HHIPL1
| HHIPL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | HHIPL1 , KIAA1822, UNQ9245, HHIP вроде 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | МГИ : 1919265 ; Гомологи : 81985 ; Генные карты : HHIPL1 ; OMA : HHIPL1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HHIP-подобный белок 1 (HHIPL1) , также известный как HHIP2, представляет собой белок , который у человека кодируется геном HHIPL1 на хромосоме 14 . [ 5 ] Он незначительно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. [ 6 ] хотя мРНК HHIPL1 была обнаружена в клетках трабекулярной кости . [ 7 ] Мало что известно о точной биологической функции HHIPL1, но этот белок связан с аденомами . [ 8 ] Ген HHIPL1 также содержит один из 27 SNP , связанных с повышенным риском развития ишемической болезни сердца . [ 9 ]
Структура
[ редактировать ]Ген
[ редактировать ]Ген HHIPL1 расположен на хромосоме 14 в участке 14q32 и содержит 13 экзонов . [ 5 ] Этот ген производит 2 изоформы путем альтернативного сплайсинга . [ 10 ]
Белок
[ редактировать ]Этот белок принадлежит к семейству HHIP и является одним из трех членов, обнаруженных у человека. [ 10 ] HHIPL1 содержит домен SRCR и N-концевой сигнальный пептид . [ 7 ] [ 10 ] Обработка сигнального пептида приводит к секреции этого белка . Как член HHIP, он также содержит консервативный гомологичный HHIP (HIPH) домен, состоящий из 18 цистеина остатков . [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Функция HHIPL1 неизвестна. В разделе ниже речь идет о функции HHIP.
Функция HHIP малоизвестна, но было показано, что она тесно связана с функцией легких. Нокаут HHIP у мышей неонатально смертелен из-за дефектного ветвления в легких. [ 11 ] [ 12 ] Было показано, что гетерозиготный нокаут HHIP способствует более тяжелой эмфиземе, вызванной сигаретным дымом, по сравнению с мышами дикого типа. [ 13 ] мышей HHIP было обнаружено повышение уровня спонтанной эмфиземы и окислительного стресса Кроме того, в легких гетерозиготных . [ 14 ] Как уровень экспрессии, так и энхансерная активность HHIP снижаются при хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) , что указывает на защитную роль HHIP в патогенезе ХОБЛ. [ 15 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Метилирование ДНК — одна из нескольких эпигенетических модификаций, признанных отличительными чертами онкогенеза. В полногеномном исследовании эпигеномных изменений, специфичных для подтипа аденомы, ген HHIPL1 был гиперметилирован в 12 из 13 нефункционирующих (НФ) аденом, а также в аденомах, секретирующих гормон роста (ГР) и пролектин. Таким образом, HHIPL1 потенциально может служить биомаркером для прогнозирования или характеристики моделей опухолевого роста. [ 8 ] В отличие от другого члена человеческого семейства генов HHIP, HHIP, который рассматривается как мишень фармакогеномики в области онкологии и сосудистой медицины, о HHIPL1 еще не сообщалось с таким потенциалом. [ 7 ]
Кроме того, в сердечно-сосудистой сфере HHIPL1 был связан с ИБС у европейцев, жителей Южной Азии и японцев. [ 16 ] [ 17 ] Однако в другом исследовании, проведенном на японском населении, эту связь не удалось воспроизвести, что позволяет предположить, что эта связь специфична для каждой популяции. [ 18 ]
Клинический маркер
[ редактировать ]Многолокусное исследование оценки генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген HHIFL1, выявило лиц с повышенным риском как возникновения, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличило клиническую пользу от терапии статинами. Исследование было основано на групповом исследовании на уровне сообщества (исследование «Диета Мальмё и рак») и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22). [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182218 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021260 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «HHIPL1 HHIP как 1 [Homo sapiens] — Ген» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 6 октября 2016 г.
- ^ «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 6 октября 2016 г.
- ^ Jump up to: а б с д Като Ю, Като М (февраль 2006 г.). «Сравнительная геномика ортологов семейства HHIP» . Международный журнал молекулярной медицины . 17 (2): 391–5. дои : 10.3892/ijmm.17.2.391 . ПМИД 16391842 .
