Малый гетеродимерный партнер

NR0B2
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1YUC, 2Q3Y, 2Z4J, 4DOR, 4ONI
Идентификаторы
Псевдонимы	NR0B2 , SHP, SHP1, член 2 группы B подсемейства ядерных рецепторов 0
Внешние идентификаторы	Опустить : 604630 ; МГИ : 1346344 ; Гомологен : 8030 ; Генные карты : NR0B2 ; OMA : NR0B2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1p36.11 Start 26,911,489 bp End 26,913,975 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 4 (mouse) Band 4 D2.3|4 66.25 cM Start 133,280,687 bp End 133,283,847 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right lobe of liver duodenum jejunal mucosa body of pancreas gonad right adrenal gland left adrenal gland left adrenal cortex right adrenal cortex gallbladder Top expressed in left lobe of liver epithelium of stomach adrenal medulla morula myocardium of ventricle duodenum right kidney embryo embryo pyloric antrum More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function DNA binding protein homodimerization activity protein domain specific binding steroid hormone receptor activity protein binding transcription corepressor activity DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific protein-containing complex binding transcription factor binding retinoic acid receptor binding peroxisome proliferator activated receptor binding retinoid X receptor binding thyroid hormone receptor binding Cellular component nucleoplasm nucleus cytoplasm protein-containing complex Biological process Notch signaling pathway regulation of transcription, DNA-templated cholesterol metabolic process negative regulation of transcription by RNA polymerase II response to glucose negative regulation of DNA-binding transcription factor activity negative regulation of gene expression transcription, DNA-templated positive regulation of gene expression animal organ regeneration transcription initiation from RNA polymerase II promoter negative regulation of transcription, DNA-templated positive regulation of insulin secretion steroid hormone mediated signaling pathway circadian rhythm circadian regulation of gene expression rhythmic process Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 8431 23957 Вместе ENSG00000131910 ENSMUSG00000037583 ЮниПрот Q15466 Q62227 RefSeq (мРНК) НМ_021969 НМ_011850 RefSeq (белок) НП_068804 НП_035980 Местоположение (UCSC) Чр 1: 26,91 – 26,91 Мб Chr 4: 133,28 – 133,28 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Малый партнер гетеродимера ( SHP ), также известный как NR0B2 (подсемейство ядерных рецепторов 0, группа B, член 2), представляет собой белок , который у людей кодируется NR0B2 геном . SHP является членом семейства рецепторов ядерных внутриклеточных факторов транскрипции . SHP необычен для ядерного рецептора тем, что у него отсутствует ДНК-связывающий домен . Таким образом, технически он не является ни транскрипционным фактором, ни ядерным рецептором, но, тем не менее, он все еще классифицируется как таковой из-за относительно высокой гомологии последовательностей с другими членами семейства ядерных рецепторов.

Функция

Основная роль SHP, по-видимому, заключается в репрессии других ядерных рецепторов посредством ассоциации с образованием непродуктивного гетеродимера. Белок также был идентифицирован как фактор-посредник в метаболических циркадных часах. Исследования показывают, что он взаимодействует с рецепторами ретиноидов и гормонов щитовидной железы , ингибируя их лиганд-зависимую активацию транскрипции. Кроме того, было продемонстрировано взаимодействие с рецепторами эстрогена, приводящее к угнетению функции. Исследования показывают, что белок подавляет трансактивацию, опосредованную рецептором ядерных гормонов, посредством двух отдельных этапов: конкуренции с коактиваторами и прямых эффектов его функции репрессора транскрипции.

Структура и лиганды

Была получена кристаллическая структура SHP, состоящего только из LBD, полученная путем совместной кристаллизации с EID1. Вместо связывания с обычным сайтом AF-2 EID1 заполняет место того, что обычно является спиралью α1 LBD, и делает SHP более растворимым. Общая структура напоминает апо (безлигандную) форму других LBD. Некоторые синтетические ретиноидные лиганды могут связываться с LBD SHP и способствовать его взаимодействию с корепрессорами, содержащими LXXLL, с использованием сайта AF-2.

