Хромосома 14
Хромосома 14 | |
---|---|
![]() Пара хромосом 14 человека после G-бэндинга . Один от матери, другой от отца. | |
![]() Хромосома 14 пара в мужской кариограмме человека . | |
Функции | |
Длина ( б.п. ) | 101 161 492 п.н. (CHM13) |
Количество генов | 583 ( ССДС ) [1] |
Тип | Аутосома |
Положение центромеры | Акроцентрический [2] (17,2 Мбит/с) [3] ) |
Полные списки генов | |
CCDS | Список генов |
HGNC | Список генов |
ЮниПрот | Список генов |
NCBI | Список генов |
Внешние программы просмотра карт | |
Вместе | Хромосома 14 |
Входить | Хромосома 14 |
NCBI | Хромосома 14 |
УКСК | Хромосома 14 |
Полные последовательности ДНК | |
RefSeq | NC_000014 ( ИСПРАВЛЕНО ) |
ГенБанк | CM000676 ( ИСПРАВЛЕНО ) |
Хромосома 14 — одна из 23 пар хромосом у человека . Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. Хромосома 14 охватывает около 101 миллиона пар оснований (строительный материал ДНК ) и составляет от 3 до 3,5% всей ДНК в клетках .
Центромера хромосомы 14 расположена примерно в положении 17,2 Мб.
Гены
[ редактировать ]Количество генов
[ редактировать ]Ниже приведены некоторые оценки количества генов в 14-й хромосоме человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотированию генома, их прогнозы количества генов в каждой хромосоме различаются (технические подробности см. в разделе «Прогнозирование генов» ). Среди различных проектов проект совместного консенсусного кодирования последовательностей ( CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих человеческие белки. [4]
По оценкам | Гены, кодирующие белки | Некодирующие гены РНК | Псевдогены | Источник | Дата выпуска |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 583 | — | — | [1] | 2016-09-08 |
HGNC | 593 | 324 | 513 | [5] | 2017-05-12 |
Вместе | 820 | 856 | 518 | [6] | 2017-03-29 |
ЮниПрот | 720 | — | — | [7] | 2018-02-28 |
NCBI | 621 | 690 | 598 | [8] [9] [10] | 2017-05-19 |
Список генов
[ редактировать ]Ниже приводится неполный список генов 14-й хромосомы человека. Полный список можно найти по ссылке в информационном окне справа.
- ACIN1 : кодирующий белок, индуктор апоптотической конденсации хроматина в ядре.
- AHNAK2 : кодирующий белок нуклеопротеин 2 Анак.
- ATXN3 : атаксин-3 (болезнь Мачадо-Джозефа)
- BCL2L2 : кодирует антиапоптотический белок Bcl -w семейства Bcl-2.
- C14orf80 : кодирующий белок C14orf80.
- C14orf93 : кодирующий белок C14orf93.
- CCDC176 : кодирующий белок фактор базальной ориентации тела 1.
- CCDC88C : кодирующий белок спиральный домен, содержащий 88C.
- CDC42BPB : кодирующий белок бета-киназы, связывающей CDC42.
- CDKL1 : кодирующий белок циклинзависимую киназу типа 1.
- CHMP4A : заряженный мультивезикулярный белок 4а тела.
- CIDEB : DFFA-подобный эффектор b, индуцирующий гибель клеток.
- CLBA1 : кодирующий белок CLBA1
- CMA1 : кодирующий фермент химазу.
- CNIH : кодирующий белок , гомолог белка рассола.
- COCH : гомолог фактора свертывания крови C, кохлин ( Limulus polyphemus )
- CRIP2 : белок 2, богатый цистеином.
- DDX24 : кодирующий фермент АТФ-зависимую РНК-геликазу DDX24.
- DEGS2 : кодирующий белок дельта(4)-десатуразу, сфинголипид 2.
- DLGAP5 : Диски, крупноассоциированный белок 5.
- DGLUCY : кодирующий белок DGLUCY, митохондриальный.
- EAPP : E2F-ассоциированный фосфопротеин.
- EGLN3 : девятый гомолог Egl 3.
- ENTPD5 : эктонуклеозидтрифосфатдифосфогидролаза 5.
