ЗЕБ2

ЗЕБ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2DA7
Идентификаторы
Псевдонимы	ZEB2 , HSPC082, SIP-1, SIP1, SMADIP1, ZFHX1B, цинковый палец, привязка электронного ящика, гомеобокс 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 605802 ; МГИ : 1344407 ; Гомологен : 8868 ; Генные карты : ZEB2 ; ОМА : ZEB2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	144,521,057 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	45,007,407 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; monocyte; ; C1 segment; ; Achilles tendon; ; corpus callosum; ; internal globus pallidus; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; epithelium of colon; ; granulocyte; ; amygdala;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; stroma of bone marrow; ; belly cord; ; human fetus; ; dentate gyrus; ; iris; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; subdivision of hippocampus; ; Region I of hippocampus proper; ; body of femur;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; phosphatase regulator activity; metal ion binding; protein binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; R-SMAD binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleolus; cytosol;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; nervous system development; transcription, DNA-templated; positive regulation of melanin biosynthetic process; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; neural crest cell migration; somitogenesis; neural tube closure; transcription by RNA polymerase II; central nervous system development; corpus callosum morphogenesis; hippocampus development; cell proliferation in forebrain; corticospinal tract morphogenesis; positive regulation of Wnt signaling pathway; positive regulation of JUN kinase activity; positive regulation of melanocyte differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; developmental pigmentation; embryonic morphogenesis; collateral sprouting; positive regulation of axonogenesis; mammillary axonal complex development; melanocyte migration; positive regulation of lens fiber cell differentiation; regulation of melanosome organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9839
	24136
	ENSG00000169554
	ENSMUSG00000026872
	О60315
	Q9R0G7
	НМ_001171653 ; НМ_014795
showНМ_015753 ; НМ_001289521 ; НМ_001355288 ; НМ_001355289 ; НМ_001355290 ;
	NM_001355291
	НП_001165124 ; НП_055610
showНП_001276450 ; НП_056568 ; НП_001342217 ; НП_001342218 ; НП_001342219 ;
	NP_001342220
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобокс 2, связывающий E-бокс с цинковым пальцем, представляет собой белок , который у человека кодируется ZEB2 геном . ^[5] Белок ZEB2 представляет собой фактор транскрипции , который играет роль в сигнальных путях трансформирующего фактора роста β (TGFβ), которые необходимы на ранних стадиях развития плода. ^[6]

Функция

ZEB2 (ранее также известный как SMADIP1, SIP1) и его паралог ZEB1 у млекопитающих принадлежат к семейству Zeb в классе гомеодоменных транскрипционных факторов ZF (цинковый палец). Белок ZEB2 имеет 8 цинковых пальцев и 1 гомеодомен. ^[7] Структура гомеодомена показана справа.

ZEB2 взаимодействует с рецептор-опосредованными активированными полноразмерными SMAD . ^[5] Активация рецепторов TGFβ приводит к фосфорилированию внутриклеточных эффекторных молекул, R-SMAD. ZEB2 представляет собой R-SMAD-связывающий белок и действует как корепрессор транскрипции. Он участвует в определении времени превращения нейроэпителиальных клеток в радиальные глиальные клетки на раннем этапе развития, механизм, который, как полагают, учитывает большие различия в размерах мозга между людьми и другими млекопитающими. ^[8]

Транскрипты ZEB2 обнаруживаются в тканях, отличных от нервного гребня , таких как ганглии черепных нервов , ганглии дорсальных корешков , симпатические ганглиозные цепи , кишечная нервная система и меланоциты . ZEB2 также обнаруживается в тканях, не происходящих из нервного гребня, включая стенку пищеварительного тракта, почки и скелетные мышцы.

