Ядерный фактор зародышевой клетки

НР6А1
Идентификаторы
Псевдонимы	NR6A1 , CT150, GCNF, GCNF1, NR61, RTR, hGCNF, hRTR, член 1 группы А подсемейства 6 ядерных рецепторов
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602778 ; МГИ : 1352459 ; Гомологен : 36308 ; Генные карты : NR6A1 ; ОМА : NR6A1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	124,771,311 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	38,817,700 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; gonad; ; oocyte; ; secondary oocyte; ; buccal mucosa cell; ; right testis; ; left testis; ; sperm; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	primitive streak; ; spermatid; ; epiblast; ; seminiferous tubule; ; secondary oocyte; ; lumbar spinal ganglion; ; zygote; ; spermatocyte; ; primary oocyte; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; protein homodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity; zinc ion binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; metal ion binding; steroid hormone receptor activity; nuclear receptor activity; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus; transcription regulator complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; gamete generation; spermatogenesis; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; cell population proliferation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; intracellular steroid hormone receptor signaling pathway; intracellular receptor signaling pathway; steroid hormone mediated signaling pathway; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2649
	14536
	ENSG00000148200
	ENSMUSG00000063972
	Q15406
	Q64249
	НМ_001278546 ; НМ_001489 ; НМ_033334 ; НМ_033335
	НМ_001159548 ; НМ_001159549 ; НМ_010264
	НП_001265475 ; НП_001480 ; НП_201591 ; НП_201591.2
	НП_001153020 ; НП_001153021 ; НП_034394
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ядерный фактор зародышевых клеток ( GCNF ), также известный как RTR (рецептор, связанный с ретиноидным рецептором, связанный с семенниками) или NR6A1 (подсемейство ядерных рецепторов 6, группа A, член 1), представляет собой белок , который у человека кодируется NR6A1. геном . ^[5]^[6] GCNF является членом семейства рецепторов ядерных внутриклеточных факторов транскрипции .

У взрослых GCNH экспрессируется преимущественно в зародышевых клетках гонад и участвует в регуляции эмбриогенеза и дифференцировки зародышевых клеток . ^[7]

Характер его экспрессии позволяет предположить, что он может участвовать в нейрогенезе и развитии зародышевых клеток. Белок может гомодимеризоваться и связываться с ДНК, но мишени in vivo не идентифицированы. Ген экспрессирует три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта. ^[8]

В клетках, подвергающихся гомологичной рекомбинации во время мейоза , процессинг промежуточных ДНК является важным шагом в обмене информацией между родительскими гомологичными хромосомами . У эукариот комплекс RTR, состоящий из топоизомеразы типа IA , геликазы RecQ и структурного белка RMI1 , используется для процессинга промежуточных продуктов рекомбинации ДНК. ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000148200 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063972 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лей В., Хиросе Т., Чжан Л.К., Адачи Х., Спинелла М.Дж., Дмитровский Э., Джеттен А.М. (апрель 1997 г.). «Клонирование ядерного фактора зародышевых клеток рецептора-сироты человека / рецептора, связанного с ретиноидным рецептором, связанного с семенниками, и его дифференциальная регуляция во время дифференцировки клеток эмбриональной карциномы». Журнал молекулярной эндокринологии . 18 (2): 167–76. дои : 10.1677/jme.0.0180167 . ПМИД 9134503 .
^ Сюсенс Ю, Боргмейер Ю (декабрь 1996 г.). «Характеристика гена ядерного фактора зародышевой клетки человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1309 (3): 179–82. дои : 10.1016/s0167-4781(96)00157-1 . ПМИД 8982251 .
^ Зехель С. (декабрь 2005 г.). «Ядерный фактор зародышевых клеток (GCNF)» . Молекулярное воспроизводство и развитие . 72 (4): 550–6. дои : 10.1002/mrd.20377 . ПМИД 16155958 . S2CID 39315293 .
^ «Ген Энтрез: подсемейство ядерных рецепторов NR6A1 6, группа А, член 1» .
^ Нолл А., Шрёпфер С., Пухта Х. Комплекс RTR как хранитель стабильности генома и его уникальная мейотическая функция у растений. Фронт Завод Науч. 2014, 12 февраля; 5:33. doi: 10.3389/fpls.2014.00033. ПМИД 24575106; PMCID: PMC3921566

