ARID4A

ARID4A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2LCC, 2MAM, 2YRV
Идентификаторы
Псевдонимы	ARID4A , RBBP-1, RBBP1, RBP-1, RBP1, богатый AT домен взаимодействия 4A
Внешние идентификаторы	Опустить : 180201 ; МГИ : 2444354 ; Гомологен : 11303 ; GeneCards : ARID4A ; ОМА : ARID4A – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	58,373,887 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	71,098,592 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; sural nerve; ; buccal mucosa cell; ; epithelium of colon; ; testicle; ; monocyte; ; ventricular zone; ; bone marrow cells; ; tendon of biceps brachii; ; ganglionic eminence;
	Top expressed in
	zygote; ; tail of embryo; ; hand; ; granulocyte; ; secondary oocyte; ; genital tubercle; ; blood; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; cumulus cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; histone deacetylase activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	transcription repressor complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol; plasma membrane;
Biological process	histone H3-K9 trimethylation; establishment of Sertoli cell barrier; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of gene expression by genetic imprinting; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; erythrocyte development; regulation of transcription by RNA polymerase II; spermatogenesis; histone H4-K20 trimethylation; histone H3-K4 trimethylation; transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription, DNA-templated; histone deacetylation; chromatin organization; cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5926
	238247
	ENSG00000032219
	ENSMUSG00000048118
	P29374
	F8VPQ2
	НМ_002892 ; НМ_023000 ; НМ_023001
	НМ_001081195
	НП_002883 ; НП_075376 ; НП_075377
	НП_001074664
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Богатый AT интерактивный домен 4A (RBP1-подобный) , также известный как ARID4A , представляет собой белок , который у человека кодируется ARID4A геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой повсеместно экспрессируемый ядерный белок. Вместе с некоторыми другими белками он напрямую связывается с белком ретинобластомы (pRB), который регулирует пролиферацию клеток. pRB подавляет транскрипцию, рекрутируя кодируемый белок. Этот белок, в свою очередь, служит мостиковой молекулой для рекрутирования HDAC и, кроме того, обеспечивает вторую HDAC-независимую функцию репрессии. Кодируемый белок обладает транскрипционной репрессивной активностью. Для этого гена наблюдалось множество альтернативно сплайсированных транскриптов, хотя не все варианты транскриптов полностью описаны. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что ARID4A взаимодействует с белком ретинобластомы . ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000032219 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048118 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ARID4A AT-богатый интерактивный домен 4A (RBP1-подобный)» .
^ Дефео-Джонс Д., Хуанг П.С., Джонс Р.Э., Хаскелл К.М., Вуоколо Г.А., Ханобик М.Г., Хубер Х.Е., Олифф А. (июль 1991 г.). «Клонирование кДНК клеточных белков, которые связываются с продуктом гена ретинобластомы». Природа . 352 (6332): 251–4. Бибкод : 1991Natur.352..251D . дои : 10.1038/352251a0 . ПМИД 1857421 . S2CID 4357523 .
^ Оттерсон Г.А., Крацке Р.А., Лин А.Ю., Джонстон П.Г., Кэй Ф.Дж. (апрель 1993 г.). «Альтернативный сплайсинг кластеров генов RBP1 во внутреннем экзоне, который кодирует потенциальные сайты фосфорилирования». Онкоген . 8 (4): 949–57. ПМИД 8455946 .
^ Лай А., Ли Дж.М., Ян В.М., ДеКаприо Дж.А., Кэлин В.Г., Сето Э., Брэнтон П.Е. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую, так и независимую от гистондеацетилазы репрессивную активность в белках семейства ретинобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6632–41. дои : 10.1128/mcb.19.10.6632 . ПМЦ 84642 . ПМИД 10490602 .