Клиническое значение

Мутации в гене ZEB2 связаны с синдромом Мовата-Вильсона . При этом заболевании наблюдаются мутации и даже полная делеция гена ZEB2 . Мутации гена могут привести к тому, что ген будет производить нефункциональные белки ZEB2 или инактивировать функцию гена в целом. Этот дефицит белка ZEB2 мешает развитию многих органов. Многие симптомы можно объяснить неравномерным развитием структур нервного гребня. ^[9]

Болезнь Гиршпрунга также имеет множество симптомов, которые можно объяснить отсутствием ZEB2 во время развития нервов пищеварительного тракта. Это заболевание вызывает тяжелые запоры и увеличение толстой кишки. ^[10]

риск гепатоцеллюлярной карциномы и цирроза печени при хроническом гепатите B Сообщалось, что связан с однонуклеотидным полиморфизмом в промоторной области ZEB2 , обозначенной rs3806475, при рецессивной модели наследования. ^[11]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169554 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026872 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: цинковый палец ZEB2, связывающий E-бокс гомеобокса 2» .
^ Басс Г., Каманд О.Дж., Каше В., Кобец А., Дастот-Ле Моал Ф., Маршан Д. и др. (март 2004 г.). «Плейотропная и разнообразная экспрессия транскриптов гена ZFHX1B во время развития мыши и человека подтверждает различные клинические проявления синдрома «Мовата-Уилсона». Нейробиология болезней . 15 (2): 240–50. дои : 10.1016/j.nbd.2003.10.004 . ПМИД 15006694 . S2CID 25770329 .
^ Бурглин Т.Р., Аффольтер М (июнь 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление» . Хромосома . 125 (3): 497–521. дои : 10.1007/s00412-015-0543-8 . ПМЦ 4901127 . ПМИД 26464018 .
^ Бенито-Квечинский С., Джандоменико С.Л., Сатклифф М., Риис Э.С., Фрейре-Притчетт П., Келава И. и др. (апрель 2021 г.). «Ранний переход формы клеток стимулирует эволюционное расширение переднего мозга человека» . Клетка . 184 (8): 2084–2102.e19. дои : 10.1016/j.cell.2021.02.050 . ПМЦ 8054913 . PMID 33765444 .
^ Дастот-Ле Моал Ф., Уилсон М., Моват Д., Колло Н., Ниль Ф., Гуссенс М. (апрель 2007 г.). «Мутации ZFHX1B у пациентов с синдромом Мовата-Вильсона». Человеческая мутация . 28 (4): 313–21. дои : 10.1002/humu.20452 . ПМИД 17203459 . S2CID 37981110 .
^ Сондерс CJ, Чжао В., Ардингер Х.Х. (ноябрь 2009 г.). «Комплексный анализ гена ZEB2 синдрома Мовата-Уилсона в когорте Северной Америки: предлагаемый подход к молекулярной диагностике». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 149А (11): 2527–31. дои : 10.1002/ajmg.a.33067 . ПМИД 19842203 . S2CID 22472646 .
^ Лю WX, Ян Л., Ян Х.М., Ян Л.Н., Чжан XL, Ма Н. и др. (2021). Арджентьеро А., Мехта Р., Ван С. (ред.). «Варианты зародышевой линии и генетические взаимодействия нескольких генов, регулирующих ЕМТ, повышают риск гепатоцеллюлярной карциномы, связанной с ВГВ» . Границы онкологии . 11 . дои : 10.3389/fonc.2021.564477 . ПМК 8226114 . ПМИД 34178612 . В эту статью включен текст из этого источника, доступного по лицензии CC BY 4.0 .

