✖


Jump to content

Тим Хаббард

Тим Хаббард
Рожденный
Тимоти Джон Филлип Хаббард
Альма-матер
Известный
Научная карьера
Поля
Учреждения
Диссертация Дизайн, экспрессия и характеристика нового белка   (1988 г.)
Докторантура Том Бланделл
Веб-сайт

Тимоти Джон Филлип Хаббард в Королевском колледже — профессор биоинформатики Лондона , руководитель отдела анализа генома в Геномике Англии и почетный преподаватель Института Сэнгера Wellcome Trust в Кембридже, Великобритания. [2] [8] [9] [10] [11] [12] [13] С 1 марта 2024 года Хаббард стал директором Европейской инфраструктуры данных медико-биологических данных ELIXIR . [14]

Образование

[ редактировать ]

Хаббард получил образование в Кембриджском университете, где в 1985 году ему была присуждена бакалавра степень естественных наук (биохимии). Он продолжил исследования в области дизайна белков на факультете кристаллографии Биркбек -колледжа в Лондоне , где ему была присуждена степень бакалавра естественных наук (биохимии). Доктор философии 1988 г. [15] для исследований под руководством Тома Бланделла .

Исследования и карьера

[ редактировать ]

Научные интересы Хаббарда лежат в области биоинформатики , вычислительной биологии и геномной информатики . [1] Во время своего пребывания в WTSI он руководил несколькими успешными аспирантами в этих областях исследований. [16] [17] [18] [19] [20] [21]

После постдокторской стажировки в Научно-исследовательском институте белковой инженерии в Осаке в рамках ЕС программы научной подготовки в Японии (1989-90) он вернулся в Кембридж, став научным сотрудником Zeneca в Совете медицинских исследований (MRC) , Центре белковой инженерии . В 1997 году он присоединился к Институту Wellcome Trust Sanger и стал главой отдела анализа генома человека . Тим был главой отдела информатики с 2007 по 2013 год, когда он был прикомандирован на неполный рабочий день в качестве консультанта-специалиста в NHS England , занимаясь внедрением геномики в программы здравоохранения. [22]

Хаббард был назначен профессором биоинформатики в Кингс в октябре 2013 года. [23] Его исследования были опубликованы в ведущих рецензируемых научных журналах, включая Nature , [24] [25] [26] Журнал молекулярной биологии , [3] [27] Исследования нуклеиновых кислот , [5] [6] Геномная биология , [4] Природные методы , [28] Обзоры природы о раке [29] и биоинформатика . [30] Его исследования финансировались Советом медицинских исследований (MRC) и Исследовательским советом по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC) . [31]

