ШЕСТЬ3

ШЕСТЬ3
Идентификаторы
Псевдонимы	SIX3 , HPE2, SIX гомеобокс 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 603714 ; МГИ : 102764 ; Гомологен : 3947 ; GeneCards : SIX3 ; ОМА : SIX3 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	44,946,071 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	85,936,730 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	retinal pigment epithelium; ; nasal epithelium; ; nucleus accumbens; ; mucosa of paranasal sinus; ; optic nerve; ; caudate nucleus; ; putamen; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; anterior pituitary; ; buccal mucosa cell;
	Top expressed in
	optic vesicle; ; epithelium of lens; ; pretectal area; ; subthalamus; ; neural layer of retina; ; zona incerta; ; suprachiasmatic nucleus; ; optic recess; ; thalamic reticular nucleus; ; optic stalk;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; histone deacetylase binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; transcription corepressor binding; signaling receptor binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription cis-regulatory region binding;
Cellular component	nucleus; transcription regulator complex;
Biological process	eye development; forebrain anterior/posterior pattern specification; pituitary gland development; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of neuron differentiation; proximal/distal axis specification; lens fiber cell apoptotic process; protein import into nucleus; neuroblast differentiation; forebrain dorsal/ventral pattern formation; optic vesicle morphogenesis; negative regulation of Wnt signaling pathway; apoptotic process involved in development; transcription by RNA polymerase II; regulation of neural precursor cell proliferation; transcription, DNA-templated; regulation of neural retina development; multicellular organism development; telencephalon regionalization; diencephalon development; telencephalon development; brain development; lens development in camera-type eye; lens fiber cell differentiation; regulation of cell population proliferation; regulation of neuroblast proliferation; lens induction in camera-type eye; epithelial cell maturation; neuroblast migration; circadian behavior; camera-type eye development; negative regulation of transcription, DNA-templated; cell proliferation in forebrain; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; visual perception; regulation of cell cycle phase transition; anatomical structure development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6496
	20473
	ENSG00000138083
	ENSMUSG00000038805
	О95343
	Q62233
	НМ_005413
	НМ_011381
	НП_005404
	НП_035511
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок SIX3 — это белок , который у человека кодируется SIX3 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Ген SIX гомеобокс 3 (SIX3) играет решающую роль в эмбриональном развитии , обеспечивая необходимые инструкции для формирования переднего мозга и развития глаз . SIX3 — это фактор транскрипции , который связывается со специфическими последовательностями ДНК , контролируя, является ли ген активным или неактивным. Активность гена SIX3 подавляет активность гена Wnt1 , который обеспечивает развитие переднего мозга и устанавливает правильную передне-заднюю идентичность в мозгу млекопитающих . Блокируя активность Wnt1, SIX3 способен предотвратить аномальное расширение задней части мозга в переднюю область мозга.

Доказано, что во время развития сетчатки SIX3 несет ключевую ответственность за активацию Pax6 , главного регулятора развития глаз . Более того, SIX3 предполагает свою активность в PLE (презумптивной эктодерме хрусталика ), области, в которой хрусталика ожидается развитие . Если его присутствие убрать из этой области, хрусталик не сможет утолщаться и привести себя в правильное морфологическое состояние. Кроме того, SIX3 играет стратегическую роль в активации SOX2 .

Также было доказано, что SIX3 играет роль в репрессии отдельных членов семейства Wnt. При развитии сетчатки SIX3 ответственен за репрессию Wnt8b . Кроме того, при развитии переднего мозга SIX3 отвечает за репрессию Wnt1 и активацию SHH, гена Sonic Hedgehog.

Клиническое значение

Мутации в SIX3 являются причиной тяжелого порока развития головного мозга, называемого голопрозэнцефалией 2 типа (HPE2). При HPE2 мозг не может разделиться на два полушария на ранних стадиях эмбрионального развития, что приводит к порокам развития глаз и головного мозга, которые приводят к серьезным аномалиям лица. ^[6]

модель мутантной рыбы данио Была разработана нокаутная , в которой передняя часть головы отсутствовала из-за атипичного повышения активности Wnt1 . При инъекции SIX3 эти эмбрионы рыбок данио смогли успешно развить нормальный передний мозг. ^[8]^[9] Когда SIX3 был отключен у мышей, это привело к отсутствию формирования сетчатки из-за чрезмерной экспрессии Wnt8b в области, где обычно развивается передний мозг. ^[10] Оба этих исследования демонстрируют важность активности SIX3 для развития мозга и глаз.

