ЗНФ238

ЗБТБ18
Идентификаторы
Псевдонимы	ZBTB18 , C2H2-171, MRD22, RP58, TAZ-1, ZNF238, цинковый палец и домен BTB, содержащий 18
Внешние идентификаторы	Опустить : 608433 ; МГИ : 1353609 ; Гомологен : 21276 ; Генные карты : ZBTB18 ; ОМА : ZBTB18 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	244,057,476 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	177,278,330 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	cerebellar vermis; ; paraflocculus of cerebellum; ; Brodmann area 23; ; Region I of hippocampus proper; ; ganglionic eminence; ; Epithelium of choroid plexus; ; endothelial cell; ; orbitofrontal cortex; ; entorhinal cortex; ; middle temporal gyrus;
	Top expressed in
	lobe of cerebellum; ; cerebellar vermis; ; barrel cortex; ; subdivision of hippocampus; ; Region I of hippocampus proper; ; cingulate gyrus; ; hippocampus proper; ; prefrontal cortex; ; primary motor cortex; ; ganglionic eminence;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; nucleic acid binding; DNA binding; sequence-specific DNA binding; metal ion binding; protein binding; transcription coactivator activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nuclear chromosome; nucleus;
Biological process	multicellular organism development; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; skeletal muscle tissue development; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; cellular response to DNA damage stimulus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10472
	30928
	ENSG00000179456
	ENSMUSG00000063659
	Q99592
	Q9WUK6
	НМ_001278196 ; НМ_006352 ; НМ_205768
showНМ_001012330 ; НМ_013915 ; НМ_001355098 ; НМ_001355099 ; НМ_001355100 ;
	NM_001355101; NM_001355102; NM_001355103
	НП_001265125 ; НП_006343 ; НП_991331
showНП_001012330 ; НП_038943 ; НП_001342027 ; НП_001342028 ; НП_001342029 ;
	NP_001342030; NP_001342031; NP_001342032
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 238 «цинковый палец» (также известный как RP58 или ZBTB18) представляет собой цинковый палец содержащий фактор транскрипции, , который у людей кодируется ZNF238 геном . ^[5]^[6]

Функция

ZNF238 — это ген, который играет важную роль в «способствовании упорядоченному и правильно рассчитанному нейрогенезу, ведущему к правильному формированию слоев и росту коры ». ^[7] Было обнаружено, что потеря ZNF238 вызывает микроцефалию , агенезию мозолистого тела , пороки развития слоев коры головного мозга и гипоплазию мозжечка . ^[7] Кроме того, его отсутствие может вызвать снижение Ngn2 и Neurod1 (в клетках-предшественниках и их увеличение в мутантных нейронах), что приводит к уменьшению количества клеток-предшественников и увеличению дифференцировки нейронов и роста глиальных клеток . ^[7] ZNF238 также регулирует репрессированные гены, которые, если их не контролировать, могут привести к прогрессированию глиомы . Более того, отсутствие ZNF238 приводит к усилению процесса эпителиально-мезенхимального перехода .

В таких опухолях , как медуллобластомы , потеря ZNF238 может дезорганизовать процессы клеточного деления опухоли, что приводит к клеточно разнообразному новообразованию. Было замечено, что это новое разнообразие увеличивает инвазивность опухоли, приводя к пролиферации в большее количество областей мозга, чем до потери ZNF238.

типа C2H2 Белки цинковых пальцев , такие как ZNF238, действуют на молекулярном уровне как активаторы или репрессоры транскрипции и участвуют в сборке хроматина . ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что ZNF238 взаимодействует с DNMT3A . ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179456 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063659 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Беккер К.Г., Ли И.Дж., Нэгл Дж.В., Каннинг Р.Д., Гадо А.М., Торрес Р., Полимеропулос М.Х., Масса П.Т., Бидисон В.Е., Дрю П.Д. (ноябрь 1997 г.). «C2H2-171: новая человеческая кДНК, представляющая регулируемый в процессе развития домен POZ/белок цинковых пальцев, преимущественно экспрессирующийся в головном мозге» . Международный журнал нейробиологии развития . 15 (7): 891–9. дои : 10.1016/S0736-5748(97)00034-8 . ПМИД 9568537 . S2CID 37032889 .
^ Аоки К., Исида Р., Касаи М. (январь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей транслин-подобный белок TRAX». Письма ФЭБС . 401 (2–3): 109–12. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01444-5 . ПМИД 9013868 . S2CID 46704829 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сян С., Баубет В., Пал С., Холдербаум Л., Татард В., Цзян П. и др. (апрель 2012 г.). «RP58/ZNF238 напрямую модулирует уровни пронейрогенных генов и необходим для дифференцировки нейронов и расширения мозга» . Смерть клеток и дифференцировка . 19 (4): 692–702. дои : 10.1038/cdd.2011.144 . ПМК 3307985 . ПМИД 22095278 .
^ «Ген Энтрез: белок 238 цинковых пальцев ZNF238» .
^ Фукс Ф., Бургерс В.А., Годин Н., Касаи М., Кузаридес Т. (май 2001 г.). «Dnmt3a связывает деацетилазы и рекрутируется с помощью специфичного для последовательности репрессора для подавления транскрипции» . Журнал ЭМБО . 20 (10): 2536–44. дои : 10.1093/emboj/20.10.2536 . ПМК 125250 . ПМИД 11350943 .