Дальнейшее чтение

Моват Д.Р., Уилсон М.Дж., Гуссенс М. (май 2003 г.). «Синдром Мовата-Вильсона» . Журнал медицинской генетики . 40 (5): 305–10. дои : 10.1136/jmg.40.5.305 . ПМЦ 1735450 . ПМИД 12746390 .
Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н. и др. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (1): 31–9. дои : 10.1093/dnares/5.1.31 . ПМИД 9628581 .
Уэки Н., Ода Т., Кондо М., Яно К., Ногучи Т., Мурамацу М. (декабрь 1998 г.). «Система отбора генов, кодирующих ядерно-направленные белки». Природная биотехнология . 16 (13): 1338–42. дои : 10.1038/4315 . ПМИД 9853615 . S2CID 20001769 .
Вершуерен К., Ремакл Дж.Э., Колларт С., Крафт Х., Бейкер Б.С. , Тыльзановски П. и др. (июль 1999 г.). «SIP1, новый репрессор цинковых пальцев/гомеодомена, взаимодействует с белками Smad и связывается с последовательностями 5'-CACCT в генах-кандидатах-мишенях» . Журнал биологической химии . 274 (29): 20489–98. дои : 10.1074/jbc.274.29.20489 . ПМИД 10400677 .
Вакамацу Н., Ямада Ю., Ямада К., Оно Т., Номура Н., Танигучи Х. и др. (апрель 2001 г.). «Мутации в SIP1, кодирующем белок-1, взаимодействующий со Smad, вызывают форму болезни Гиршпрунга». Природная генетика . 27 (4): 369–70. дои : 10.1038/86860 . ПМИД 11279515 . S2CID 39070888 .
Комейн Дж., Беркс Г., Вермассен П., Вершуерен К., ван Грунсвен Л., Брюнель Э. и др. (июнь 2001 г.). «Двуручный Е-бокс, связывающий белок цинковых пальцев SIP1, подавляет E-кадгерин и индуцирует инвазию» . Молекулярная клетка . 7 (6): 1267–78. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00260-X . ПМИД 11430829 .
Каше В., Дастот-Ле Моал Ф., Кяарияйнен Х., Бондюран Н., Ринтала Р., Буасье Б. и др. (июль 2001 г.). «Мутации потери функции в белке 1, взаимодействующем с SIP1 Smad, приводят к синдромальной болезни Гиршпрунга» . Молекулярная генетика человека . 10 (14): 1503–10. дои : 10.1093/hmg/14.10.1503 . ПМИД 11448942 .
Тылжановский П., Вершуерен К., Хайлебрук Д., Люйтен Ф.П. (октябрь 2001 г.). «Smad-взаимодействующий белок 1 является репрессором транскрипции щелочной фосфатазы печени/костей/почек при остеогенной дифференцировке клеток C2C12, индуцированной костным морфогенетическим белком» . Журнал биологической химии . 276 (43): 40001–7. дои : 10.1074/jbc.M104112200 . ПМИД 11477103 .
Ямада К., Ямада Ю., Номура Н., Миура К., Вакако Р., Хаякава С. и др. (декабрь 2001 г.). «Нонсенс-мутации и мутации со сдвигом рамки считывания в ZFHX1B, кодирующем белок 1, взаимодействующий с Smad, вызывают сложное нарушение развития с большим разнообразием клинических особенностей» . Американский журнал генетики человека . 69 (6): 1178–85. дои : 10.1086/324343 . ПМЦ 1235530 . ПМИД 11592033 .
Амиэль Дж., Эспиноза-Паррилья Ю., Стеффанн Дж., Госсет П., Пеле А., Приер М. и др. (декабрь 2001 г.). «Крупномасштабные делеции и укороченные мутации SMADIP1 при синдромальной болезни Гиршпрунга с поражением срединных структур» . Американский журнал генетики человека . 69 (6): 1370–7. дои : 10.1086/324342 . ПМЦ 1235547 . ПМИД 11595972 .
Цвайер С., Альбрехт Б., Митулла Б., Беренс Р., Биз М., Гиллессен-Кесбах Г. и др. (март 2002 г.). « Синдром «Мовата-Уилсона» с болезнью Гиршпрунга и без нее представляет собой отчетливую, распознаваемую множественную врожденную аномалию — синдром умственной отсталости, вызванный мутациями в гене гомеобокса 1B «цинковых пальцев» . Американский журнал медицинской генетики . 108 (3): 177–81. дои : 10.1002/ajmg.10226 . ПМИД 11891681 .
Нагая М., Като Дж., Ниими Н., Танака С., Вакамацу Н. (август 2002 г.). «Клинические особенности формы болезни Гиршпрунга, вызванной новой генетической аномалией». Журнал детской хирургии . 37 (8): 1117–22. дои : 10.1053/jpsu.2002.34455 . ПМИД 12149685 .
Гуайта С., Пуч И., Франси С., Гарридо М., Домингес Д., Батль Е. и др. (октябрь 2002 г.). «Индукция улиткой эпителиально-мезенхимального перехода в опухолевых клетках сопровождается репрессией MUC1 и экспрессией ZEB1» . Журнал биологической химии . 277 (42): 39209–16. дои : 10.1074/jbc.M206400200 . ПМИД 12161443 .
Эспиноза-Паррилла И., Амиэль Дж., Оге Дж., Энча-Разави Ф., Мюнних А., Лионнет С. и др. (июнь 2002 г.). «Экспрессия гена SMADIP1 на ранних этапах развития человека». Механизмы развития . 114 (1–2): 187–91. дои : 10.1016/S0925-4773(02)00062-X . ПМИД 12175509 . S2CID 18645909 .
Йонеда М., Фудзита Т., Ямада Ю., Ямада К., Фуджи А., Инагаки Т. и др. (ноябрь 2002 г.). «Поздняя инфантильная болезнь Гиршпрунга - синдром умственной отсталости с делецией 3 п.н. в ZFHX1B». Неврология . 59 (10): 1637–40. дои : 10.1212/01.wnl.0000034842.78350.4e . ПМИД 12451214 . S2CID 34389990 .
Постиго А.А. (май 2003 г.). «Противоположные функции белков ZEB в регуляции сигнального пути TGFbeta/BMP» . Журнал ЭМБО . 22 (10): 2443–52. дои : 10.1093/emboj/cdg225 . ПМК 155983 . ПМИД 12743038 .
Постиго А.А., Депп Дж.Л., Тейлор Дж.Дж., Кролл К.Л. (май 2003 г.). «Регуляция передачи сигналов Smad посредством дифференциального рекрутирования коактиваторов и корепрессоров белками ZEB» . Журнал ЭМБО . 22 (10): 2453–62. дои : 10.1093/emboj/cdg226 . ПМК 155984 . ПМИД 12743039 .
Цвайер С., Темпл И.К., Бимер Ф., Закай Э., Лерман-Сэги Т., Вешке Б. и др. (август 2003 г.). «Характеристика делеций региона ZFHX1B и анализ генотипа-фенотипа при синдроме Мовата-Вильсона» . Журнал медицинской генетики . 40 (8): 601–5. дои : 10.1136/jmg.40.8.601 . ПМЦ 1735564 . ПМИД 12920073 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о синдроме Мовата-Уилсона
ZEB2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169554 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026872 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: цинковый палец ZEB2, связывающий E-бокс гомеобокса 2» .

