ЭЛЬФ5

ЭЛЬФ5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1WWX
Идентификаторы
Псевдонимы	ELF5 , ESE2, E74, подобные фактору транскрипции 5 ETS
Внешние идентификаторы	Опустить : 605169 ; МГИ : 1335079 ; Гомологен : 7702 ; Генные карты : ELF5 ; OMA : ELF5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	34,525,193 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	103,281,334 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	parotid gland; ; amniotic fluid; ; seminal vesicula; ; epithelium of lactiferous gland; ; lactiferous duct; ; minor salivary glands; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; mucosa of paranasal sinus; ; buccal mucosa cell; ; palpebral conjunctiva;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; parotid gland; ; lactiferous gland; ; olfactory epithelium; ; left lung lobe; ; submandibular gland; ; lacrimal gland; ; medullary collecting duct; ; esophagus; ; lip;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; ectodermal cell fate commitment; negative regulation of cell differentiation; cell differentiation; ectoderm development; cell population proliferation; regulation of transcription, DNA-templated; somatic stem cell population maintenance; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; mammary gland epithelial cell differentiation; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2001
	13711
	ENSG00000135374
	ENSMUSG00000027186
	Q9UKW6
	Q8VDK3
	НМ_198381 ; НМ_001243080 ; НМ_001243081 ; НМ_001422
	НМ_001145813 ; НМ_010125
	NP_001230009 ; НП_001230010 ; НП_001413 ; НП_938195
	НП_001139285 ; НП_034255
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

E74-подобный фактор 5 (фактор транскрипции домена ets) представляет собой ген , обнаруженный как у мышей, так и у людей. ^[5] У людей он также называется ESE2.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом специфического для эпителия подкласса семейства транскрипционных факторов ETS . Помимо своей роли в регуляции более поздних стадий терминальной дифференцировки кератиноцитов, он, по-видимому, регулирует ряд эпителий-специфичных генов, обнаруженных в тканях, содержащих железистый эпителий, таких как слюнные железы и предстательная железа. Он имеет очень низкое сродство к ДНК из-за его отрицательного регуляторного домена на аминоконце. Для этого гена описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^[5]

Связь с болезнью

Известна его роль в развитии рака молочной железы или простаты. ^[6] Имеются предварительные сообщения о том, что генетический вариант аллеля C rs61882275 вблизи хромосомы 11.13 имеет вариабельную частоту встречаемости в человеческих популяциях. ^[7] связано с тяжелым течением COVID-19 . ^[8] Дальнейшие исследования, проведенные другими, показали, что эта связь вызвана тканеспецифичным влиянием этого аллеля на экспрессию ELF5 в эндотелии легких , что приводит к более чем 4-кратному повышению риска тяжелого течения COVID-19 у людей с инфекцией SARS-CoV2 . ^[9]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135374 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027186 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ELF5 E74-подобный фактор 5 (фактор транскрипции домена ets)» .
^ Пиггин КЛ, Роден ДЛ, Гальего-Ортега Д, Ли Х.Дж., Оукс С.Р., Орманди СиДжей (7 января 2016 г.). «Экспрессия изоформы ELF5 тканеспецифична и значительно изменяется при раке» . Исследование рака молочной железы . 18 (1). 4. дои : 10.1186/s13058-015-0666-0 . ПМК 4704400 . ПМИД 26738740 .
^ «Короткие генетические вариации dbSNP: rs61882275» . Проверено 21 января 2022 г.
^ Кусатанас А. и др. (8 сентября 2021 г.). «Полногеномное секвенирование позволяет выявить несколько локусов критических заболеваний, вызванных COVID-19». medRxiv 10.1101/2021.09.02.21262965 .
^ Питцнер М. и др. (19 января 2022 г.). «ELF5 — это ген риска, специфичный для респираторных эпителиальных клеток, для тяжелого течения COVID-19». medRxiv 10.1101/2022.01.17.22269283 .