Ссылки

[ редактировать ]
У Схолии есть авторский профиль Тима Хаббарда .
  1. ^ Перейти обратно: а б Публикации Тима Хаббарда, индексируемые Google Scholar Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ Перейти обратно: а б «Genomics England публикует результаты своей оценки аннотаций» . Геномика Англии. 2014. Архивировано из оригинала 12 января 2015 г.
  3. ^ Перейти обратно: а б Мурзин, А.Г.; Бреннер, С .; Хаббард, Т .; Чотия, К. (1995). «SCOP: База данных структурной классификации белков для исследования последовательностей и структур» (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 247 (4): 536–540. дои : 10.1016/S0022-2836(05)80134-2 . ПМИД   7723011 . Архивировано из оригинала (PDF) 26 апреля 2012 г.
  4. ^ Перейти обратно: а б Харроу, Дж; Деноэ, Ф; Франкиш, А; Реймонд, А; Чен, СК; Храст, Дж; Лагард, Дж; Гилберт, Дж. Г.; Стори, Р; Сварбрек, Д; Россье, К; Укла, К; Хаббард, Т; Антонаракис, SE; Гиго, Р. (2006). «GENCODE: создание ссылочной аннотации для ENCODE» . Геномная биология . 7 (Приложение 1): С4.1–9. дои : 10.1186/gb-2006-7-s1-s4 . ПМК   1810553 . ПМИД   16925838 .
  5. ^ Перейти обратно: а б Хаббард, Т .; Баркер, Д.; Бирни, Э .; Кэмерон, Г.; Чен, Ю.; Кларк, Л.; Кокс, Т.; Кафф, Дж.; Карвен, В.; Даун, Т.; Дурбин, Р.; Эйрас, Э.; Гилберт, Дж.; Хаммонд, М.; Гуминецкий, Л.; Каспшик, А.; Леваслайхо, Х.; Лейнзаад, П.; Мелсопп, К.; Монгин, Э.; Пететт, Р.; Покок, М.; Поттер, С.; Руст, А.; Шмидт, Э.; Сирл, С.; Слейтер, Г.; Смит, Дж.; Спунер, В.; Стабенау, А. (2002). «Проект базы данных генома Ensembl» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 38–41. дои : 10.1093/нар/30.1.38 . ПМК   99161 . ПМИД   11752248 .
  6. ^ Перейти обратно: а б Фаррелл, CM; О'Лири, Северная Каролина; Харт, РА; Лавленд, Дж. Э.; Уилминг, LG; Валлин, К.; Диканс, М.; Баррелл, Д.; Сирл, SMJ; Акен, Б.; Хиатт, С.М.; Франкиш, А.; Сунер, М.-М.; Раджпут, Б.; Стюард, Калифорния; Браун, Греция; Беннетт, Р.; Мерфи, М.; Ву, В.; Кей, член парламента; Харт, Дж.; Раджан, Дж.; Вебер, Дж.; Сноу, К.; Риддик, LD; Хант, Т.; Уэбб, Д.; Томас, М.; Тамез, П.; Рангвала, SH (2013). «Текущий статус и новые возможности базы данных последовательностей консенсусного кодирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных): D865–D872. дои : 10.1093/нар/gkt1059 . ПМЦ   3965069 . ПМИД   24217909 .
  7. ^ Моулт, Дж; Хаббард, Т ; Фиделис, К; Педерсен, Дж.Т. (1999). «Критическая оценка методов прогнозирования структуры белков (CASP): Раунд III». Белки . Приложение 3 (S3): 2–6. doi : 10.1002/(sici)1097-0134(1999)37:3+<2::aid-prot2>3.3.co;2-u . ПМИД   10526346 .
  8. ^ Тим Хаббард на X Отредактируйте это в Викиданных
  9. ^ Хаббард, публикации Тима Дж. П., индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  10. ^ Тима Дж. П. Хаббарда Страница профиля автора ACM. в цифровой библиотеке Отредактируйте это в Викиданных
  11. ^ Тим Дж. П. Хаббард на DBLP библиографическом сервере Отредактируйте это в Викиданных
  12. ^ Хопкин, Карен (1 октября 2009 г.). «Тим Хаббард: гуру генома» . Ученый . Архивировано из оригинала 4 марта 2014 г.
  13. ^ Тима Хаббарда Публикации из Europe PubMed Central
  14. ^ «Тим Хаббард станет новым директором ЭЛИКСИР» . 01.12.2023.
  15. ^ Хаббард, Тим (1988). Дизайн, экспрессия и характеристика нового белка (кандидатская диссертация). Лондонский университет. Архивировано из оригинала 19 мая 2015 г.
  16. ^ Брош, Маркус (2010). Разработка вычислительных методов анализа протеомных данных для аннотации генома (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   890149364 .
  17. ^ Вниз, Томас Александр (2004). Вычислительная локализация промоторов и сайтов начала транскрипции в геномах млекопитающих (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  18. ^ Догрюэль, Мутлу (2008). Компьютерная идентификация субклеточной локализации белков на основе мотивов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   890154619 .