[6] Басс Г., Каманд О.Дж., Каше В., Кобец А., Дастот-Ле Моал Ф., Маршан Д. и др. (март 2004 г.). «Плейотропная и разнообразная экспрессия транскриптов гена ZFHX1B во время развития мыши и человека подтверждает различные клинические проявления синдрома «Мовата-Уилсона». Нейробиология болезней . 15 (2): 240–50. дои : 10.1016/j.nbd.2003.10.004 . ПМИД 15006694 . S2CID 25770329 .

[pmid26464018-7] Бурглин Т.Р., Аффольтер М (июнь 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление» . Хромосома . 125 (3): 497–521. дои : 10.1007/s00412-015-0543-8 . ПМЦ 4901127 . ПМИД 26464018 .

[8] Бенито-Квечинский С., Джандоменико С.Л., Сатклифф М., Риис Э.С., Фрейре-Притчетт П., Келава И. и др. (апрель 2021 г.). «Ранний переход формы клеток стимулирует эволюционное расширение переднего мозга человека» . Клетка . 184 (8): 2084–2102.e19. дои : 10.1016/j.cell.2021.02.050 . ПМЦ 8054913 . PMID 33765444 .

[9] Дастот-Ле Моал Ф., Уилсон М., Моват Д., Колло Н., Ниль Ф., Гуссенс М. (апрель 2007 г.). «Мутации ZFHX1B у пациентов с синдромом Мовата-Вильсона». Человеческая мутация . 28 (4): 313–21. дои : 10.1002/humu.20452 . ПМИД 17203459 . S2CID 37981110 .

[10] Сондерс CJ, Чжао В., Ардингер Х.Х. (ноябрь 2009 г.). «Комплексный анализ гена ZEB2 синдрома Мовата-Уилсона в когорте Северной Америки: предлагаемый подход к молекулярной диагностике». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 149А (11): 2527–31. дои : 10.1002/ajmg.a.33067 . ПМИД 19842203 . S2CID 22472646 .

[11] Лю WX, Ян Л., Ян Х.М., Ян Л.Н., Чжан XL, Ма Н. и др. (2021). Арджентьеро А., Мехта Р., Ван С. (ред.). «Варианты зародышевой линии и генетические взаимодействия нескольких генов, регулирующих ЕМТ, повышают риск гепатоцеллюлярной карциномы, связанной с ВГВ» . Границы онкологии . 11 . дои : 10.3389/fonc.2021.564477 . ПМК 8226114 . ПМИД 34178612 . В эту статью включен текст из этого источника, доступного по лицензии CC BY 4.0 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]