Гистон H3
| Гистон H3, семейство 3A (H3.3A) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | H3F3A | ||
| Альт. символы | H3F3 | ||
| ген NCBI | 3020 | ||
| HGNC | 4764 | ||
| МОЙ БОГ | 601128 | ||
| RefSeq | НМ_002107 | ||
| ЮниПрот | Q66I33 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Хр. 1 q41 | ||
| |||
| Гистон H3, семейство 3B (H3.3B) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | H3F3B | ||
| ген NCBI | 3021 | ||
| HGNC | 4765 | ||
| МОЙ БОГ | 601058 | ||
| RefSeq | НМ_005324 | ||
| ЮниПрот | P84243 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Хр. 17 q25 | ||
| |||
Гистон Н3 — один из пяти основных гистонов, участвующих в структуре хроматина эукариотических клеток . [1] [2] Обладая основным глобулярным доменом и длинным N-концевым хвостом , H3 участвует в структуре нуклеосом структуры «бусинки на нити». Гистоновые белки сильно модифицируются посттрансляционно, однако гистон H3 является наиболее модифицированным из пяти гистонов. Сам по себе термин «Гистон H3» намеренно неоднозначен, поскольку он не различает варианты последовательности или состояния модификации. Гистон H3 является важным белком в развивающейся области эпигенетики , где варианты его последовательности и различные состояния модификации, как полагают, играют роль в динамической и долгосрочной регуляции генов.
Эпигенетика и посттрансляционные модификации
[ редактировать ]N -конец H3 выступает из ядра глобулярной нуклеосомы и подвержен посттрансляционной модификации, влияющей на клеточные процессы. Эти модификации включают ковалентное присоединение метильных или ацетильных групп к лизину и аргинину аминокислотам и фосфорилирование серина или треонина . Ди- и триметилирование лизина 9 связано с репрессией и гетерохроматином (см. H3K9me2 и H3K9me3 ), тогда как монометилирование K4 (K4 соответствует остатку лизина в 4-м положении) (см. H3K4me1 ) связано с активными генами. [3] [4] Ацетилирование гистона H3 по нескольким позициям лизина в хвосте гистона осуществляется ферментами гистон-ацетилтрансферазы (HAT). Ацетилирование лизина14 обычно наблюдается в генах, которые активно транскрибируются в РНК (см. H3K14ac ).
Варианты последовательности
[ редактировать ]Клетки млекопитающих имеют семь известных вариантов последовательности гистона H3. Они обозначены как гистон H3.1, гистон H3.2, гистон H3.3, гистон H3.4 (H3T), гистон H3.5, гистон H3.X и гистон H3.Y, но имеют высококонсервативные последовательности, отличающиеся только мало аминокислот. [5] [6] Было обнаружено, что гистон H3.3 играет важную роль в поддержании целостности генома во время развития млекопитающих. [7] Варианты гистонов разных организмов, их классификацию и особенности вариантов можно найти в базе данных «HistoneDB - with Variants» .
Генетика
[ редактировать ]Гистоны H3 кодируются несколькими генами в геноме человека, в том числе:
- H3.1: HIST1H3A , HIST1H3B , HIST1H3C , HIST1H3D , HIST1H3E , HIST1H3F , HIST1H3G , HIST1H3H , HIST1H3I , HIST1H3J
- H3.2: HIST2H3A , HIST2H3C , HIST2H3D
- H3.3: H3F3A , H3F3B
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Бхасин М., Рейнхерц Э.Л., Рече П.А. (2006). «Распознавание и классификация гистонов с использованием машины опорных векторов» (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 13 (1): 102–12. дои : 10.1089/cmb.2006.13.102 . ПМИД 16472024 .
- ^ Хартл Д.Л., Фрайфельдер Д., Снайдер Л.А. (1988). Базовая генетика . Бостон: Издательство Jones and Bartlett. ISBN 978-0-86720-090-4 .
- ^ Розенфельд Дж. А., Ван З., Шонес Д.Э., Чжао К., ДеСалле Р., Чжан М.К. (март 2009 г.). «Определение обогащенных модификаций гистонов в негенных частях генома человека» . БМК Геномика . 10 :143. дои : 10.1186/1471-2164-10-143 . ПМК 2667539 . ПМИД 19335899 .
- ^ Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С., Мехтлер К., Дженувейн Т. (март 2001 г.). «Метилирование гистона H3 лизина 9 создает сайт связывания для белков HP1» . Природа . 410 (6824): 116–20. Бибкод : 2001Natur.410..116L . дои : 10.1038/35065132 . ПМИД 11242053 . S2CID 4331863 .
- ^ Марзлафф В.Ф., Гонгиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Малтаис Л.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Гистоны человека и мыши, зависимые от репликации» . Геномика . 80 (5): 487–98. дои : 10.1016/S0888-7543(02)96850-3 . ПМИД 12408966 .
- ^ Хейк С.Б., Гарсия Б.А., Дункан Э.М., Кауэр М., Деллер Дж., Шабановиц Дж., Базетт-Джонс Д.П., Эллис К.Д., Хант Д.Ф. (январь 2006 г.). «Схемы экспрессии и посттрансляционные модификации, связанные с вариантами гистона H3 млекопитающих» . Журнал биологической химии . 281 (1): 559–68. дои : 10.1074/jbc.M509266200 . ПМИД 16267050 .
- ^ Джанг К.В., Шибата И., Стармер Дж., Йи Д., Магнусон Т. (июль 2015 г.). «Гистон H3.3 поддерживает целостность генома во время развития млекопитающих» . Гены и развитие . 29 (13): 1377–92. дои : 10.1101/gad.264150.115 . ПМЦ 4511213 . ПМИД 26159997 .