Цитидиндезаминаза

CDA
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1MQ0
Идентификаторы
Псевдонимы	CDA , CDD, цитидиндезаминаза
Внешние идентификаторы	Опустить : 123920 ; МГИ : 1919519 ; Гомологен : 1352 ; GeneCards : CDA ; ОМА : CDA – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	20,618,903 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	138,095,303 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; monocyte; ; blood; ; bone marrow; ; right lobe of liver; ; trabecular bone; ; bone marrow cells; ; testicle; ; rectum; ; skin of leg;
	Top expressed in
	right kidney; ; duodenum; ; gastrula; ; human kidney; ; intestinal villus; ; jejunum; ; proximal tubule; ; lumbar spinal ganglion; ; facial motor nucleus; ; endothelial cell of lymphatic vessel;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; nucleoside binding; cytidine deaminase activity; zinc ion binding; metal ion binding; protein binding; catalytic activity; identical protein binding; hydrolase activity;
Cellular component	cytosol; extracellular region; secretory granule lumen; tertiary granule lumen; ficolin-1-rich granule lumen;
Biological process	cytosine metabolic process; pyrimidine nucleoside salvage; cell surface receptor signaling pathway; cytidine deamination; negative regulation of cell growth; pyrimidine-containing compound salvage; negative regulation of nucleotide metabolic process; protein homotetramerization; neutrophil degranulation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	978
	72269
	ENSG00000158825
	ENSMUSG00000028755
	P32320
	P56389
	НМ_001785
	НМ_028176
	НП_001776
	НП_082452
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цитидиндезаминаза — это фермент , который у человека кодируется CDA геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует фермент, участвующий в утилизации пиримидина . Кодируемый белок образует гомотетрамер, который катализирует необратимое гидролитическое дезаминирование цитидина и дезоксицитидина до уридина и дезоксиуридина соответственно. Это одна из нескольких деаминаз, ответственных за поддержание клеточного пула пиримидинов. Мутации в этом гене связаны со снижением чувствительности к аналогу цитозинового нуклеозида цитозинарабинозиду, используемому при лечении некоторых детских лейкозов. ^{[ 7 ]} Большинство цитидиндезаминаз действуют на РНК , а те немногие, которые действуют на ДНК, требуют оцДНК . ^{[ 8 ]}

Родственная индуцированная активацией (цитидин) деаминаза (AID) регулирует диверсификацию антител , особенно процесс соматической гипермутации .

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[ § 1 ]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

|alt=Фторурацил (5-ФУ) Редактирование активности ]]

активность Фторурацил (5-ФУ) Редактировать

^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «Фторпиримидинактивность_WP1601» .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000158825 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028755 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кюн К., Бертлинг В.М., Эммрих Ф. (январь 1993 г.). «Клонирование функциональной кДНК цитидиндезаминазы человека (CDD) и ее использование в качестве маркера дифференцировки моноцитов/макрофагов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 190 (1): 1–7. дои : 10.1006/bbrc.1993.1001 . ПМИД 8422236 .
^ Демонтис С., Терао М., Бривио М., Занотта С., Бруски М., Гараттини Е. (декабрь 1998 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего цитидиндезаминазу человека». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1443 (3): 323–33. дои : 10.1016/s0167-4781(98) 00235-8 ПМИД 9878810 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: цитидиндезаминаза CDA» .
^ Комор А.С., Ким Ю.Б., Пакер М.С., Зурис Дж.А., Лю Д.Р. (май 2016 г.). «Программируемое редактирование целевого основания геномной ДНК без двухцепочечного расщепления ДНК» . Природа . 533 (7603): 420–4. Бибкод : 2016Natur.533..420K . дои : 10.1038/nature17946 . ПМЦ 4873371 . ПМИД 27096365 .