- ERG28 : кодирующий белок. Вероятный биосинтетический белок 28 эргостерина.
- Fam158a : кодирующий белок UPF0172, белок FAM158A.
- FAM181A : кодирующее семейство белков со сходством последовательностей 181, член A.
- FAM71D : Семейство со сходством последовательностей 71, член D.
- FCF1 : гомолог белка FCF1, процессирующего рРНК.
- FSCB : кодирующий белок Фиброзная оболочка CABYR-связывающий белок
- GALC : галактозилцерамидаза (болезнь Краббе)
- GARNL1 : GTPase-активирующий домен, подобный домену 1 Rap/Ran-GAP.
- GCH1 : GTP-циклогидролаза 1 ( дофа-зависимая дистония )
- GPHB5 : гликопротеиновый гормон бета-5.
- GSKIP, кодирующий белок, взаимодействующий с GSK3B белок
- HHIPL1 : кодирующий белок HHIP-подобный белок 1.
- IFI27 : кодирующий белок альфа-индуцируемый интерфероном белок 27.
- IFT43 : внутрижгутиковый транспорт 43
- IGH@ : иммуноглобулина. тяжелой цепи локус
- IRF2BPL : кодирующий белок, связывающий регуляторный фактор интерферона 2, подобный белку
- ITPK1 : кодирующий фермент инозитол-тетракисфосфат-1-киназу.
- JKAMP : кодирующий белок мембранный белок, связанный с JNK1.
- JPH4 : кодирующий белок Junctophilin 4.
- LINC00520 : длинная некодирующая РНК.
- LINC00637 : кодирующий белок. Длинная межгенная небелковая кодирующая РНК 637.
- MAPK1IP1L : кодирующий белок, подобный белку, взаимодействующему с MAPK и стабилизирующему веретено
- MIA2 : кодирующий белок белка 2, ингибирующего активность меланомы.
- MIR494, кодирующий белок микроРНК 494
- MIR495 : кодирующий белок микроРНК 495.
- MIR3173 : кодирующий белок микроРНК 3173.
- MIS18BP1 : кодирующий белок MIS18, связывающий белок 1.
- MOAP1 : кодирующий белок -модулятор апоптоза 1.
- MYH7 : миозина (MHC-β). изоформа бета-тяжелой цепи [11]
- NEMF (ген) : кодирующий белок, фактор-посредник ядерного экспорта.
- NPC2 : болезнь Нимана-Пика, тип C2.
- NUBPL : кодирующий белок железо-серный белок NUBPL (IND1).
- OSGEP : кодирующий фермент вероятную эндопептидазу O-сиалогликопротеина.
- PAPOLA : кодирующий фермент поли(А)-полимеразу альфа.
- PCNX : кодирующий белок пеканекс-подобный белок 1.
- PELI2 : кодирующий белок , гомолог белка пеллино 2.
- PLEKHG3 : кодирующий гомологию белка плекстрина и домен rhogef, содержащий g3.
- PSEN1 : пресенилин 1 (болезнь Альцгеймера 3)
- RIOX1 : кодирующий белок RIOX1
- RTRAF : кодирующий белок RTRAF
- RPL10L : кодирующий белок 60S, подобный рибосомному белку L10.
- SERPINA1 : ингибитор серпинпептидазы, клада A (антипротеиназа альфа-1, антитрипсин), член 1.
- SERPINA3 : кодирующий белок альфа-1-антхимотрипсин (ACT).
- SERPINA12 : кодирующий белок SERPIN A12.
- SIX6OS1 : кодирующий белок SIX6OS1.
- SGPP1 : кодирующий фермент сфингозин-1-фосфатфосфатазу 1.
- SNORD9 : кодирующий белок Малая ядрышковая РНК, c/d box 9
- SYNE3 : кодирующий белок повтор спектрина, содержащий член семейства ядерной оболочки.
- TC2N : кодирующий белок ядерный белок тандемных доменов C2.
- TCL1B : кодирующий белок 1B Т-клеточного лейкоза/лимфомы.
- TIMM9 : кодирующий фермент субъединицу транслоказы митохондриального импорта внутренней мембраны Tim9.
- TMED10 : кодирующий белок. Трансмембранный белок 10, содержащий домен emp24.
- TMEM260 : кодирующий белок TMEM260.
