ПКНОКС2

ПКНОКС2
Идентификаторы
Псевдонимы	PKNOX2 , PREP2, АТС/узловой 1 гомеобокс 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 613066 ; МГИ : 2445415 ; Гомологен : 32527 ; Генные карты : PKNOX2 ; ОМА : PKNOX2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	125,433,389 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	37,058,703 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	retinal pigment epithelium; ; sural nerve; ; right frontal lobe; ; primary visual cortex; ; prefrontal cortex; ; cartilage tissue; ; dorsolateral prefrontal cortex; ; Brodmann area 9; ; Brodmann area 23; ; superior frontal gyrus;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; tail of embryo; ; gastrula; ; Gonadal ridge; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; piriform cortex; ; superior frontal gyrus; ; lumbar spinal ganglion; ; skeletal muscle tissue; ; primary visual cortex;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; actin filament binding; actin monomer binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; microtubule cytoskeleton; actin cytoskeleton; nucleus; nucleoplasm; intercellular bridge;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	63876
	208076
	ENSG00000165495
	ENSMUSG00000035934
	Q96KN3
	Q8BG99
	НМ_022062
	НМ_001029838 ; НМ_148950
showНП_001369252 ; НП_001369253 ; НП_001369254 ; НП_001369255 ; НП_001369256 ;
	NP_001369257; NP_001369258; NP_001369259; NP_001369260; NP_001369261; NP_001369262; NP_001369263; NP_001369264; NP_001369265; NP_001369266; NP_001369267; NP_001369268; NP_001369269; NP_001369270
	НП_001025009 ; НП_683752
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок PBX/Knotted 1 Homeobox 2 (PKNOX2) принадлежит к классу гомеодоменовых белков с расширением трех аминокислотных петель (TALE) и у человека кодируется геном PKNOX2 . Белок регулирует транскрипцию других генов и влияет на анатомическое развитие. ^[5]

Функция

Белок PKNOX2 регулирует экспрессию других генов путем связывания с ДНК специфичным для последовательности образом, т.е. со специфическими последовательностями ДНК. Он связывается с уникальными мотивами узнавания ДНК , действуя как фактор ядерной транскрипции . ^[6] Ядерный фактор транскрипции — это белок, который регулирует транскрипцию генетической информации с ДНК на информационную РНК . Другие функции PKNOX2 включают связывание актиновых филаментов. Важным паралогом гена PKNOX2 является PKNOX1 .

Структура

PKNOX2 принадлежит к классу гомеодоменовых белков с расширением трех аминокислотных петель (TALE). Этот класс характеризуется расширением из 3 аминокислот между альфа-спиралью 1 и 2 в гомеодомене. ^[7]

Гомеодоменные белки представляют собой специфичные для последовательности транскрипционные факторы, которые имеют высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют решающую роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток. ^[7]

Клиническое значение

В обзорной статье 2014 года , посвященной общегеномным результатам алкогольной зависимости , исследователи пришли к выводу, что на основе функционального анализа (демонстрация причинно-следственной связи), ^[8] генетические варианты, связанные с геном PKNOX2, могут играть роль в риске алкогольной зависимости, хотя и незначительную по сравнению с ролью, которую играют гены, расположенные в кластере алкогольдегидрогеназы. ^[9]

См. также

Гомеобокс
Связывание со специфическими последовательностями ДНК
человека Местоположение генома PKNOX2 и PKNOX2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165495 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035934 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Имото I, Сонода I, Юки Ю, Инадзава Дж (сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика человеческого PKNOX2, нового гена, содержащего гомеобокс». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 287 (1): 270–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5578 . ПМИД 11549286 .
^ Фоньяни С., Килструп-Нильсен С., Бертельсен Дж., Ферретти Е., Заппавинья В., Блази Ф. (май 2002 г.). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство гомеодоменных транскрипционных факторов MEINOX TALE» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (9): 2043–51. дои : 10.1093/нар/30.9.2043 . ПМЦ 113854 . ПМИД 11972344 .
^ Jump up to: ^а ^б «PKNOX2 PBX/завязанный 1 гомеобокс 2 — Gene — GTR — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 31 августа 2020 г. Гомеодоменные белки представляют собой специфичные для последовательности факторы транскрипции, которые имеют высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют фундаментальную роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток. PKNOX2 принадлежит к классу гомеодоменовых белков TALE (расширение петли из 3 аминокислот), характеризующихся расширением из 3 аминокислот между альфа-спиралями 1 и 2 внутри гомеодомена. В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
^ Ивата Б.А., Дозье К.Л. (2008). «Клиническое применение методологии функционального анализа» . Анализ поведения на практике . 1 (1): 3–9. дои : 10.1007/BF03391714 . ПМЦ 2846577 . ПМИД 22477673 .
^ Цзо Л, Лу Л, Тан Ю, Пан Х, Цай Ю, Ван Х, Хун Дж, Чжун С, Ван Ф, Чжан XY, Вандерлинден Л.А., Табакофф Б, Луо Х (2014). «Общегеномные открытия ассоциации алкогольной зависимости» . Американский журнал о зависимостях . 23 (6): 526–39. дои : 10.1111/j.1521-0391.2014.12147.x . ПМЦ 4187224 . ПМИД 25278008 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165495 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035934 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11549286-5] Имото I, Сонода I, Юки Ю, Инадзава Дж (сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика человеческого PKNOX2, нового гена, содержащего гомеобокс». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 287 (1): 270–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5578 . ПМИД 11549286 .

[pmid11972344-6] Фоньяни С., Килструп-Нильсен С., Бертельсен Дж., Ферретти Е., Заппавинья В., Блази Ф. (май 2002 г.). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство гомеодоменных транскрипционных факторов MEINOX TALE» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (9): 2043–51. дои : 10.1093/нар/30.9.2043 . ПМЦ 113854 . ПМИД 11972344 .

[AutoMO-1-7] Jump up to: ^а ^б «PKNOX2 PBX/завязанный 1 гомеобокс 2 — Gene — GTR — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 31 августа 2020 г. Гомеодоменные белки представляют собой специфичные для последовательности факторы транскрипции, которые имеют высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют фундаментальную роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток. PKNOX2 принадлежит к классу гомеодоменовых белков TALE (расширение петли из 3 аминокислот), характеризующихся расширением из 3 аминокислот между альфа-спиралями 1 и 2 внутри гомеодомена. В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .

[pmid22477673-8] Ивата Б.А., Дозье К.Л. (2008). «Клиническое применение методологии функционального анализа» . Анализ поведения на практике . 1 (1): 3–9. дои : 10.1007/BF03391714 . ПМЦ 2846577 . ПМИД 22477673 .

[pmid25278008-9] Цзо Л, Лу Л, Тан Ю, Пан Х, Цай Ю, Ван Х, Хун Дж, Чжун С, Ван Ф, Чжан XY, Вандерлинден Л.А., Табакофф Б, Луо Х (2014). «Общегеномные открытия ассоциации алкогольной зависимости» . Американский журнал о зависимостях . 23 (6): 526–39. дои : 10.1111/j.1521-0391.2014.12147.x . ПМЦ 4187224 . ПМИД 25278008 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]