Protein-coding gene in the species Homo sapiens
ГАБПА Идентификаторы Псевдонимы GABPA Внешние идентификаторы Опустить : 600609 ; МГИ : 95610 ; Гомологен : 1543 ; GeneCards : ГАБПА ; ОМА : ГАППА – ортологи показывать Мышь ) Chr. Chromosome 16 (mouse)[2] Band 16 C3.3|16 46.92 cM Start 84,631,813 bp [2] End 84,660,667 bp [2]
Викиданные
Альфа-цепь ГА-связывающего белка представляет собой белок , который у человека кодируется GABPA геном . [5]
Этот ген кодирует одну из трех фактора транскрипции субъединиц GA-связывающего белка , которая функционирует как субъединица ДНК-связывающего белка . Поскольку эта субъединица идентична субъединице, кодирующей ген ядерного респираторного фактора 2 , она, вероятно, участвует в активации экспрессии -с-оксидазы цитохром и ядерном контроле функции митохондрий . Эта субъединица также имеет идентичность с субъединицей, составляющей фактор транскрипции E4TF1, ответственный за экспрессию гена аденовируса E4 . Благодаря своей хромосомной локализации и способности образовывать гетеродимеры с другими полипептидами , этот ген может играть роль в синдрома Дауна фенотипе . [6]
Было показано, что GABPA взаимодействует с фактором C1 клетки-хозяина . [7] Транскрипционный фактор Sp1 [8] транскрипционный фактор Sp3 . [8]
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154727 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000008976 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Ватанабэ Х., Савада Дж., Яно К., Ямагути К., Гото М., Ханда Х. (март 1993 г.). «Клонирование кДНК субъединиц транскрипционного фактора E4TF1 с мотивами Ets и Notch» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (3): 1385–91. дои : 10.1128/MCB.13.3.1385 . ПМК 359448 ПМИД 8441384 . ^ «Ген Энтреза: фактор транскрипции белка, связывающего GABPA GA, альфа-субъединица 60 кДа» . ^ Фогель Дж.Л., Кристи Т.М. (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции с помощью GABP» . Журнал ЭМБО . 19 (4): 683–90. дои : 10.1093/emboj/19.4.683 . ПМК 305606 ПМИД 10675337 . ^ Перейти обратно: а б Гальваньи Ф., Капо С., Оливьеро С. (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора утрофина» (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 306 (5): 985–96. дои : 10.1006/jmbi.2000.4335 . hdl : 2318/141203 ПМИД 11237613 . Краст Р., Чен Х., Моррис М.А., Антонаракис С.Е. (июль 1995 г.). «Картирование гена транскрипционного фактора человека GABPA (E4TF1-60) на хромосоме 21». Геномика . 28 (1): 119–22. дои : 10.1006/geno.1995.1117 . ПМИД 7590737 . Савада Дж., Гото М., Ватанабэ Х., Ханда Х., Ёсида М.К. (январь 1995 г.). «Региональное картирование двух субъединиц транскрипционного фактора E4TF1 на хромосоме человека» . Японский журнал исследований рака . 86 (1): 10–2. дои : 10.1111/j.1349-7006.1995.tb02981.x . ПМЦ 5920589 ПМИД 7737900 . Гугнея С., Вирбасиус Й.В., Скарпулла RC (январь 1995 г.). «Четыре структурно различных, не связывающихся с ДНК субъединицы ядерного респираторного фактора 2 человека имеют консервативный домен активации транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (1): 102–11. дои : 10.1128/MCB.15.1.102 . ПМК 231915 ПМИД 7799916 . Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 . Гото М, Симидзу Т, Савада Дж, Сава С, Ватанабэ Х, Итикава Х, Охира М, Оки М, Ханда Х (декабрь 1995 г.). «Присвоение гена E4TF1-60 хромосоме человека 21q21.2-q21.3». Джин . 166 (2): 337–8. дои : 10.1016/0378-1119(95)00575-7 . ПМИД 8543189 . Сава С., Гото М., Сузуки Ф., Ватанабэ Х., Савада Дж., Ханда Х. (декабрь 1996 г.). «Функциональные домены транскрипционного фактора hGABP beta1/E4TF1-53, необходимые для ядерной локализации и активации транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 24 (24): 4954–61. дои : 10.1093/нар/24.24.4954 . ПМК 146336 ПМИД 9016666 . Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 . Бэтчелор А.Х., Пайпер Д.Е., де ла Брусс, Макнайт С.Л., Вольбергер К. (февраль 1998 г.). «Структура GAB-альфа / бета: домен ETS - гетеродимер анкиринового повтора, связанный с ДНК». Наука . 