Дальнейшее чтение

Вентворт Д.Ф., Вольфенден Р. (ноябрь 1975 г.). «О взаимодействии 3,4,5,6-тетрагидроуридина с цитидиндезаминазой печени человека». Биохимия . 14 (23): 5099–105. дои : 10.1021/bi00694a012 . ПМИД 53069 .
Лалиберте Дж., Момпарлер Р.Л. (октябрь 1994 г.). «Цитидиндезаминаза человека: очистка фермента, клонирование и экспрессия его комплементарной ДНК». Исследования рака . 54 (20): 5401–7. ПМИД 7923172 .
Сакконе С., Бесати С., Андреоцци Л., Делла Валле Дж., Гараттини Э., Терао М. (август 1994 г.). «Отнесение гена цитидиндезаминазы человека (CDA) к полосе p35-p36.2 хромосомы 1». Геномика . 22 (3): 661–2. дои : 10.1006/geno.1994.1448 . ПМИД 8001985 .
Гран С., Бойум А., Йохансен Р.Ф., Лёвхауг Д., Зееберг ЕС (июнь 1998 г.). «Ингибирование роста гранулоцито-макрофагальных колониеобразующих клеток цитидиндезаминазой человека требует каталитической функции белка». Кровь . 91 (11): 4127–35. дои : 10.1182/blood.V91.11.4127 . ПМИД 9596658 .
Сомасекарам А., Джармуз А., Хоу А., Скотт Дж., Наваратнам Н. (октябрь 1999 г.). «Внутриклеточная локализация цитидиндезаминазы человека. Идентификация сигнала функциональной ядерной локализации» . Журнал биологической химии . 274 (40): 28405–12. дои : 10.1074/jbc.274.40.28405 . ПМИД 10497201 .
Вистов Г., Бернштейн С.Л., Вятт М.К., Бехал А., Тачман Дж.В., Буффард Г. и др. (июнь 2002 г.). «Анализ выраженных меток последовательности хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Молекулярное видение . 8 : 171–84. ПМИД 12107413 .
Тайси С., Полат М.Ф., Сари Р.А., Бакан Э. (май 2002 г.). «Активность сывороточной аденозиндезаминазы и цитидиндезаминазы у пациентов с системной красной волчанкой». Клиническая химия и лабораторная медицина . 40 (5): 493–5. дои : 10.1515/CCLM.2002.085 . ПМИД 12113294 . S2CID 32965037 .
Бранштейн Р., Фам П., Шарф М.Д., Гудман М.Ф. (апрель 2003 г.). «Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией, дезаминирует дезоксицитидин на одноцепочечной ДНК, но требует действия РНКазы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (7): 4102–7. Бибкод : 2003PNAS..100.4102B . дои : 10.1073/pnas.0730835100 . ПМК 153055 . ПМИД 12651944 .
Сунь ZQ, Цзян Б, Чжао XS, Бао Л, Ву Т, Лу XJ и др. (июнь 2003 г.). «[Экспрессия мРНК цитидиндезаминазы в клетках костного мозга пациентов с острым лейкозом]». Чжунго Ши Янь Сюэ Е Сюэ За Чжи . 11 (3): 246–50. ПМИД 12844405 .
Винченцетти С., Костанци С., Кристалли Г., Мариани П., Квадрини Б., Каммертони Н., Вита А (2003). «Межсубъединичные взаимодействия в цитидиндезаминазе человека». Нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты . 22 (5–8): 1535–8. дои : 10.1081/NCN-120023028 . ПМИД 14565460 . S2CID 8626156 .
Костанци С., Винченцетти С., Вита А., Ламбертуччи С., Таффи С., Вольпини Р. и др. (2003). «Цитидиндезаминаза человека: понимание каталитического механизма». Нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты . 22 (5–8): 1539–43. дои : 10.1081/NCN-120023029 . ПМИД 14565461 . S2CID 6849333 .
Ге Ю., Дженсен Т.Л., Стаут М.Л., Флэтли Р.М., Грохар П.Дж., Равиндранат Ю. и др. (январь 2004 г.). «Роль мутаций цитидиндезаминазы и GATA1 в повышенной чувствительности цитозин-арабинозидов миелобластов с синдромом Дауна и клеточных линий лейкемии» . Исследования рака . 64 (2): 728–35. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-03-2456 . ПМИД 14744791 .
Винченцетти С., Де Санктис Г., Костанци С., Кристалли Г., Мариани П., Мей Г. и др. (декабрь 2003 г.). «Функциональные свойства взаимодействий субъединиц цитидиндезаминазы человека» . Белковая инженерия . 16 (12): 1055–61. дои : 10.1093/протеин/gzg117 . ПМИД 14983087 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А., Шенмен С.М., Граус Л.Х., Шулер Г. и др. (октябрь 2004 г.). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Чунг С.Дж., Фромм Дж.К., Вердин Г.Л. (февраль 2005 г.). «Структура цитидиндезаминазы человека, связанной с мощным ингибитором» . Журнал медицинской химии . 48 (3): 658–60. дои : 10.1021/jm0496279 . ПМИД 15689149 .
Винченцетти С., Мариани П.Л., Каммертони Н., Ползонетти В., Наталини П., Квадрини Б. и др. (декабрь 2004 г.). «Изоферментативные формы цитидиндезаминазы человека» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 17 (12): 871–7. дои : 10.1093/протеин/гж101 . ПМИД 15713780 .
Костанци С., Винченцетти С., Кристалли Г., Вита А. (сентябрь 2006 г.). «Цитидиндезаминаза человека: трехмерная модель гомологии тетрамерного металлофермента, выведенная из кристаллической структуры отдаленно родственного димерного гомолога». Журнал молекулярной графики и моделирования . 25 (1): 10–6. дои : 10.1016/j.jmgm.2005.10.008 . ПМИД 16303324 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P32320 (цитидиндезаминаза) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[WikiPathways-9] Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «Фторпиримидинактивность_WP1601» .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000158825 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028755 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8422236-5] Кюн К., Бертлинг В.М., Эммрих Ф. (январь 1993 г.). «Клонирование функциональной кДНК цитидиндезаминазы человека (CDD) и ее использование в качестве маркера дифференцировки моноцитов/макрофагов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 190 (1): 1–7. дои : 10.1006/bbrc.1993.1001 . ПМИД 8422236 .

