БХЛХБ2

БХЛХЭ40
Идентификаторы
Псевдонимы	BHLHE40 , BHLHB2, DEC1, HLHB2, SHARP-2, STRA13, Stra14, базовый член семейства спираль-петля-спираль e40, Clast5, SHARP2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604256 ; МГИ : 1097714 ; Гомологен : 2722 ; GeneCards : BHLHE40 ; OMA : BHLHE40 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	4,985,323 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	108,643,886 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	saphenous vein; ; vena cava; ; beta cell; ; mucosa of pharynx; ; synovial joint; ; pericardium; ; tail of epididymis; ; gastric mucosa; ; mucosa of paranasal sinus; ; human penis;
	Top expressed in
	ankle; ; decidua; ; plantaris muscle; ; extensor digitorum longus muscle; ; cervix; ; iris; ; left lobe of liver; ; tibialis anterior muscle; ; ciliary body; ; triceps brachii muscle;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; protein dimerization activity; protein homodimerization activity; MRF binding; transcription corepressor activity; protein domain specific binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; bHLH transcription factor binding; E-box binding; protein binding; protein heterodimerization activity; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor binding; sequence-specific DNA binding; sequence-specific double-stranded DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nuclear body;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; response to light stimulus; rhythmic process; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; circadian regulation of gene expression; transcription, DNA-templated; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; negative regulation of transcription, DNA-templated; entrainment of circadian clock by photoperiod; circadian rhythm; somitogenesis; Notch signaling pathway; cell differentiation; regulation of neurogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8553
	20893
	ENSG00000134107
	ENSMUSG00000030103
	О14503
	О35185
	НМ_003670
	НМ_011498
	НП_003661
	НП_035628
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Основной белок 40 спираль-петля-спираль класса E представляет собой белок , который у человека кодируется BHLHE40 геном . ^[5]^[6]^[7]^[8]

Функция

DEC1 кодирует основной белок спираль-петля-спираль, экспрессирующийся в различных тканях. Экспрессия в хондроцитах реагирует на добавление Bt2cAMP. Считается, что в дифференцированных эмбриональных хондроцитах экспрессируется ген 1, который участвует в контроле дифференцировки клеток. ^[8]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134107 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000030103 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шен М., Кавамото Т., Ян В., Накамасу К., Тамагами М., Кояно Ю., Ноширо М., Като Ю. (июль 1997 г.). «Молекулярная характеристика нового основного белка спираль-петля-спираль DEC1, экспрессируемого в дифференцированных хондроцитах эмбриона человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 236 (2): 294–8. дои : 10.1006/bbrc.1997.6960 . ПМИД 9240428 .
^ Антоневич Т., Танея Р. (октябрь 1999 г.). «Присвоение1 человеческого гена Stra13 (STRA13) хромосоме 3p26 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 85 (3–4): 254–5. doi : 10.1159/000015305 (неактивен 25 июля 2024 г.). ПМИД 10449910 . S2CID 25761427 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )
^ Стивенс Дж.Д., Роалсон Э.Х., Скиннер М.К. (ноябрь 2008 г.). «Филогенетический и анализ экспрессии основного семейства генов транскрипционных факторов спираль-петля-спираль: геномный подход к клеточной дифференциации» . Дифференциация; Исследования биологического разнообразия . 76 (9): 1006–22. дои : 10.1111/j.1432-0436.2008.00285.x . ПМК 5728086 . ПМИД 18557763 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: содержащий базовый домен спираль-петля-спираль BHLHB2, класс B, 2» .