- TRAJ56 : кодирующий белок Т-клеточного рецептора альфа, соединяющий 56
- TRAV12-2 : кодирует белка 12-2. альфа-переменную рецептора Т-клеток
- TSHR : рецептор тиреотропного гормона.
- ТУНАР : длинная некодирующая РНК.
- VASH1 : кодирующий белок вазогибин-1.
- VIPAS39 : кодирующий белок VIPAS39.
- ВОЙНЫ : кодирующий фермент триптофанил-тРНК-синтетазу, цитоплазматический
- YLPM1 : кодирующий белок 1, содержащий мотив YLP.
- ZBTB1 : кодирующий белок «Цинковый палец» и домен BTB, содержащий 1
- ZFHX2 : кодирующий белок гомеобокс 2 с цинковым пальцем.
- ZNF839 : кодирующий белок белок 839 цинкового пальца.
Болезни и расстройства
[ редактировать ]Следующие заболевания относятся к числу тех, которые связаны с генами на хромосоме 14:
- Дефицит альфа-1-антитрипсина
- болезнь Альцгеймера
- Лимфома Беркитта (t8;14)
- врожденный гипотиреоз
- дофамин-зависимая дистония
- Фолликулярная лимфома (t14;18)
- Синдром FOXG1
- Гипертрофическая кардиомиопатия
- Крабовая болезнь
- Кранио-лентикуло-шовная дисплазия
- Болезнь Мачадо-Джозефа
- Мозаичная моносомия 14
- Множественная миелома
- Болезнь Нимана-Пика
- Несиндромальная глухота
- синдром Сенсенбреннера
- Дефицит тетрагидробиоптерина
- Однородительская дисомия (УПД) 14
- Окулофарингеальная мышечная дистрофия
Цитогенетическая полоса
[ редактировать ]Хр. | Рука [17] | Группа [18] | ISCN начинать [19] | ISCN останавливаться [19] | Базовая пара начинать | Базовая пара останавливаться | Пятно [20] | Плотность |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
14 | п | 13 | 0 | 284 | 1 | 3,600,000 | гвар | |
14 | п | 12 | 284 | 624 | 3,600,001 | 8,000,000 | выслеживать | |
14 | п | 11.2 | 624 | 1249 | 8,000,001 | 16,100,000 | гвар | |
14 | п | 11.1 | 1249 | 1433 | 16,100,001 | 17,200,000 | акцент | |
14 | д | 11.1 | 1433 | 1660 | 17,200,001 | 18,200,000 | акцент | |
14 | д | 11.2 | 1660 | 2043 | 18,200,001 | 24,100,000 | гнег | |
14 | д | 12 | 2043 | 2313 | 24,100,001 | 32,900,000 | GPS | 100 |
14 | д | 13.1 | 2313 | 2469 | 32,900,001 | 34,800,000 | гнег | |
14 | д | 13.2 | 2469 | 2582 | 34,800,001 | 36,100,000 | GPS | 50 |
14 | д | 13.3 | 2582 | 2724 | 36,100,001 | 37,400,000 | гнег | |
14 | д | 21.1 | 2724 | 2923 | 37,400,001 | 43,000,000 | GPS | 100 |
14 | д | 21.2 | 2923 | 3008 | 43,000,001 | 46,700,000 | гнег | |
14 | д | 21.3 | 3008 | 3264 | 46,700,001 | 50,400,000 | GPS | 100 |
14 | д | 22.1 | 3264 | 3491 | 50,400,001 | 53,600,000 | гнег | |
14 | д | 22.2 | 3491 | 3604 | 53,600,001 | 55,000,000 | GPS | 25 |
14 | д | 22.3 | 3604 | 3718 | 55,000,001 | 57,600,000 | гнег | |
14 | д | 23.1 | 3718 | 3916 | 57,600,001 | 61,600,000 | GPS | 75 |
14 | д | 23.2 | 3916 | 4044 | 61,600,001 | 64,300,000 | гнег | |
14 | д | 23.3 | 4044 | 4186 | 64,300,001 | 67,400,000 | GPS | 50 |
14 | д | 24.1 | 4186 | 4484 | 67,400,001 | 69,800,000 | гнег | |
14 | д | 24.2 | 4484 | 4626 | 69,800,001 | 73,300,000 | GPS | 50 |
14 | д | 24.3 | 4626 | 4839 | 73,300,001 | 78,800,000 | гнег | |
14 | д | 31.1 | 4839 | 5051 | 78,800,001 | 83,100,000 | GPS | 100 |
14 | д | 31.2 | 5051 | 5094 | 83,100,001 | 84,400,000 | гнег | |
14 | д | 31.3 | 5094 | 5349 | 84,400,001 | 89,300,000 | GPS | 100 |
14 | д | 32.11 | 5349 | 5406 | 89,300,001 | 91,400,000 | гнег | |
14 | д | 32.12 | 5406 | 5505 | 91,400,001 | 94,200,000 | GPS | 25 |
14 | д | 32.13 | 5505 | 5619 | 94,200,001 | 95,800,000 | гнег | |
14 | д | 32.2 | 5619 | 5732 | 95,800,001 | 100,900,000 | GPS | 50 |
14 | д | 32.31 | 5732 | 5903 | 100,900,001 | 102,700,000 | гнег | |
14 | д | 32.32 | 5903 | 6016 | 102,700,001 | 103,500,000 | GPS | 50 |