Дальнейшее чтение

Дефео-Джонс Д., Хуанг П.С., Джонс Р.Э., Хаскелл К.М., Вуоколо Г.А., Ханобик М.Г., Хубер Х.Е., Олифф А. (июль 1991 г.). «Клонирование кДНК клеточных белков, которые связываются с продуктом гена ретинобластомы». Природа . 352 (6332): 251–4. Бибкод : 1991Natur.352..251D . дои : 10.1038/352251a0 . ПМИД 1857421 . S2CID 4357523 .
Фаттей А.Р., Хелин К., Дембски М.С., Дайсон Н., Харлоу Э., Вуоколо Г.А., Ханобик М.Г., Хаскелл К.М., Олифф А., Дефео-Джонс Д. (ноябрь 1993 г.). «Характеристика белков, связывающих ретинобластому, RBP1 и RBP2». Онкоген . 8 (11): 3149–56. ПМИД 8414517 .
Оттерсон Г.А., Крацке Р.А., Лин А.Ю., Джонстон П.Г., Кэй Ф.Дж. (апрель 1993 г.). «Альтернативный сплайсинг кластеров генов RBP1 во внутреннем экзоне, который кодирует потенциальные сайты фосфорилирования». Онкоген . 8 (4): 949–57. ПМИД 8455946 .
Марготин Ф., Бур С.П., Дюран Х., Селиг Л., Бенишу С., Ричард В., Томас Д., Штребель К., Бенарус Р. (март 1998 г.). «Новый человеческий белок WD, h-бета TrCp, который взаимодействует с Vpu ВИЧ-1, соединяет CD4 с путем деградации ER посредством мотива F-бокса» . Молекулярная клетка . 1 (4): 565–74. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80056-8 . ПМИД 9660940 .
Лай А., Марселлус Р.К., Корбейл Х.Б., Брэнтон П.Е. (март 1999 г.). «RBP1 вызывает остановку роста за счет репрессии E2F-зависимой транскрипции» . Онкоген . 18 (12): 2091–100. дои : 10.1038/sj.onc.1202520 . ПМИД 10321733 .
Цао Дж., Гао Т., Джулиано А.Э., Ири Р.Ф. (февраль 1999 г.). «Распознавание эпитопа антигена рака молочной железы человеческим антителом». Исследование и лечение рака молочной железы . 53 (3): 279–90. дои : 10.1023/А:1006115922401 . ПМИД 10369074 . S2CID 34896754 .
Лай А., Ли Дж.М., Ян В.М., ДеКаприо Дж.А., Кэлин В.Г., Сето Э., Брэнтон П.Е. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую, так и независимую от гистондеацетилазы репрессивную активность в белках семейства ретинобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6632–41. дои : 10.1128/mcb.19.10.6632 . ПМЦ 84642 . ПМИД 10490602 .
Лай А., Кеннеди Б.К., Барби Д.А., Бертос Н.Р., Ян XJ, Теберге М.К., Цай С.К., Сето Е, Чжан Ю., Кузьмичев А., Лейн В.С., Рейнберг Д., Харлоу Э., Брэнтон П.Е. (апрель 2001 г.). «RBP1 рекрутирует комплекс mSIN3-гистондеацетилазы в карман белков семейства супрессоров опухоли ретинобластомы, обнаруженных в ограниченных дискретных областях ядра при остановке роста» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (8): 2918–32. дои : 10.1128/MCB.21.8.2918-2932.2001 . ПМК 86920 . ПМИД 11283269 .
Флейшер Т.С., Юн У.Дж., Айер Д.Э. (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (10): 3456–67. дои : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . ПМК 164750 . ПМИД 12724404 .
Михан В.Дж., Самант Р.С., Хоппер Дж.Э., Карроцца М.Дж., Шевде Л.А., Уоркман Дж.Л., Эккерт К.А., Вердераме М.Ф., Уэлч Д.Р. (январь 2004 г.). «Супрессор метастазов рака молочной железы 1 (BRMS1) образует комплексы с ретинобластомосвязывающим белком 1 (RBP1) и комплексом гистондеацетилазы mSin3 и подавляет транскрипцию» . Журнал биологической химии . 279 (2): 1562–9. дои : 10.1074/jbc.M307969200 . ПМИД 14581478 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» ( ) 16 1 : 55–65 « 10.1101 /gr.4039406 . PMID . . . 16344560 doi
Монро Д.Г., Секрето Ф.Дж., Хоуз-младший, Субраманиам М., Хосла С., Спелсберг Т.К. (сентябрь 2006 г.). «Изоформно-специфическая регуляция гена ретинобластомосвязывающего белка 1 (RBBP1) рецептора эстрогена: роль AF1 и энхансерных элементов» . Журнал биологической химии . 281 (39): 28596–604. дои : 10.1074/jbc.M605226200 . ПМИД 16873370 .

Внешние ссылки

ARID4A+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека ARID4A Расположение генома ARID4A и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
человека Местоположение генома RBP1 и RBP1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000032219 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048118 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ARID4A AT-богатый интерактивный домен 4A (RBP1-подобный)» .

[pmid1857421-6] Дефео-Джонс Д., Хуанг П.С., Джонс Р.Э., Хаскелл К.М., Вуоколо Г.А., Ханобик М.Г., Хубер Х.Е., Олифф А. (июль 1991 г.). «Клонирование кДНК клеточных белков, которые связываются с продуктом гена ретинобластомы». Природа . 352 (6332): 251–4. Бибкод : 1991Natur.352..251D . дои : 10.1038/352251a0 . ПМИД 1857421 . S2CID 4357523 .

[pmid8455946-7] Оттерсон Г.А., Крацке Р.А., Лин А.Ю., Джонстон П.Г., Кэй Ф.Дж. (апрель 1993 г.). «Альтернативный сплайсинг кластеров генов RBP1 во внутреннем экзоне, который кодирует потенциальные сайты фосфорилирования». Онкоген . 8 (4): 949–57. ПМИД 8455946 .

[pmid10490602-8] Лай А., Ли Дж.М., Ян В.М., ДеКаприо Дж.А., Кэлин В.Г., Сето Э., Брэнтон П.Е. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую, так и независимую от гистондеацетилазы репрессивную активность в белках семейства ретинобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6632–41. дои : 10.1128/mcb.19.10.6632 . ПМЦ 84642 . ПМИД 10490602 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]