Взаимодействия

Было показано, что SIX3 взаимодействует с TLE1. ^[11] и орфанный рецептор 1 нейронного происхождения . ^[12]^[13]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000138083 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038805 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гранадино Б., Галлардо М.Э., Лопес-Риос Х., Санс Р., Рамос К., Аюсо К., Боволента П., Родригес де Кордоба С. (январь 1999 г.). «Геномное клонирование, структура, характер экспрессии и хромосомное расположение человеческого гена SIX3». Геномика . 55 (1): 100–5. дои : 10.1006/geno.1998.5611 . ПМИД 9889003 .
^ Jump up to: ^а ^б Уоллис Д.Э., Росслер Э., Хер У., Нанни Л., Уилтшир Т., Ричиери-Коста А., Гиллессен-Кесбах Г., Закай Э.Х., Ромменс Дж., Мюнке М. (июнь 1999 г.). «Мутации в гомеодомене гена SIX3 человека вызывают голопрозэнцефалию». Природная генетика . 22 (2): 196–8. дои : 10.1038/9718 . ПМИД 10369266 . S2CID 8319986 .
^ «Ген Энтреза: безглазый гомолог 3 гомеобокса SIX3 (дрозофила)» .
^ Лагутин О.В., Чжу С.С., Кобаяши Д., Топчевски Дж., Шимамура К., Пуэльлес Л., Рассел Х.Р., Маккиннон П.Дж., Солника-Крезель Л., Оливер Г. (февраль 2003 г.). «Репрессия Six3 передачи сигналов Wnt в передней нейроэктодерме необходима для развития переднего мозга позвоночных» . Гены и развитие . 17 (3): 368–79. дои : 10.1101/gad.1059403 . ЧВК 195989 . ПМИД 12569128 .
^ Лавадо А., Лагутин О.В., Оливер Г. (февраль 2008 г.). «Инактивация Six3 вызывает прогрессирующую каудализацию и аберрантное формирование промежуточного мозга млекопитающих». Разработка . 135 (3): 441–50. дои : 10.1242/dev.010082 . ПМИД 18094027 . S2CID 1838148 .
^ Лю В., Лагутин О., Суинделл Э., Джамрич М., Оливер Г. (октябрь 2010 г.). «Спецификация нейроретины у эмбрионов мышей требует Six3-опосредованной супрессии Wnt8b в передней нервной пластинке» . Журнал клинических исследований . 120 (10): 3568–77. дои : 10.1172/JCI43219 . ПМЦ 2947236 . ПМИД 20890044 .
^ Лопес-Риос Х., Тессмар К., Лусли Ф., Виттбродт Дж., Боволента П. (январь 2003 г.). «Активность Six3 и Six6 модулируется членами семейства граучо» . Разработка . 130 (1): 185–95. дои : 10.1242/dev.00185 . ПМИД 12441302 .
^ Лафламм С., Филион С., Бридж Дж.А., Ладани М., Голдринг М.Б., Лабелль Ю. (январь 2003 г.). «Гомеотический белок Six3 является коактиватором ядерного рецептора NOR-1 и корепрессором слитого белка EWS/NOR-1 во внескелетных миксоидных хондросаркомах человека». Исследования рака . 63 (2): 449–54. ПМИД 12543801 .
^ Окура Н., Окубо Т., Маруяма К., Цукада Т., Ямагути К. (2001). «Сиротский ядерный рецептор NOR-1 взаимодействует с гомеобоксом, содержащим белок Six3». Развивающая нейронаука . 23 (1): 17–24. дои : 10.1159/000048692 . ПМИД 11173923 . S2CID 84167063 .