Дальнейшее чтение

Грещик Х, Шуле Р (1999). «Ядерный фактор зародышевой клетки: сиротский рецептор с неожиданными свойствами». Журнал молекулярной медицины . 76 (12): 800–10. дои : 10.1007/s001090050284 . ПМИД 9846950 . S2CID 9368668 .
Хиросе Т., О'Брайен Д.А., Джеттен А.М. (январь 1995 г.). «RTR: новый член суперсемейства ядерных рецепторов, который высоко экспрессируется в мышиных семенниках» . Джин . 152 (2): 247–51. дои : 10.1016/0378-1119(94)00656-D . ПМИД 7835709 .
Ян З.Х., Медведев А., Хиросе Т., Готох Х., Джеттен А.М. (апрель 1997 г.). «Характеристика ответного элемента и свойств связывания ДНК ядерного фактора зародышевых клеток ядерного рецептора / рецептора, связанного с ретиноидным рецептором, связанного с семенниками» . Журнал биологической химии . 272 (16): 10565–72. дои : 10.1074/jbc.272.16.10565 . ПМИД 9099702 .
Капелле М., Кречмар Дж., Хуземанн М., Шлейнинг В.Д. (май 1997 г.). «Клонирование кДНК двух близкородственных форм ядерного фактора зародышевых клеток человека (GCNF)». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1352 (1): 13–7. дои : 10.1016/s0167-4781(97)00043-2 . ПМИД 9177477 .
Агульник И.Ю., Чо Ю., Нидербергер С., Кибак Д.Г., Куни А.Дж. (март 1998 г.). «Клонирование, анализ экспрессии и хромосомная локализация гена ядерного рецептора человека GCNF» . Письма ФЭБС . 424 (1–2): 73–8. Бибкод : 1998FEBSL.424...73A . дои : 10.1016/S0014-5793(98)00142-2 . ПМИД 9537518 . S2CID 26848550 .
Грещик Х., Вурц Дж.М., Хублиц П., Кёлер Ф., Морас Д., Шуле Р. (январь 1999 г.). «Характеристика свойств ДНК-связывания и димеризации ядерного фактора зародышевых клеток рецептора-сироты» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (1): 690–703. дои : 10.1128/mcb.19.1.690 . ПМЦ 83926 . ПМИД 9858592 .
Шмитц Т.П., Зюсенс Ю., Боргмайер У. (сентябрь 1999 г.). «Связывание ДНК, взаимодействие белков и дифференциальная экспрессия ядерного фактора зародышевых клеток человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1446 (3): 173–80. дои : 10.1016/s0167-4781(99)00079-2 . ПМИД 10524192 .
Ян З., Джеттен А.М. (ноябрь 2000 г.). «Характеристика репрессорной функции ядерного фактора ретиноидного рецептора, связанного с семенниками/ядерного фактора зародышевых клеток» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35077–85. дои : 10.1074/jbc.M005566200 . ПМИД 10940306 .
Сюсенс Ю, Боргмейер Ю (2001). «Геномная структура гена ядерного фактора зародышевых клеток мыши (GCNF). II. Сравнение с геномной структурой гена GCNF человека» . Геномная биология . 2 (5): ИССЛЕДОВАНИЕ0017. doi : 10.1186/gb-2001-2-5-research0017 . ПМК 32189 . ПМИД 11387038 .
Мехта Д.В., Ким Ю.С., Диксон Д., Джеттен А.М. (апрель 2002 г.). «Характеристика экспрессии ретиноидного рецептора, связанного с семенниками (RTR) в трофобластах». Плацента . 23 (4): 281–7. дои : 10.1053/plac.2001.0779 . ПМИД 11969338 .
Ян З., Ким Ю.С., Джеттен А.М. (август 2002 г.). «RAP80, новый ядерный белок, который взаимодействует с ретиноидным рецептором, связанным с семенниками» . Журнал биологической химии . 277 (35): 32379–88. дои : 10.1074/jbc.M203475200 . ПМИД 12080054 .
Лан З.Дж., Чунг А.С., Сюй Икс, ДеМайо Ф.Дж., Куни Эй.Дж. (декабрь 2002 г.). «Эмбриональная функция ядерного фактора зародышевой клетки зависит от ДНК-связывающего домена» . Журнал биологической химии . 277 (52): 50660–7. дои : 10.1074/jbc.M209586200 . ПМИД 12381721 .
Ян Г., Чжан Ю.Л., Бухолд Г.М., Джеттен А.М., О'Брайен Д.А. (май 2003 г.). «Анализ транскриптов ядерного фактора зародышевых клеток и экспрессии белков во время сперматогенеза» . Биология размножения . 68 (5): 1620–30. doi : 10.1095/biolreprod.102.012013 . ПМИД 12606326 .
Райкович М., Миддендорф Р., Ветцель М.Г., Фркович Д., Дамеров С., Зейтц Х.Дж., Вайцель Дж.М. (декабрь 2004 г.). «Ядерный фактор зародышевых клеток снимает тау-опосредованную модулятором элемента ответа цАМФ активацию специфического для семенников промотора митохондриальной глицерин-3-фосфатдегидрогеназы человека» . Журнал биологической химии . 279 (50): 52493–9. дои : 10.1074/jbc.M404467200 . ПМИД 15456763 .

Внешние ссылки

NR6A1+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 9 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000148200 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063972 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9134503-5] Лей В., Хиросе Т., Чжан Л.К., Адачи Х., Спинелла М.Дж., Дмитровский Э., Джеттен А.М. (апрель 1997 г.). «Клонирование ядерного фактора зародышевых клеток рецептора-сироты человека / рецептора, связанного с ретиноидным рецептором, связанного с семенниками, и его дифференциальная регуляция во время дифференцировки клеток эмбриональной карциномы». Журнал молекулярной эндокринологии . 18 (2): 167–76. дои : 10.1677/jme.0.0180167 . ПМИД 9134503 .

[pmid8982251-6] Сюсенс Ю, Боргмейер Ю (декабрь 1996 г.). «Характеристика гена ядерного фактора зародышевой клетки человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1309 (3): 179–82. дои : 10.1016/s0167-4781(96)00157-1 . ПМИД 8982251 .

[pmid16155958-7] Зехель С. (декабрь 2005 г.). «Ядерный фактор зародышевых клеток (GCNF)» . Молекулярное воспроизводство и развитие . 72 (4): 550–6. дои : 10.1002/mrd.20377 . ПМИД 16155958 . S2CID 39315293 .

[entrez-8] «Ген Энтрез: подсемейство ядерных рецепторов NR6A1 6, группа А, член 1» .

[9] Нолл А., Шрёпфер С., Пухта Х. Комплекс RTR как хранитель стабильности генома и его уникальная мейотическая функция у растений. Фронт Завод Науч. 2014, 12 февраля; 5:33. doi: 10.3389/fpls.2014.00033. ПМИД 24575106; PMCID: PMC3921566

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]