14 | д | 32.33 | 6016 | 6300 | 103,500,001 | 107,043,718 | гнег |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Результаты поиска — 14[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («имеет ccds»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . CCDS Release 20 для Homo Sapiens . 08.09.2016 . Проверено 28 мая 2017 г.
- ^ Том Страчан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека . Гирляндная наука. п. 45. ИСБН 978-1-136-84407-2 .
- ^ Jump up to: а б Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (850 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 3 июня 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ Пертеа М., Зальцберг С.Л. (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества генов человека» . Геном Биол . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . ПМК 2898077 . ПМИД 20441615 .
- ^ «Статистика и загрузки для хромосомы 14» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . 12 мая 2017 г. Проверено 19 мая 2017 г.
- ^ «Хромосома 14: Сводка хромосом — Homo sapiens» . Ансамбль Выпуск 88 . 2017-03-29 . Проверено 19 мая 2017 г.
- ^ «Хромосома человека 14: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM» . ЮниПрот . 28 февраля 2018 г. Проверено 16 марта 2018 г.
- ^ «Результаты поиска — 14[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («кодирующий белок генотип»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ "Результаты поиска - 14[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ( ("genetype miscrna"[Свойства] OR "генотип ncrna"[Свойства] OR "генотип rrna"[Свойства] OR "генотип trna"[Свойства] ИЛИ "генотип scrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства]) НЕ "генотип, кодирующий белок"[Свойства] И живой[prop]) - Ген" . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ «Результаты поиска — 14[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («псевдогенный ген»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ Куят Д., Фёлкер К.А., Пей Дж., Гришин Н.В., Грейндж Р.В., Бассель-Дюби Р., Олсон Э.Н. (июнь 2011 г.). «Согласованная регуляция экспрессии генов, специфичных для миофибрилл, и мышечной деятельности с помощью репрессора транскрипции Sox6» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (25): 10196–201. Бибкод : 2011PNAS..10810196Q . дои : 10.1073/pnas.1107413108 . ПМК 3121857 . ПМИД 21633012 .
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (400 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 4 марта 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (550 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 11 августа 2015 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013 г.). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013) . Каргерское медицинское и научное издательство. ISBN 978-3-318-02253-7 .
- ^ Сетакулвичай, В.; Манитпорнсут, С.; Вибунрат, М.; Лилакиацакун, В.; Ассавамакин, А.; Тонгсима, С. (2012). «Оценка разрешения на уровне полос изображений хромосом человека» . 2012 Девятая Международная конференция по информатике и программной инженерии (JCSSE) . стр. 276–282. дои : 10.1109/JCSSE.2012.6261965 . ISBN 978-1-4673-1921-8 . S2CID 16666470 .
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (850 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 3 июня 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ " p ": Короткая рука; « q »: Длинная рука.
- ^ Номенклатуру цитогенетических полос см. в статье locus .
- ^ Jump up to: а б Эти значения (начало/конец ISCN) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN «Международная система цитогенетической номенклатуры человека» (2013). Произвольная единица .