Дальнейшее чтение

Хехт Б.К., Хехт Ф., Мюнке М. (июль 1991 г.). «Ген расщепления переднего мозга, вызывающий голопрозэнцефалию: картирование делеции на участке хромосомы 2p21». Американский журнал медицинской генетики . 40 (1): 130. doi : 10.1002/ajmg.1320400131 . ПМИД 1887845 .
Лепперт Г.С., Ян Дж.М., Сундин О.Г. (март 1999 г.). «Последовательность и расположение SIX3, гомеобоксного гена, экспрессируемого в человеческом глазу». Офтальмологическая генетика . 20 (1): 7–21. дои : 10.1076/opge.20.1.7.2298 . ПМИД 10415461 .
Ото Х., Камада С., Таго К., Томинага С.И., Одзаки Х., Сато С., Каваками К. (октябрь 1999 г.). «Сотрудничество шестерки и еи в активации генов-мишеней посредством ядерной транслокации еи» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (10): 6815–24. дои : 10.1128/mcb.19.10.6815 . ПМК 84678 . ПМИД 10490620 .
Миккола И., Бруун Дж.А., Холм Т., Йохансен Т. (февраль 2001 г.). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из парных сайтов связывания доменов путем независимого от ДНК рекрутирования различных гомеодоменовых белков» . Журнал биологической химии . 276 (6): 4109–18. дои : 10.1074/jbc.M008882200 . ПМИД 11069920 .
Окура Н., Окубо Т., Маруяма К., Цукада Т., Ямагути К. (2001). «Сиротский ядерный рецептор NOR-1 взаимодействует с гомеобоксом, содержащим белок Six3». Развивающая нейронаука . 23 (1): 17–24. дои : 10.1159/000048692 . ПМИД 11173923 . S2CID 84167063 .
Ленглер Дж., Грау Дж. (сентябрь 2001 г.). «Регуляция промотора гена SIX3 человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 287 (2): 372–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5605 . ПМИД 11554737 .
Чжу CC, Дайер М.А., Учикава М., Кондо Х., Лагутин О.В., Оливер Г. (июнь 2002 г.). «Six3-опосредованная ауторепрессия и развитие глаз требуют взаимодействия с членами семейства ко-репрессоров, связанных с Граучо». Разработка . 129 (12): 2835–49. дои : 10.1242/dev.129.12.2835 . ПМИД 12050133 .
Лопес-Риос Х., Тессмар К., Лусли Ф., Виттбродт Дж., Боволента П. (январь 2003 г.). «Активность Six3 и Six6 модулируется членами семейства граучо» . Разработка . 130 (1): 185–95. дои : 10.1242/dev.00185 . ПМИД 12441302 .
Лафламм С., Филион С., Бридж Дж.А., Ладани М., Голдринг М.Б., Лабелль Ю. (январь 2003 г.). «Гомеотический белок Six3 является коактиватором ядерного рецептора NOR-1 и корепрессором слитого белка EWS/NOR-1 во внескелетных миксоидных хондросаркомах человека». Исследования рака . 63 (2): 449–54. ПМИД 12543801 .
Дель Бене Ф., Тессмар-Райбл К., Виттбродт Дж. (февраль 2004 г.). «Прямое взаимодействие геминина и Six3 в развитии глаз». Природа . 427 (6976): 745–9. Бибкод : 2004Natur.427..745B . дои : 10.1038/nature02292 . ПМИД 14973488 . S2CID 4410030 .
Дюбур К., Лазаро Л., Паскье Л., Бендавид С., Блайо М., Ле Дафф Ф., Дуру М.Р., Одент С., Дэвид В. (июль 2004 г.). «Молекулярный скрининг генов SHH, ZIC2, SIX3 и TGIF у пациентов с особенностями спектра голопрозэнцефалии: обзор мутаций и корреляции генотип-фенотип». Человеческая мутация . 24 (1): 43–51. дои : 10.1002/humu.20056 . ПМИД 15221788 . S2CID 34076824 .
Лафламм С., Филион С., Лабелль Ю. (декабрь 2004 г.). «Функциональная характеристика мутаций гомеодомена SIX3 при голопрозэнцефалии: взаимодействие с ядерным рецептором NR4A3/NOR1» . Человеческая мутация . 24 (6): 502–8. дои : 10.1002/humu.20102 . ПМИД 15523651 . S2CID 42925900 .
Паскье Л., Дюбур К., Гонсалес М., Лазаро Л., Давид В., Одент С., Энча-Разави Ф. (январь 2005 г.). «Первое возникновение апросэнцефалии/ателэнцефалии и голопрозэнцефалии в семье с мутацией гена SIX3 и корреляцией фенотипа/генотипа в нашей серии мутаций SIX3» . Журнал медицинской генетики . 42 (1): e4. дои : 10.1136/jmg.2004.023416 . ПМК 1735902 . ПМИД 15635066 .
Бендавид С., Дюбур С., Жикель И., Паскье Л., Сожер-Вебер П., Дуру М.Р., Жайар С., Фребур Т., Хаддад Б.Р., Генри К., Одент С., Дэвид В. (март 2006 г.). «Молекулярная оценка плодов с голопрозэнцефалией показывает высокую частоту микроделеций в генах HPE». Генетика человека . 119 (1–2): 1–8. дои : 10.1007/s00439-005-0097-6 . ПМИД 16323008 . S2CID 24211129 .
Манавати Б., Пэн С., Райала С.К., Талукдер А.Х., Ван М.Х., Ван Р.А., Баласентил С., Агарвал Н., Фришман Л.Дж., Кумар Р. (август 2007 г.). «Репрессия Six3 корепрессором регулирует экспрессию родопсина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (32): 13128–33. Бибкод : 2007PNAS..10413128M . дои : 10.1073/pnas.0705878104 . ЧВК 1941821 . ПМИД 17666527 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об обзоре анофтальмии/микрофтальмии

