Гомеобоксный белок SIX1

ШЕСТЬ1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 4EGC
Идентификаторы
Псевдонимы	SIX1 , BOS3, DFNA23, TIP39, SIX гомеобокс 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601205 ; МГИ : 102780 ; Гомологен : 4360 ; GeneCards : SIX1 ; ОМА : SIX1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 14 (human) Band 14q23.1 Start 60,643,421 bp End 60,658,259 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 12 (mouse) Band 12 C3|12 30.34 cM Start 73,086,789 bp End 73,100,661 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in Skeletal muscle tissue of biceps brachii parotid gland Skeletal muscle tissue of rectus abdominis bronchial epithelial cell vastus lateralis muscle body of tongue muscle of thigh olfactory zone of nasal mucosa triceps brachii muscle palpebral conjunctiva Top expressed in lumbar spinal ganglion extensor digitorum longus muscle plantaris muscle muscle of thigh parotid gland lacrimal gland saccule otic vesicle soleus muscle triceps brachii muscle More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific chromatin binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific transcription coactivator binding transcription cis-regulatory region binding Cellular component cytoplasm transcription regulator complex nucleolus nucleus Biological process pattern specification process negative regulation of neuron apoptotic process regulation of neuron differentiation embryonic skeletal system morphogenesis mesonephric tubule formation neurogenesis animal organ development ureteric bud development myoblast migration positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis renal system development regulation of transcription, DNA-templated epithelial cell differentiation olfactory placode formation regulation of skeletal muscle cell differentiation tongue development organ induction kidney development anatomical structure development thymus development ureter smooth muscle cell differentiation neuron fate specification myotome development skeletal system morphogenesis outflow tract morphogenesis trigeminal ganglion development negative regulation of apoptotic process negative regulation of transcription by RNA polymerase II hearing aorta morphogenesis regulation of branch elongation involved in ureteric bud branching fungiform papilla morphogenesis transcription, DNA-templated generation of neurons otic vesicle development regulation of protein localization positive regulation of transcription, DNA-templated multicellular organism development branching involved in ureteric bud morphogenesis thyroid gland development inner ear morphogenesis cochlea morphogenesis positive regulation of ureteric bud formation positive regulation of mesenchymal cell proliferation involved in ureter development middle ear morphogenesis regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction protein localization to nucleus regulation of gene expression embryonic cranial skeleton morphogenesis inner ear development positive regulation of secondary heart field cardioblast proliferation negative regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis cell population proliferation regulation of epithelial cell proliferation regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation skeletal muscle tissue development metanephric mesenchyme development facial nerve morphogenesis positive regulation of transcription by RNA polymerase II pharyngeal system development apoptotic process transcription by RNA polymerase II cellular response to 3,3',5-triiodo-L-thyronine negative regulation of transcription, DNA-templated regulation of skeletal muscle cell proliferation skeletal muscle fiber development Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6495 20471 Вместе ENSG00000126778 ENSMUSG00000051367 ЮниПрот Q15475 Q62231 RefSeq (мРНК) НМ_005982 НМ_009189 RefSeq (белок) НП_005973 НП_033215 Местоположение (UCSC) Чр 14: 60,64 – 60,66 Мб Чр 12: 73.09 – 73.1 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок SIX1 (Sine oculis гомеобоксный гомолог 1) представляет собой белок , который у человека кодируется SIX1 геном .

Функция

Гены SIX позвоночных являются гомологами гена 'sine oculis' (so) дрозофилы, который экспрессируется преимущественно в развивающейся зрительной системе мух. Члены семейства генов SIX кодируют белки, которые характеризуются дивергентным ДНК-связывающим гомеодоменом и вышестоящим доменом SIX, который может участвовать как в определении специфичности связывания ДНК, так и в обеспечении межбелковых взаимодействий. Было показано, что гены семейства SIX играют роль в развитии позвоночных и насекомых или участвуют в поддержании дифференцированного состояния тканей. [предоставлено OMIM]

Взаимодействия

Было показано, что SIX1 взаимодействует с EYA1 . DACH, GRO и MDFI .