Взаимодействия

Крупномасштабные и среднемасштабные эксперименты Y2H, а также анализ текстов литературы по NR выявили важную роль SHP в сети димеризации ядерных рецепторов и его относительно высокосвязанный статус по сравнению с другими NR.

Было показано, что партнер малого гетеродимера взаимодействует с:

• Андрогенный рецептор ,
• Рецептор эстрогена альфа ,
• Ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа ,
• Гомолог печеночного рецептора-1 ,
• X-рецептор печени альфа ,
• Гамма-рецептор, активирующий пролифератор пероксисомы ,
• Рецептор ретиноевой кислоты альфа ,
• ЭИД1 ,
• Ретиноид X-рецептор альфа .

Дальнейшее чтение

• Соль В., Чхве Х.С., Мур Д.Д. (май 1996 г.). «Осиротный ядерный гормональный рецептор, у которого отсутствует ДНК-связывающий домен и который гетеродимеризуется с другими рецепторами». Наука . 272 (5266): 1336–9. Бибкод : 1996Sci...272.1336S . дои : 10.1126/science.272.5266.1336 . ПМИД   8650544 . S2CID   32853062 .
• Сеол В., Ханстейн Б., Браун М., Мур Д.Д. (октябрь 1998 г.). «Ингибирование действия рецептора эстрогена сиротским рецептором SHP (коротким партнером гетеродимера)» . Молекулярная эндокринология . 12 (10): 1551–7. дои : 10.1210/me.12.10.1551 . ПМИД   9773978 .
• Ли Ю.К., Делл Х., Дохан Д.Х., Хадзопулу-Кладарас М., Мур Д.Д. (январь 2000 г.). «Сиротский ядерный рецептор SHP ингибирует ядерный фактор гепатоцитов 4 и трансактивацию рецептора ретиноида X: два механизма репрессии» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (1): 187–95. дои : 10.1128/MCB.20.1.187-195.2000 . ПМК   85074 . ПМИД   10594021 .
• Йоханссон Л., Бовнер А., Томсен Дж.С., Фернегорд М., Густафссон Дж.А., Трейтер Э. (февраль 2000 г.). «Сиротский ядерный рецептор SHP использует консервативные мотивы, связанные с LXXLL, для взаимодействия с активированными лигандом эстрогеновыми рецепторами» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1124–33. дои : 10.1128/MCB.20.4.1124-1133.2000 . ПМК   85230 . ПМИД   10648597 .
• Лу Т.Т., Макишима М., Репа Дж.Дж., Шунджанс К., Керр Т.А., Ауверкс Дж., Мангельсдорф DJ (сентябрь 2000 г.). «Молекулярные основы обратной регуляции синтеза желчных кислот ядерными рецепторами» . Молекулярная клетка . 6 (3): 507–15. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00050-2 . ПМИД   11030331 .
• Нисигори Х., Томура Х., Тонука Н., Канамори М., Ямада С., Шо К. и др. (январь 2001 г.). «Мутации в гене-партнере малого гетеродимера связаны с легким ожирением у японцев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (2): 575–80. дои : 10.1073/pnas.021544398 . ПМК   14629 . ПМИД   11136233 .
• Ли Ю.К., Мур Д.Д. (январь 2002 г.). «Двойные механизмы репрессии мономерного сиротского рецептора белка-1, гомологичного рецептору печени, партнером-сиротой малого гетеродимера» . Журнал биологической химии . 277 (4): 2463–7. дои : 10.1074/jbc.M105161200 . ПМИД   11668176 .
• Нисидзава Х., Ямагата К., Симомура И., Такахаси М., Курияма Х., Кисида К. и др. (январь 2002 г.). «Маленький партнер гетеродимера, сиротский ядерный рецептор, усиливает гамма-трансактивацию рецептора, активируемого пролифератором пероксисомы» . Журнал биологической химии . 277 (2): 1586–92. дои : 10.1074/jbc.M104301200 . ПМИД   11696534 .