- ^ Jump up to: а б Дуонг К.В., Эмес Р.Д., Уэссели Ф., Якуб-Усман К., Клейтон Р.Н., Фаррелл В.Е. (декабрь 2012 г.). «Количественный полногеномный анализ метилома ДНК в спорадических аденомах гипофиза» . Эндокринный рак . 19 (6): 805–16. дои : 10.1530/ERC-12-0251 . ПМИД 23045325 .
- ^ Jump up to: а б Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж. и др. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
- ^ Jump up to: а б с «HHIPL1 - предшественник HHIP-подобного белка 1 - Homo sapiens (человек) - ген и белок HHIPL1» . ЮниПрот . Проверено 6 октября 2016 г.
- ^ Чуанг П.Т., Кавчак Т., МакМахон А.П. (февраль 2003 г.). «Контроль обратной связи передачи сигналов Hedgehog у млекопитающих с помощью Hedgehog-связывающего белка Hip1 модулирует передачу сигналов Fgf во время морфогенеза ветвления легких» . Гены и развитие . 17 (3): 342–7. дои : 10.1101/gad.1026303 . ЧВК 195990 . ПМИД 12569124 .
- ^ Чуанг П.Т., МакМахон А.П. (февраль 1999 г.). «Передача сигналов Hedgehog у позвоночных, модулируемая индукцией белка, связывающего Hedgehog». Природа . 397 (6720): 617–21. Бибкод : 1999Natur.397..617C . дои : 10.1038/17611 . ПМИД 10050855 . S2CID 204991314 .
- ^ Лао Т., Гласс К., Цю В., Полверино Ф., Гупта К., Морроу Дж. и др. (01.01.2015). «Гаплонедостаточность белка, взаимодействующего с Hedgehog, вызывает усиление эмфиземы, вызванной сигаретным дымом из-за переподключения сети» . Геномная медицина . 7 (1): 12. doi : 10.1186/s13073-015-0137-3 (неактивен 31 марта 2024 г.). ПМЦ 4355149 . ПМИД 25763110 .
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на март 2024 г. ( ссылка ) - ^ Лао Т., Цзян Цз., Юн Дж., Цю В., Го Ф., Хуан С. и др. (август 2016 г.). «Гаплонедостаточность Hhip повышает чувствительность мышей к возрастной эмфиземе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (32): Е4681-7. Бибкод : 2016PNAS..113E4681L . дои : 10.1073/pnas.1602342113 . ПМЦ 4987811 . ПМИД 27444019 .
- ^ Чжоу X, барон Р.М., Хардин М., Чо М.Х., Зелински Дж., Гаврилкевич I и др. (март 2012 г.). «Идентификация генетической детерминанты хронической обструктивной болезни легких, которая регулирует HHIP» . Молекулярная генетика человека . 21 (6): 1325–35. дои : 10.1093/hmg/ddr569 . ПМК 3284120 . ПМИД 22140090 .
- ^ Шункерт Х., Кениг И.Р., Катиресан С., Рейли М.П., Ассимес Т.Л., Холм Х. и др. (апрель 2011 г.). «Крупномасштабный ассоциативный анализ выявил 13 новых локусов восприимчивости к ишемической болезни сердца» . Природная генетика . 43 (4): 333–8. дои : 10.1038/ng.784 . ПМК 3119261 . ПМИД 21378990 .
- ^ Педен Дж. Ф. (апрель 2011 г.). «Полногеномное исследование ассоциации среди европейцев и жителей Южной Азии выявило пять новых локусов ишемической болезни сердца» . Природная генетика . 43 (4): 339–44. дои : 10.1038/ng.782 . ПМИД 21378988 . S2CID 39712343 .
- ^ Дехаметакун С., Икеда С., Араи Т., Сато Н., Савабе М., Мурамацу М. (01.01.2014). «Связь между полиморфизмами CDKN2A/B, ADTRP и PDGFD и развитием коронарного атеросклероза у японских пациентов» . Журнал атеросклероза и тромбоза . 21 (7): 680–90. дои : 10.5551/jat.22640 . ПМИД 24573017 .