ЭЛИКСИР
| ЭЛИКСИР | |
|---|---|
| Заявление о миссии | Мы даем возможность ученым получать доступ к данным медико-биологических наук и анализировать их. |
| Расположение |
|
| Учредил | 13 декабря 2013 г. |
| Веб-сайт | www |
ELIXIR (Европейская инфраструктура наук о жизни для биологической информации) – это инициатива, которая позволяет лабораториям наук о жизни по всей Европе обмениваться и хранить данные своих исследований как часть организованной сети. Его цель — объединить европейские исследовательские организации и центры обработки данных , чтобы помочь координировать сбор, контроль качества и хранение больших объемов биологических данных, полученных в результате экспериментов в области медико-биологических наук . ELIXIR стремится обеспечить интеграцию биологических данных в объединенную систему, легко доступную научному сообществу. [ 1 ]
Миссия
[ редактировать ]
Миссия ELIXIR — создать устойчивую европейскую инфраструктуру для биологической информации, поддержать исследования в области наук о жизни и их внедрение в медицину и окружающую среду, биоиндустрию и общество. [ 3 ]
Результаты биологических экспериментов дают огромное количество результатов, которые сохраняются в виде данных с помощью компьютерного программного обеспечения . Европейские страны вложили значительные средства в исследования, которые производят, анализируют и хранят биологическую информацию. [ 4 ] Однако сбор, хранение, архивирование и интеграция этих больших объемов данных представляет собой проблему, которую не может решить одна страна. ELIXIR представляет собой объединение независимых бионаучных учреждений для создания интегрированной сети, которая решает сложную проблему хранения и управления биологическими данными. Предоставляя устойчивую и распределенную структуру для обработки данных и инструменты поиска данных, ELIXIR надеется обеспечить общеевропейские инвестиции в биоинформатику , обеспечивая стабильность для проведения исследований во всех областях наук о жизни, как в академических кругах, так и в промышленности. [ 1 ]
Организация и структура
[ редактировать ]ELIXIR — межправительственная организация, объединяющая существующие ресурсы биоинформатики . Его координирует Центр ELIXIR, расположенный рядом с Европейским институтом биоинформатики Европейской лаборатории молекулярной биологии ( EMBL -EBI) в кампусе Wellcome Trust Genome в Хинкстоне, Кембридж.
Членами консорциума ELIXIR являются европейские страны, представленные их правительствами и министерствами; научное сообщество в каждой стране-члене развивает свой национальный узел , который управляет сервисами и ресурсами, входящими в состав ELIXIR. Каждый узел ELIXIR сам по себе представляет собой сеть национальных организаций в области медико-биологических наук, деятельность которых координирует ведущий институт.
Европейская лаборатория молекулярной биологии является межправительственной организацией, поэтому это единственный узел, не связанный со страной.
ELIXIR концентрирует усилия вокруг пяти основных областей деятельности, называемых «Платформы» . Они охватывают данные, инструменты, вычисления, совместимость и обучение. Работа в этих областях направлена на улучшение доступа к ресурсам и инструментам открытых данных за счет улучшения возможности подключения, обнаружения и доступа к вычислительным мощностям, а также разработки обучения для пользователей и поставщиков услуг для достижения этих целей.
ELIXIR поддерживает пользователей, решающих сложные задачи в области биологических исследований в различных областях. ELIXIR поддерживает ряд самостоятельно выбранных сообществ , которые фокусируются на темах высокого уровня, таких как «Человеческие данные» и «Науки о растениях», до более конкретных и целенаправленных дисциплин, таких как «Метаболомика» и «Внутренне неупорядоченные белки», а также сообщество, посвященное ресурсу «Галактика». Эти сообщества созданы для разработки биоинформатических стандартов и стандартов данных, услуг и обучения, которые необходимы, чтобы помочь этому сообществу достичь своих научных целей.
Участники
[ редактировать ]По состоянию на сентябрь 2023 года следующие страны и EMBL-EBI подписали Соглашение о консорциуме ELIXIR (ECA) , чтобы стать членом ELIXIR: Бельгия, Чехия, Дания, Эстония, Финляндия, Франция, Германия, Греция, Венгрия, Ирландия, Израиль, Италия, Люксембург, Нидерланды, Норвегия, Португалия, Словения, Испания, Швеция, Швейцария и Великобритания.