• Саньял С., Ким Дж.И., Ким Х.Дж., Такеда Дж., Ли Ю.К., Мур Д.Д., Чой Х.С. (январь 2002 г.). «Дифференциальная регуляция промотора гена малого гетеродимера-партнера (SHP) сиротского ядерного рецептора изоформами ERR сиротского ядерного рецептора» . Журнал биологической химии . 277 (3): 1739–48. дои : 10.1074/jbc.M106140200 . ПМИД   11705994 .
• Гобине Дж., Аузу Дж., Николас Дж.К., Султан С., Жалагье С. (декабрь 2001 г.). «Характеристика взаимодействия между андрогенным рецептором и новым ингибитором транскрипции, SHP». Биохимия . 40 (50): 15369–77. дои : 10.1021/bi011384o . ПМИД   11735420 .
• Клинге CM, Джерниган СК, Райзингер К.Э. (март 2002 г.). «Агонистическая активность тамоксифена ингибируется коротким партнерским гетеродимерным орфанным ядерным рецептором в клетках рака эндометрия человека» . Эндокринология . 143 (3): 853–67. дои : 10.1210/endo.143.3.8676 . ПМИД   11861507 .
• Огата М., Авадзи Т., Ивасаки Н., Миядзаки С., Белл Г.И., Ивамото Ю. (март 2002 г.). «Ядерная транслокация SHP и визуализация взаимодействия с HNF-4альфа в живых клетках». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 292 (1): 8–12. дои : 10.1006/bbrc.2002.6593 . ПМИД   11890664 .
• Цао Х, Хегеле Р.А. (2002). «Идентификация полиморфизмов в гене SHP1 человека» . Журнал генетики человека . 47 (8): 445–7. дои : 10.1007/s100380200062 . ПМИД   12181644 .
• Брендель С., Шунджанс К., Ботруньо О.А., Трейтер Э., Ауверкс Дж. (сентябрь 2002 г.). «Маленький гетеродимер-партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность» . Молекулярная эндокринология . 16 (9): 2065–76. дои : 10.1210/me.2001-0194 . ПМИД   12198243 .
• Боргиус Л.Дж., Стеффенсен К.Р., Густафссон Дж.А., Трейтер Э. (декабрь 2002 г.). «Передача сигналов глюкокортикоидов нарушается атипичными орфанными рецепторами и корепрессорами SHP» . Журнал биологической химии . 277 (51): 49761–6. дои : 10.1074/jbc.M205641200 . ПМИД   12324453 .
• Хунг CC, Фаруки И.С., Онг К., Луан Дж., Кио Дж.М., Пембри М. и др. (май 2003 г.). «Вклад вариантов малого гена-партнера гетеродимера в массу тела при рождении, ожирение и уровень инсулина: мутационный анализ и исследования ассоциаций в нескольких популяциях» . Диабет . 52 (5): 1288–91. дои : 10.2337/диабет.52.5.1288 . ПМИД   12716767 .
• Лай К., Харниш, округ Колумбия, Эванс, М.Дж. (сентябрь 2003 г.). «Эстрогеновый рецептор альфа регулирует экспрессию малого гетеродимера-партнера рецептора-сироты» . Журнал биологической химии . 278 (38): 36418–29. дои : 10.1074/jbc.M303913200 . ПМИД   12842887 .
• Ковачич А., Спид СиДжей, Симпсон Э.Р., Клайн К.Д. (январь 2004 г.). «Ингибирование транскрипции ароматазы через промотор II коротким гетеродимерным партнером в преадипоцитах человека» . Молекулярная эндокринология . 18 (1): 252–9. дои : 10.1210/me.2003-0211 . ПМИД   14593077 .

Внешние ссылки

• small+heterodimer+partner+protein в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)