Майкл Уотерман

Майкл Уотерман
Майкл Уотерман
	Майкл Уотерман в 2004 году
Рожденный	Майкл Спенсер Уотерман ; 28 июня 1942 г. ( 82 года) ; Кокиль, Орегон , США
Альма-матер	Государственный университет Орегона ; Мичиганский государственный университет (доктор философии)
Известный	Алгоритм Смита-Уотермана ; Формула Ландера-Ватермана ; последовательности Де Брейна Сборка ;
Награды	Стипендия Гуггенхайма (1995) ; Международная премия Фонда Гайрднера (2002 г.) ; Сотрудник ISCB (2009 г.) ; Премия Дэна Дэвида (2015) ;
	Научная карьера
Поля	Вычислительная биология ; Вероятность ; Статистика ; Информатика ; Дискретная математика ; Комбинаторика ;
Учреждения	Университет Вирджинии ; Университет Южной Калифорнии ; Лос-Аламосская национальная лаборатория ; Государственный университет Айдахо ;
Диссертация	Некоторые эргодические свойства многомерных F-разложений (1969)
Докторантура	Джон Рэнкин Кинни
Известные студенты	Павел Певзнер (постдок) ; Тэнди Варноу (постдок)
Веб-сайт	Дорнсайф .usc .edu /лаборатории /мсв /

Майкл Спенсер Уотерман (родился 28 июня 1942 года) — , математики профессор биологии и информатики в Университете Южной Калифорнии (USC) , ^[1]^[6] где он возглавляет кафедру Endowed Associates в области биологических наук, математики и информатики. Ранее он ^{[ когда? ]} занимал должности в Лос-Аламосской национальной лаборатории и Университете штата Айдахо .

Образование и молодость

Уотерман вырос недалеко от Бэндона, штат Орегон . ^[7] и получил степень бакалавра математики в Университете штата Орегон , а затем докторскую степень по статистике и вероятности в Университете штата Мичиган в 1969 году. ^[4]^[8]

Исследования и карьера

Уотерман — один из основателей и нынешних лидеров в области вычислительной биологии . Он специализируется на применении математики, статистики и методов информатики для решения различных задач молекулярной биологии . Его работа способствовала созданию некоторых из наиболее широко используемых инструментов в этой области. В частности, алгоритм Смита-Уотермана (разработанный совместно с Темплом Ф. Смитом ) является основой многих программ выравнивания последовательностей . ^[9] В 1988 году Уотерман и Эрик Ландер опубликовали знаковую статью, описывающую математическую модель картирования отпечатков пальцев. ^[10] Эта работа стала одним из теоретических краеугольных камней для многих последующих проектов картирования и секвенирования ДНК, особенно проекта «Геном человека» . В статье Идури и Уотермана 1995 года была представлена сборка последовательности Эйлера-Де Брейна , которая широко используется в проектах секвенирования следующего поколения. ^[11]

Вместе с Павлом А. Певзнером (бывшим постдокторантом его лаборатории) он начал международную конференцию «Исследования в области вычислительной молекулярной биологии» (RECOMB) . ^[12] и он является одним из редакторов-основателей журнала вычислительной биологии . Уотерман также является автором одного из первых учебников в этой области: « Введение в вычислительную биологию» . ^[13]

Награды и почести

Вместе с Сайрусом Чотией и Дэвидом Хаусслером Уотерман был удостоен премии Дэна Дэвида 2015 года за вклад в область биоинформатики . ^[3] В 2011 году ему была присвоена степень почетного доктора Тель -Авивского университета . ^{[ нужна ссылка ]} почетный доктор Университета Южной Дании в 2013 г., ^{[ нужна ссылка ]} и почетный доктор Университета штата Орегон в 2024 году.

