Нир Фридман
Нир Фридман | |
---|---|
Альма-матер | Тель-Авивский университет , Научный институт Вейцмана , Стэнфордский университет |
Награды | Майкла Бруно (2010), Премия Мемориала [1] Премия Европейского исследовательского совета сэра Зельмана Коуэна (2007 г.) за исследования (2009–2014 гг.), Премия Джулудана (2007 г.), Премия Университетского фонда [2] |
Научная карьера | |
Поля | Машинное обучение и вычислительная биология |
Учреждения | Еврейский университет Иерусалима |
Докторантура | Джозеф Халперн |
Другие научные консультанты | Дэвид Харел , Стюарт Рассел |
Известные студенты | Дана Пеэр |
Нир Фридман (1967 г.р.) — израильский профессор компьютерных наук и биологии Еврейского университета в Иерусалиме . [3] [4]
Его исследования сочетают машинное обучение и статистическое обучение с системной биологией , особенно в области регуляции генов , транскрипции и хроматина .
Образование и исследования
[ редактировать ]Фридман получил степень бакалавра наук в Тель-Авивском университете (1987 г.) и степень магистра наук в Институте науки Вейцмана (1992 г.). [5] В 1997 году он защитил докторскую диссертацию. в Стэнфорде под руководством Джозефа Халперна в области искусственного интеллекта . [6]
После некоторой постдокторской работы в Калифорнийском университете в Беркли он принял должность преподавателя в Школе компьютерных наук. [7] Еврейский университет в Иерусалиме .
Его высоко цитируемые исследования [8] [9] включает работу над классификаторами байесовских сетей [10] (совместно с Дэнни Гейгером и Мойзесом Гольдшмидтом ), Байесовская структурная ЭМ, [11] и использование байесовских методов для анализа об экспрессии генов. данных [12] [13] [14] [15] (с Авивом Регевом , Даной Пеер , Эраном Сигалом , Дафной Коллер и Дэвидом Ботштейном ). Более поздние работы посвящены вероятностным графическим моделям , реконструкции регуляторных сетей , генетическим взаимодействиям и роли хроматина в регуляции транскрипции (совместно с Оливером Рэндо ). [16]
В 2009 году Фридман и Коллер опубликовали учебник по вероятностным графическим моделям . [17] Позже в том же году он поступил в Институт наук о жизни, [18] и открыл экспериментальную лабораторию, где он использует передовые роботизированные инструменты для изучения регуляции транскрипции в дрожжах Saccharomyces cerevisiae . [19]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Нир Фридман — Яд Ханадив» . Yadhanadiv.org.il . Архивировано из оригинала 25 июня 2016 года . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Молодой биолог из Ху получает австралийскую награду» . «Джерузалем Пост» — JPost.com . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Нир Фридман» . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Лаборатория Нира Фридмана» . Systemsbio.cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Биографическая справка — Нир Фридман» (PDF) . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 25 апреля 2012 года . Проверено 22 октября 2011 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка ) - ^ «Школа компьютерных наук и инженерии Рэйчел и Селима Бенина» . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Нир Фридман — Google Scholar» . Scholar.google.com . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ Результаты поиска автора Фридмана Н. на PubMed .
- ^ «Байесовские сетевые классификаторы» . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ «Байесовский структурный EM-алгоритм» . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ Фридман, Н.; Линиал, М.; Нахман, И.; Пеер, Д. (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных экспрессии». Журнал вычислительной биологии . 7 (3–4): 601–620. CiteSeerX 10.1.1.191.139 . дои : 10.1089/106652700750050961 . ПМИД 11108481 .
- ^ Сигал, Э.; Шапира, М.; Регев, А.; Пеер, Д.; Ботштейн, Д.; Коллер, Д.; Фридман, Н. (2003). «Сети модулей: идентификация регуляторных модулей и их регуляторов, зависящих от состояния, на основе данных об экспрессии генов». Природная генетика . 34 (2): 166–176. дои : 10.1038/ng1165 . ПМИД 12740579 . S2CID 6146032 .
- ^ Фридман, Н. (2004). «Определение сотовых сетей с использованием вероятностных графических моделей». Наука . 303 (5659): 799–805. Бибкод : 2004Sci...303..799F . дои : 10.1126/science.1094068 . ПМИД 14764868 . S2CID 6819971 .
- ^ Сигал, Э.; Фридман, Н.; Коллер, Д.; Регев, А. (2004). «Карта модулей, показывающая условную активность модулей экспрессии при раке» . Природная генетика . 36 (10): 1090–1098. дои : 10.1038/ng1434 . ПМК 2271138 . ПМИД 15448693 .
- ^ «Нир Фридман» . Cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .
- ^ Дафна Коллер и Нир Фридман (2009). Вероятностные графические модели . МТИ Пресс. ISBN 978-0-262-01319-2 .
- ^ «Институт наук о жизни Александра Зильбермана» . Био.huji.ac.il. Архивировано из оригинала 26 апреля 2016 г. Проверено 25 мая 2016 г.
- ^ «Роботизированный комплекс» . Systemsbio.cs.huji.ac.il . Проверено 25 мая 2016 г. .