Дальнейшее чтение

• Оливер Г., Вер Р., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г., Чейетт Б.Н., Хартенштейн В., Зипурски С.Л., Грусс П. (март 1995 г.). «Гены гомеобокса и рисунок соединительной ткани». Разработка . 121 (3): 693–705. дои : 10.1242/dev.121.3.693 . hdl : 11858/00-001M-0000-0013-037D-E . ПМИД   7720577 .
• Адрадос I, Ларраса-Алонсо Х, Галаррета А, Лопес-Антона I, Менендес К, Абад М, Палмеро I (2015). «Гомеопротеин SIX1 контролирует клеточное старение посредством регуляции p16INK4A и генов, связанных с дифференцировкой» . Онкоген . 35 (27): 3485–3494. дои : 10.1038/onc.2015.408 . ПМК   5730042 . ПМИД   26500063 .
• Форд Х.Л., Кабингу Э.Н., Бамп Э.А., Муттер Г.Л., Парди AB (октябрь 1998 г.). «Отмена контрольной точки клеточного цикла G2, связанная со сверхэкспрессией HSIX1: возможный механизм канцерогенеза молочной железы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (21): 12608–13. Бибкод : 1998PNAS...9512608F . дои : 10.1073/pnas.95.21.12608 . ПМК   22878 . ПМИД   9770533 .
• Салам А.А., Хэфнер Ф.М., Линдер Т.Е., Спиллманн Т., Шинцель А.А., Леал С.М. (июнь 2000 г.). «Новый локус (DFNA23) прелингвальной аутосомно-доминантной несиндромальной тугоухости сопоставляется с 14q21-q22 у швейцарско-немецких родственников» . Американский журнал генетики человека . 66 (6): 1984–8. дои : 10.1086/302931 . ПМК   1378045 . ПМИД   10777717 .
• Ford HL, Landesman-Bollag E, Dacwag CS, Stukenberg PT, Pardee AB, Seldin DC (июль 2000 г.). «Регулируемое клеточным циклом фосфорилирование человеческого гомеодоменного белка SIX1» . Журнал биологической химии . 275 (29): 22245–54. дои : 10.1074/jbc.M002446200 . ПМИД   10801845 .
• Fan X, Brass LF, Poncz M, Spitz F, Maire P, Manning DR (октябрь 2000 г.). «Альфа-субъединицы Gz и Gi взаимодействуют с глазами, в которых отсутствует кофактор транскрипции Eya2, предотвращая его взаимодействие с шестью классами гомеодомен-содержащих белков» . Журнал биологической химии . 275 (41): 32129–34. дои : 10.1074/jbc.M004577200 . ПМИД   10906137 .
• Буллер С., Сюй X, Маркиз В., Шванке Р., Сюй ПХ (ноябрь 2001 г.). «Молекулярные эффекты мутаций домена Eya1, вызывающих дефекты органов при синдроме BOR» . Молекулярная генетика человека . 10 (24): 2775–81. дои : 10.1093/hmg/10.24.2775 . ПМИД   11734542 .
• Ли СМ, ​​Го М, Борчук А, Пауэлл К.А., Вэй М, Такер Х.М., Фридман Р., Кляйн У., Тыко Б (июнь 2002 г.). «Экспрессия генов в опухоли Вильмса имитирует самую раннюю стадию метанефрического мезенхимально-эпителиального перехода» . Американский журнал патологии . 160 (6): 2181–90. дои : 10.1016/S0002-9440(10)61166-2 . ПМЦ   1850829 . ПМИД   12057921 .
• Икеда К., Ватанабэ Ю., Ото Х., Каваками К. (октябрь 2002 г.). «Молекулярное взаимодействие и синергическая активация промотора белками Six, Eya и Dach, опосредованная через связывающий белок CREB» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6759–66. дои : 10.1128/MCB.22.19.6759-6766.2002 . ПМК   134036 . ПМИД   12215533 .
• Лопес-Риос Х., Тессмар К., Лусли Ф., Виттбродт Дж., Боволента П. (январь 2003 г.). «Активность Six3 и Six6 модулируется членами семейства граучо» . Разработка . 130 (1): 185–95. дои : 10.1242/dev.00185 . ПМИД   12441302 .
• Руф Р.Г., Беркман Дж., Вольф М.Т., Нюрнберг П., Гаттас М., Руф Э.М., Хайланд В., Кромберг Дж., Гласс И., Макмиллан Дж., Отто Э., Нюрнберг Г., Луке Б., Хеннис Х.К., Хильдебрандт Ф. (июль 2003 г.). «Локус гена бранхиотического синдрома картирован на хромосоме 14q21.3-q24.3» . Журнал медицинской генетики . 40 (7): 515–9. дои : 10.1136/jmg.40.7.515 . ПМЦ   1735534 . ПМИД   12843324 .
• Чжэн В., Хуан Л., Вэй ЗБ, Сильвиус Д., Тан Б., Сюй ПХ (сентябрь 2003 г.). «Роль Six1 в развитии слуховой системы млекопитающих» . Разработка . 130 (17): 3989–4000. дои : 10.1242/dev.00628 . ПМЦ   3873880 . ПМИД   12874121 .
• Ли Х, Оги К.А., Чжан Дж., Кронес А., Буш К.Т., Гласс С.К., Нигам С.К., Аггарвал А.К., Маас Р., Роуз Д.В., Розенфельд М.Г. (ноябрь 2003 г.). «Активность протеинфосфатазы Eya регулирует транскрипционные эффекты Six1-Dach-Eya в органогенезе млекопитающих». Природа . 426 (6964): 247–54. Бибкод : 2003Natur.426..247L . дои : 10.1038/nature02083 . ПМИД   14628042 . S2CID   4348941 .
• Колетта Р.Д., Кристенсен К., Райхенбергер К.Дж., Лэмб Дж., Микомонако Д., Хуанг Л., Вольф Д.М., Мюллер-Тидоу С., Голуб Т.Р., Каваками К., Форд Х.Л. (апрель 2004 г.). «Гомеопротеин Six1 стимулирует онкогенез путем реактивации циклина А1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (17): 6478–83. Бибкод : 2004PNAS..101.6478C . дои : 10.1073/pnas.0401139101 . ПМК   404070 . ПМИД   15123840 .
• Грифон Р., Лаклеф С., Шпитц Ф., Лопес С., Деминьон Дж., Гуидотти Дж.Э., Каваками К., Сюй П.С., Келли Р., Петроф Б.Дж., Дагелен Д., Конкорде Дж.П., Мэр П. (июль 2004 г.). «Экспрессия Six1 и Eya1 может перепрограммировать мышцы взрослого человека из фенотипа медленных сокращений в фенотип быстрых сокращений» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (14): 6253–67. дои : 10.1128/MCB.24.14.6253-6267.2004 . ПМЦ   434262 . ПМИД   15226428 .
• Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте белково-белкового взаимодействия человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Ито Т., Ногучи Ю., Яшима Т., Китамура К. (май 2006 г.). «Мутация SIX1, связанная с расширением вестибулярного водопровода у пациента с синдромом бранхио-ото». Ларингоскоп . 116 (5): 796–9. дои : 10.1097/01.mlg.0000209096.40400.96 . ПМИД   16652090 . S2CID   19273457 .