Белково-аргининдезаминаза
| протеин-аргининдезаминаза | |||
|---|---|---|---|
 Белок-аргининдеиминаза 4, димер, Человек | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 3.5.3.15 | ||
| Номер CAS. | 75536-80-0 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии протеин -аргининдеиминаза ( EC 3.5.3.15 ) представляет собой фермент , который катализирует форму посттрансляционной модификации, называемую деиминированием или цитруллинированием аргинина :
- белок L -аргинин + H 2 O белок L -цитруллин + NH 3
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются белок L -аргинин (остаток аргинина внутри белка) и H 2 O , тогда как двумя его продуктами являются белок L -цитруллин и NH 3 :
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , действующих на связи углерод-азот , отличные от пептидных связей , особенно на линейные амидины . Систематическое название этого класса ферментов — протеин-L-аргининиминогидролаза . Этот фермент также называют пептидиларгининдеиминазой .
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года семь структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1WD8 , 1WD9 , 1WDA , 2DEW , 2DEX , 2DEY и 2DW5 .
Белки млекопитающих
[ редактировать ]У млекопитающих есть 5 протеин-аргининдеиминаз с символами
кроме грызунов , там регистр букв другой:
- Пади1, Пади2, Пади3, Пади4, Пади6 [ 3 ]
Другой случай — всего лишь исторический артефакт. Это не означает, что белки грызунов особенные.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Самс, КЛ; Мукаи, К; Маркс, бакалавр; Миттал, К; Деметра, Е.А.; Нелиссен, С; Гренье, Дж. К.; Тейт, А.Е.; Ахмед, Ф; Кунрод, ЮАР (октябрь 2022 г.). «Задержка полового созревания, аномалии гонадотропинов и субфертильность у самцов мышей с двойным нокаутом Padi2/Padi4» . Репрод Биол Эндокринол . 20 (1): 150. дои : 10.1186/s12958-022-01018-w . ПМЦ 9555066 . ПМИД 36224627 .
- ^ «Результаты поиска по запросу «пептидиларгининдеиминаза» » . Комитет по номенклатуре генов позвоночных . Проверено 9 февраля 2022 г.
- ^ «Детали белкового суперсемейства: белок-аргинин_деиминаза» . Информатика генома мыши.
- Фудзисаки М., Сугавара К. (январь 1981 г.). «Свойства пептидиларгининдеиминазы из эпидермиса новорожденных крыс». Дж. Биохим . 89 (1). Токио: 257–63. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133189 . ПМИД 7217033 .
- протеин-аргинин + деиминаза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
