Гомеобоксный белок CDX-4

CDX4
Идентификаторы
Псевдонимы	CDX4 , гомеобокс 4 каудального типа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 300025 ; МГИ : 88362 ; Гомологен : 3806 ; Генные карты : CDX4 ; ОМА : CDX4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	73,455,171 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	102,374,198 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; gonad; ; embryo; ; skin of limb; ; skin of leg; ; nervous system; ; tibial nerve;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; embryo; ; urethra; ; male urethra; ; primitive streak; ; embryo; ; blastocyst; ; allantois; ; right kidney; ; proximal tubule;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity;
Cellular component	nucleus;
Biological process	animal organ morphogenesis; multicellular organism development; labyrinthine layer development; cell differentiation; blood vessel development; anterior/posterior axis specification; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; anterior/posterior pattern specification; placenta development; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1046
	12592
	ENSG00000131264
	ENSMUSG00000031326
	О14627
	Q07424
	НМ_005193
	НМ_007674
	НП_005184
	НП_031700
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок CDX-4 — это белок , который у человека кодируется CDX4 геном . Этот ген является членом каудальному каналу родственного гомеобокса, семейства транскрипционных факторов , которое также включает CDX1 и CDX2. ^[5]

Функция

Транскрипционный фактор, кодируемый геном CDX4, участвует в формировании внеэмбриональных тканей, формировании передне-заднего паттерна и кроветворении во время эмбриогенеза. Это происходит посредством регуляции экспрессии гена Hox. ^[6] ^[7]^[8]

До того, как произойдет плацентация, CDX4 играет роль в ее развитии. Мутанты CDX4 рождаются здоровыми и плодовитыми, однако его важность обнаруживается у сложных мутантов CDX. Сложные мутанты, несущие один нулевой аллель CDX2 и гомозиготные ноль по CDX4, не способны образовывать заднюю ткань каудальнее задних конечностей, и большинство этих эмбрионов погибают примерно на 10,5 день эмбрионального развития из-за отсутствия развития плаценты. Около 10% представителей этого фенотипа могут прогрессировать до доношенного срока, но затем умирают вскоре после рождения. При осмотре отмечен морфогенез аноректальной и уретральной тканей. ^[9] ^[10]

Наиболее хорошо описанной функцией генов CDX является их роль в формировании хвостового тела. Транскрипционные факторы семейства генов CDX частично контролируют экспрессию генов Hox, реагируя на сигнальные молекулы ретиноевой кислоты, Wnt и FGF. Избыточный вклад CDX4 в аксиальное удлинение показан в том, что ни нулевой CDX4, ни мутанты соединения CDX1/CDX4 не появляются с нарушенным аксиальным удлинением. Однако CDX4 действительно играет роль в определении количества B-клеток поджелудочной железы, определяя передне-заднее расположение органов передней кишки, включая поджелудочную железу и печень. Таким образом, у эмбрионов, дефицитных по CDX4, аномальное состояние проявляется смещением кзади поджелудочной железы, печени и тонкого кишечника. ^[11] ^[12]

В кроветворении регуляция Hox-генов CDX4 необходима для спецификации судьбы гемопоэтических клеток во время эмбриогенеза. Об этом свидетельствует тот факт, что дефицит крови у мутантов CDX4 можно устранить за счет избыточной экспрессии определенных Hox-генов. ^[13]

Модели нокаута были созданы на мышах, как описано в роли CDX4 в формировании хвостового тела.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131264 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031326 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: фактор транскрипции 4 гомеобокса CDX1 каудального типа» .
^ ван Нес Дж., де Грааф В., Лебрен Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и раскрывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей» . Разработка . 133 (3): 419–28. дои : 10.1242/dev.02216 . ПМИД 16396910 .
^ ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .
^ Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Ю., Декенс М.П., Кингсли П.Д., Палис Дж. и др. (сентябрь 2003 г.). «Мутанты cdx4 не могут определить предшественников крови и могут быть спасены с помощью нескольких генов hox». Природа . 425 (6955): 300–6. Бибкод : 2003Natur.425..300D . дои : 10.1038/nature01973 . ПМИД 13679919 . S2CID 4315496 .
^ ван Нес Дж., де Грааф В., Лебрен Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и раскрывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей» . Разработка . 133 (3): 419–28. дои : 10.1242/dev.02216 . ПМИД 16396910 .
^ ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .
^ ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .
^ Кинкель, доктор медицинских наук, Имс С.К., Алонзо М.Р., Принс В.Е. (март 2008 г.). «Cdx4 необходим в энтодерме для локализации поджелудочной железы и ограничения количества бета-клеток» . Разработка . 135 (5): 919–29. дои : 10.1242/dev.010660 . ПМИД 18234725 .
^ Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Ю., Декенс М.П., Кингсли П.Д., Палис Дж. и др. (сентябрь 2003 г.). «Мутанты cdx4 не могут определить предшественников крови и могут быть спасены с помощью нескольких генов hox». Природа . 425 (6955): 300–6. Бибкод : 2003Natur.425..300D . дои : 10.1038/nature01973 . ПМИД 13679919 . S2CID 4315496 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома CDX4 и страница сведений о гене CDX4 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000131264 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031326 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: фактор транскрипции 4 гомеобокса CDX1 каудального типа» .

[6] ван Нес Дж., де Грааф В., Лебрен Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и раскрывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей» . Разработка . 133 (3): 419–28. дои : 10.1242/dev.02216 . ПМИД 16396910 .

[7] ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .

[8] Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Ю., Декенс М.П., Кингсли П.Д., Палис Дж. и др. (сентябрь 2003 г.). «Мутанты cdx4 не могут определить предшественников крови и могут быть спасены с помощью нескольких генов hox». Природа . 425 (6955): 300–6. Бибкод : 2003Natur.425..300D . дои : 10.1038/nature01973 . ПМИД 13679919 . S2CID 4315496 .

[9] ван Нес Дж., де Грааф В., Лебрен Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и раскрывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей» . Разработка . 133 (3): 419–28. дои : 10.1242/dev.02216 . ПМИД 16396910 .

[10] ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .

[11] ван де Вен С., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж.Э., Стрингер Э.Дж. и др. (август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx/Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и клоакальных производных из задней зоны роста» . Разработка . 138 (16): 3451–62. дои : 10.1242/dev.066118 . hdl : 10400.7/644 . ПМИД 21752936 .

[12] Кинкель, доктор медицинских наук, Имс С.К., Алонзо М.Р., Принс В.Е. (март 2008 г.). «Cdx4 необходим в энтодерме для локализации поджелудочной железы и ограничения количества бета-клеток» . Разработка . 135 (5): 919–29. дои : 10.1242/dev.010660 . ПМИД 18234725 .

[13] Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Ю., Декенс М.П., Кингсли П.Д., Палис Дж. и др. (сентябрь 2003 г.). «Мутанты cdx4 не могут определить предшественников крови и могут быть спасены с помощью нескольких генов hox». Природа . 425 (6955): 300–6. Бибкод : 2003Natur.425..300D . дои : 10.1038/nature01973 . ПМИД 13679919 . S2CID 4315496 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]