): 681–692. дои : 10.1006/jmbi.2001.4920 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 11518523 .
- ^ Йегер-Лотем, Эсти; Саттат, Шмуэль; Каштан, Надав; Ицковиц, Шалев; Майло, Рон; Пинтер, Рон Ю.; Алон, Ури; Маргалит, Хана (2004). «Сетевые мотивы в интегрированных клеточных сетях регуляции транскрипции и белок-белкового взаимодействия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (16): 5934–5939. Бибкод : 2004PNAS..101.5934Y . дои : 10.1073/pnas.0306752101 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 395901 . ПМИД 15079056 .
- ^ Аргаман, Л.; Хершберг, Р.; Фогель, Дж.; Беджерано, Г.; Вагнер, Э.Г.; Маргалит, Х.; Алтувиа, С. (26 июня 2001 г.). «Новые гены, кодирующие малые РНК, в межгенных областях Escherichia coli» . Современная биология . 11 (12): 941–950. дои : 10.1016/s0960-9822(01)00270-6 . ISSN 0960-9822 . ПМИД 11448770 .
- ^ Шимони, Ишай; Фридлендер, Гилджи; Хецрони, Гай; Нив, Гали; Алтувия, Шоши; Бихам, Офер; Маргалит, Хана (2007). «Регуляция экспрессии генов с помощью малых некодирующих РНК: количественный взгляд» . Молекулярная системная биология . 3 : 138. дои : 10.1038/msb4100181 . ISSN 1744-4292 . ПМК 2013925 . ПМИД 17893699 .
- ^ Штерн-Гиносар, Ноам; Элефант, Наама; Циммерманн, Альберт; Вольф, Дана Г.; Салех, Нивин; Битон, Моше; Хорвиц, Элад; Прокоцимер, Зафнат; Причард, Марк; Хан, Габриэле; Гольдман-Воль, Дебра; Хан, Габриэле; Гринфилд, Кэрин; Ягель, Симха; Хенгель, Хартмут; Алтувия, Яэль; Маргалит, Хана; Мандельбойм, Офер (2007). «Нацеливание на гены иммунной системы хозяина с помощью вирусной микроРНК» . Наука . 317 (5836): 376–381. Бибкод : 2007Sci...317..376S . дои : 10.1126/science.1140956 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 4283197 . ПМИД 17641203 .
- ^ Меламед, Сахар; Пер, Асаф; Файгенбаум-Ромм, Рая; Гатт, Яир Э.; Рейсс, Нив; Бар, Амир; Алтувия, Яэль; Аргаман, Лирон; Маргалит, Хана (2016). «Глобальное картирование взаимодействий малых РНК-мишеней у бактерий» . Молекулярная клетка . 63 (5): 884–897. doi : 10.1016/j.molcel.2016.07.026 . ISSN 1097-4164 . ПМК 5145812 . ПМИД 27588604 .
- ^ «Лаборатория Ханы Маргалит» . margalit.huji.ac.il . Проверено 28 ноября 2018 г.
- ^ «Фонд Ландау – Премия в области науки и исследований» (на иврите). 17 июня 2012 г. Архивировано из оригинала 17 июня 2012 г. Проверено 28 ноября 2018 г.
- ^ «Премия Ротшильдов» . Премия Ротшильдов . Проверено 7 марта 2020 г.