[pmid9878810-6] Демонтис С., Терао М., Бривио М., Занотта С., Бруски М., Гараттини Е. (декабрь 1998 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего цитидиндезаминазу человека». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1443 (3): 323–33. дои : 10.1016/s0167-4781(98) 00235-8 ПМИД 9878810 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: цитидиндезаминаза CDA» .

[8] Комор А.С., Ким Ю.Б., Пакер М.С., Зурис Дж.А., Лю Д.Р. (май 2016 г.). «Программируемое редактирование целевого основания геномной ДНК без двухцепочечного расщепления ДНК» . Природа . 533 (7603): 420–4. Бибкод : 2016Natur.533..420K . дои : 10.1038/nature17946 . ПМЦ 4873371 . ПМИД 27096365 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ § 1 ]

v т и Гидролазы : углерод-азотные непептиды ( EC 3,5)
3.5.1 : Линейные амиды/ Амидогидролазы	Аспарагиназа Глутаминаза Уреаза Биотинидаза Аминоацилаза ACY1 Аспартоацилаза (ACY2) ACY3 Керамидаза Аспартилглюкозаминидаза Гидролаза амидов жирных кислот Гистоновая деацетилаза Сэр Гарден
3.5.2 : Циклические амиды/ Амидогидролазы	Барбитураза Бета-лактамазы Дигидрооротаза
3.5.3 : Линейные амидины/ Уреогидролазы	Аргиназа Агматиназа Белково-аргининдезаминаза
3.5.4 : Циклические амидины/ Аминогидролазы	Гуаниндезаминаза Аденозиндезаминаза АМФ дезаминаза Инозинмонофосфатсинтаза ДКМП дезаминаза ГТФ-циклогидролаза I Цитидиндезаминаза АИКДА Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией
3.5.5 : Нитрилы/ Аминогидролазы	Нитрилаза
3.5.99 : Другое	Рибофлавиназа Тиаминаза II

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )