Jump to content

RAR-связанный сиротский рецептор альфа

ПЛЕВАТЬ
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы RORA , NR1F1, ROR1, ROR2, ROR3, RZR-АЛЬФА, RZRA, RAR-связанный орфанный рецептор A, IDDECA
Внешние идентификаторы Опустить : 600825 ; МГИ : 104661 ; Гомологен : 56594 ; GeneCards : RORA ; ОМА : РОРА - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_002943
НМ_134260
НМ_134261
НМ_134262

НМ_013646
НМ_001289916
НМ_001289917

RefSeq (белок)

НП_002934
НП_599022
НП_599023
НП_599024

НП_001276845
НП_001276846
НП_038674

Местоположение (UCSC) Чр 15: 60,49 – 61,23 Мб Chr 9: 68,56 – 69,3 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Связанный с RAR орфанный рецептор альфа ( RORα ), также известный как NR1F1 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа F, член 1), представляет собой ядерный рецептор , который у людей кодируется RORA геном . [5] RORα участвует в регуляции транскрипции некоторых генов, участвующих в циркадных ритмах . [6] У мышей RORα необходим для развития мозжечка. [7] [8] путем прямой регуляции генов, экспрессируемых в клетках Пуркинье. [9] Он также играет важную роль в развитии врожденных лимфоидных клеток 2 типа (ILC2), а у мутантных животных наблюдается дефицит ILC2. [10] [11] Кроме того, клетки ILC3 и Th17 от мышей с дефицитом RORα, хотя и присутствуют в нормальных количествах, дефектны в производстве цитокинов . [12]

Открытие

[ редактировать ]

Первые три человеческие изоформы RORα были первоначально клонированы и охарактеризованы как ядерные рецепторы в 1994 году Жигером и его коллегами, когда их структура и функция были впервые изучены. [13]

В начале 2000-х годов различные исследования показали, что RORα демонстрирует ритмические паттерны экспрессии в циркадном цикле в печени , почках , сетчатке и легких . [14] млекопитающих является циркадным Интересно, что примерно в это же время было обнаружено, что содержание RORα в супрахиазматическом ядре . [15] RORα необходим для нормальных циркадных ритмов у мышей . [16] демонстрируя его значение в хронобиологии .

Структура

[ редактировать ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства ядерных рецепторов гормонов NR1. [16] У людей были идентифицированы 4 изоформы RORα, которые генерируются посредством альтернативного сплайсинга и использования промотора и демонстрируют дифференциальную тканеспецифическую экспрессию. Белковая содержащего структура RORα состоит из четырех канонических функциональных групп: N-концевого (A/B) домена, ДНК -связывающего домена, два цинковых пальца , шарнирного домена и C-концевого лиганд -связывающего домена. В семействе ROR ДНК-связывающий домен высококонсервативен, а лиганд-связывающий домен консервативен лишь умеренно. [14] Различные изоформы RORα обладают разной специфичностью связывания и силой транскрипционной активности. [5]

Регуляция циркадного ритма

[ редактировать ]

Основные млекопитающих циркадные часы представляют собой петлю отрицательной обратной связи , состоящую из Per1/Per2 , Cry1/Cry2 , Bmal1 и Clock . [15] Эта петля обратной связи стабилизируется посредством другой петли, включающей регуляцию транскрипции Bmal1 . [17] Трансактивация Bmal1 REV регулируется через вышестоящий элемент ответа ROR/REV-ERB (RRE) в промоторе Bmal1 , с которым связываются RORα и -ERBα . [17] Эта стабилизирующая регуляторная петля сама по себе индуцируется гетеродимером Bmal1/Clock , который индуцирует транскрипцию RORα и REV-ERBα . [15] RORα, который активирует транскрипцию Bmal1 , и REV-ERBα, который подавляет транскрипцию Bmal1 , конкурируют за связывание с RRE. [17] эта петля обратной связи, регулирующая экспрессию Bmal1 Считается, что , стабилизирует механизм основных часов, помогая защитить его от изменений в окружающей среде . [17]

Механизм

[ редактировать ]

Специфическая ассоциация с элементами ROR (RORE) в регуляторных областях необходима для функции RORα как активатора транскрипции. [18] RORα достигает этого путем специфического связывания с консенсусным основным мотивом в RORE, RGGTCA. Это взаимодействие возможно благодаря ассоциации первого цинкового пальца RORα с мотивом ядра в большой бороздке, P-box, и ассоциации его C-концевого продолжения с AT-богатой областью в 5'-области RORE. [16]

Гомология

[ редактировать ]

RORα, RORβ и RORγ являются активаторами транскрипции, распознающими элементы ROR-ответа. [19] ROR-альфа экспрессируется в различных типах клеток и участвует в регуляции некоторых аспектов развития, воспалительных реакций и развития лимфоцитов . [20] Изоформы RORα (от RORα1 до RORα3) возникают в результате альтернативного процессинга РНК, при этом RORα2 и RORα3 имеют общую аминоконцевую область, отличную от RORα1. [5] В отличие от RORα, RORβ экспрессируется в тканях центральной нервной системы (ЦНС), участвующих в обработке сенсорной информации и генерации циркадных ритмов , тогда как RORγ имеет решающее значение в лимфатических узлов органогенезе и тимопоэзе . [20]

ДНК-связывающие домены орфанного рецептора DHR3 у дрозофилы демонстрируют особенно тесную гомологию в амино- и карбоксильных областях, прилегающих ко второму региону цинкового пальца в RORα, что позволяет предположить, что эта группа остатков важна для функциональности белков. [5]

PDP1 и VRI у дрозофилы регулируют циркадные ритмы, конкурируя за один и тот же сайт связывания, VP-бокс, аналогично тому, как ROR и REV-ERB конкурентно связываются с RRE. [17] PDP1 и VRI составляют петлю обратной связи и являются функциональными гомологами ROR и REV-ERB у млекопитающих. [17]

Прямые ортологи этого гена были идентифицированы у мышей и человека.

человека Псевдоген цитохрома c HC2 и RORα имеют перекрывающуюся геномную организацию с псевдогеном HC2, расположенным внутри транскрипционной единицы RORα2. Нуклеотидные и выведенные аминокислотные последовательности псевдогена, процессированного цитохромом с, находятся на смысловой цепи, тогда как последовательности аминоконцевого экзона RORα2 находятся на антисмысловой цепи. [5]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Как мишень для наркотиков

[ редактировать ]

Поскольку RORα и REV-ERBα представляют собой ядерные рецепторы, которые имеют одни и те же гены-мишени и участвуют в процессах, регулирующих метаболизм , развитие , иммунитет и циркадный ритм, они обладают потенциалом в качестве мишеней для лекарств . Синтетические лиганды имеют множество потенциальных терапевтических применений и могут использоваться для лечения таких заболеваний, как диабет , атеросклероз , аутоиммунитет и рак . Было обнаружено, что T0901317 и SR1001, два синтетических лиганда, являются RORα и RORγ, обратными агонистами которые подавляют репортерную активность и, как было показано, задерживают начало и клиническую тяжесть рассеянного склероза и других Th17 аутоиммунных заболеваний, опосредованных клетками . SR1078 был обнаружен как агонист RORα и RORγ, который увеличивает экспрессию G6PC и FGF21, что дает терапевтический потенциал для лечения ожирения и диабета, а также рака молочной железы , яичников и простаты . SR3335 также был обнаружен как обратный агонист RORα. [13]

КГП 52608

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000069667 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032238 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б с д и Жигер В., Тини М., Флок Дж., Онг Э., Эванс Р.М., Отулаковски Г. (март 1994 г.). «Специфические для изоформы аминоконцевые домены определяют ДНК-связывающие свойства ROR-альфа, нового семейства ядерных рецепторов орфанных гормонов» . Гены и развитие . 8 (5): 538–53. дои : 10.1101/gad.8.5.538 . ПМИД   7926749 .
  6. ^ Jump up to: а б с «Ген Энтрез: RORA RAR-связанный сиротский рецептор А» .
  7. ^ Сидман Р.Л., Лейн П.В., Дики М.М. (август 1962 г.). «Штаггерер, новая мутация у мышей, поражающая мозжечок». Наука . 137 (3530): 610–2. Бибкод : 1962Sci...137..610S . дои : 10.1126/science.137.3530.610 . ПМИД   13912552 . S2CID   30733570 .
  8. ^ Гамильтон Б.А., Франкель В.Н., Керреброк А.В., Хокинс Т.Л., ФитцХью В., Кусуми К. и др. (февраль 1996 г.). «Нарушение работы ядерного рецептора гормона RORalpha у мышей-шатгереров». Природа . 379 (6567): 736–9. Бибкод : 1996Natur.379..736H . дои : 10.1038/379736a0 . ПМИД   8602221 . S2CID   4318427 .
  9. ^ Голд Д.А., Бэк С.Х., Шорк Н.Дж., Роуз Д.В., Ларсен Д.Д., Сакс Б.Д. и др. (декабрь 2003 г.). «RORalpha координирует реципрокную передачу сигналов в развитии мозжечка посредством звукового ежа и кальций-зависимых путей» . Нейрон . 40 (6): 1119–31. дои : 10.1016/s0896-6273(03)00769-4 . ПМК   2717708 . ПМИД   14687547 .
  10. ^ Халим Т.Ю., Макларен А., Романиш М.Т., Голд М.Дж., МакНэгни К.М., Такей Ф. (сентябрь 2012 г.). «Сиротский ядерный рецептор альфа, связанный с рецептором ретиноевой кислоты, необходим для развития естественных хелперных клеток и аллергического воспаления» . Иммунитет . 37 (3): 463–74. doi : 10.1016/j.immuni.2012.06.012 . ПМИД   22981535 .
  11. ^ Голд М.Дж., Антиньяно Ф., Халим Т.Ю., Хирота Дж.А., Бланше М.Р., Заф С. и др. (апрель 2014 г.). «Врожденные лимфоидные клетки группы 2 способствуют сенсибилизации к локальному, но не системному воздействию TH2-индуцирующих аллергенов». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 133 (4): 1142–8. дои : 10.1016/j.jaci.2014.02.033 . ПМИД   24679471 .
  12. ^ Ло Б.С., Голд М.Дж., Хьюз М.Р., Антиньяно Ф., Вальдес Ю., Заф С. и др. (сентябрь 2016 г.). «Осиротский ядерный рецептор ROR-альфа и врожденные лимфоидные клетки группы 3 вызывают фиброз в мышиной модели болезни Крона» . Наука Иммунология . 1 (3): eaaf8864. doi : 10.1126/sciimmunol.aaf8864 . ПМЦ   5489332 . ПМИД   28670633 .
  13. ^ Jump up to: а б Кожетин DJ, Беррис Т.П. (март 2014 г.). «Ядерные рецепторы REV-ERB и ROR как мишени для лекарств» . Обзоры природы. Открытие наркотиков . 13 (3): 197–216. дои : 10.1038/nrd4100 . ПМЦ   4865262 . ПМИД   24577401 .
  14. ^ Jump up to: а б с д и Джеттен А.М., Куребаяши С., Уэда Э. (2001). «Подсемейство ядерных рецепторов-сирот ROR: критические регуляторы множества биологических процессов» . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии . 69 : 205–47 . дои : 10.1016/S0079-6603(01)69048-2 . ISBN  978-0-12-540069-5 . ПМИД   11550795 .
  15. ^ Jump up to: а б с Ко Ч., Такахаши Дж.С. (октябрь 2006 г.). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих» . Молекулярная генетика человека . 15 Спецификация № 2 (2): R271-7. дои : 10.1093/hmg/ddl207 . ПМЦ   3762864 . ПМИД   16987893 .
  16. ^ Jump up to: а б с д и ж Эмери П., Репперт С.М. (август 2004 г.). «Ритмичный Рор» . Нейрон . 43 (4): 443–6. дои : 10.1016/j.neuron.2004.08.009 . ПМИД   15312644 .
  17. ^ Лайтинен С., Стальс Б. (2003). «Потенциальная роль ROR-альфа в сердечно-сосудистой эндокринологии» . Передача сигналов ядерных рецепторов . 1 : e011. дои : 10.1621/nrs.01011 . ПМК   1402228 . ПМИД   16604183 .
  18. ^ Чжао X, Чо Х, Ю РТ, Аткинс А.Р., Даунс М., Эванс Р.М. (май 2014 г.). «Ядерные рецепторы работают круглосуточно» . Отчеты ЭМБО . 15 (5): 518–28. дои : 10.1002/эмбр.201338271 . ПМК   4210094 . ПМИД   24737872 .
  19. ^ Jump up to: а б Ду Дж, Хуан С., Чжоу Б, Зиглер С.Ф. (апрель 2008 г.). «Изоформ-специфическое ингибирование ROR-альфа-опосредованной активации транскрипции человеческим FOXP3» . Журнал иммунологии . 180 (7): 4785–92. дои : 10.4049/jimmunol.180.7.4785 . ПМИД   18354202 .
  20. ^ Сюн Г., Ван С., Эверс Б.М., Чжоу Б.П., Сюй Р. (апрель 2012 г.). «RORα подавляет инвазию опухоли молочной железы, индуцируя экспрессию SEMA3F» . Исследования рака . 72 (7): 1728–39. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-11-2762 . ПМК   3319846 . ПМИД   22350413 .
  21. ^ Паравичини Г., Штайнмайр М., Андре Э., Беккер-Андре М. (октябрь 1996 г.). «Кандидат в супрессоры метастазирования нуклеотиддифосфаткиназа NM23 специфически взаимодействует с членами подсемейства ядерных орфанных рецепторов ROR/RZR». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 227 (1): 82–7. дои : 10.1006/bbrc.1996.1471 . ПМИД   8858107 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5a8770b5b99f806f8f88c11620517e46__1721786880
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/5a/46/5a8770b5b99f806f8f88c11620517e46.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
RAR-related orphan receptor alpha - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)