  19. ^ Мэттисон, Дженни (2009). Анализ полногеномных наборов данных о мутациях, связанных с раком, у мышей и человека (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   890152898 .
  20. ^ Пийпари, Матиас (2011). Вывод и классификация эукариотических цис-регуляторных мотивов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  21. ^ Покок, Мэтью Ричард (2004). Компьютерный анализ геномов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC   890159072 .
  22. ^ «Почетный преподаватель Института Сэнгера Wellcome Trust — доктор Тим Хаббард» . Архивировано из оригинала 23 марта 2015 г.
  23. ^ «Профессор Тим Хаббард, Королевский колледж Лондона» . Архивировано из оригинала 23 февраля 2014 г.
  24. ^ Консорциум проекта ENCODE, Бирни Э. , Стаматояннопулос Х.А. , Дутта А., Гиго Р., Гингерас Т.Р., Маргулис Э.Х., Венг З., Снайдер М., Дермицакис Э.Т.; и др. (2007). «Идентификация и анализ функциональных элементов в 1% генома человека в рамках пилотного проекта ENCODE» . Природа . 447 (7146): 799–816. Бибкод : 2007Natur.447..799B . дои : 10.1038/nature05874 . ПМК   2212820 . ПМИД   17571346 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  25. ^ Ландер, ES ; Линтон, М.; Биррен, Б.; Нусбаум, К.; Зоди, К.; Болдуин, Дж.; Девон, К.; Дьюар, К.; Дойл, М.; Фицхью, В.; Функе, Р.; Гейдж, Д.; Харрис, К.; Хифорд, А.; Хауленд, Дж.; Канн, Л.; Лехочки, Дж.; Левин, Р.; Макьюэн, П.; МакКернан, К.; Мелдрим, Дж.; Месиров, Дж.П.; Миранда, К.; Моррис, В.; Нейлор, Дж.; Раймонд, К.; Розетти, М.; Сантос, Р.; Шеридан, А.; и др. (февраль 2001 г.). «Первичное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. Бибкод : 2001Natur.409..860L . дои : 10.1038/35057062 . ISSN   0028-0836 . ПМИД   11237011 .
  26. ^ Бирни, Э ; Бейтман, А ; Зажим, МЭ; Хаббард, Ти Джей (2001). «Разведка проекта генома человека» . Природа . 409 (6822): 827–8. Бибкод : 2001Natur.409..827B . дои : 10.1038/35057004 . ПМЦ   2658632 . ПМИД   11236999 .
  27. ^ Парк, Дж; Тейхманн, SA ; Хаббард, Т ; Чотия, К. (1997). «Промежуточные последовательности улучшают обнаружение гомологии между последовательностями». Журнал молекулярной биологии . 273 (1): 349–54. дои : 10.1006/jmbi.1997.1288 . ПМИД   9367767 .
  28. ^ Энгстрем, PRG; Стейгер, Т.; Сипос, Б.; Грант, Греция; Калес, А.; Алиото, Т.; Бер, Дж.; Бертоне, П.; Бонерт, Р.; Кампанья, Д.; Дэвис, Калифорния; Добин, А.; Энгстрем, PRG; Гингерас, ТР; Гольдман, Н.; Грант, Греция; Гиго, Р.; Харроу, Дж.; Хаббард, Ти Джей; Жан, гр; Калес, А.; Косарев П.; Ли, С.; Лю, Дж.; Мейсон, CE; Молодцов В.; Нин, З.; Понстингл, Х.; Принс, Дж. Ф.; Ретч, Г. (2013). «Систематическая оценка программ сплайсинга для данных РНК-секвенирования» . Природные методы . 10 (12): 1185–91. дои : 10.1038/nmeth.2722 . ПМК   4018468 . ПМИД   24185836 .
  29. ^ Фуреал, Пенсильвания; Монета, л; Маршалл, М; Вниз, Т; Хаббард, Т ; Вустер, Р.; Рахман, Н ; Страттон, MR (2004). «Перепись генов рака человека» . Обзоры природы Рак . 4 (3): 177–83. дои : 10.1038/nrc1299 . ПМЦ   2665285 . ПМИД   14993899 .
  30. ^ Ривз, Джорджия; Эйлбек, К.; Магран, М.; О'Донован, К.; Монтекки-Палацци, Л.; Харрис, Массачусетс; Орчард, С.; Хименес, RC; Прлич, А.; Хаббард, TJP ; Хермякоб, Х.; Торнтон, Дж. М. (2008). «Онтология свойств белков: инструмент для унификации аннотаций свойств белков» . Биоинформатика . 24 (23): 2767–2772. doi : 10.1093/биоинформатика/btn528 . ПМК   2912506 . ПМИД   18936051 .
  31. ^ «Гранты правительства Великобритании предоставлены Тиму Хаббарду» . Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала 9 апреля 2015 г.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Tim_Hubbard&oldid=1213816974"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: ba5614ce50cbf0de340fe95e569e470e__1710480900
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ba/0e/ba5614ce50cbf0de340fe95e569e470e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Tim Hubbard - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)