Дальнейшее чтение

Шаррокс А.Д., Браун А.Л., Линг Ю., Йейтс П.Р. (декабрь 1997 г.). «Семейство транскрипционных факторов ETS-домена». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 29 (12): 1371–87. дои : 10.1016/S1357-2725(97)00086-1 . ПМИД 9570133 .
Чжоу Дж., Нг А.Ю., Тиммс М.Дж., Джермин Л.С., Сет А.К., Томас Р.С., Кола I (ноябрь 1998 г.). «Новый фактор транскрипции, ELF5, принадлежит к подсемейству ELF генов ETS и картируется на хромосоме человека 11p13-15, области, подверженной LOH и перестройке в клеточных линиях карциномы человека» . Онкоген . 17 (21): 2719–32. дои : 10.1038/sj.onc.1202198 . ПМИД 9840936 .
Оттген П., Кас К., Дубе А., Гу Х, Гралль Ф., Тамронгсак У., Акбарали Ю., Фингер Е., Болтакс Дж., Эндресс Г., Мангер К., Кунш С., Либерманн Т.А. (октябрь 1999 г.). «Характеристика ESE-2, нового фактора транскрипции Ets, связанного с ESE-1, который ограничен железистым эпителием и дифференцированными кератиноцитами» . Журнал биологической химии . 274 (41): 29439–52. дои : 10.1074/jbc.274.41.29439 . ПМИД 10506207 .
Лапинскас Э.Дж., Палмер Дж., Рикардо С., Герцог П.Дж., Хамахер А., Притчард М.А. (декабрь 2004 г.). «Основным местом экспрессии фактора транскрипции ets Elf5 является эпителий экзокринных желез». Гистохимия и клеточная биология . 122 (6): 521–6. дои : 10.1007/s00418-004-0713-x . ПМИД 15655699 . S2CID 28936823 .
Янив Д., Ху Дж. (июнь 2005 г.). «Эпителий-специфичный транскрипционный фактор 2 ets усиливает экспрессию цитокератина 18 в легочных эпителиальных клетках посредством взаимодействия с интроном 1 цитокератина 18» . Клеточные исследования . 15 (6): 423–9. дои : 10.1038/sj.cr.7290310 . ПМЦ 4494830 . ПМИД 15987600 .
Туммала Р., Синха С. (март 2006 г.). «Дифференциально-специфическая регуляция транскрипции гена ESE-2 с помощью нового фактора, ограниченного кератиноцитами». Журнал клеточной биохимии . 97 (4): 766–81. дои : 10.1002/jcb.20685 . ПМИД 16229011 . S2CID 46125527 .
Чой Ю.С., Синха С. (сентябрь 2006 г.). «Определение консенсусной ДНК-связывающей последовательности и домена активации транскрипции для ESE-2» . Биохимический журнал . 398 (3): 497–507. дои : 10.1042/BJ20060375 . ПМЦ 1559455 . ПМИД 16704374 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .

Внешние ссылки

ELF5 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135374 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027186 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: ELF5 E74-подобный фактор 5 (фактор транскрипции домена ets)» .

[6] Пиггин КЛ, Роден ДЛ, Гальего-Ортега Д, Ли Х.Дж., Оукс С.Р., Орманди СиДжей (7 января 2016 г.). «Экспрессия изоформы ELF5 тканеспецифична и значительно изменяется при раке» . Исследование рака молочной железы . 18 (1). 4. дои : 10.1186/s13058-015-0666-0 . ПМК 4704400 . ПМИД 26738740 .

[dbSMP-7] «Короткие генетические вариации dbSNP: rs61882275» . Проверено 21 января 2022 г.

[8] Кусатанас А. и др. (8 сентября 2021 г.). «Полногеномное секвенирование позволяет выявить несколько локусов критических заболеваний, вызванных COVID-19». medRxiv 10.1101/2021.09.02.21262965 .

[9] Питцнер М. и др. (19 января 2022 г.). «ELF5 — это ген риска, специфичный для респираторных эпителиальных клеток, для тяжелого течения COVID-19». medRxiv 10.1101/2022.01.17.22269283 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]