Дальнейшее чтение

Адамс МД, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Балт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Э.Ф., Вайнсток К.Г., Гокейн Дж.Д., Уайт О (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия и моделей экспрессии генов человека на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК». Природа (PDF). 377 (6547 Приложение): 3–174. ПМИД 7566098 .
Беккер К.Г., Нэгл Дж.В., Каннинг Р.Д., Бидисон В.Е., Озато К., Дрю П.Д. (апрель 1995 г.). «Быстрое выделение и характеристика 118 новых кДНК цинковых пальцев типа C2H2, экспрессируемых в мозге человека». Молекулярная генетика человека . 4 (4): 685–91. дои : 10.1093/hmg/4.4.685 . ПМИД 7633419 .
Аоки К., Мэн Г., Сузуки К., Такаши Т., Камеока И., Накахара К., Исида Р., Касаи М. (октябрь 1998 г.). «RP58 связывается с конденсированным хроматином и опосредует специфичную для последовательности репрессию транскрипции» . Журнал биологической химии . 273 (41): 26698–704. дои : 10.1074/jbc.273.41.26698 . ПМИД 9756912 .
Ахмад К.Ф., Энгель К.К., Приве Г.Г. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура домена BTB из PLZF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (21): 12123–8. Бибкод : 1998PNAS...9512123F . дои : 10.1073/pnas.95.21.12123 . ПМК 22795 . ПМИД 9770450 .
Мэн Г., Инадзава Дж., Исида Р., Токура К., Накахара К., Аоки К., Касаи М. (январь 2000 г.). «Структурный анализ гена, кодирующего RP58, трансрепрессор, специфичный для последовательности, связанный с гетерохроматином». Джин . 242 (1–2): 59–64. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00477-1 . ПМИД 10721697 .
Фукс Ф., Бургерс В.А., Годин Н., Касаи М., Кузаридес Т. (май 2001 г.). «Dnmt3a связывает деацетилазы и рекрутируется с помощью специфичного для последовательности репрессора для подавления транскрипции» . Журнал ЭМБО . 20 (10): 2536–44. дои : 10.1093/emboj/20.10.2536 . ПМК 125250 . ПМИД 11350943 .

Внешние ссылки

ZNF238+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179456 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063659 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9568537-5] Беккер К.Г., Ли И.Дж., Нэгл Дж.В., Каннинг Р.Д., Гадо А.М., Торрес Р., Полимеропулос М.Х., Масса П.Т., Бидисон В.Е., Дрю П.Д. (ноябрь 1997 г.). «C2H2-171: новая человеческая кДНК, представляющая регулируемый в процессе развития домен POZ/белок цинковых пальцев, преимущественно экспрессирующийся в головном мозге» . Международный журнал нейробиологии развития . 15 (7): 891–9. дои : 10.1016/S0736-5748(97)00034-8 . ПМИД 9568537 . S2CID 37032889 .

[pmid9013868-6] Аоки К., Исида Р., Касаи М. (январь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей транслин-подобный белок TRAX». Письма ФЭБС . 401 (2–3): 109–12. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01444-5 . ПМИД 9013868 . S2CID 46704829 .

[:0-7] Jump up to: ^а ^б ^с Сян С., Баубет В., Пал С., Холдербаум Л., Татард В., Цзян П. и др. (апрель 2012 г.). «RP58/ZNF238 напрямую модулирует уровни пронейрогенных генов и необходим для дифференцировки нейронов и расширения мозга» . Смерть клеток и дифференцировка . 19 (4): 692–702. дои : 10.1038/cdd.2011.144 . ПМК 3307985 . ПМИД 22095278 .

[entrez-8] «Ген Энтрез: белок 238 цинковых пальцев ZNF238» .

[pmid11350943-9] Фукс Ф., Бургерс В.А., Годин Н., Касаи М., Кузаридес Т. (май 2001 г.). «Dnmt3a связывает деацетилазы и рекрутируется с помощью специфичного для последовательности репрессора для подавления транскрипции» . Журнал ЭМБО . 20 (10): 2536–44. дои : 10.1093/emboj/20.10.2536 . ПМК 125250 . ПМИД 11350943 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]