Австрия, Кипр и Румыния являются странами-наблюдателями и работают над ратификацией ЭКА в ближайшем будущем.
Страны, подписавшие ECA, получают представительство в Совете ELIXIR .
Подготовительную фазу ELIXIR координировала профессор Дам Джанет Торнтон из EMBL-EBI .
Директор-основатель ELIXIR, доктор Никлас Бломберг, приступил к работе в новом центре ELIXIR в Кембридже в мае 2013 года. [ 5 ] Он покинул ЭЛИКСИР в декабре 2023 года, а профессор Тим Хаббард . с марта 2024 года новым директором был назначен [ 6 ]
Финансирование
[ редактировать ]К концу 2012 года ELIXIR завершил пятилетний подготовительный этап, финансируемый Седьмой рамочной программой ЕС. [ 7 ] в рамках процесса Европейского стратегического форума по исследовательским инфраструктурам (ESFRI).
В 2015 году компания ELIXIR получила финансирование в размере 19 миллионов евро в рамках HORIZON 2020 для реализации проекта EXCELERATE, за которым в 2020 году последовал проект CONVERGE. [ 8 ] [ 9 ] Оба проекта позволили ELIXIR координировать и расширять национальные и международные ресурсы данных. [ 10 ] ELIXIR также наладил сотрудничество для подачи заявок на другое крупномасштабное финансирование для других проектов ЕС, в которых он также участвует в организационном качестве, например, для проектов CORBEL, FAIRplus, EOSC-Life, B1MG, GDI и BY-COVID.
Каждое государство-член совместно вносит свой вклад в финансирование ELIXIR Hub пропорционально своему ВВП. Некоторые страны выделили новые средства для финансирования своего узла ELIXIR. Услуги и деятельность узлов ELIXIR по-прежнему будут финансироваться национальными агентствами. Совместно члены ELIXIR подадут заявку на дополнительное внешнее финансирование.
В 2024 году ELIXIR начнет свою четвертую пятилетнюю научную программу . [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Кроссвелл, ЖК; Торнтон, Дж. М. (2012). «ЭЛИКСИР: Распределенная инфраструктура для европейских биологических данных». Тенденции в биотехнологии . 30 (5): 241–242. дои : 10.1016/j.tibtech.2012.02.002 . ПМИД 22417641 .
- ^ «БиоХакатон Европа» . biohackathon-europe.org . Проверено 26 ноября 2021 г.
- ^ ЭЛИКСИР (2 сентября 2019 г.). «Научная программа ЭЛИКСИР 2019-2023» . F1000Исследования . 8 (1570): 1570. doi : 10.7490/f1000research.1117352.1 .
- ^ «Бизнес-кейс ЭЛИКСИР» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 23 апреля 2013 года . Проверено 25 апреля 2013 г.
- ^ «ELIXIR назначает директора-основателя» . ЭЛИКСИР . 5 февраля 2013 года . Проверено 16 ноября 2023 г.
- ^ «Тим Хаббард станет новым директором ЭЛИКСИР» . ЭЛИКСИР . 1 декабря 2023 г. Проверено 8 января 2024 г.
- ^ Описание FP7 Советом по экономическим и социальным исследованиям . Архивировано 1 сентября 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ ЭЛИКСИР (11 мая 2015 г.). «ELIXIR ускоряется благодаря крупному финансированию Horizon 2020» . ЭЛИКСИР . Проверено 30 сентября 2019 г.
- ^ «ELIXIR-EXCELERATE: Ускоренное внедрение ELIXIR и стимулирование раннего использования пользователями в области наук о жизни» . КОРДИС . Европейская комиссия . Проверено 30 сентября 2019 г.
- ^ ЭЛИКСИР (2 сентября 2019 г.). «Успешное завершение ELIXIR-EXCELERATE знаменует собой новый этап в развитии ELIXIR» . ЭЛИКСИР . Проверено 30 сентября 2019 г.
- ^ «ЭЛИКСИР публикует научную программу на 2024–2028 годы» . ЭЛИКСИР . 4 декабря 2023 г. Проверено 8 января 2024 г.
