Барбитураза
| Барбитураза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 3.5.2.1 | ||
| Номер CAS. | 9025-16-5 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| |||
Барбитураза ( EC 3.5.2.1 ) представляет собой цинксодержащую амидогидролазу . Его системное название — барбитуратамидогидролаза (образующая 3-оксо-3-уреидопропаноат) . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Барбитураза действует как катализатор на второй стадии окислительной деградации пиримидина, способствуя гидролизу барбитуровой кислоты с раскрытием цикла до уреидомалоновой кислоты. Хотя он и сгруппирован в существующие в природе амидогидролазы , он демонстрирует большую гомологию с амидогидролазой циануровой кислоты . Поэтому было предложено объединить барбитуразу вместе с циануровой кислотой в новое семейство. КЕГГ
Фон
[ редактировать ]Барбитураза состоит из четырех идентичных субъединиц, каждая из которых связана с атомом цинка (Zn). Анализ спектра поглощения показывает, что цинк является единственным кофактором, присутствующим в барбитуразе. В отличие от других цинксодержащих амидогидролаз, цинксвязывающий мотив барбитуразы находится на конце карбоновой кислоты , особенно у аминокислот с 320 по 324. Несколько высококонсервативных остатков гистидина были обнаружены в области цинксвязывающего мотива барбитуразы, что позволяет предположить, что в этом участвуют остатки гистидина. в связывании цинка и необходимы для каталитической активности барбитуразы. Эксперименты показали, что барбитураза чувствительна к хелаторам ионов металлов . Наконец, активность барбитуразы может быть заблокирована при добавлении ионов других металлов, таких как медь и ртуть.
Молекулярная масса барбитуразы составляет 172000 кДа. Его Km составляет 1,0 мм. Его Vmax составляет 2,5 мкмоль/мин/мг. Наибольшая ферментативная активность барбитуразы наблюдается при рН 8 и 40-45°С. При температуре выше 55 °С барбитураза теряет активность.
Реакция
[ редактировать ]Равновесие реакции благоприятствует образованию барбитуровой кислоты. Барбитураза очень специфична к барбитуровой кислоте и не реагирует с ее производными. Мочевина , малонат и циануровая кислота ингибируют гидролиз барбитуровой кислоты. Дигидро-L-оротат является промежуточным продуктом в пути биосинтеза пиримидинов и конкурентно ингибирует барбитуразу. Кроме того, барбитуровая кислота ингибирует множество ферментов , которые участвуют в синтезе пиримидинов de novo. Эти последние два пункта предполагают связь между пиримидиновым анаболизмом и окислительным катаболизмом.
Барбитуразная активность или существование окислительного пиримидинового метаболизма у млекопитающих еще не обнаружены.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Хаяиши О, Корнберг А (май 1952 г.). «Метаболизм цитозина, тимина, урацила и барбитуровой кислоты бактериальными ферментами». Журнал биологической химии . 197 (2): 717–32. ПМИД 12981104 .
- ^ Сунг С.Л., Огава Дж., Симидзу С. (август 2001 г.). «Новые амидогидролитические реакции в окислительном метаболизме пиримидинов: анализ реакции барбитуразы и открытие нового фермента, уреидомалоназы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 286 (1): 222–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5356 . ПМИД 11485332 .
- ^ Сунг С.Л., Огава Дж., Сакурадани Э., Симидзу С. (март 2002 г.). «Барбитураза, новая цинксодержащая амидогидролаза, участвующая в окислительном метаболизме пиримидинов» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7051–8. дои : 10.1074/jbc.M110784200 . ПМИД 11748240 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- барбитураза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