Дальнейшее чтение

Терамото М., Накамасу К., Ноширо М., Мацуда Ю., Гото О., Шен М., Цуцуми С., Кавамото Т., Ивамото Ю., Като Ю. (март 2001 г.). «Структура гена и хромосомное расположение транскрипционного фактора bHLH человека DEC1 x Stra13 x SHARP-2/BHLHB2». Журнал биохимии . 129 (3): 391–6. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002869 . ПМИД 11226878 .
Иванова А.В., Иванов С.В., Данилкович-Мягкова А., Лерман М.И. (май 2001 г.). «Регуляция STRA13 с помощью белка-супрессора опухоли фон Хиппель-Линдау, гипоксии и пути деградации протеасом UBC9 / убиквитина» . Журнал биологической химии . 276 (18): 15306–15. дои : 10.1074/jbc.M010516200 . ПМИД 11278694 .
Сунь Х., Лу Б., Ли Р.К., Флавелл Р.А., Танеджа Р. (ноябрь 2001 г.). «Дефектная активация Т-клеток и аутоиммунное заболевание у мышей с дефицитом Stra13». Природная иммунология . 2 (11): 1040–7. дои : 10.1038/ni721 . ПМИД 11668339 . S2CID 26633291 .
Юн Д.Ю., Бухлер П., Саарикоски С.Т., Хайнс О.Дж., Ребер Х.А., Хэнкинсон О. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация генов, дифференциально индуцируемых гипоксией в клетках рака поджелудочной железы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 288 (4): 882–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5867 . ПМИД 11688991 .
Ли Ю, Чжан Х, Се М, Ху М, Ге С, Ян Д, Ван Ю, Ян Б (октябрь 2002 г.). «Обильная экспрессия Dec1/stra13/sharp2 при карциноме толстой кишки: ее антагонистическая роль в апоптозе, вызванном депривацией сыворотки, и селективном ингибировании активации прокаспаз» . Биохимический журнал . 367 (Часть 2): 413–22. дои : 10.1042/BJ20020514 . ПМЦ 1222902 . ПМИД 12119049 .
Сен-Пьер Б., Флок Г., Заксенхаус Э., Иган С.Э. (ноябрь 2002 г.). «Гомодимеры Stra13 подавляют транскрипцию через элементы E-box класса B» . Журнал биологической химии . 277 (48): 46544–51. дои : 10.1074/jbc.M111652200 . ПМИД 12297495 .
Миядзаки К., Кавамото Т., Танимото К., Нисияма М., Хонда Х., Като Ю. (декабрь 2002 г.). «Идентификация функциональных элементов ответа на гипоксию в промоторной области генов DEC1 и DEC2» . Журнал биологической химии . 277 (49): 47014–21. дои : 10.1074/jbc.M204938200 . ПМИД 12354771 .
Шен М., Ёсида Э., Ян В., Кавамото Т., Суардита К., Кояно Ю., Фудзимото К., Носиро М., Като Ю. (декабрь 2002 г.). «Основной белок спираль-петля-спираль DEC1 способствует дифференцировке хондроцитов на ранних и терминальных стадиях» . Журнал биологической химии . 277 (51): 50112–20. дои : 10.1074/jbc.M206771200 . ПМИД 12384505 .
Хонма С., Кавамото Т., Такаги Ю., Фудзимото К., Сато Ф., Носиро М., Като Ю., Хонма К. (октябрь 2002 г.). «Dec1 и Dec2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих». Природа . 419 (6909): 841–4. Бибкод : 2002Natur.419..841H . дои : 10.1038/nature01123 . ПМИД 12397359 . S2CID 4426418 .
Ли Ю, Се М, Сонг Х, Граген С, Сачдева К, Ван Ю, Ян Б (май 2003 г.). «DEC1 отрицательно регулирует экспрессию DEC2 посредством связывания с E-box в проксимальном промоторе» . Журнал биологической химии . 278 (19): 16899–907. дои : 10.1074/jbc.M300596200 . ПМИД 12624110 .
Гиатроманолаки А., Кукуракис М.И., Сивридис Э., Терли Х., Вайкофф К.С., Гаттер К.К., Харрис А.Л. (июнь 2003 г.). «Экспрессия белка DEC1 (STRA13) связана с индуцируемой гипоксией сверхэкспрессией фактора 1-альфа и карбоангидразы-9 при немелкоклеточном раке легких». Журнал патологии . 200 (2): 222–8. дои : 10.1002/путь.1330 . ПМИД 12754744 . S2CID 26744393 .
Иванова А.В., Иванов С.В., Чжан Х, Иванов В.Н., Тимофеева О.А., Лерман М.И. (июль 2004 г.). «STRA13 взаимодействует со STAT3 и модулирует транскрипцию STAT3-зависимых мишеней». Журнал молекулярной биологии . 340 (4): 641–53. дои : 10.1016/j.jmb.2004.05.025 . ПМИД 15223310 .
Сато Ф, Кавамото Т, Фудзимото К, Ноширо М, Хонда КК, Хонма С, Хонма К, Като Ю (ноябрь 2004 г.). «Функциональный анализ основного транскрипционного фактора спираль-петля-спираль DEC1 в циркадной регуляции. Взаимодействие с BMAL1» . Европейский журнал биохимии . 271 (22): 4409–19. дои : 10.1111/j.1432-1033.2004.04379.x . ПМИД 15560782 .
Иванова А.В., Иванов С.В., Лерман М.Л. (февраль 2005 г.). «Ассоциация, взаимная стабилизация и транскрипционная активность белков STRA13 и MSP58» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 62 (4): 471–84. дои : 10.1007/s00018-004-4423-2 . ПМИД 15719173 . S2CID 6528873 .
Иванова А, Ляо С.Ю., Лерман М.И., Иванов С., Стэнбридж Э.Дж. (июль 2005 г.). «Экспрессия STRA13 и субклеточная локализация в нормальных и опухолевых тканях: значение для использования в качестве диагностического и дифференцировочного маркера» . Журнал медицинской генетики . 42 (7): 565–76. дои : 10.1136/jmg.2004.029835 . ПМК 1736099 . ПМИД 15994878 .
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

Внешние ссылки

BHLHB2+белок,+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук BHLHE40
Местоположение генома человека BHLHE40 и BHLHE40 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
человека Местоположение генома DEC1 и страница сведений о гене DEC1 в браузере генома UCSC .
человека Местоположение генома STRA13 и STRA13 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134107 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000030103 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9240428-5] Шен М., Кавамото Т., Ян В., Накамасу К., Тамагами М., Кояно Ю., Ноширо М., Като Ю. (июль 1997 г.). «Молекулярная характеристика нового основного белка спираль-петля-спираль DEC1, экспрессируемого в дифференцированных хондроцитах эмбриона человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 236 (2): 294–8. дои : 10.1006/bbrc.1997.6960 . ПМИД 9240428 .

[pmid10449910-6] Антоневич Т., Танея Р. (октябрь 1999 г.). «Присвоение1 человеческого гена Stra13 (STRA13) хромосоме 3p26 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 85 (3–4): 254–5. doi : 10.1159/000015305 (неактивен 25 июля 2024 г.). ПМИД 10449910 . S2CID 25761427 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )

[pmid18557763-7] Стивенс Дж.Д., Роалсон Э.Х., Скиннер М.К. (ноябрь 2008 г.). «Филогенетический и анализ экспрессии основного семейства генов транскрипционных факторов спираль-петля-спираль: геномный подход к клеточной дифференциации» . Дифференциация; Исследования биологического разнообразия . 76 (9): 1006–22. дои : 10.1111/j.1432-0436.2008.00285.x . ПМК 5728086 . ПМИД 18557763 .

[entrez-8] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: содержащий базовый домен спираль-петля-спираль BHLHB2, класс B, 2» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]