279 (5353): 1037–41. Бибкод : 1998Sci...279.1037B . дои : 10.1126/science.279.5353.1037 . ПМИД 9461436 . Сузуки Ф, Гото М, Сава С, Ито С, Ватанабэ Х, Савада Дж, Ханда Х (ноябрь 1998 г.). «Функциональные взаимодействия субъединиц GA-связывающего белка транскрипционного фактора человека» . Журнал биологической химии . 273 (45): 29302–8. дои : 10.1074/jbc.273.45.29302 ПМИД 9792629 . Ито К., Вакабаяши Н., Като Й., Исии Т., Игараси К., Энгель Дж.Д., Ямамото М. (январь 1999 г.). «Keap1 подавляет ядерную активацию элементов, чувствительных к антиоксидантам, с помощью Nrf2 посредством связывания с аминоконцевым доменом Neh2» . Гены и развитие . 13 (1): 76–86. дои : 10.1101/gad.13.1.76 . ПМК 316370 ПМИД 9887101 . Баннерт Н., Авотс А., Байер М., Серфлинг Э., Курт Р. (февраль 1999 г.). «GA-связывающие белковые факторы в сочетании с коактиватором CREB-связывающим белком/p300 контролируют индукцию промотора интерлейкина 16 в Т-лимфоцитах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (4): 1541–6. Бибкод : 1999PNAS...96.1541B . дои : 10.1073/pnas.96.4.1541 ПМЦ 15509 ПМИД 9990060 . Савада Дж., Симидзу Н., Сузуки Ф., Сава С., Гото М., Хасегава М., Имаи Т., Ватанабэ Х., Ханда Х. (декабрь 1999 г.). «Синергическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор активации транскрипции / цАМФ» . Журнал биологической химии . 274 (50): 35475–82. дои : 10.1074/jbc.274.50.35475 ПМИД 10585419 . Го А, Не Ф, Вонг-Райли М (февраль 2000 г.). «КДНК альфа-субъединицы ядерного респираторного фактора 2 человека: выделение, субклонирование, секвенирование и гибридизация транскриптов in situ в нормальной и монокулярно лишенной зрительной системе макаков». Журнал сравнительной неврологии . 417 (2): 221–32. doi : 10.1002/(SICI)1096-9861(20000207)417:2<221::AID-CNE7>3.0.CO;2-4 . ПМИД 10660899 . S2CID 25982934 . Фогель Дж.Л., Кристи Т.М. (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции с помощью GABP» . Журнал ЭМБО . 19 (4): 683–90. дои : 10.1093/emboj/19.4.683 . ПМК 305606 ПМИД 10675337 . Хаттори М, Фудзияма А, Тейлор ТД, Ватанабэ Х, Яда Т, Пак ХС, Тойода А, Исии К, Тотоки Ю, Чой Д.К., Гронер Ю, Соеда Э, Оки М, Такаги Т, Сакаки Ю, Таудиен С, Блехшмидт К. , Полли А, Мензель У, Делабар Дж, Кумпф К, Леманн Р, Паттерсон Д, Райхвальд К, Румп А, Шиллхабель М, Шуди А, Циммерманн В, Розенталь А, Кудо Дж, Шибуя К, Кавасаки К, Асакава С, Шинтани А, Сасаки Т, Нагамине К, Мицуяма С, Антонаракис С.Е., Миношима С, Симидзу Н, Нордсик Г, Хорнишер К, Брант П, Шарфе М, Шон О, Десарио А, Райхельт Дж, Кауэр Дж, Блокер Х, Рамсер Дж, Бек А., Клагес С., Хенниг С., Риссельманн Л., Даганд Э., Хааф Т., Вермейер С., Борзим К., Гардинер К., Низетик Д., Фрэнсис Ф., Лерах Х., Рейнхардт Р., Яспо М.Л. (май 2000 г.). «Последовательность ДНК 21-й хромосомы человека ». Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natural.405..311H . дои : 10.1038/35012518 ПМИД 10830953 . Гальваньи Ф., Капо С., Оливьеро С. (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора утрофина» (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 306 (5): 985–96. дои : 10.1006/jmbi.2000.4335 . hdl : 2318/141203 ПМИД 11237613 . Дакшинамурти С., Портер АГ (май 2004 г.). «Индуцированная оксидом азота активация транскрипции защитных генов с помощью Nrf2 через элемент антиоксидантного ответа противодействует апоптозу клеток нейробластомы» . Журнал биологической химии . 279 (19): 20096–107. дои : 10.1074/jbc.M312492200 ПМИД 14985350 . Шен Г., Хеббар В., Наир С., Сюй С., Ли В., Лин В., Кеум Ю.С., Хан Дж., Галло М.А., Конг А.Н. (май 2004 г.). «Регуляция активности домена трансактивации Nrf2. Дифференциальные эффекты митоген-активируемых протеинкиназных каскадов и синергетический стимулирующий эффект Raf и CREB-связывающего белка» . Журнал биологической химии . 279 (22): 23052–60. дои : 10.1074/jbc.M401368200 ПМИД 15020583 .
показывать
hide (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
show (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