Уотерман является членом Американской академии искусств и наук США с 1995 года. ^{[ нужна ссылка ]} член Национальной инженерной академии США с 2012 года, ^{[ нужна ссылка ]} член Китайской академии наук с 2013 года, ^{[ нужна ссылка ]} и член Национальной академии наук США с 2001 года. ^{[ нужна ссылка ]} С 2005 года является академиком Французской академии наук . ^{[ нужна ссылка ]}

Уотерман был избран членом ISCB в 2009 году Международным обществом вычислительной биологии. ^[2] и был награжден премией старшего научного сотрудника ISCB в 2009 году. ^[6]

Личная жизнь

Уотерман написал мемуары « Выход наружу» . ^[7] о детстве, проведенном на изолированном животноводческом ранчо на южном побережье Орегона в середине двадцатого века.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Анон (2017). «Майкл С. Уотерман: профессор биологических наук, математики и информатики, Университет Южной Калифорнии» . doornsife.usc.edu/labs/msw . Архивировано из оригинала 2 февраля 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б Анон (2017). «Стипендиаты ISCB» . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . Архивировано из оригинала 20 марта 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б Анон (2015). «Соучредитель Википедии Джимми Уэйлс среди лауреатов премии Дэна Дэвида 2015 года» . www.eurekalert.org . Проверено 13 февраля 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б Майкл Уотерман в проекте «Математическая генеалогия»
^ Американские мужчины и женщины науки, Томсон Гейл, 2005 г. ^{[ ISBN отсутствует ]}
^ Jump up to: ^а ^б Мейзел, М. (2006). «ISCB чтит Майкла С. Уотермана и Матье Бланшетта» . PLOS Вычислительная биология . 2 (8): е105. Бибкод : 2006PLSCB...2..105M . дои : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . ПМК 1526462 .
^ Jump up to: ^а ^б Уотерман, Майкл (2016). Выход на улицу: детство на Дальнем Западе . Независимая издательская платформа CreateSpace. ISBN 978-1530929344 .
^ Уотерман, Майкл Смит (1969). Некоторые эргодические свойства многомерных F-разложений (кандидатская диссертация). Мичиганский государственный университет. ОСЛК 25799203 . ПроКвест 302449931 . (требуется подписка)
^ Смит, Т.; Уотерман, М.С. (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195–197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . дои : 10.1016/0022-2836(81)90087-5 . ПМИД 7265238 .
^ Ландер, ES ; Уотерман, М.С. (1988). «Геномное картирование путем снятия отпечатков пальцев случайных клонов: математический анализ». Геномика . 2 (3): 231–239. дои : 10.1016/0888-7543(88)90007-9 . ПМИД 3294162 .
^ Идури, Рамана М.; Уотерман, Майкл С. (1995). «Новый алгоритм сборки последовательности ДНК» (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 2 (2): 291–306. CiteSeerX 10.1.1.79.6459 . дои : 10.1089/cmb.1995.2.291 . ISSN 1066-5277 . ПМИД 7497130 .
^ Анон (2017). «Серия конференций RECOMB» . сайт recomb.org .
^ Уотерман, Майкл Р.; Уотерман, М.С. (1995). Введение в вычислительную биологию: карты, последовательности и геномы . Лондон: Чепмен и Холл. ISBN 978-0-412-99391-6 .

[usc-1] Jump up to: ^а ^б ^с Анон (2017). «Майкл С. Уотерман: профессор биологических наук, математики и информатики, Университет Южной Калифорнии» . doornsife.usc.edu/labs/msw . Архивировано из оригинала 2 февраля 2017 г.

[fellows-2] Jump up to: ^а ^б Анон (2017). «Стипендиаты ISCB» . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . Архивировано из оригинала 20 марта 2017 г.

[dan-david-prize-3] Jump up to: ^а ^б Анон (2015). «Соучредитель Википедии Джимми Уэйлс среди лауреатов премии Дэна Дэвида 2015 года» . www.eurekalert.org . Проверено 13 февраля 2015 г.

[mathgene-4] Jump up to: ^а ^б Майкл Уотерман в проекте «Математическая генеалогия»

[5] Американские мужчины и женщины науки, Томсон Гейл, 2005 г. ^{[ ISBN отсутствует ]}

[senior-6] Jump up to: ^а ^б Мейзел, М. (2006). «ISCB чтит Майкла С. Уотермана и Матье Бланшетта» . PLOS Вычислительная биология . 2 (8): е105. Бибкод : 2006PLSCB...2..105M . дои : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . ПМК 1526462 .

