Михаил Грибсков
Михаил Грибсков — профессор биологических наук и информатики в Университете Пердью . В 1979 году Грибсков окончил Государственный университет Орегона со степенью бакалавра наук в области биохимии и биофизики. Позже, в 1985 году, он получил степень доктора философии по молекулярной биологии в Университете Висконсин-Мэдисон . [1]
Он был президентом Международного общества вычислительной биологии . [2] На странице его факультета указано, что он является председателем Научно-консультативного совета по надзору и консультативному совету по информационным ресурсам белков , а также членом редакционных коллегий журналов «Биоинформатика» , «Журнал вычислительной биологии и химии» и «Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии» . [1]
| Год | Позиция |
|---|---|
| 1979 | Бакалавр с отличием в области биохимии и биофизики, Университет штата Орегон |
| 1979–1984 | Грант NIH на преддокторскую подготовку, Университет Висконсин-Мэдисон |
| 1985 | доктор философии в Университете молекулярной биологии Висконсин-Мэдисон |
| 1985–1987 | Постдокторская стипендия Американского онкологического общества, Калифорнийский университет, Лос-Анджелес |
| 1988–1992 | Научный сотрудник Национального института рака — FCRDC |
| 1992 | Штатный научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего |
| 1993–1996 | Старший научный сотрудник Суперкомпьютерного центра Сан-Диего |
| 1993–1999 | Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего |
| 1994–1997 | Главный исследователь Структурные запросы к базам данных нуклеиновых кислот |
| 1999–2003 | Адъюнкт-профессор биологии Калифорнийского университета, Сан-Диего |
| 2004 – настоящее время | Профессор биологических наук и информатики Университета Пердью |
Анализ профиля
[ редактировать ]Грибсков вместе с Дэвидом Айзенбергом и Эндрю Маклахланом представил метод профильного анализа в 1987 году; это метод обнаружения отдаленно родственных белков путем сравнения последовательностей. Профиль представляет собой оценочную матрицу для конкретной позиции , и он создается из группы ранее выровненных последовательностей (зонд). Сходство любой другой последовательности (цели) (одной или нескольких) с зондом можно проверить путем сравнения цели с файлом с помощью динамического программирования . Этот алгоритм состоит из двух шагов. Первым шагом является создание профиля с помощью программного обеспечения PROFWARE, которое использует существующее выравнивание (зонд) на основе сходства последовательностей или соответствующей трехмерной структуры для создания профиля. Вторым шагом является сравнение профиля с базой данных последовательностей или отдельной последовательностью. На этом этапе на основе созданного профиля целевую последовательность или группу последовательностей можно выровнять с помощью PROFINAL, при выравнивании используется динамическое программирование. [3]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Профиль факультета Университета Пердью. Архивировано 3 декабря 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ История ISCB
- ^ Грибсков М; Маклахлан, AD; Айзенберг, Д. (июль 1987 г.). «Профильный анализ: обнаружение отдаленно родственных белков» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (13): 4355–8. Бибкод : 1987PNAS...84.4355G . дои : 10.1073/pnas.84.13.4355 . ПМК 305087 . ПМИД 3474607 .