- ^ gpos : область, положительно окрашенная G-полосами , обычно богатая АТ и бедная генами; gneg : область, отрицательно окрашенная G-полосами, обычно богатая CG и богатая генами; acen Центромера . var : Переменная область; стебель : Стебель.
- Кампо Э (2003). «Генетические и молекулярно-генетические исследования в диагностике В-клеточных лимфом I: лимфомы мантийных клеток, фолликулярной лимфомы и лимфомы Беркитта». Хум Патол . 34 (4): 330–5. дои : 10.1053/hupa.2003.97 . ПМИД 12733111 .
- Гилберт Ф (1999). «Гены и хромосомы болезней: карты болезней генома человека. Хромосома 14». Генетический тест . 3 (4): 379–91. дои : 10.1089/gte.1999.3.379 . ПМИД 10627948 .
- Хейлиг Р., Эккенберг Р., Пети Х.Л., Фонкнехтен Н., Да Силва К., Каттолико Л., Леви М., Барбе В., де Берардинис В., Урета-Видаль А., Пеллетье Е., Вико В., Антуард В., Роуэн Л., Мадан А., Цинь С, Сан Х, Ду Х, Пепин К, Артигенав Ф, Роберт С, Круо С, Брюлс Т, Жайон О, Фридлендер Л, Самсон Дж, Бротье П, Кюр С, Сегуренс Б, Аньер Ф, Самаин С, Креспео Х, Аббаси Н, Айах Н, Боскус Д, Дикхофф Р, Дорс М, Дюбуа И, Фридман С, Гуивено М, Джеймс Р, Мадан А, Майри-Эстрада Б, Манжено С, Мартинс Н, Менар М, Озтас С, Рэтклифф А, Шаффер Т, Траск Б, Вашери Б, Бельмер С, Бельзер С, Беснар-Гонне М, Бартоль-Мавель Д, Бутар М, Брие-Силла С, Комбетт С, Дюфосс-Лоран В, Феррон С, Лешапле С, Луесс С, Мюсле Д, Магделенат Г, Пато Е, Пети Е, Сирвен-Трукневич П, Трибу А, Вега-Чарни Н, Батай Е, Блют Е, Борделе I, Дюбуа М, Дюмон С, Герен Т, Хаффрэ С, Хаммади Р, Муанга Дж., Пеллуэн В., Робер Д., Вундерле Э., Гоге Дж., Рой А., Сент-Март Л., Вердье Дж., Вердье-Дискала К., Хиллиер Л., Фултон Л., Макферсон Дж., Мацуда Ф., Уилсон Р., Скарпелли К., Гьяпай Дж. , Винкер П., Саурин В., Кветье Ф., Уотерстон Р., Худ Л., Вайсенбах Дж. (2003). «Последовательность ДНК и анализ 14 хромосомы человека» . Природа . 421 (6923): 601–7. Бибкод : 2003Natur.421..601H . дои : 10.1038/nature01348 . ПМИД 12508121 .
- Камнасаран Д., Кокс Д.В. (2002). «Текущий статус 14-й хромосомы человека» . Джей Мед Жене . 39 (2): 81–90. дои : 10.1136/jmg.39.2.81 . ПМК 1735028 . ПМИД 11836355 .
- Лемир Э.Г., Кардуэлл С. (1999). «Необычный фенотип при частичной трисомии 14» . Am J Med Genet . 87 (4): 294–6. doi : 10.1002/(SICI)1096-8628(19991203)87:4<294::AID-AJMG2>3.0.CO;2-S . ПМИД 10588832 .
- ван Карнебек CD, Quik S, Sluijter S, Hulsbeek MM, Hoovers JM, Hennekam RC (2002). «Дальнейшее описание синдрома терминальной делеции хромосомы 14q». Am J Med Genet . 110 (1): 65–72. дои : 10.1002/ajmg.10207 . ПМИД 12116274 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Национальные институты здравоохранения. «Хромосома 14» . Домашний справочник по генетике . Архивировано из оригинала 4 февраля 2012 г. Проверено 6 мая 2017 г.
- «Хромосома 14» . Информационный архив проекта «Геном человека», 1990–2003 гг . Проверено 6 мая 2017 г.