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000138083 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038805 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9889003-5] Гранадино Б., Галлардо М.Э., Лопес-Риос Х., Санс Р., Рамос К., Аюсо К., Боволента П., Родригес де Кордоба С. (январь 1999 г.). «Геномное клонирование, структура, характер экспрессии и хромосомное расположение человеческого гена SIX3». Геномика . 55 (1): 100–5. дои : 10.1006/geno.1998.5611 . ПМИД 9889003 .

[pmid10369266-6] Jump up to: ^а ^б Уоллис Д.Э., Росслер Э., Хер У., Нанни Л., Уилтшир Т., Ричиери-Коста А., Гиллессен-Кесбах Г., Закай Э.Х., Ромменс Дж., Мюнке М. (июнь 1999 г.). «Мутации в гомеодомене гена SIX3 человека вызывают голопрозэнцефалию». Природная генетика . 22 (2): 196–8. дои : 10.1038/9718 . ПМИД 10369266 . S2CID 8319986 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: безглазый гомолог 3 гомеобокса SIX3 (дрозофила)» .

[pmid12569128-8] Лагутин О.В., Чжу С.С., Кобаяши Д., Топчевски Дж., Шимамура К., Пуэльлес Л., Рассел Х.Р., Маккиннон П.Дж., Солника-Крезель Л., Оливер Г. (февраль 2003 г.). «Репрессия Six3 передачи сигналов Wnt в передней нейроэктодерме необходима для развития переднего мозга позвоночных» . Гены и развитие . 17 (3): 368–79. дои : 10.1101/gad.1059403 . ЧВК 195989 . ПМИД 12569128 .

[pmid18094027-9] Лавадо А., Лагутин О.В., Оливер Г. (февраль 2008 г.). «Инактивация Six3 вызывает прогрессирующую каудализацию и аберрантное формирование промежуточного мозга млекопитающих». Разработка . 135 (3): 441–50. дои : 10.1242/dev.010082 . ПМИД 18094027 . S2CID 1838148 .

[pmid20890044-10] Лю В., Лагутин О., Суинделл Э., Джамрич М., Оливер Г. (октябрь 2010 г.). «Спецификация нейроретины у эмбрионов мышей требует Six3-опосредованной супрессии Wnt8b в передней нервной пластинке» . Журнал клинических исследований . 120 (10): 3568–77. дои : 10.1172/JCI43219 . ПМЦ 2947236 . ПМИД 20890044 .

[pmid12441302-11] Лопес-Риос Х., Тессмар К., Лусли Ф., Виттбродт Дж., Боволента П. (январь 2003 г.). «Активность Six3 и Six6 модулируется членами семейства граучо» . Разработка . 130 (1): 185–95. дои : 10.1242/dev.00185 . ПМИД 12441302 .

[pmid12543801-12] Лафламм С., Филион С., Бридж Дж.А., Ладани М., Голдринг М.Б., Лабелль Ю. (январь 2003 г.). «Гомеотический белок Six3 является коактиватором ядерного рецептора NOR-1 и корепрессором слитого белка EWS/NOR-1 во внескелетных миксоидных хондросаркомах человека». Исследования рака . 63 (2): 449–54. ПМИД 12543801 .

[pmid11173923-13] Окура Н., Окубо Т., Маруяма К., Цукада Т., Ямагути К. (2001). «Сиротский ядерный рецептор NOR-1 взаимодействует с гомеобоксом, содержащим белок Six3». Развивающая нейронаука . 23 (1): 17–24. дои : 10.1159/000048692 . ПМИД 11173923 . S2CID 84167063 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]