[getting-7] Jump up to: ^а ^б Уотерман, Майкл (2016). Выход на улицу: детство на Дальнем Западе . Независимая издательская платформа CreateSpace. ISBN 978-1530929344 .

[phd-8] Уотерман, Майкл Смит (1969). Некоторые эргодические свойства многомерных F-разложений (кандидатская диссертация). Мичиганский государственный университет. ОСЛК 25799203 . ПроКвест 302449931 . (требуется подписка)

[9] Смит, Т.; Уотерман, М.С. (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195–197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . дои : 10.1016/0022-2836(81)90087-5 . ПМИД 7265238 .

[10] Ландер, ES ; Уотерман, М.С. (1988). «Геномное картирование путем снятия отпечатков пальцев случайных клонов: математический анализ». Геномика . 2 (3): 231–239. дои : 10.1016/0888-7543(88)90007-9 . ПМИД 3294162 .

[IduryWaterman1995-11] Идури, Рамана М.; Уотерман, Майкл С. (1995). «Новый алгоритм сборки последовательности ДНК» (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 2 (2): 291–306. CiteSeerX 10.1.1.79.6459 . дои : 10.1089/cmb.1995.2.291 . ISSN 1066-5277 . ПМИД 7497130 .

[12] Анон (2017). «Серия конференций RECOMB» . сайт recomb.org .

[13] Уотерман, Майкл Р.; Уотерман, М.С. (1995). Введение в вычислительную биологию: карты, последовательности и геномы . Лондон: Чепмен и Холл. ISBN 978-0-412-99391-6 .

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

v т и Члены Международного общества вычислительной биологии по годам избрания
2009	David Haussler David Lipman Webb Miller David Sankoff Temple Smith Janet Thornton Michael Waterman
2010	Russ Altman Lawrence Hunter Eugene Myers Chris Sander Gary Stormo Alfonso Valencia
2011	Michael Ashburner Phil Bourne Søren Brunak Richard Durbin
2012	Bonnie Berger Peter Karp Jill Mesirov Pavel Pevzner Ron Shamir Martin Vingron Gunnar von Heijne
2013	Pierre Baldi David Eisenberg Minoru Kanehisa Satoru Miyano Ruth Nussinov Steven Salzberg
2014	Amos Bairoch Ewan Birney Nir Friedman Robert Gentleman Andrej Šali
2015	Rolf Apweiler Cyrus Chothia Julio Collado-Vides Mark Gerstein Des Higgins Thomas Lengauer Michael Levitt Burkhard Rost
2016	Helen M. Berman Steven Brenner Dan Gusfield Barry Honig Janet Kelso Michal Linial Christine Orengo Aviv Regev Lincoln Stein Sarah Teichmann Anna Tramontano Shoshana Wodak Haim Wolfson
2017	Alex Bateman Andrea Califano Daphne Koller Anders Krogh William Noble Lior Pachter Olga Troyanskaya Tandy Warnow
2018	Patricia Babbitt Terry Gaasterland Hanah Margalit Yves Moreau Bernard Moret William Pearson Mona Singh Mike Steel
2019	Vineet Bafna Eleazar Eskin Xiaole Shirley Liu Marie-France Sagot
2020	Serafim Batzoglou Judith Blake Mark Borodovsky Rita Casadio Paul Flicek Osamu Gotoh Rafael Irizarry Laxmi Parida Katherine Pollard Ben Raphael Zhiping Weng Xuegong Zhang
2021	Atul Butte A. Keith Dunker Eran Halperin Wolfgang Huber Sorin Istrail Christina Leslie Ming Li Núria López Bigas Dana Pe'er Teresa Przytycka Eytan Ruppin Gustavo Stolovitzky
2022	Barbara Bryant Sean Eddy Mikhail Gelfand Takashi Gojobori Trey Ideker David Jones Fran Lewitter Jun Liu Debora Marks Mihai Pop Reinhard Schneider

Базы данных авторитетного контроля
International	ISNI VIAF WorldCat
National	Germany Israel United States Czech Republic Netherlands
Academics	DBLP MathSciNet Mathematics Genealogy Project zbMATH
Artists	ULAN
Other	IdRef